Detailed information on CNT0002243 (Glycine max)


BLAST search results

BLAST vs PNRD: nothing found

BLAST vs Swiss-Prot:
sp|Q8L5U0|CSN4_ARATH, E-value = 3e-09

BLAST vs NONCODE (A. thaliana): nothing found

Potential orthologs
: nothing found

Most similar lncRNAs
: nothing found

Expression of CNT0002243

Peptides detected in this lncRNA

>peptide 1 (30 aa)
MAMGRGRDRYCLPNSRPRLPQHVPILVPDT*

>peptide 2 (32 aa)
MSPYLYPIPDGLKFIISSPYPLGIGYPRPRPIP

>peptide 3 (48 aa)
MFSEWGKHYCKVFSRHGNGARQGQVLSPQFPTPTPPTCPHTCTRYLTG*

>peptide 4 (52 aa)
MPQLLHFPQQALLPDIFTVLDRAMIEHNLLSASKLYTNIRFGKLYYQFISYV*

>peptide 5 (78 aa)
SRFQSGEKRASRSFKRVIATAMGHMRSCKFVFILSSLSSNSFSNELFHVQSTNCVPFRSRESEACSHGLQNRSSFLMN*

>peptide 6 (37 aa)
MRRGRKEVEVIDKVGDVSMASTPFYDENMYILNQCEK*

>peptide 7 (35 aa)
MVMEANSNALESANYTGKIPPPHPSSVIWPSTLIT*

Sequence

>CNT0002243
ATCTAGGTTTCAAAGTGGAGAGAAGAGAGCATCGCGCAGCTTCAAGCGAGTGATAGCCACAGCCATGGGTCATATGCGCAGTTGCAAGTTTGTATTCATT
CTTTCATCTCTATCATCAAATTCCTTCTCAAACGAGCTCTTTCATGTCCAAAGCACGAACTGCGTTCCATTCCGCAGCCGCGAAAGCGAAGCATGTTCTC
ATGGACTTCAAAATCGATCTAGTTTCTTGATGAACTGAAGCATATAAAGTGGAGACCTCCACATATAGGAACAAAGCAGGGTTGGCAAGATAGAACAAAC
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GTTCTTGTTATTCAGAATGATTTTCAGGTTAATGAATAACGATACAACTAGCCTATTAAAATTTTGGGCTTTTTGACCAAGTCTTGAGGGCAAACAAACT
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TTATATTTTACATCTACTCGTTTATGGAAAGATCCTACATGAATTTCTGTTCTACAATTTGTAACTTGAACTAAAGTAGTATACGGTAATGTCAATACAT
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GCAAGCTCTTCTTCCAGACATTTTCACTGTGCTGGACCGCGCTATGATTGAGCACAATCTTTTGAGTGCTAGCAAACTGTATACTAATATTAGGTTTGGG
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AGCTCTGTGTGCCTCTATTGATCAGGTATAAATAACAATTGCAACCTCTGTTTATAAAAGTATTCTAAAGAAATAGAAATAATAATTGAAGGAATCTTCT
TGTTGGATTGCTGTATGGGAACTAGTAAAAGGGTATGATGTAGGAGGAGAGTTTTTATATGTTCTCAGAGTGGGGAAAACATTATTGTAAGGTTTTTAGT
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