Parental gene: | TAF15, ENSSHAG00000003105 |
| Aliases: | None |
| Description: | TAF15 RNA polymerase II, TATA box binding protein (TBP)-associated factor, 68kDa [Source:HGNC Symbol;Acc:11547] |
| Organism: | Tasmanian devil (Sarcophilus harrisii) |
| Coordinates: | GL856999.1:51677..74028(-) |
>ENSSHAG00000003105
ATGTCGGATTCTGGAAGTTACGGTCAGTCTGGGGGCGATCAGCAAAGCTATTCCTATGGCAATCAAAGCAACCAAAGCTA
TGGACAAGCACCACAAGGTTATTCTGGCTATGGGCAAACGGCTGATTCCTCTTATGGACAGAACTATGGCGGCTACTCAA
GTTATGGACAGAGTCAATCAGGTTATTCACAGTCCTACGGTGGTTATGAAAATCAAAAGCAGAGCTCATATGGCCAGCAA
TCTTATAATAACCAGGGACAGCAAAACACGGACTCATCGGGAGGCCAAGGTGGAAGAGCGCCTTCATATGACCAGTCAGA
CTATGGTCAACAAGATTCATATGACCAACAGTCAGGCTATGACCAACACCAAGGTTCATATGACGAGCAGTCAAATTATG
ATCAGCAGCAAGACTCATATAATCAAAATCAGCAGTCCTATCATTCACAAAGGGAAAGTTACAGCCACCATACACAAGAT
GACCGTCGTGACATGAGTAGGTATGGAGAAGATAATAGAGGATATGGCGGGTCACAGGGAGGAGGTAGAGGGCGTGGGGG
ATATGACAAGGATGGAAGAGGTCCTATGACAGGATCAAGTGGTGGTGACCGCGGTGGCTTCAAAAATTTTGGTGGCCACA
GGGATTATGGACCGAAAACAGATGCTGACTCAGAGTCTGATAATTCAGACAACAACACGATCTTTGTTCAAGGACTTGGA
GAAGGGGTATCAACTGATCAAGTTGGGGACTTCTTTAAGCAAATAGGAATTATTAAGACAAATAAGAAGACTGGTAAACC
GATGATAAATCTATATACAGACAAGGATACAGGCAAGCCAAAAGGAGAGGCAACAGTGTCATTTGATGACCCTCCTTCAG
CTAAAGCTGCAATTGATTGGTTTGATGGAAAAGAATTCCATGGCAATATCATCAAAGTATCTTTTGCCACTAGAAGACCT
GAGTTCCTGAGAGGGGGTGGAAGTGGAGGTGGGCGACGAGGTTCTCGTGGTGGATACAGAGGGCGTGGAGGCTTTCAAGG
TAGAGGAGGTGACCCGAAAAGTGGTGACTGGGTTTGTCCTAATCCGTCATGTGGAAACATGAACTTTGCCCGAAGGAATT
CCTGTAATCAGTGTAATGAACCCAGACCAGAGGACTCTCGTCCTTCAGGAGGAGATTTCCGAGGGAGAGGCTATGGTGGC
GAGAGGGGCTATAGAGGCCGGGGTGGCAGAGGTGGAGACCGAGGAGGCGGTGGCTATGGAGGAGACCGAAGTGGCGGTGG
TGGCTATGGAGGAGACCGAAGTGGCGGCGGCTATGGAGGAGACCGAAGTGGCGGCGGCTACGGGGGTGACCGGAGTGGCG
GTGGTGGCTATGGGGGTGATCGGAGTGGTGGCTATGGGGGTGACCGGAGTGGCGGCGGTGGCGGTGGTTACGGAGGTGAC
CGAAGTGGCGGTGGCTACGGAGGTGACAGAAGTGGTGGCTATGGTGGAGACCGAAGTGGCGGTGGCTATGGAGGTGACCG
AAGTGGCGGCGGCTATGGGGGAGACCGAGGTGGTGGTTATGGCGGAGACCGAGGAGGTGGTTATGGTGGCAAAATGGGAG
GCAGAAATGACTACAGAAATGATCAGCGTAATCGACCATACTGA
