Parental gene: | WLS, ENSCJAG00000017517 |
| Aliases: | None |
| Description: | None |
| Organism: | Marmoset (Callithrix jacchus) |
| Coordinates: | 7:103699639..103830420(-) |
>ENSCJAG00000017517
ATGGCTGGGGCAATTATAGAAAACATGAGCACCAAGAAGCTGTGCATTGTTGGTGGGATTCTGCTCGTGTTCCAAATCAT
CGCCTTTCTGGTGGGAGGCTTGATTGGGCCCACAACAGCAGTGTCCTACATGTCGGTGAAATGTGTGGATGCCCGTAAGA
ACCATCACAAGACAAAATGGTTAATGCCTTGGGGACCCAATCAGTGTGACAAGATCCGAGACATTGAAGAAGCAATTCCA
AGGGAAATTGAAGCCAATGACATTGTGTTTTCCGTCCATATTCCCCTCCCCTCCATGGAGATGAGTCCTTGGTTCCAGTT
CATGCTGTTTATCCTGCAGCTGGACATTGCATTCAAGCTAAACAACCAAATCAGAGAAAATGCAGAAGTTTCCATGGATG
TTTCCCTGGCTTACCGTGATGATGCGTTTGCTGAGTGGACTGAAATGGCCCATGAGAGAGTACCGCGGAAACTCAAATGC
ACCTTCGCATCTCCCAAGACCCCAGAGCATGAGGGCCGTTACTATGAATGCGATGTCCTTCCTTTCATGGAAATTGGGTC
TGTGGCCCATAAGTTTTACCTTTTAAACATCCGGCTGCCTGTGAATGAGAAGAAGAAAATCAATGTGGGGATTGGGGAGA
TAAAGGATATCCGGTTGGTGGGGATCCACCAAAATGGAGGCTTCACCAAGGTGTGGTTTGCCATGAAGACCTTCCTTACG
CCCAGCATCTTCATCATTATGGTGTGGTACTGGAGGAGGATCACCATGATGTCCCGACCCCCAGTGCTTCTGGAAAAAGT
CATCTTTGCCCTTGGGATTTCCATGACCTTTATCAATATCCCAGTGGAATGGTTTTCCATCGGGTTTGACTGGACCTGGA
TGCTGCTGTTTGGTGACATCCGACAGGGCATCTTCTATGCGATGCTTCTGTCCTTCTGGATCATCTTCTGTGGCGAGCAC
ATGATGGATCAGCATGAGCGGAACCATATTGCAGGGTATTGGAAGCAAGTCGGACCCATTGCCGTTGGCTCCTTCTGCCT
CTTCATATTTGACATGTGTGAGAGAGGGGTACAACTCACGAATCCCTTCTATAGTATCTGGACTACAGATGTTGGAACAG
AGCTGGCCATGGCCTTCATTATCGTGGCTGGAATCTGCCTCTGCCTCTACTTCCTGTTTCTATGCTTCATGGTATTTCAG
GTGTTTCGGAACATCAGTGGGAAGCAGTCCAGCCTGCCAGCTATGAGCAAAGTCCGGCGGCTACACTATGAGGGGCTAAT
TTTTAGATTCAAGTTCCTCATGCTTATCACCTTGGCCTGTGCTGCCATGACTGTCATATTCTTCATCGTTAGTCAGGTAA
CGGAAGGCCACTGGAAATGGGGCGGTGTCACAGTCCAAGTGAACAGTGCCTTTTTCACCGGCATCTATGGAATGTGGAAC
CTGTACGTCTTTGCTCTGATGTTCTTGTATGCACCATCCCATAAAAACTATGGGGAAGACCAGTCCAACGGAATGCCACT
CCCATGTAAATCGAGGGAAGATTGTGCTTTGTTTGTTTCGGAACTTTATCAAGAATTGTTCAGCACTTCGAAATATTCCT
TCATCAATGACAACGCAGCTGCTGGTATTTGA
ATGGCTGGGGCAATTATAGAAAACATGAGCACCAAGAAGCTGTGCATTGTTGGTGGGATTCTGCTCGTGTTCCAAATCAT
CGCCTTTCTGGTGGGAGGCTTGATTGGGCCCACAACAGCAGTGTCCTACATGTCGGTGAAATGTGTGGATGCCCGTAAGA
ACCATCACAAGACAAAATGGTTAATGCCTTGGGGACCCAATCAGTGTGACAAGATCCGAGACATTGAAGAAGCAATTCCA
