Parental gene: | PP1S381_15V6 |
| Aliases: | None |
| Description: | None |
| Organism: | Moss (Physcomitrella patens) |
| Coordinates: | DS545268.1:193916..201344(+) |
>PP1S381_15V6
ATGGATATGTCCTCGGTGAGGGCGCTGGTATCAGTCAGGGCGCATATGATGATGTCGACTCACTCAGATGGAAACACTTT
GGGCCTCACCAAGCACACACCCCCAGATGTCGCAGAGATGGACATAAGGGCACATGATGGGGCTCTGTATGAATGGGAGG
GAGATGTGTTGGCACTTGGTGTTTTTGAAGAAAATCTCACTCGTTCTGAAGAAAACAAATTCCTTCATCCGGGCCTTGCC
GAGCTTGACTATGTGATGGGCGGAGTGTTAGGAGAATTGGCAGATGAAGATGACTTCACAGGGAAGTTGGGACAACTTTC
AGTGGTGCGTCTAGCTTCAAGCAAGATTAAAAGGCTTGCTCTTGTGGGATTGGGACGAGCAAATAATGTCATGGATGCTG
TGTATGCTTCTGATTCATGGCGTATTTTAGGTTTTACTGCAGCTCGAATTGCTAAACAGCTCAAGATGTGCAGCATGGGA
CTGGCAGCCATGGATACAAACCTCATGGATGAGTCCTCGAAACTCGTGGCAGTGGAATCTATTGCGTCGGGTGCTATTCT
CGGCACATACGAAGATACACGCTTCAAGTCTGAGGTGTACAGTCTTATGGATTCGATGTTGGCTAAATTCGAGAAAGAAA
GAATTAACCTGGAGATGCTCTCAATCGCCGCTTCACGTAAGGCCAAACCATCCAAGTTGACGCAGGTGGCAGTGATGTCA
CTAGGCACTGGAAGCGATCGAGATGAAGCACTGCGGCGGGCAGTATGTATCACCGCTGGAGTTATTGTTGCAAAGCAACT
GGTAGCTGCTCCTGCCAATGTGTTGACTCCAGGTGCCCTTGCTGATGCAGCAGTGAGCATTGCTATGGCACACAGTGAAG
TGTTGACCTGCACTATTCTGGAGAAAGTAGATTGCGAGGCTCTTGGAATGGGTGCATTTCTAGGTGTAGCGAATGGTTCT
GATCAACCACCGAAGTTCATTCACTTAAAGTACTGCCCCCCAGATGGTGTTGTGTACAAGAGGGTGGCCATTGTTGGTAA
AGGTATCTGCTTTGATTCAGGAGGTTACAATATAAAGACGGGTGCTAATTGCGCTGTGGAACTTATGAAGTTCGATATGG
GCGGAGCAGGTGCAGCTCTCGGAGCAGCCTCGGCTATAGGTGCCCTTAAACCGAAGGGAGTTGAGGTTCACTTTATCAGT
GCAGCATGCGAAAACATGATCAGTGGCAAGGGCATGCGGCCTGGAGACATTGTGACAGCTATGAACGGCATAACAATTGA
GGTTAACAATACAGATGCAGAGGGCAGGTTGACTCTTGCTGATTCCTTGGTTTATGCCTGTCGGCTTCGTGTAGATGCGA
TTGTGGACCTGGCAACCTTGACCGGAGCATGTGTAGTAGCTCTCGGACATGAAGTGGGCGGATTTTTTACACCTAGTGCT
ACTATGGCCCAGCAGTTGGAAACAGCTGCACAGATTGCTGGAGAGAAAATCTGGCGGATGCCACTTGTTGAACAGTATAA
GCAGACACTCGAGAGTCCCATCGCTGACCTCGTGAATACAAGCGGTCGTGATGGAGGTAGCATTAAGGCAGCACTTTTCT
TAAAAGAGTTTGTGGATCCAGGTATGGAATGGGCGCACTTGGACATAGCTGGACCAGTATGGAACCGCAAAACTGGCACC
GCAACAGGGTACCCAGTCCGGACACTGGTAAAATGGATTGATCAACAGCAGATCGTTGCTGGAGTTGCTGACTCCTGA
ATGGATATGTCCTCGGTGAGGGCGCTGGTATCAGTCAGGGCGCATATGATGATGTCGACTCACTCAGATGGAAACACTTT