ATGTCGGATTCTGGAAGTTACGGTCAGTCTGGGGGCGATCAGCAAAGCTATTCCTATGGCAATCAAAGCAACCAAAGCTA
TGGACAAGCACCACAAGGTTATTCTGGCTATGGGCAAACGGCTGATTCCTCTTATGGACAGAACTATGGCGGCTACTCAA
GTTATGGACAGAGTCAATCAGGTTATTCACAGTCCTACGGTGGTTATGAAAATCAAAAGCAGAGCTCATATGGCCAGCAA
TCTTATAATAACCAGGGACAGCAAAACACGGACTCATCGGGAGGCCAAGGTGGAAGAGCGCCTTCATATGACCAGTCAGA
CTATGGTCAACAAGATTCATATGACCAACAGTCAGGCTATGACCAACACCAAGGTTCATATGACGAGCAGTCAAATTATG
ATCAGCAGCAAGACTCATATAATCAAAATCAGCAGTCCTATCATTCACAAAGGGAAAGTTACAGCCACCATACACAAGAT
GACCGTCGTGACATGAGTAGGTATGGAGAAGATAATAGAGGATATGGCGGGTCACAGGGAGGAGGTAGAGGGCGTGGGGG
ATATGACAAGGATGGAAGAGGTCCTATGACAGGATCAAGTGGTGGTGACCGCGGTGGCTTCAAAAATTTTGGTGGCCACA
GGGATTATGGACCGAAAACAGATGCTGACTCAGAGTCTGATAATTCAGACAACAACACGATCTTTGTTCAAGGACTTGGA
GAAGGGGTATCAACTGATCAAGTTGGGGACTTCTTTAAGCAAATAGGAATTATTAAGACAAATAAGAAGACTGGTAAACC
GATGATAAATCTATATACAGACAAGGATACAGGCAAGCCAAAAGGAGAGGCAACAGTGTCATTTGATGACCCTCCTTCAG
CTAAAGCTGCAATTGATTGGTTTGATGGAAAAGAATTCCATGGCAATATCATCAAAGTATCTTTTGCCACTAGAAGACCT
GAGTTCCTGAGAGGGGGTGGAAGTGGAGGTGGGCGACGAGGTTCTCGTGGTGGATACAGAGGGCGTGGAGGCTTTCAAGG
TAGAGGAGGTGACCCGAAAAGTGGTGACTGGGTTTGTCCTAATCCGTCATGTGGAAACATGAACTTTGCCCGAAGGAATT
CCTGTAATCAGTGTAATGAACCCAGACCAGAGGACTCTCGTCCTTCAGGAGGAGATTTCCGAGGGAGAGGCTATGGTGGC
GAGAGGGGCTATAGAGGCCGGGGTGGCAGAGGTGGAGACCGAGGAGGCGGTGGCTATGGAGGAGACCGAAGTGGCGGTGG
TGGCTATGGAGGAGACCGAAGTGGCGGCGGCTATGGAGGAGACCGAAGTGGCGGCGGCTACGGGGGTGACCGGAGTGGCG
GTGGTGGCTATGGGGGTGATCGGAGTGGTGGCTATGGGGGTGACCGGAGTGGCGGCGGTGGCGGTGGTTACGGAGGTGAC
CGAAGTGGCGGTGGCTACGGAGGTGACAGAAGTGGTGGCTATGGTGGAGACCGAAGTGGCGGTGGCTATGGAGGTGACCG
AAGTGGCGGCGGCTATGGGGGAGACCGAGGTGGTGGTTATGGCGGAGACCGAGGAGGTGGTTATGGTGGCAAAATGGGAG
GCAGAAATGACTACAGAAATGATCAGCGTAATCGACCATACTGA
No homologs available
| # | RetrogeneDB ID | Identity (%) | Coverage (%) | ORF conservation | Expression evidence | RDV |
|---|---|---|---|---|---|---|
| 1. | retro_shar_773 | 86.29 | 53.75 | Please wait, loading  | Please wait, loading | Please wait, loading |
Download FASTA sequences of all ENSSHAG00000003105 retrocopies