Detailed information on CNT0002168 (Glycine max)


BLAST search results

BLAST vs PNRD: nothing found

BLAST vs Swiss-Prot:
sp|B3GS44|LRE_ARATH, E-value = 8e-31

BLAST vs NONCODE (A. thaliana): nothing found

Potential orthologs
: nothing found

Most similar lncRNAs
: nothing found

Expression of CNT0002168

Peptides detected in this lncRNA

>peptide 1 (66 aa)
VGERKKKDSLQKSRFARIGAVTHYNVRLDRVFFLSLLSSLIPYLPLPTLIPFFFFPLVITQIGNII*

>peptide 2 (54 aa)
MRHDTCIIILITIYSTPFYVSISLYHIIYYISKFSLSFHFSRFLFLCCKICCTN*

>peptide 3 (45 aa)
MENTLLASLLVSVMKGNLVSLVLHCHRLHQQMTQQIKLYTVHLYC*

>peptide 4 (72 aa)
MVFSFNQSFCLSSSLLLLLMALCVSSLSDTVFNSQAAHTARNLLQAKKSLYFFSSAYAFGSTRLLCFFFWSC*

>peptide 5 (127 aa)
MMLFFHLAPAGCSVNFEFLNYTVITSKCKGPHYPPKECCGAFKEFACPYVDVLNDLTNECASTMFSYINLYGKYPPGLFASECHEGKLGLACPALPPSAS
ADDTANQVVHCPSLLLMLTACFLILLF*

