Detailed information on CNT0002450 (Glycine max)


BLAST search results

BLAST vs PNRD: nothing found

BLAST vs Swiss-Prot:
sp|Q9C8K2|AB12G_ARATH, E-value = 4e-44

BLAST vs NONCODE (A. thaliana): nothing found

Potential orthologs: nothing found

Most similar lncRNAs: nothing found

Expression of CNT0002450

Peptides detected in this lncRNA

>peptide 1 (34 aa)
MLLYIGRDLYVFFKCVCENKYNSNILRLYPLLIL*

>peptide 2 (37 aa)
MTFKSIVGFPSFIEEMKVRLYYYYYIWTLIWEMSQVN*

>peptide 3 (66 aa)
MNLATAQIKATLVEKYRRSTYATRAKNRIQELSIDEGLQPPTQHGSQASWWKQLFNTDKEIICEHV*

>peptide 4 (183 aa)
MMKLVFYRERLNGYYGVAAYILANFLSSFPFLVLIALTSCTIMYNMVKFRPGINHFVFFFLNIYSCISVIESLMIVVASLVPNFLMGIITGAGIIGIMMM
TSGFFTLLSDLPKPVWRYPYLYISYGSCLLGQYRVRFHYGHPDVFDRILHITRGGISKASCGINLSKDIFAVCEGQISVEKIW*

>peptide 5 (49 aa)
WIALEKVKKSLTLIPFPFLTPQKPQKAPTLCLIFRTLCTLSSTVILACA*

>peptide 6 (53 aa)
MPQGQRTEFKNCLLMKGFNLQHNMEVKLVGGSNYLTLTKRSFVNMCRDVGYYW*

>peptide 7 (75 aa)
LDCLREGEEIPNPYSFSLSHTSKTTKSSDIVPDLQNTMYAFIDGYPCVRLMNLSGTISCSRNSLILDEIRLWLRL*

Sequence

>CNT0002450
ACTGGATTGCCTTAGAGAAGGTGAAGAAATCCCTAACCCTTATTCCTTTTCCCTTTCTCACACCTCAAAAACCACAAAAAGCTCCGACATTGTGCCTGAT
CTTCAGAACACTATGTACGCTTTCATCGACGGTTATCCTTGCGTGCGCCTGATGAATCTCTCTGGAACCATCAGTTGTTCAAGAAATTCTTTGATCCTGG
ACGAGATAAGGTTGTGGCTCCGATTGTAAGGTTCGAAAATGTTGACATAATAGCTGAGCCTTCTGCTGTATTGGTGTCACTGGATGAGTTCCAAACTCTC
TTTACTAGGATGTTCCAAATTCACCAGATCCTTTCATGAATTTGGCTACAGCACAGATTAAGGCAACACTAGTTGAGAAATATAGGCGTTCAACATATGC
CACAAGGGCAAAGAACAGAATTCAAGAACTGTCTATTGATGAAGGGCTTCAACCTCCAACACAACATGGAAGTCAAGCTAGTTGGTGGAAGCAACTATTT
AACACTGACAAAGAGATCATTTGTGAACATGTGTAGAGATGTGGGTTACTACTGGTGAGGATCATAACTTATATCATTGTATCCATATGTTTGGGAACCG
TTTATTTTGATGTTGGCTATAGCTACACTTCCATCCTGCCCCTAGATGCCTACGGTGCATTTATATCAGGATTTATGACATTCAAGTCAATTGTTGGCTT
TCCATCATTTATTGAAGAAATGAAGGTACGACTATACTACTACTATTATATATGGACTTTGATTTGGGAAATGTCACAAGTTAATTAATCTAAGCTGCTA
ATGTTTTCACTATTAATCTCCTTTGATTAATTTGTATATTGTGTTTATGCACAATACATGTTTAACACTTAGGCTTATTTAATTTGTTGACATGATGAAA
CTGGTATTTTATCGAGAAAGGCTTAATGGATACTATGGAGTAGCAGCATATATTTTAGCCAACTTCCTTTCTTCATTCCCATTCTTGGTTCTAATTGCTC
TGACATCCTGCACCATTATGTATAACATGGTGAAATTCAGGCCAGGAATCAATCACTTTGTGTTTTTCTTTCTCAACATCTACAGCTGCATCTCCGTAAT
AGAGAGCCTCATGATTGTTGTAGCTTCACTTGTTCCAAATTTCCTCATGGGAATAATTACAGGGGCTGGAATAATAGGAATCATGATGATGACCTCCGGA
TTCTTCACGTTGCTCTCTGATCTTCCAAAGCCAGTTTGGCGCTACCCATATTTATATATCAGTTATGGTTCTTGCCTTCTTGGGCAATACAGGGTGCGAT
TCCACTATGGTCATCCAGATGTATTTGATAGAATTTTGCACATAACTCGAGGAGGAATTAGCAAGGCATCTTGTGGCATCAATCTGAGCAAGGATATTTT
TGCTGTATGTGAGGGACAGATATCAGTGGAGAAAATATGGTAAAAAAGTCACCAGAGATAACCCTTCTCCTAGGGCTTACTTCAAGTGTTCATATGCCCC
AAGCTGCCCAGTGAACAAGTTTTTCCGCGGATCATGTTAATCACTGACTCTGTAATGAGTCATTTAAGTCAAGTGCAGTCGCAGGTACAGGTACCACCAG
TATAGAGATACCATCAAGTAGGAGGAGCCAGGTTAAAGTTGATAACTATGTTGCTATATATAGGTAGGGATCTTTATGTTTTTTTCAAATGCGTGTGTGA
AAACAAGTATAATAGTAACATATTGAGACTCTATCCATTGTTAATACTATAATACCCTACCCAAATTTACTCATTGTCATTCCTATATTTCACTAAATTT
GAAATTTATTTTTAAAATTTGAATTTGAACTTGTCCCTTTTGACAACGTTAGATTGAGCAACCTATTTTATCACCTCTAATAATAAATATGGGTAAGTTG
AGCATGGCAGGATAGCCTGCTTAACCCACCAAAAATGACGGGAGTAGGCTAATTGACTTAAT