Detailed information on CNT0002520 (Glycine max)


BLAST search results

BLAST vs PNRD: nothing found

BLAST vs Swiss-Prot:
sp|Q93XY5|TET18_ARATH, E-value = 3e-28

BLAST vs NONCODE (A. thaliana): nothing found

Potential orthologs
: nothing found

Most similar lncRNAs
: nothing found

Expression of CNT0002520

Peptides detected in this lncRNA

>peptide 1 (38 aa)
MALDSFFSYFISKVNFRIINCTCTDSSSLKSHMTSGLC*

>peptide 2 (42 aa)
MTSDEKLFSPKLESLILIILEACLVERGPRCCHGTHKSCLNF*

>peptide 3 (81 aa)
MRLNLCHVSLGFVLKFLNFLQCFVGLSILLYSLWMFNEWDHSVPPDPPLPPAFHFYLKLNSINLPAPWCYYYFAHIFVNFC*

>peptide 4 (51 aa)
MKFAKASPLFLFAFSLRSTIRFDLVIRVLRVGRKIKHALSYFFFFFNLILM*

>peptide 5 (35 aa)
MAIGEYSHPFIHLKKVFVFVPLFYLQASVPSDCKE*

>peptide 6 (53 aa)
MSLVKCLDGYSFLFLANANLFFFPLDETGSSTISWDLEYWCYAFLSWVALQLK*

>peptide 7 (44 aa)
MVIHFYSLLMPTFFFSHLMRQVHLQFHGIWNIGVMHFFLGLHCS*

>peptide 8 (55 aa)
MGFGILVLCISFLGCIAAEMINGCCLCFVSHSNLECLFSYTTSEAQAFKLFCCAR*

>peptide 9 (46 aa)
MVAACVLYPTQTWNVYFHILLRKLKLLNCFVALVDIVENCRQIRLM*

>peptide 10 (34 aa)
MLRYPLQSDAWWGQNEVCKSIPTLSFCIQFAVDY*

Sequence

>CNT0002520
GCCTTTTTTCAAATAATTTTTTTTAAATGTATGCAGAGTCAGAGAGTACCTGACGGAAAAACCAAAAATGAGATAAAATAGAAATTGGGGAAGGAAGACA
AGTAAAGAGTGGTGGACGAGATCTGATTATCTAGTTTGCTCTGGCTTTTGGAAATCCGAATAATCAAAACCAAACACACGCAAGGAAGAAGAAGAAACCC
TAAAAAATTATTAAGAAATAAGATGCGGCTGAATTTGTGCCACGTTTCGCTTGGTTTCGTTCTGAAATTCCTGAATTTCCTTCAATGCTTCGTTGGCCTT
TCCATTCTGCTCTATTCCCTATGGATGTTCAACGAATGGGACCATAGTGTCCCTCCTGATCCTCCTCTTCCTCCCGCCTTCCATTTCTATCTCAAACTCA
ATTCCATCAACCTACCCGCTCCATGGTGCTACTACTATTTTGCTCACATTTTTGTTAATTTTTGTTAGAAATGTCATTTTGAAGATTCCAACTTGCAATC
TCTCACTATTCATTTCTCTTATAAGTTTTATTCTCAGTGGTAGTGTTCTGATTTGGGTGCTGTCAAGTGTATTAAATGCCATCAACTACTTTTTTCACGC
CTCAAAGGGAAATTAAATCTTTACGTCTCTTTATTTTATTTTACTGTTTTAGTGCATGTTGAGATATCCGTTGCAATCAGACGCTTGGTGGGGGCAAAAT
GAAGTTTGCAAAAGCATCCCCACTCTTTCTTTTTGCATTCAGTTTGCGGTCGACTATTAGATTTGATCTTGTAATTCGTGTACTGCGAGTCGGACGGAAA
ATCAAACATGCTCTTAGTTACTTTTTTTTCTTTTTTAATTTAATTTTGATGTGATTGTAATGTCTTTGGTGAAATGCTTAGATGGTTATTCATTTTTATT
CCTTGCTAATGCCAACCTTTTTTTTTTCCCACTTGATGAGACAGGTTCATCTACAATTTCATGGGATTTGGAATATTGGTGTTATGCATTTCTTTCTTGG
