Detailed information on CNT0002000 (Glycine max)


BLAST search results

BLAST vs PNRD: nothing found

BLAST vs Swiss-Prot: nothing found

BLAST vs NONCODE (A. thaliana): nothing found

Potential orthologs: nothing found

Most similar lncRNAs: nothing found

Expression of CNT0002000

Peptides detected in this lncRNA

>peptide 1 (60 aa)
MLFNLALNKVLIALLLVPFFSFLGGIGVRKLHMQRKHFRCVNCICTNYSSCDGCWGCIGG*

>peptide 2 (157 aa)
MDAGDALVDDHESQDLSEEEINVHHLLRLARKLWLPAFFFLTVCQTWTTQLQILFIKLTLFLLSTKPNPFSVYVFVDKLCQRYMHQETRFFKVKSLYASK
IEVQDYKLLCLADVEVRDQKFTLVGILGSWWPILHLPFWEAFSFFRNRIGSILVKTT*

>peptide 3 (170 aa)
MLVKSLSPYSHAFSSFSASFGTNPSWVPLKSSNSLCCSSKPRNLSRFLCLSTQNGGGFRENSGEVGRGDAVIIVDHGSRRKESNLMLSKLNPSVLCFITV
FVLTPFIFLFFGRGVGVCVEPAHMELAEPSIRDAFQSCVEQGAHRIIVSPFFLFPGRHWSQEVTYAAEAF*

>peptide 4 (30 aa)
ILQVVVVLLVYLCGWTIRTKFVPCVYYYLF*

>peptide 5 (48 aa)
YFAGCCCSLSLFMWMDNQNEICPLCILLFILILITFPQIENLKMDYCF*

>peptide 6 (34 aa)
MSQICKHLYLCKNVTSQHSVTAPILPLPLFDILN*

Sequence

>CNT0002000
ATATTTTGCAGGTTGTTGTTGTTCTCTTAGTTTATTTATGTGGATGGACAATCAGAACGAAATTTGTCCCTTGTGTATATTATTATTTATTTTGATTTTA
ATTACTTTTCCACAAATTGAAAACCTAAAAATGGATTATTGTTTTTGAGCTAGATGCGGCTGTGTCCCATTGTCCTTTTTTTTAATAGACCATTGCGGCC
ATTGGTTTGCTAATCATTTGCAGGATCACGTTTTCTGATATCAGTTGGTGGAAACCAGAAATTGTGGGTAGAGTTGGATAGGAACGGGGCAAAACAGAAC
TATAGTATCCCGTCTCTCTTGAAAGAAGTGGTGTTGACTTTCTCGTAATCAGTGATGCTGGTGAAGTCTCTATCACCTTATTCTCATGCCTTCTCAAGTT
TTTCTGCAAGTTTTGGAACAAACCCAAGTTGGGTTCCCTTAAAGTCCTCAAATAGCCTCTGCTGTTCCTCCAAGCCTAGAAATTTAAGCAGATTTTTATG
TCTGAGCACTCAAAATGGTGGTGGCTTCAGAGAAAACTCTGGTGAAGTTGGACGTGGAGATGCAGTGATAATTGTGGATCATGGGTCACGTCGCAAAGAG
TCAAATCTCATGCTTAGTAAGCTAAACCCATCCGTTTTGTGTTTTATCACTGTTTTTGTATTAACTCCTTTTATTTTTTTATTTTTTGGACGGGGGGTGG
GGGTGTGTGTGGAGCCTGCTCATATGGAATTAGCAGAACCATCAATAAGAGATGCTTTTCAATCTTGCGTTGAACAAGGTGCTCATCGCATTATTGTTAG
TCCCTTTTTTCTCTTTCCTGGGAGGCATTGGAGTCAGGAAGTTACATATGCAGCGGAAGCATTTTAGGTGTGTCAATTGCATCTGCACCAATTATAGCTC
ATGCGATGGATGCTGGGGATGCATTGGTGGATGATCATGAATCACAGGACCTTTCAGAGGAGGAAATAAATGTGCATCACTTGTTGAGATTGGCTAGGAA
ACTTTGGCTGCCTGCTTTTTTCTTTCTTACCGTTTGTCAAACTTGGACGACTCAATTACAAATATTATTCATTAAACTTACTCTATTCCTCCTCAGTACA
AAGCCCAACCCTTTCTCTGTCTATGTATTTGTTGATAAGTTGTGCCAACGATATATGCACCAAGAAACTCGATTCTTTAAAGTAAAGTCACTTTATGCCA
GCAAAATCGAAGTGCAGGACTATAAGCTTCTTTGCTTGGCTGATGTTGAAGTGAGAGATCAAAAGTTCACTTTGGTTGGAATTCTTGGTAGTTGGTGGCC
TATACTGCATTTGCCATTTTGGGAAGCATTCTCTTTTTTCAGAAATAGAATTGGAAGCATCTTGGTGAAAACAACATAACAAGGGAGTTGGGCCTCTGTT
GGTTTTGTCCCTTTTGGAGCTTCAACTAAATCATGTTATTCATTGAAGATACCATCCCAAAAGTGTTATGCATAGAAGAAGAAAATAAGGGGCAGGAAAT
GAGACAGGACTGATTATTACTTGCAAATAAAGTAGCATTTCAAATACTAACTGCCTAGGCTATAAGGTTATCCCTCTCTTGTTTGATGAGTCAAATATGC
AAACATTTATATCTTTGTAAAAATGTGACATCTCAACATTCTGTCACAGCCCCTATTCTTCCTCTGCCACTTTTTGATATTTTAAATTAATCGTTAGTAT
TGAAGTTTAGTTTGTTTGAAAATAGACTTAAATATGTTTTTGTTCATGTAAGTTTGTATTTTTTTAATTTTGGTCCTGGT