Detailed information on CNT0002338 (Glycine max)


BLAST search results

BLAST vs PNRD: nothing found

BLAST vs Swiss-Prot: nothing found

BLAST vs NONCODE (A. thaliana): nothing found

Potential orthologs: nothing found

Most similar lncRNAs: nothing found

Expression of CNT0002338

Peptides detected in this lncRNA

>peptide 1 (67 aa)
MDHESLLQILLTVSCLRDASVSILTYCSVHAQIQIDSTHPPPIVLRLARENEASFTLFLLFLIGFGI*

>peptide 2 (53 aa)
MFATCGIISMRILHIADNSAFHILLICVIFMRGQLYVLILVMIKAAQQELRDY*

>peptide 3 (36 aa)
MESWDSCLGLRSNEKPHIFILKNTGRFFIISKCEIS*

>peptide 4 (91 aa)
MKPLLHFFCCSSLDLAFKDSHVCNVWNNIHANPTHCRQLSISYFVDLCYLHAWTALRSHLGYDQSCSTGVERLLMRMVSNFLPIYFSFLFP*

Sequence

>CNT0002338
GCAATGTGTGTGAAGGCTAGCTGTTGATCTAAAGCTCATAGATGGAAAGCTGGGATTCTTGTTTGGGACTGAGAAGTAACGAAAAACCCCATATATTTAT
TTTGAAGAACACTGGTAGGTTCTTTATTATTTCAAAATGTGAAATCAGTTGAAGCTTTTATTTGACTGAAGAACCATTGGTCACTGGTGGATGCATGTAT
TTTACCTGGCTGTGATGGATTGAGATAAACGCATTAGCACGCGTTTGTTGTGTTGGATCACATTATTGTGAGATTGGAAATGAAAGCTTTGGTGGTAAGC
AACTAAGCATGGGTTGTTTCTAACTTACAAATGTTAGTTTACTTTGCGAGATGGATCATGAGTCCTTGCTTCAGATATTGCTTACTGTGTCGTGTCTGAG
GGATGCCTCAGTATCTATCTTGACCTATTGTTCAGTACATGCCCAAATTCAGATTGATTCTACTCATCCACCACCTATTGTTTTGAGGCTGGCTCGAGAA
AATGAAGCCTCTTTTACACTTTTTTTGTTGTTCCTCATTGGATTTGGCATTTAAAGATAGTCATGTTTGCAACGTGTGGAATAATATCCATGCGAATCCT
ACACATTGCAGACAACTCAGCATTTCATATTTTGTTGATTTGTGTTATCTTCATGCGTGGACAGCTTTACGTTCTCATCTTGGTTATGATCAAAGCTGCT
CAACAGGAGTTGAGAGACTATTGATGCGGATGGTTTCCAATTTCTTACCCATCTATTTCAGTTTTCTGTTTCCTTAATGGTTGATTTTGGTGCAGTTGCT
TTTGATCGTGTGATTGCGGTTTATTTTTCACTGAACTAGATGCCCGTTACTTATTAGGTTTTACTATTTTAAGGGTTATAAAGTTGTGGCCGAATTTTCT
ATTTGGTCTTGCAAAAATAGCATGATTTTTTTTTTTCATTTGGTAACTTATTTAGTATTTTGTAAATTCCTTTATCCATTCTTA