>peptide 6 (46 aa)
MLKFVNFYNNYLKNLIYLAFDWLTESIFLCAIFFVVCYGFCLYNFF*

>peptide 7 (37 aa)
MAKFSFQTHNAPVPLEGLSPLIPNIYVHSWHANFDQS*

>peptide 8 (43 aa)
MYNNSYNNLFNTILCVYLSLSYNLLYFKIFSLLSLFSLSLSLL*

>peptide 9 (33 aa)
MRLVSYPVGWELSRTLMQDQRRLSISLIVKPKN*

>peptide 10 (74 aa)
MLVNFIFFSRKKQAFYLILCSHTYVSNGLFENYGPKISNSIDYTMSYGKIFLSNPQCSRPLRGSFSIDPQYICT*

>peptide 11 (74 aa)
MGLQLLVKAIVRGRSWVCQEIIFLPERKTITNYHFGFPNTYLISQFGPLKVCVSKLVLQKFEVTSIKIDFTLNL*

Sequence

>CNT0002168
GTGGGAGAAAGAAAAAAAAAAGACAGCTTGCAGAAGAGCAGGTTTGCGCGTATTGGTGCTGTCACTCATTACAACGTTAGATTAGATCGTGTCTTCTTCC
TCTCTCTACTTTCTTCTCTAATACCATACCTGCCACTTCCAACACTTATTCCTTTTTTTTTTTTCCCTCTTGTCATTACTCAAATTGGAAACATTATTTG
AAGCTATCAAACAACAATCTTTCTTCTATCAACCCTCAGCCATGGTGTTTTCTTTCAACCAAAGCTTCTGCCTTTCTTCTTCGCTTCTCCTTCTCCTCAT
GGCCCTCTGTGTTTCTTCTCTTTCTGACACCGTTTTCAACTCTCAAGCAGCGCATACCGCTCGGAACCTTCTTCAGGCTAAAAAAAGTTTGTATTTTTTT
TCCTCTGCCTATGCTTTTGGATCTACCCGATTATTATGCTTTTTTTTTTGGTCCTGCTAACTTAATCAACCTATATCTTAAATATTAAAAGGGTGTGGTT
TAGTTGGTAATTAACATTTGTTGAGCATGTGAGTTTGCTCACATTACAAATTCTTGGGGAGAGGCTAAGAGATTTAAATGTGATTAAGCCACAAGACTAA
GAATTGATCTAACCAAAAGAGTTGGTGCAATGGTGTAAGATTATGCTACTTTCATATGTGTGAAAATGAGATTAGTCTCTTATCCCGTGGGTTGGGAACT
CTCGAGGACTCTGATGCAGGACCAAAGAAGATTAAGTATTAGTCTCATAGTTAAGCCAAAGAATTGAAACTTGTGAGGATACTTGAGTGTCCCATCAGGG
ATTTAAAGACCTTAACTATGAGACATGATACATGTATAATAATTCTTATAACAATTTATTCAACACCATTTTATGTGTCTATCTCTCTCTATCATATAAT
TTATTATATTTCAAAATTTTCTCTCTCCTTTCACTTTTCTCGCTTTCTCTTTCTTTGTTGTAAGATTTGTTGTACAAATTAATAACATTTCTCTAACTTA
ATTAGGATAGTTACTGGAAAAAAATATATCAAAAGTATTGAGTATGTAATTTACATTGTCATTCAATTATAACCTGTTATCTATGTTAAAGTTTGTTAAT
TTTTACAATAATTACCTTAAAAATCTTATCTACTTGGCTTTTGATTGGTTGACAGAGTCAATCTTTCTATGTGCTATATTTTTTGTGGTTTGTTATGGAT
TTTGTCTGTATAATTTTTTTTAGATTGAAGAAAACAAAGTTCACTAGCAGTAAGTAAAGATGGGTTTACAATTGCTCGTTAAAGCAATAGTAAGAGGAAG
AAGCTGGGTTTGCCAGGAAATAATATTTCTTCCAGAAAGAAAGACTATAACTAACTACCATTTTGGTTTTCCAAATACATATTTGATATCACAATTTGGT
CCTCTGAAGGTTTGTGTGAGCAAATTAGTCCTTCAAAAGTTTGAAGTGACATCGATTAAAATTGATTTCACTTTAAATCTTTGAAAGGCTGATTTGATAG
CACAATATTTCAGTTGTCCAAATTGATGTTCAGTGTATCTTTGGAGGATCAAAATGTTGGTTAATTTTATTTTTTTTTCCAGAAAGAAACAAGCTTTCTA
CTTAATCTTATGTTCACATACATACGTTAGTAATGGGCTATTTGAGAATTATGGCCCCAAAATTAGCAATAGTATAGACTATACAATGAGTTATGGCAAA
ATTTTCCTTTCAAACCCACAATGCTCCCGTCCCCTTAGAGGGTCTTTCTCCATTGATCCCCAATATATATGTACATAGCTGGCACGCCAATTTTGACCAA
AGCTAAATATTAGTCAGATGATGCTGTTTTTTCACCTTGCACCTGCAGGTTGTTCTGTGAATTTCGAGTTTTTAAACTACACAGTAATCACAAGCAAATG
CAAAGGACCCCATTACCCTCCCAAAGAATGTTGTGGGGCTTTTAAAGAATTTGCTTGCCCTTATGTCGATGTATTAAATGATTTAACGAACGAGTGCGCC
TCAACCATGTTTAGTTACATTAATCTCTATGGAAAATACCCTCCTGGCCTCTTTGCTAGTGAGTGTCATGAAGGGAAACTTGGTCTCGCTTGTCCTGCAT
TGCCACCGTCTGCATCAGCAGATGACACAGCAAATCAAGTTGTACACTGTCCATCTCTATTGCTGATGCTCACAGCCTGCTTCTTAATCTTGTTATTTTG
ATATCTTTCTATACACAACTTTTATTCTTTTTCTCGCACAATATTGATGTATAATCAGTTACCATTTTTTATATGTTGTGTGTGAATTACTTTTTGAGCA
AAAAAAATTGACAATGTACCTGTAGTTTAAGGAGAGTTCTATTGATCAAATTTTATCTAATGAAATTACGTTTGCCAAGTGCGCAGGA