GGGCCTCACCAAGCACACACCCCCAGATGTCGCAGAGATGGACATAAGGGCACATGATGGGGCTCTGTATGAATGGGAGG
GAGATGTGTTGGCACTTGGTGTTTTTGAAGAAAATCTCACTCGTTCTGAAGAAAACAAATTCCTTCATCCGGGCCTTGCC
GAGCTTGACTATGTGATGGGCGGAGTGTTAGGAGAATTGGCAGATGAAGATGACTTCACAGGGAAGTTGGGACAACTTTC
AGTGGTGCGTCTAGCTTCAAGCAAGATTAAAAGGCTTGCTCTTGTGGGATTGGGACGAGCAAATAATGTCATGGATGCTG
TGTATGCTTCTGATTCATGGCGTATTTTAGGTTTTACTGCAGCTCGAATTGCTAAACAGCTCAAGATGTGCAGCATGGGA
CTGGCAGCCATGGATACAAACCTCATGGATGAGTCCTCGAAACTCGTGGCAGTGGAATCTATTGCGTCGGGTGCTATTCT
CGGCACATACGAAGATACACGCTTCAAGTCTGAGGTGTACAGTCTTATGGATTCGATGTTGGCTAAATTCGAGAAAGAAA
GAATTAACCTGGAGATGCTCTCAATCGCCGCTTCACGTAAGGCCAAACCATCCAAGTTGACGCAGGTGGCAGTGATGTCA
CTAGGCACTGGAAGCGATCGAGATGAAGCACTGCGGCGGGCAGTATGTATCACCGCTGGAGTTATTGTTGCAAAGCAACT
GGTAGCTGCTCCTGCCAATGTGTTGACTCCAGGTGCCCTTGCTGATGCAGCAGTGAGCATTGCTATGGCACACAGTGAAG
TGTTGACCTGCACTATTCTGGAGAAAGTAGATTGCGAGGCTCTTGGAATGGGTGCATTTCTAGGTGTAGCGAATGGTTCT
GATCAACCACCGAAGTTCATTCACTTAAAGTACTGCCCCCCAGATGGTGTTGTGTACAAGAGGGTGGCCATTGTTGGTAA
AGGTATCTGCTTTGATTCAGGAGGTTACAATATAAAGACGGGTGCTAATTGCGCTGTGGAACTTATGAAGTTCGATATGG
GCGGAGCAGGTGCAGCTCTCGGAGCAGCCTCGGCTATAGGTGCCCTTAAACCGAAGGGAGTTGAGGTTCACTTTATCAGT
GCAGCATGCGAAAACATGATCAGTGGCAAGGGCATGCGGCCTGGAGACATTGTGACAGCTATGAACGGCATAACAATTGA
GGTTAACAATACAGATGCAGAGGGCAGGTTGACTCTTGCTGATTCCTTGGTTTATGCCTGTCGGCTTCGTGTAGATGCGA
TTGTGGACCTGGCAACCTTGACCGGAGCATGTGTAGTAGCTCTCGGACATGAAGTGGGCGGATTTTTTACACCTAGTGCT
ACTATGGCCCAGCAGTTGGAAACAGCTGCACAGATTGCTGGAGAGAAAATCTGGCGGATGCCACTTGTTGAACAGTATAA
GCAGACACTCGAGAGTCCCATCGCTGACCTCGTGAATACAAGCGGTCGTGATGGAGGTAGCATTAAGGCAGCACTTTTCT
TAAAAGAGTTTGTGGATCCAGGTATGGAATGGGCGCACTTGGACATAGCTGGACCAGTATGGAACCGCAAAACTGGCACC
GCAACAGGGTACCCAGTCCGGACACTGGTAAAATGGATTGATCAACAGCAGATCGTTGCTGGAGTTGCTGACTCCTGA
No homologs available
| # | RetrogeneDB ID | Identity (%) | Coverage (%) | ORF conservation | Expression evidence | RDV |
|---|---|---|---|---|---|---|
| 1. | retro_ppat_1 | 62.32 | 58.97 | Please wait, loading  | Please wait, loading | Please wait, loading |
Download FASTA sequences of all PP1S381_15V6 retrocopies