Parental gene: | PGSC0003DMG400014862 |
| Aliases: | None |
| Description: | Subtilisin-like protease [Source:PGSC_GENE;Acc:PGSC0003DMG400014862] |
| Organism: | Potato (Solanum tuberosum) |
| Coordinates: | 3:7245968..7248783(-) |
>PGSC0003DMG400014862
ATGGCGAAATCACAAATGCCAGAGGGTTTTGAAGATCATACTCATTGGTATGATTCGTCGTTGAGATCAGTTTCTGCTTC
TGCAGAAATGTTGTATGTTTACAACAATGCTGTTCATGGTTTTGCTGCCAGGCTTACTCCTGAGGAAGCAGAGTCTTTAC
AGAATCAACCTGGGATTTTGTCGGTTTTGCCGGAGATGAAGTATGAACTTCATACGACAAGGACGCCTTTGTTTTTGGGT
CTTGATGTAAGTGCTGATTATTTTCCGGAATCGAATGCGATGGGTGATGTGATTGTTGGTGTGCTTGATACTGGGGTTTG
GCCAGAGAGTAAGAGTTTTGATGATAATGGATTTGGACCCATTCCAGCTTCATGGAAAGGGGAATGTGAATCTGGAACTA
ATTTCACTTCCAAGAATTGTAATAGGAAGTTGATTGGTGCCAGGTACTTTGCTAAAGGTTATGAATCTACTTTGGGTCCG
ATTGATGTATCGAAAGAATCGAAATCTCCGAGGGATGATGATGGACATGGAACACATACTTCTACTACTGCAGCTGGTTC
AGTTGTTCAGGGTGCTAGTCTCCTTGGGTATGCTTCTGGAAATGCTCGCGGAATGGCAACTCATGCTAGAGTTGCTGTCT
ATAAAGTTTGTTGGGTTGGTGGTTGTTTTAGCTCTGATATATTAGCAGGTTTGGATAAAGCCATTGATGATAATGTGAAT
GTGCTTTCTTTATCACTTGGTGGTGGCAATTCAGATTACTATAGAGATAGTATTGCGATTGGTGCCTTTGCTGCTATGGA
GAAAGGGATTTTAGTATCTTGCTCTGCAGGTAATGCTGGTCCTAGTCCTTACAGTTTGTCCAATGTAGCACCATGGATCA
CTACTGTGGGTGCAGGAACATTGGACCGTGATTTTCCTGCATATGTAAGTCTAGGCAATGGTAAGAATTTCTCCGGTGTT
TCGCTCTATAAAGGGGATTCATCACTAAGCAAAATGCTTCCCTTTGTGTATGCTGGTAATGCTAGTAATATGACAAATGG
AAATCTTTGCATGACGGGTACCTTAATTCCTGAGGAAGTTAAAGGAAAAATTGTTCTATGTGACCGTGGGATAAATCCCA
GGGTCCAAAAGGGTTCTGTGGTAAAAGCAGCTGGTGGAGCTGGTATGGTCTTGGCTAATACCGCTGCAAATGGGGATGAG
CTAATTGCTGATGCTCATTTGATTCCAGCAACGTCGGTGGGACAGACAACAGGGGAAGCAATCAAGAAGTACTTAACCTC
GGACCCTAATCCGACAGCCACTATTCTTTTCGAGGGAACTAAGGTGGGAATCAAACCATCACCAGTGGTTGCTGCATTTA
GCTCCAGAGGGCCAAACTCGATCACACAGGAAATTCTGAAACCAGACATCATAGCACCAGGTGTTAACATTCTTGCAGGA
TGGACAGGTGCAGCTGGTCCGACAGGGTTGGCCGAGGACGACAGACGTGTTGAGTTTAATATTATTTCGGGCACGTCTAT
GTCATGCCCTCACGTGAGTGGTTTGGCTGCTTTGCTTAAAGGAGCGCACCCTGATTGGAGCCCAGCAGCTATCCGCTCAG
CTCTTATGACCACGGCGTATACAGTGTATAAGAAAGGAGGTGCGCTCCAAGATGTTGTGACAGGAAAGCCATCCACGCCA
TTTGATCATGGTGCAGGACATGTAGATCCTGTTGCAGCACTAAACCCCGGACTTGTTTATGACTTGAAGGCTGATGATTA
TCTGAATTTCCTCTGTGCATTGAACTACACATCAATCCAGATCAATAGTGTTGCCAGAAGACCCTTTAGTTGCGAAACAA
GTAAAAAATTTAGTGTCGCTGATTTGAATTACCCTTCATTTGCTGTTGTATTTCCAGAACAAATGACTGCAAGCAGCGGA
AGTGGTTCCAGTTCAATCAAACACACACGAACGCTTACTAATGTTGGACCAGCCGGAACATACAAAGTCAATGTTATTTC
ACCAAGCAACTCAGTGAAAGTCGTGGTTGAGCCTGAAATATTGGCTTTTACTCGGATGAACGAGCAGAAATCATATACCG
TGACTTTCACTGCTCCTTCAATGCCGTCAACTGAAAATGTTTATGCTCGAATTGAGTGGTCAGATGGAAAGCATATAGTG
AGTAGTCCAGTGGCCATAAGTTGGACATGA
ATGGCGAAATCACAAATGCCAGAGGGTTTTGAAGATCATACTCATTGGTATGATTCGTCGTTGAGATCAGTTTCTGCTTC
TGCAGAAATGTTGTATGTTTACAACAATGCTGTTCATGGTTTTGCTGCCAGGCTTACTCCTGAGGAAGCAGAGTCTTTAC
