Detailed information on CNT0002592 (Glycine max)


BLAST search results

BLAST vs PNRD: nothing found

BLAST vs Swiss-Prot:
sp|Q9SZ13|VA0E2_ARATH, E-value = 8e-14

BLAST vs NONCODE (A. thaliana): nothing found

Potential orthologs: nothing found

Most similar lncRNAs:
CNT0007118, E-value = 2e-13 (V. vinifera)
CNT0013687, E-value = 6e-11 (S. tuberosum)

Expression of CNT0002592

Peptides detected in this lncRNA

>peptide 1 (50 aa)
MGFSVTTLVFAVIGIVASLSTRICFNRGPSANLYYALLASSFLSRTYEAI*

>peptide 2 (33 aa)
MYSCWIMTFQLDLPLPALPHVTIVVFNPRSFHK*

Sequence

>CNT0002592
AGCCTTTAAAAGTCTGACTTATTTTCATCCCTATTCCTATGGATCAAGAAACCCAAATAGTAATTAGGATAGGAGATTTTCGTAAATCCCATAAGATGGG
CCCATATGCGTGATTGCTCAGATTACGGCACTAAGGGGGTAATGTAAATGTTTCGTTCTCACTCTCACGTTCTTAATTTTTGTTTGTGTCTCTCTCGCAG
GAATTAGGATCCGATATGGGGTTCTCGGTAACAACGCTAGTTTTCGCAGTGATTGGAATTGTGGCGTCCCTTTCTACCAGAATTTGTTTCAACAGAGGAC
CTTCCGCCAATCTGTATTATGCTTTGCTTGCTTCTTCATTTCTTTCTAGGACTTATGAAGCAATTTAATAATTGCTGTTGCTAATCTTATAAAAAAAAAT
CATAATCTCACATAGCTCATAGATCTAATATGTCATTGAAGGAATTATGATATGCTTTTTTTTCTCAGAGGCTGTAAGAATGCCTGCTTTGCATAACTAA
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AAGTTGTCCTCATTGAATAATGTCTCCTCTCACAAAATTACTCTTCTCTGTATGAACTAATATCTTATTACTACGTTGCAGATTTCACCTAACTTTGGTT
CTTACTGCAACAACATGCTGCTGGATGATGTGGGCGATTGTATATCTGGCACAGATGAAACCGCTCATAGTACCTATCTTGAGTGAGGGTGAATAACTTT
CTGTATAAACAGATGCAACTCTTCAGAATGTGAATCACTAGTTAGACGCTGGAGAGGAGTTGATTTCAGCTCTCATAAATCATTCAGTGTTTACTCTGGC
TGGATCTGTATGTATTCTTGTTGGATAATGACGTTTCAGTTGGATCTTCCATTGCCGGCATTACCCCATGTTACAATCGTTGTATTCAACCCTCGTTCGT
TCCATAAGTAGTGGTATTAAGTATGTATTTTGGTGAAATAAGTTGATACAAGAAAATTATATCTTGGTTTTACTATATTATATATATAAAAAAATTGATG
AGAGGATTTTTTCATGCAATCATGATCTTATATATGATCCTGTAGAGAAGAAGGAAGCTCTGGTCATTACCAATTATAAGAAACGTGATGAATTATGAGA