Detailed information on CNT0002821 (Glycine max)


BLAST search results

BLAST vs PNRD: nothing found

BLAST vs Swiss-Prot:
sp|Q12200|NPC1_YEAST, E-value = 1e-06

BLAST vs NONCODE (A. thaliana): nothing found

Potential orthologs: nothing found

Most similar lncRNAs: nothing found

Expression of CNT0002821

Peptides detected in this lncRNA

>peptide 1 (61 aa)
MLGLSGVILVMLSIIGSVGFFSVLGVKSILIIMEVIPFLVLANDSSRGRGVRFFCGAAEPT*

>peptide 2 (52 aa)
MFAYISLTLGDTLHPLSFYISSKVLSHPLYQSIFLPFYFLICNLSSLSFILY*

Sequence

>CNT0002821
GTTTACACTCATTTCTAATGCTGTGAATGGATATAATTTTGTTGAACATATGATAACTATAATGTGATTTATTTAAGACAGGCATCTGCGTTCATCGTAA
CATATCCATTAAATAATGCTATTAATGAAGAAGGTAATGGAACCAGAAAGGCAGTTGCTTGGGAGAAGACCTTTATTCAGTTGGTGAAGGATGAGCTGTT
ACCGATGGTACAACCAAGAAATTTGACACTGGCTTTTTTATCTGAAAGCTCTATTGAGGAAGAATTGAAAGTACTGCAGATGCTATAACTATATTGGTTA
GCTATCTTGTGATGTTTGCTTACATATCTCTTACTTTAGGGGATACCCTCCACCCTTTGTCTTTCTATATTTCATCTAAGGTGTTGTCCCATCCACTGTA
TCAATCCATCTTTCTCCCTTTCTATTTTTTGATTTGTAATTTATCTTCCCTCTCCTTTATCCTTTATTAGTTTTACTTACGAAAATCAATTTATGATTTG
AAGCAGTTTATGTTGTGGAGATAGATTTTTATGATGTACATAAATATTTATTGGATAGTTTCAGATTGCAGGTGATGCTTGGTCTTTCAGGAGTAATTCT
TGTTATGCTGTCTATCATTGGATCAGTTGGATTTTTTAGTGTGCTTGGTGTAAAATCTATTCTGATCATCATGGAAGTTATCCCATTTCTTGTCCTAGCC
AATGACAGCAGTAGAGGACGAGGAGTGAGATTCTTTTGTGGAGCCGCCGAGCCGACGTGATGATGTTGTGATTATTTTGGGAGAGAGTTGTGTTTTGTTA
ATCAACTCTTCCATAGCTGGTTCTGTAATTCTTTTGTTGATATAAGGATGTAAATCACAAATTTATTTATATGTACGAACAAATTTACCTTTAATTTTGT