Detailed information on CNT0002313 (Glycine max)


BLAST search results

BLAST vs PNRD: nothing found

BLAST vs Swiss-Prot:
sp|O23044|PER3_ARATH, E-value = 3e-37

BLAST vs NONCODE (A. thaliana): nothing found

Potential orthologs: nothing found

Most similar lncRNAs: nothing found

Expression of CNT0002313

Peptides detected in this lncRNA

>peptide 1 (33 aa)
MVLGLIILIFPLFLKSTFWMNLVLGIICQEYMF*

>peptide 2 (76 aa)
IVNAACHRPPRAHQHQPLLPLHHKRHLGNGATHGNHALCRDDHRHDREEKLEIPRVDEELDALTSRIKLEEGNTKF*

>peptide 3 (33 aa)
MLWFLTKWLCSRCSIILKLTLLKLHVLYCGRLW*

>peptide 4 (56 aa)
MHFHDCFVRGCDASALLNSTTNQVEKNARPNLTVRGFDFIGIIKSLVEAECHGVVS*

>peptide 5 (48 aa)
MLNLLHNNFMICSSLLNKGSQTLKVFCPIRALSTNYFFIVLGTIITCK*

>peptide 6 (29 aa)
MYSITLWHMLVAWIISMICHVTCSSTLGL*

>peptide 7 (34 aa)
MEPHMGTTRFVGMTTATTERKSLRSLGWTKSWMH*

>peptide 8 (58 aa)
MKAWETTQDEMMIAGGLHVVVFNKMVVFTVFNHFKIDTFEASCLILWQVMVKWLYYKF*

Sequence

>CNT0002313
TAATTGTCAACGCGGCATGTCATCGTCCTCCGCGGGCTCACCAACACCAGCCTTTGCTTCCACTCCACCATAAACGACACCTTGGGAATGGAGCCACACA
TGGGAACCACGCGCTTTGTCGGGATGACCACCGCCACGACAGAGAGGAAAAGCTTGAGATCCCTAGGGTGGACGAAGAGCTGGATGCATTAACTTCACGT
ATAAAGCTGGAGGAAGGAAATACAAAGTTCTAGAAATGTCACTTTTCAGGGGAGATGGTTACAGGAAAGGGAAGTTGAGTTGACAATCAAAGTTATGCAG
AAGGTAAATAGCTAAACCTTGACTATTTTTTCCTTTTAACTGTAAGCTTGCTTCTTGTTGAAATGGTTTTAAATGTAGAAGGGATCTATTGAGTATTACA
AAAACAACCCAGCAATGTCCATGTGTACTTTGGAAGAAAGGTAGCATCTTGGCGTTCAAAAAGTCGTGATCTTTGTTTGGAAAGATTTTATCCCTCTCCG
ACTTGGGTAATGAAAGCATGGGAAACAACTCAAGATGAAATGATGATTGCTGGTGGTCTGCATGTTGTGGTTTTTAACAAAATGGTTGTGTTCACGGTGT
TCAATCATTTTAAAATTGACACTTTTGAAGCTTCATGTCTTATACTGTGGCAGGTTATGGTGAAATGGTTATACTATAAGTTTTAATTTGAAATCCACAA
GATGTCAACCTACTAAGTGAAGTTACCTTAATCCTATATAAGTTGAAGTGAATAGATGGTATGGTATTAGGCTTAATTATTTTGATATTTCCTTTGTTTT
TGAAGTCTACTTTCTGGATGAACCTGGTCCTAGGAATCATATGCCAAGAGTACATGTTTTGATAACATGACACCAACATTATGCACTACAAAAACTCTTA
AAATCAATATTTATTAAAATGTTGAATTTGTTGCATAACAATTTTATGATTTGCTCAAGTCTCTTAAATAAAGGAAGCCAAACATTAAAAGTGTTTTGTC
CTATAAGGGCACTGTCAACTAATTATTTTTTTATTGTATTAGGTACAATTATTACATGCAAATGAATGGTAAAGCAGAATGTATAGCATCACCTTATGGC
ACATGTTAGTTGCATGGATCATCTCTATGATTTGTCATGTTACTTGTAGCTCAACCTTAGGACTATAAATCACTGACTATTATTGTGGAAACAACAAAGA
GAAATGAAAATTGCCGCTTTCAAGAAGCATCTGAGTGTTTACTATTTTATACTCTATTATATATAGTCACTCAAGCTTCTAGAATTTTTGTCAGCTGCAT
CAAAATGGGAAGCAACTTGAGGTTTTTGAGTCTTTGCATCAACTCATGCTCAACTTTAGCTTGGTTTTTATGTTAACAGTTGCCCAAAAATAGAGCAAAT
TGTTTTGAAATTTGTTCATGACCATATCCATAATGCTCCATCACTAGCAGCTGCATTAATAAGAATGCACTTTCATGACTGTTTTGTAAGGGGATGTGAT
GCATCAGCCCTTTTGAACTCAACAACCAATCAGGTTGAGAAGAATGCTCGTCCAAATCTTACAGTAAGAGGCTTTGACTTCATTGGCATTATAAAGAGCC
TTGTTGAAGCTGAATGCCATGGTGTGGTCTCTTGAGCTGATATCCTCACTTTGGTTGCCAAAG