Detailed information on CNT0002016 (Glycine max)


BLAST search results

BLAST vs PNRD: nothing found

BLAST vs Swiss-Prot:
sp|Q9SJD4|LACS8_ARATH, E-value = 2e-06

BLAST vs NONCODE (A. thaliana): nothing found

Potential orthologs: nothing found

Most similar lncRNAs: nothing found

Expression of CNT0002016

Peptides detected in this lncRNA

>peptide 1 (50 aa)
VSTTKTIFYIAGSELFREKQCQIKCGGISVNNNKNLALVNKIDVERVIEH*

>peptide 2 (46 aa)
MEFGKGFLPLVNCLGDWRYRATEFCKEKGFQLVAELWVSTSVSGLD*

>peptide 3 (31 aa)
MINPFLTQRTKNKFAFPGPPRSSILFSKMFI*

>peptide 4 (48 aa)
MCMFLITSTRFWTKINISTIFLALPNGSFALPPNKLCSYFRTTISSVP*

Sequence

>CNT0002016
GGTATCTACTACAAAAACTATTTTTTACATTGCTGGATCCGAACTGTTTAGAGAAAAACAATGTCAAATAAAATGTGGTGGTATCTCGGTAAATAATAAC
AAAAATCTGGCATTGGTAAATAAAATCGATGTTGAAAGAGTTATAGAACATTGACTTAGTTAATAGCCGAAGTTCGGCTATTTTGCATCGTTTTTAAAAA
ACCGTCCTTGAAGGACAAATAAAAACCTTCTCTCTCGAGCCCTATCTGTAAATCTCCCTCCCAACAGCCTCTCCTTCAAATCTTGGTTCCTCTCTCGCCT
TTCAACTTCCGTCGAGGTGCGAAACAACCAATTGAAGCTGGTGTTCGTGTCATTGGTCAGATGTGCATGTTTCTCATAACATCGACGCGCTTTTGGACCA
AGATAAACATCAGCACTATTTTCCTGGCCCTGCCAAATGGGAGCTTTGCCTTGCCACCAAACAAGCTCTGCAGTTACTTCAGGACAACTATCTCGAGTGT
CCCGTGATGGTATAGCATGATCAATCCCTTCTTGACTCAGAGGACCAAAAACAAATTTGCTTTTCCTGGACCACCCAGGTCATCGATACTCTTTTCTAAA
ATGTTTATTTGATCGCAAAGCCATCCCAAACTGGATGCCCTTTATTTCTTCTGTTAAGGGAGAGATGCAACAACAAAGAGAAGAAGCCAAATAACAAAGG
TACAGAGGCATGGAATTTGGCAAAGGTTTTCTTCCACTAGTCAATTGTCTTGGAGATTGGAGGTACAGAGCCACGGAATTTTGTAAAGAAAAAGGGTTCC
AATTAGTAGCTGAGTTATGGGTTTCTACTTCAGTGAGTGGATTGGATTAATATTTAAGTTTAAAGTGCATTTTGATTGTGTTTTATTTTCTTAATTTTTC
TAATGTTGCATGTTTTGAAAAACTCAAATACTTGTTTTAGAATTTGACAGTTGTTGGAGGTTGTATGGGATATGAATCTCCTTTGACTTTAACTTGTACA
TAAAACAAAATAAGAAAAGGGGAAACGGGGGGATGCCACTGCACTGATGCCAACTATGAGGGCAGCTGCACGCGTAATTCTTGATAATGTACGTGAGGGA
GTGCTCAAGAGGGTATTTGATTTGTGACGCCTTTGAATAATACAATCCTACATATCAATATTATGCATTTATGTCTC