Detailed information on CNT0002467 (Glycine max)


BLAST search results

BLAST vs PNRD: nothing found

BLAST vs Swiss-Prot:
sp|Q7XKD0|TRXX_ORYSJ, E-value = 4e-26

BLAST vs NONCODE (A. thaliana): nothing found

Potential orthologs: nothing found

Most similar lncRNAs: nothing found

Expression of CNT0002467

Peptides detected in this lncRNA

>peptide 1 (35 aa)
MMASSQSGSCSVLAAEFWGIWHGLRLAWNQDCCVF*

>peptide 2 (40 aa)
MFQSSDLCWETCDIGAYLFVSISCMKQFNRFIQLYNLYNI*

>peptide 3 (30 aa)
MLYWNQYQFHSHHHIHTCFKVLTCAGRLAI*

Sequence

>CNT0002467
AAACTTTGGTGATCTTGGGCCTTGGGCTTGTATCAAATAATAACTGTTTGATGATTGTTGAATGAATCCCAACATAATGCTGCTAATGGTCATTGGTGGA
AGAGGAATATGAAGACAGATTAACGGTTGTAAAGATTGATCATGATGCCAACCCGCAGCTAATTGAAGAGTATAAAGTTTATGGACTACCGACATTAATA
CTCTTCAAGAACGGGCAGGAAGTTCCAGAAAGCAGAAGGGAAGGTGCAATTACAAAATTGAAACTTAAAGAGTACGTGGATGCTTTATTGGAATCAATAT
CAGTTTCATAGTCATCATCATATTCATACATGTTTCAAAGTTCTGACCTGTGCTGGGAGACTTGCGATATAGGAGCATATCTGTTTGTTTCCATATCTTG
TATGAAACAGTTTAACAGGTTTATACAGTTGTATAATCTATATAATATCTGAAGCTGCAAATACAGCATAATGTGGTGAAGGAAGGTTGTGCTAAAGGGT
TTCTACTCGGGGCTGGGATTCAGTCATTCTAAATCCAAAAATAAAATTTGTTAGAGACAAATACGAAGAAAAATAAAATAAAAATTGAAAAAAGACAAGT
ATTTGGCTGGGTAATTGGATTCCAAAATGATGGCATCCTCTCAGTCAGGCTCGTGTTCAGTCCTTGCAGCGGAGTTTTGGGGAATTTGGCATGGATTACG
TCTAGCTTGGAATCAGGATTGTTGTGTATTTTGATTTTGATTTTGATTCTAGCAATGCTATTAATTTTTGCTAACTGATGACTGTTGCAATATTCATCCT
TGCTATAATTTGGCGAAGTCCATAGGGACCAAATCAATTGAACTAACATGTAGCAAGAAGTGAATCAAGTAGCTGATGCGTTGGCTAAATTTGGGATTAA
TCTTAATCATCA