Detailed information on CNT0002017 (Glycine max)


BLAST search results

BLAST vs PNRD: nothing found

BLAST vs Swiss-Prot:
sp|Q9SJD4|LACS8_ARATH, E-value = 4e-06

BLAST vs NONCODE (A. thaliana): nothing found

Potential orthologs
: nothing found

Most similar lncRNAs
: nothing found

Expression of CNT0002017

Peptides detected in this lncRNA

>peptide 1 (62 aa)
MQEKIPNLILCFFLHKFSLVTIAICYSCYITFLQPIPNQKIHWRCMEKIYACALAVNSRNVK*

>peptide 2 (48 aa)
MCMFLITSTRFWTKINISTIFLALPNGSFALPPNKLCSYFRTTISSVP*

>peptide 3 (31 aa)
MLYHLLATHSKSENPLAMYGKNLRLCTSSEL*

>peptide 4 (35 aa)
MEPSKLQGPFIISNDCLLSLTQKICCLFFFAKSNI*

>peptide 5 (31 aa)
MINPFLTQRTKNKFAFPGPPRSSILFSKMFI*

>peptide 6 (46 aa)
MEFGKGFLPLVNCLGDWRYRATEFCKEKGFQLVAELWVSTSVSGLD*

>peptide 7 (31 aa)
MIFSLLHFDFMQMLDLFHRYCQTNLTYHDGP*

>peptide 8 (50 aa)
VSTTKTIFYIAGSELFREKQCQIKCGGISVNNNKNLALVNKIDVERVIEH*

>peptide 9 (44 aa)
MFVLIVIIFLLSSLNLQVCQICLTTLILIMILKGEMQQQREEAK*

Sequence

>CNT0002017
GGTATCTACTACAAAAACTATTTTTTACATTGCTGGATCCGAACTGTTTAGAGAAAAACAATGTCAAATAAAATGTGGTGGTATCTCGGTAAATAATAAC
AAAAATCTGGCATTGGTAAATAAAATCGATGTTGAAAGAGTTATAGAACATTGACTTAGTTAATAGCCGAAGTTCGGCTATTTTGCATCGTTTTTAAAAA
ACCGTCCTTGAAGGACAAATAAAAACCTTCTCTCTCGAGCCCTATCTGTAAATCTCCCTCCCAACAGCCTCTCCTTCAAATCTTGGTTCCTCTCTCGCCT
TTCAACTTCCGTCGAGGTGCGAAACAACCAATTGAAGCTGGTGTTCGTGTCATTGGTCAGATGTGCATGTTTCTCATAACATCGACGCGCTTTTGGACCA
AGATAAACATCAGCACTATTTTCCTGGCCCTGCCAAATGGGAGCTTTGCCTTGCCACCAAACAAGCTCTGCAGTTACTTCAGGACAACTATCTCGAGTGT
CCCGTGATGGTATAGCATGATCAATCCCTTCTTGACTCAGAGGACCAAAAACAAATTTGCTTTTCCTGGACCACCCAGGTCATCGATACTCTTTTCTAAA
ATGTTTATTTGATCGCAAAGCCATCCCAAACTGGATGCCCTTTATTTCTTCTGTTAAGGTGTGTGCTTGCTTTCCTTCTCACCCTCTATTCTAAGGATCA
GTTTTCTTAAATTACAGAAATCGGGTCTTGTGAGGGAGGGGGGAAATGAAGTCCCTTAGTTGTTCACATTGCTTAAAACATTTACTCATGTTTTTCTTAG
CATCATAAAATATCTGGGTATATTATGGAACCTAGTAAATTGCAAGGGCCTTTCATAATCAGCAATGATTGTCTACTAAGTTTAACACAGAAGATATGTT
GCTTGTTTTTCTTTGCTAAGTCAAACATCTAGCTGGTGTTTTGGAACCTAAGATCCCCTGCCTTTTTGCTAAGGGAAGATAGCCTGACATTAGGATCACG
CTCTAGGCATTCTTGCTTTGGATCCAAATGATTTTTTCTCTCTTGCATTTTGATTTTATGCAAATGTTGGACTTGTTTCACAGATATTGCCAGACAAACC
TGACCTATCACGATGGTCCTTGAAGTATAAGGCATTTGGTCCTAATATTGAATTCTCTTGGCTTGCTCGTAAAATGCAGGAAAAGATCCCAAACTTAATA
CTATGCTTTTTTCTCCATAAATTCTCTTTAGTTACAATTGCTATTTGTTATTCATGCTATATCACCTTCTTGCAACCCATTCCAAATCAGAAAATCCACT
GGCGATGTATGGAAAAAATCTACGCCTGTGCACTAGCAGTGAACTCTAGGAATGTGAAATGAAATGTTTCTAGAATGATTAAAGAATTCCTCGTTGTATC
TTGTTCAAACTATCATATTGTGGTTAGCATGATATGTTTGTACTTATTGTAATAATTTTCCTTTTATCCTCATTGAATTTGCAAGTGTGTCAGATTTGCT
TGACTACATTAATCCTAATTATGATACTAAAGGGAGAGATGCAACAACAAAGAGAAGAAGCCAAATAACAAAGGTACAGAGGCATGGAATTTGGCAAAGG
TTTTCTTCCACTAGTCAATTGTCTTGGAGATTGGAGGTACAGAGCCACGGAATTTTGTAAAGAAAAAGGGTTCCAATTAGTAGCTGAGTTATGGGTTTCT
ACTTCAGTGAGTGGATTGGATTAATATTTAAGTTTAAAGTGCATTTTGATTGTGTTTTATTTTCTTAATTTTTCTAATGTTGCATGTTTTGAAAAACTCA
AATACTTGTTTTAGAATTTGACAGTTGTTGGAGGTTGTATGGGATATGAATCTCCTTTGACTTTAACTTGTACATAAAACAAAATAAGAAAAGGGGAAAC
GGGGGGATGCCACTGCACTGATGCCAACTATGAGGGCAGCTGCACGCGTAATTCTTGATAATGTACGTGAGGGAGTGCTCAAGAGGGTATTTGATTTGTG
ACGCCTTTGAATAATACAATCCTACATATCAATATTATGCATTTATGTCTC