Detailed information on CNT0002508 (Glycine max)


BLAST search results

BLAST vs PNRD: nothing found

BLAST vs Swiss-Prot:
sp|Q39685|CMB1_DIACA, E-value = 2e-09

BLAST vs NONCODE (A. thaliana): nothing found

Potential orthologs
: nothing found

Most similar lncRNAs
: nothing found

Expression of CNT0002508

Peptides detected in this lncRNA

>peptide 1 (39 aa)
MTLIAAIQAIVYAFCFETDLSQWKLGSGIRLLIALYTVC*

>peptide 2 (89 aa)
MIYHETKLLWQGIVATGLVNIATSWCVPNRGPLLASIFYPLCPVLVAFASSLLLQEHLYLGRSTRSTTAVQWRPPVQLTTLRTIRNVPD*

>peptide 3 (31 aa)
RERKYEKMGIGSSYLFRLDDGYVVSIYCCSI*

>peptide 4 (33 aa)
VNVSMRRWELEAVTFLDLMMVMWLVYIVVVFKF*

>peptide 5 (49 aa)
MCVFSSLEHSDTVLFFGVTLAFTNSMLETLLIETNNVLRSKVIIISRSNA

>peptide 6 (71 aa)
MFQIKSKGRSFATFSEEPIRGRSCPNDLEQLENQLEAALRNIRSTKTQFMLDQLSDLHHRVDVCFFFLRTF*

>peptide 7 (39 aa)
MKFVSNGHQAFCLQYFSAIPLFIVSMIFLNPCPYLIGKC*

>peptide 8 (44 aa)
MDLCLLMHPMFDGIDFSFRGLCIIFAKKIVARRFGVDKQATLDE*

>peptide 9 (91 aa)
MNEICFQWPPSILPSIFLCYSLVYCFHDFPESLSLSYRKMLNNMICVIRTLIKEVKRKNILLECVKMRSRSHMMFNKNLSCICHGLTWDTF*

Sequence

>CNT0002508
CGTGAACGTAAGTATGAGAAGATGGGAATTGGAAGCAGTTACCTTTTTAGACTTGATGATGGTTATGTGGTTAGTATATATTGTTGTAGTATTTAAATTT
TAGATTTTGGAAGTTTCACTTATCTTGCTTCTCTAAGGTAATTATAGAGTCATTGCTATTTGAAATGTAATGAAGTTTATGGTAAAGCCAACATTTCTAC
GAAGGGGCTAGTGGATGGTTAACTAAATAGATAGTTGTGGTTTTCTTAATATGATCATTGGGTGATTCATCAAGACATCATCGCCACTTGACTTTGAGAA
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AGACCACTACATAAGCTTAAATAAGACCTAATAAACAAAAATCTTATCCAAATGAAGTGTTAGATTACATTTATTTTTGCATGTCTGCTAATTAATATTC
TCTAGATAAAGTGTATATTGATAAATTCGAATCCAATGACAACTATTGAAATGCTACATTTGCTTTCCTTGTTTGAGTATATGTAGGTTGATGCTACTAA
GAGAGGTAGGATTGCAAGATTACCACTCTTGTGAGGTACTTGTGTACTTTTAAATGCATTTTTTTTATCCACACATTTAAGGAAGTATTTTGGGCATATG
CATGTGTCACTTCTATTCTTCATTTCACGTTCTTCCTGATTTGAACTAGAGTTTTTGGCAGCCCAACTGCTATACAAAGGTTATATCTGTTGAGGGTCAA
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AGTCACAAAAAATGTTCTCTCAAACCAAATAGGCTCTAATATTGGGTGCCTCCAGCCATCCTCTGTAATATGTTTTAACTGTTAGTACTCTTCTCTCTGA
AAACAATAGATGGATCTTTGTCTTCTGATGCATCCAATGTTTGATGGGATTGATTTTAGTTTTAGAGGCCTTTGTATAATATTTGCTAAAAAGATAGTGG
CTAGAAGGTTTGGGGTTGACAAACAAGCAACTCTTGATGAATGAAATTTGTTTCCAATGGCCACCAAGCATTTTGCCTTCAATATTTCTCTGCTATTCCC
TTGTTTATTGTTTCCATGATTTTCCTGAATCCTTGTCCCTATCTTATAGGAAAATGCTAAACAATATGATTTGTGTCATAAGGACACTAATTAAGGAAGT
AAAAAGAAAAAATATTTTATTAGAATGTGTCAAAATGCGTTCTCGCTCTCACATGATGTTCAATAAAAACTTATCTTGTATATGCCATGGTTTGACTTGG
GATACCTTTTGAAATTAACCCTATATATATGTATGCAATTGGCTAAGGTAAGTAAGTAATATCCAAGCCATAACTCAAGTACAGCGTTGATGACCTTAAT
AGCAGCAATACAAGCCATAGTCTATGCCTTCTGTTTTGAGACAGATTTGAGTCAATGGAAGTTGGGTTCAGGTATCAGGCTTCTAATAGCACTTTATACG
GTATGTTAATTAATTTCATAATTAGTGTTGGATGGTGAACTAATGTTATACCAATAATTAATGGATGATTTATCATGAGACTAAACTTTTGTGGCAGGGA
ATTGTGGCTACTGGATTAGTGAACATTGCCACTTCATGGTGTGTACCGAACAGAGGTCCATTGCTTGCATCTATTTTCTACCCCCTTTGCCCTGTGCTCG
TGGCTTTTGCTAGTTCCCTGTTATTACAAGAGCACCTATACTTAGGAAGAAGTACCAGAAGTACAACTGCAGTGCAGTGGAGACCACCTGTCCAATTAAC
GACACTCAGAACTATCAGGAATGTTCCAGATTAAAAGCAAGGGTAGAAGTTTTGCAACGTTCTCAGAGGAACCTATCCGGGGAAGATCTTGCCCAAATGA
CCTAGAGCAACTTGAGAATCAACTGGAGGCAGCACTGAGGAATATTAGGTCAACAAAGACTCAATTCATGCTTGACCAGCTTTCTGATCTTCATCACCGG
GTAGATGTGTGTTTTTTCTTCCTTAGAACATTCTGATACCGTCCTATTCTTTGGTGTAACCTTGGCTTTTACAAATTCAATGCTGGAAACATTGCTTATT
GAAACCAATAATGTGTTAAGGAGTAAGGTAATAATTATTTCCAGATCAAATGCA