Detailed information on CNT0002044 (Glycine max)


BLAST search results

BLAST vs PNRD: nothing found

BLAST vs Swiss-Prot:
sp|A0JPP1|NC2A_RAT, E-value = 9e-13

BLAST vs NONCODE (A. thaliana): nothing found

Potential orthologs: nothing found

Most similar lncRNAs: nothing found

Expression of CNT0002044

Peptides detected in this lncRNA

>peptide 1 (29 aa)
MQCYHNLNNPIVISIFPPNSMLIIHIHLS*

>peptide 2 (51 aa)
MRLFENLLGSEHVIHIIYRNSETIYNGFPIIRERIKDLQDFQPNWLIMYRK*

>peptide 3 (31 aa)
MILILWGAATNAETRGSWKLCQGSDKEDNAS*

>peptide 4 (109 aa)
MLQSWYAHALSPFTLHLAVTSIHLTLALHPALTSTSSSWTFPNLCSDPSPVKGRVFVRTKTPNPNIVAAPRVVGFGKKRGPNSMCSGGILFCSSLTPATH
SPQCLHQCH*

>peptide 5 (68 aa)
MQKLEEVGSSVKARIKKIMQADEDVGKIALAVPVLVSKALELFLQDLCDRTYEITLQRGAKTMNSLHL*

Sequence

>CNT0002044
ATTAATACCAACTTTTTATAAAGCTTAACGACGGGTCTTGTAAACCGCTTTTGATACAAACATTACGAAGGCGGTTTTATAAAAACCGCCTTTGTTTGTT
AGCCTATTACTACGGTTTTATACGAAAACCGCCTTTGTCTCATTTGTAGTTATTTTTATTAATTATTTATGCTTCAGTCTTGGTACGCGCATGCCCTTTC
GCCCTTCACCCTTCACCTTGCCGTGACCTCCATACATCTCACTCTCGCCCTTCACCCTGCCCTGACCTCCACAAGCTCGTCGTGGACATTTCCCAACCTG
TGCTCTGACCCGTCTCCGGTGAAGGGTAGGGTTTTTGTGAGAACGAAAACACCTAACCCTAATATTGTTGCTGCTCCAAGAGTGGTGGGATTCGGAAAGA
AGCGTGGACCAAACTCTATGTGTAGTGGTGGGATTCTATTTTGCTCATCTCTTACACCAGCAACACATTCCCCACAATGTCTCCATCAATGTCATTGAAA
CATGATCCTAATCCTTTGGGGAGCTGCTACTAATGCAGAAACTAGAGGAAGTTGGAAGCTCTGTCAAGGCTCGGATAAAGAAGATAATGCAAGCTGATGA
GGATGTTGGAAAGATAGCACTCGCTGTGCCTGTTTTAGTTTCTAAAGCTCTAGAACTATTTTTGCAAGATCTTTGTGACCGCACTTATGAAATAACTCTT
CAAAGAGGAGCAAAGACCATGAATTCATTGCATTTGTAAGTCTCTTATGTTATTATTACTTTTCTTCAATCTCCCATTTTAGTGATTTAGAACCAACTCT
AGAACTTAGAATAATGCCTTTATAATTGACTTCTTTTAATATTCTTAGCTTTGATTTTAATCCTCACTTTCCCCTTTTCCATATGTCCAAGTTATAAATG
GAAGCTAAATGTGAAACAGGAAAGTAGCCATTTTTTAGGTTTTAAAAAATTCTCAATAATGTAAATGAAGTATGAATGGCCAAACCTGATTAGAAGTGTT
TATTTATGTTTAAAAGGTAATTTGCTTGTTAGGGTATGCATCCATGTGTGAAGTAGATTGTTAAACATTATTGGTATATCTTATTTGCACTGTCACTTCA
ACATAATTTTGTGTTGTGTGTTCTATCACTTGAATCTGAAGGAAACTATGAGATTGTTTGAAAACTTGCTTGGGAGTGAGCATGTCATCCATATCATATA
TAGAAACAGTGAAACAATATACAATGGGTTTCCCATAATTAGGGAAAGAATAAAAGATCTGCAAGATTTTCAGCCTAATTGGCTAATTATGTACAGAAAA
TAAAGGGGAATTAATTACTATGAAATCAAATATTGTAGCACAATCTCAGCTTATATCTGAAAATCTCAATGCAATGCTATCATAACCTCAACAATCCTAT
TGTAATCTCAATATTCCCCCCCAACTCGATGCTTATAATTCATATTCATCTATCTTGATACATATGATATCCTCTGTCCACAAAGAGATTTAGTGAAGAT
CTGCTGGTTAATCAATAGAATAGAACCAACAAATTGTGTAGTGACAGTCAATCTAAATGCACATGTGCAAGGATGCCTGATTATCACCTATGGTATTCAT
AGGGCCTACTTTACAAAATTTAGCTCTTGGAAGAGTTGCTTCAGCCCTATGAGTTCACATGTGATGAG