GTTGCATTGCAGCTGAAATGATTAATGGTTGCTGCTTGTGTTTTGTATCCCACTCAAACTTGGAATGTTTATTTTCATATACTACTTCGGAAGCTCAAGC
TTTTAAACTGTTTTGTTGCGCTCGTTGATATTGTGGAAAACTGTAGACAAATAAGGCTGATGTAGCGACGTTATGGTCATAGACACCCCAAAAATCTCTA
TGTTGTAGTTGAAATTGCGGTCAATGACCATTTTTTAAAACCTTTTTGGCTGAAAGTATAATGATCTTTTACTTTGAAGTAGTGTAAACTTGTGTGGAAT
GCTTTGAAATAGTAGCTTTTTACTTTACTTTTTATTTTAATTTTTTAAAAATTATCTTTGCTTTTCACTCCTTGACCTTTTAAAAAATGTTAGTACTCTA
TACTCGTGGTGGTGCTTCTTCTTCTGGAAGCTTCTCTGGTGGGATTCATTGCACTTGATAGTGATTGGGAAAAGGATATTCCATTTGATCCAACTGGTCA
ACTTGACGAGCTTCGAGCTTTCATTGAAGATAATATAGATACCTGCACATGGGTTGGCATTGCTGTGCTTGTGATTCAGGCATTATCTCTACTACTGGCA
TTAATTTTGCGAGCCACAGTTTCTTCTAGGAGAGCAGATTTTGATTATGAGGATGGATATGATGTTAGGGGTAGAAGTTGGGAGCCCCTACTGAATCCTC
AACCTGGCCAACCATCTGGGTCTAGCAAAGGTGATAATAGTGGAAATCACTCAGATTTTTGGAGTGTGCGGATGAGAGAGAAGTACGGATTGAACCATGG
TGATAAGAGCAGCTACCAACCATGAATTCCAGGCAATGAGTGCTACTAGCCATCAAGCAATTCAATGCTGTGTTGACATCTGAGTATATGTGTATATCTT
TGGTTTTAATGTTTTGTTTTACTTTCATTTGTTCTCAGGAAAATCTATGATGTAAGCAATATAGTGGTGGTAGTATATGTATTTTAAATTATACTAGTTA
TTGATTGAAGATTAAGAATCTTGTACTTAAAAAGCTTAGCAAAAGAGAAAAATGAAAAACAAAGGCTACAATACAAAGGACCTGATGTAAGCACCTTCCT
CAATGCTGTACTGATCGTGCAGTCTACATAATGGAACACGTGAAACACACGTCTTGCATGTGTTGCCATTCAATATTTTGCTTTTGTCAAGAACAAATAT
TTTGAATAATTTTTGAACAAGCTTAATTGGTGTGTTAAATATTGCACTGTGGAAAGTGAATTTCTTTGAGAACTTAACAAGTAAACGACTCTAATACAAC
TCATCTGGTGAAGTCGGAGAGGGGAAAATTTCCAATATTCTTGCTGTACTTAATTTGCTTGATCATGGCTCTTGATAGTTTCTTTTCTTATTTTATTTCA
AAAGTTAATTTTAGAATAATTAATTGTACTTGTACAGACTCGAGCAGTTTGAAGTCGCATATGACAAGTGGACTATGTTGATCATTGAATTTGGTGAGGT
CGTATGTTAGTATTTTGGCTGAATCGACCATGGCAAACGGTTGTTGAATATGTTCCTGTAGAACCACATTTTTTTTAAAGGAAGAATAAACAAAAGCACA
AGCTTCTTCTCTACACAGTACGTATCACAACACTCTTTCTCTTCCGTTTCTGTATAGGAAAATGACAAGTGATGAGAAATTGTTCTCTCCCAAACTGGAG
TCACTGATCTTAATAATTCTGGAAGCTTGTCTCGTGGAACGTGGTCCACGGTGCTGTCACGGGACTCATAAGTCGTGCCTCAATTTTTAAGTTGTAGATT
CCATACTTTGTCTTTTAGTTTAGTTAGAAATTTCACATCGAATGGCCATTGGGGAATATTCTCACCCTTTTATCCACTTGAAAAAGGTGTTTGTCTTTGT
CCCCTTATTCTACTTGCAGGCTTCAGTTCCTTCAGATTGCAAAGAGTAGTCCCCTCATGGCTCAGGCCATGTGTTTTAAGAATCTTTCCACGATTTACGT
AGAAAAATTGATCCACGAAAAGTTTAGAGGAAGAGGATGATTTCTCAATTCAAGACAAGAAAAAGTCTAAGAACTCAAATAATACTTGCTAAAAAAACTT
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