AGGGAAATTGAAGCCAATGACATTGTGTTTTCCGTCCATATTCCCCTCCCCTCCATGGAGATGAGTCCTTGGTTCCAGTT
CATGCTGTTTATCCTGCAGCTGGACATTGCATTCAAGCTAAACAACCAAATCAGAGAAAATGCAGAAGTTTCCATGGATG
TTTCCCTGGCTTACCGTGATGATGCGTTTGCTGAGTGGACTGAAATGGCCCATGAGAGAGTACCGCGGAAACTCAAATGC
ACCTTCGCATCTCCCAAGACCCCAGAGCATGAGGGCCGTTACTATGAATGCGATGTCCTTCCTTTCATGGAAATTGGGTC
TGTGGCCCATAAGTTTTACCTTTTAAACATCCGGCTGCCTGTGAATGAGAAGAAGAAAATCAATGTGGGGATTGGGGAGA
TAAAGGATATCCGGTTGGTGGGGATCCACCAAAATGGAGGCTTCACCAAGGTGTGGTTTGCCATGAAGACCTTCCTTACG
CCCAGCATCTTCATCATTATGGTGTGGTACTGGAGGAGGATCACCATGATGTCCCGACCCCCAGTGCTTCTGGAAAAAGT
CATCTTTGCCCTTGGGATTTCCATGACCTTTATCAATATCCCAGTGGAATGGTTTTCCATCGGGTTTGACTGGACCTGGA
TGCTGCTGTTTGGTGACATCCGACAGGGCATCTTCTATGCGATGCTTCTGTCCTTCTGGATCATCTTCTGTGGCGAGCAC
ATGATGGATCAGCATGAGCGGAACCATATTGCAGGGTATTGGAAGCAAGTCGGACCCATTGCCGTTGGCTCCTTCTGCCT
CTTCATATTTGACATGTGTGAGAGAGGGGTACAACTCACGAATCCCTTCTATAGTATCTGGACTACAGATGTTGGAACAG
AGCTGGCCATGGCCTTCATTATCGTGGCTGGAATCTGCCTCTGCCTCTACTTCCTGTTTCTATGCTTCATGGTATTTCAG
GTGTTTCGGAACATCAGTGGGAAGCAGTCCAGCCTGCCAGCTATGAGCAAAGTCCGGCGGCTACACTATGAGGGGCTAAT
TTTTAGATTCAAGTTCCTCATGCTTATCACCTTGGCCTGTGCTGCCATGACTGTCATATTCTTCATCGTTAGTCAGGTAA
CGGAAGGCCACTGGAAATGGGGCGGTGTCACAGTCCAAGTGAACAGTGCCTTTTTCACCGGCATCTATGGAATGTGGAAC
CTGTACGTCTTTGCTCTGATGTTCTTGTATGCACCATCCCATAAAAACTATGGGGAAGACCAGTCCAACGGAATGCCACT
CCCATGTAAATCGAGGGAAGATTGTGCTTTGTTTGTTTCGGAACTTTATCAAGAATTGTTCAGCACTTCGAAATATTCCT
TCATCAATGACAACGCAGCTGCTGGTATTTGA
| Library | Parental gene expression (RPM) |
|---|---|
| SRP051959_spleen | 15 .61 RPM |
| SRP051959_skeletal_muscle | 3 .17 RPM |
| SRP051959_lymph_node | 3 .24 RPM |
| SRP051959_lung | 31 .98 RPM |
| SRP051959_liver | 9 .49 RPM |
| SRP051959_kidney | 15 .06 RPM |
| SRP051959_heart | 25 .22 RPM |
| SRP051959_colon | 13 .91 RPM |
No homologs available
| # | RetrogeneDB ID | Identity (%) | Coverage (%) | ORF conservation | Expression evidence | RDV |
|---|---|---|---|---|---|---|
| 1. | retro_cjac_3460 | 85.42 | 55.81 | Please wait, loading  | Please wait, loading | Please wait, loading |
Download FASTA sequences of all ENSCJAG00000017517 retrocopies