AGAATCAACCTGGGATTTTGTCGGTTTTGCCGGAGATGAAGTATGAACTTCATACGACAAGGACGCCTTTGTTTTTGGGT
CTTGATGTAAGTGCTGATTATTTTCCGGAATCGAATGCGATGGGTGATGTGATTGTTGGTGTGCTTGATACTGGGGTTTG
GCCAGAGAGTAAGAGTTTTGATGATAATGGATTTGGACCCATTCCAGCTTCATGGAAAGGGGAATGTGAATCTGGAACTA
ATTTCACTTCCAAGAATTGTAATAGGAAGTTGATTGGTGCCAGGTACTTTGCTAAAGGTTATGAATCTACTTTGGGTCCG
ATTGATGTATCGAAAGAATCGAAATCTCCGAGGGATGATGATGGACATGGAACACATACTTCTACTACTGCAGCTGGTTC
AGTTGTTCAGGGTGCTAGTCTCCTTGGGTATGCTTCTGGAAATGCTCGCGGAATGGCAACTCATGCTAGAGTTGCTGTCT
ATAAAGTTTGTTGGGTTGGTGGTTGTTTTAGCTCTGATATATTAGCAGGTTTGGATAAAGCCATTGATGATAATGTGAAT
GTGCTTTCTTTATCACTTGGTGGTGGCAATTCAGATTACTATAGAGATAGTATTGCGATTGGTGCCTTTGCTGCTATGGA
GAAAGGGATTTTAGTATCTTGCTCTGCAGGTAATGCTGGTCCTAGTCCTTACAGTTTGTCCAATGTAGCACCATGGATCA
CTACTGTGGGTGCAGGAACATTGGACCGTGATTTTCCTGCATATGTAAGTCTAGGCAATGGTAAGAATTTCTCCGGTGTT
TCGCTCTATAAAGGGGATTCATCACTAAGCAAAATGCTTCCCTTTGTGTATGCTGGTAATGCTAGTAATATGACAAATGG
AAATCTTTGCATGACGGGTACCTTAATTCCTGAGGAAGTTAAAGGAAAAATTGTTCTATGTGACCGTGGGATAAATCCCA
GGGTCCAAAAGGGTTCTGTGGTAAAAGCAGCTGGTGGAGCTGGTATGGTCTTGGCTAATACCGCTGCAAATGGGGATGAG
CTAATTGCTGATGCTCATTTGATTCCAGCAACGTCGGTGGGACAGACAACAGGGGAAGCAATCAAGAAGTACTTAACCTC
GGACCCTAATCCGACAGCCACTATTCTTTTCGAGGGAACTAAGGTGGGAATCAAACCATCACCAGTGGTTGCTGCATTTA
GCTCCAGAGGGCCAAACTCGATCACACAGGAAATTCTGAAACCAGACATCATAGCACCAGGTGTTAACATTCTTGCAGGA
TGGACAGGTGCAGCTGGTCCGACAGGGTTGGCCGAGGACGACAGACGTGTTGAGTTTAATATTATTTCGGGCACGTCTAT
GTCATGCCCTCACGTGAGTGGTTTGGCTGCTTTGCTTAAAGGAGCGCACCCTGATTGGAGCCCAGCAGCTATCCGCTCAG
CTCTTATGACCACGGCGTATACAGTGTATAAGAAAGGAGGTGCGCTCCAAGATGTTGTGACAGGAAAGCCATCCACGCCA
TTTGATCATGGTGCAGGACATGTAGATCCTGTTGCAGCACTAAACCCCGGACTTGTTTATGACTTGAAGGCTGATGATTA
TCTGAATTTCCTCTGTGCATTGAACTACACATCAATCCAGATCAATAGTGTTGCCAGAAGACCCTTTAGTTGCGAAACAA
GTAAAAAATTTAGTGTCGCTGATTTGAATTACCCTTCATTTGCTGTTGTATTTCCAGAACAAATGACTGCAAGCAGCGGA
AGTGGTTCCAGTTCAATCAAACACACACGAACGCTTACTAATGTTGGACCAGCCGGAACATACAAAGTCAATGTTATTTC
ACCAAGCAACTCAGTGAAAGTCGTGGTTGAGCCTGAAATATTGGCTTTTACTCGGATGAACGAGCAGAAATCATATACCG
TGACTTTCACTGCTCCTTCAATGCCGTCAACTGAAAATGTTTATGCTCGAATTGAGTGGTCAGATGGAAAGCATATAGTG
AGTAGTCCAGTGGCCATAAGTTGGACATGA
| Species | Parental gene accession | Homology type | Retrogenes number | |
|---|---|---|---|---|
| Solanum lycopersicum | Solyc03g044150.2 | ortholog_one2one | 1 retrogene |
| # | RetrogeneDB ID | Identity (%) | Coverage (%) | ORF conservation | Expression evidence | RDV |
|---|---|---|---|---|---|---|
| 1. | retro_stub_9 | 66.26 | 100.00 | Please wait, loading  | Please wait, loading | Please wait, loading |
| 2. | retro_stub_57 | 80.80 | 100.00 | Please wait, loading | Please wait, loading | Please wait, loading |
Download FASTA sequences of all PGSC0003DMG400014862 retrocopies