Common name: Brownbeard rice
Latin name: Oryza rufipogon
Genome assembly: PRJEB4137
All retrocopies: 46
Parental genes: 45

Summary: Number of retrocopies :
Conserved ORF: 46 ORF 0 ORF

# RetrogeneDB ID Identity Coverage ORF conservation
1. retro_oruf_1 60.34 % 61.39 % ORF
2. retro_oruf_2 65.11 % 66.97 % ORF
3. retro_oruf_3 67.73 % 65.96 % ORF
4. retro_oruf_4 66.86 % 71.37 % ORF
5. retro_oruf_5 59.40 % 78.25 % ORF
6. retro_oruf_6 76.69 % 99.16 % ORF
7. retro_oruf_7 51.09 % 96.48 % ORF
8. retro_oruf_8 64.19 % 68.15 % ORF
9. retro_oruf_9 54.20 % 80.34 % ORF
10. retro_oruf_10 79.83 % 86.94 % ORF
11. retro_oruf_11 52.65 % 89.29 % ORF
12. retro_oruf_12 58.27 % 92.46 % ORF
13. retro_oruf_13 97.47 % 94.43 % ORF
14. retro_oruf_14 68.08 % 96.65 % ORF
15. retro_oruf_15 58.06 % 68.59 % ORF
16. retro_oruf_16 66.42 % 92.91 % ORF
17. retro_oruf_17 79.94 % 59.93 % ORF
18. retro_oruf_18 70.08 % 95.19 % ORF
19. retro_oruf_19 54.14 % 76.89 % ORF
20. retro_oruf_20 51.37 % 77.84 % ORF
21. retro_oruf_21 74.12 % 54.14 % ORF
22. retro_oruf_22 65.36 % 71.39 % ORF
23. retro_oruf_23 59.26 % 74.29 % ORF
24. retro_oruf_24 67.92 % 94.14 % ORF
25. retro_oruf_25 82.96 % 95.54 % ORF
26. retro_oruf_26 55.16 % 59.78 % ORF
27. retro_oruf_27 52.43 % 92.61 % ORF
28. retro_oruf_28 69.81 % 86.48 % ORF
29. retro_oruf_29 64.55 % 90.29 % ORF
30. retro_oruf_30 71.49 % 87.06 % ORF
31. retro_oruf_31 59.08 % 66.39 % ORF
32. retro_oruf_32 55.66 % 78.27 % ORF
33. retro_oruf_33 83.87 % 79.48 % ORF
34. retro_oruf_34 69.94 % 60.15 % ORF
35. retro_oruf_35 62.69 % 91.90 % ORF
36. retro_oruf_36 68.45 % 70.00 % ORF
37. retro_oruf_37 73.41 % 97.30 % ORF
38. retro_oruf_38 73.62 % 95.53 % ORF
39. retro_oruf_39 58.27 % 82.19 % ORF
40. retro_oruf_40 59.66 % 69.71 % ORF
41. retro_oruf_41 58.47 % 73.16 % ORF
42. retro_oruf_42 57.64 % 92.87 % ORF
43. retro_oruf_43 57.14 % 88.03 % ORF
44. retro_oruf_44 77.68 % 57.02 % ORF
45. retro_oruf_45 71.26 % 93.96 % ORF
46. retro_oruf_46 69.17 % 88.97 % ORF
# Ensembl ID Symbol Description
1. ORUFI01G47680
2. ORUFI02G24680
3. ORUFI02G09610
4. ORUFI02G34000
5. ORUFI01G01660
6. ORUFI06G18690
7. ORUFI10G18850
8. ORUFI08G12410
9. ORUFI01G24440
10. ORUFI04G26070
11. ORUFI05G21470
12. ORUFI10G17520
13. ORUFI10G19380
14. ORUFI02G02720
15. ORUFI05G00870
16. ORUFI02G02210
17. ORUFI03G14280
18. ORUFI05G18300
19. ORUFI06G23740
20. ORUFI08G05030
21. ORUFI02G33530
22. ORUFI02G01160
23. ORUFI09G10540
24. ORUFI07G00430
25. ORUFI07G02180
26. ORUFI06G04700
27. ORUFI02G33000
28. ORUFI03G37950
29. ORUFI08G14100
30. ORUFI05G15150
31. ORUFI05G25500
32. ORUFI03G13820
33. ORUFI06G01440
34. ORUFI01G32100
35. ORUFI03G33580
36. ORUFI05G02420
37. ORUFI05G01180
38. ORUFI02G27020
39. ORUFI07G19310
40. ORUFI04G05780
41. ORUFI01G42080
42. ORUFI05G20280
43. ORUFI02G09480
44. ORUFI03G33430
45. ORUFI02G26160
Retrogenes FASTA BED
TSV (download all or selected columns from MySQL table)
Parental genes FASTA BED
TSV (download all or selected columns from MySQL table)