Parental gene: | Solyc03g115230.2 |
| Aliases: | None |
| Description: | None |
| Organism: | Tomato (Solanum lycopersicum) |
| Coordinates: | 3:65011965..65016121(-) |
>Solyc03g115230.2
ATGAATCCTGAAAAATTTACTCACAAGACAAATGAGGCTATTGCTGAGGCACATGAACTGGCTGTATCAGCAGGGCATGC
TCAGTTGACACCTCTGCATATGGCTTTGGCTTTATTATCTGATCACAGTGGTATATTCTGGCAAGCAATTGTCAATGCTG
CTGGTAGTGAAGAGACTGCCAATGGTGTTGAAAGAGTGTTCAATCAAGCTAAGAAGAAAATTCCTTCTCAGTCACCAGCA
CCTGATCAAGTTCCAGCAAGTACTTCGCTTATTAAGGTGCTACGACGAGCACAGTCGTTGCAGAAGTCTCGTGGTGACAG
CCATTTGGCGGTTGATCTGTTGATTTTAGGCCTTCTGGAAGATTCCCAAATTGCAGATCTTTTGAAAGATTCTGGTCTTA
GTGCAGCAAGAGTGAAATCAGAAGTTGAGAAACTTAGAGGAAAAGATGGAAAGAAAGTGGAAAGTGCTACAGGGGATACT
ACATTTCAAGCACTTAAGACCTATGGTCGTGATCTTGTGGAACAGGCAGGAAAACTTGATCCTGTGATTGGTAGGGATGA
AGAAATTCGAAGAGTAATTCGGATTCTTTCGAGGAGGACAAAGAACAATCCGGTGCTTATTGGTGAGCCTGGTGTTGGTA
AAACAGCTGTAGTTGAAGGGCTAGCACAAAGGATAGTTCGAGGGGATGTTCCAAGCAATTTGGCTGATGTTAGGCTTATA
GCATTGGATATGGGAGCACTCATTGCTGGAGCAAAGTACAGAGGTGAATTTGAAGAGAGATTGAAGGCTGTTCTGAAGGA
AGTGGAAGATGCAGAAGGGAAAGTAATTCTCTTCATTGATGAGATCCACTTGGTTTTAGGTGCTGGTAGGACTGAAGGAT
CAATGGATGCTGCCAATTTGTTCAAACCGATGCTTGCTCGGGGCCAATTAAGGTGCATTGGTGCAACAACCCTGGAAGAG
TACAGGAAGTATGTGGAGAAAGATGCTGCATTCGAAAGGCGTTTCCAGCAGGTATATGTCGCTGAGCCTAGCGTTCCCGA
CACTATAAGTATCCTTCGAGGGTTGAAGGAGAAGTATGAAGGCCATCATGGTGTCAAGATTCAGGATAGGGCTCTCGTTA
TTGCAGCCCAGCTTTCAGCTCGATACATTACAGGTCGACATTTGCCTGATAAGGCTATTGACTTAGTTGATGAGGCTTGT
GCAAATGTGAGGGTGCAACTTGATAGCCAGCCAGAAGAAATTGATAATCTTGAAAGGAAGAGGATTCAGCTAGAAGTTGA
ACATCATGCTCTTGAAAAGGAAAAAGACAAGGCTAGCAAGGCTCGACTTGTTGAAGTGAGGAAAGAGCTCGATGACTTGA
GGGACAAACTCCAACCTTTGATGATGAGGTATAAGAAAGAGAAGGAACGGGTTGATGAGCTTCGAAGGCTTAAGCAAAAG
CGCGATGAACTTACATATGCTTTACAAGAAGCTGAAAGGAGATATGATCTTGCTAGAGCAGCAGATCTTAGATACGGTGC
CATCCAAGAAGTAGAATCTGCAATAGCAAATCTTGAGAGTAGCACAGATGAGAGTACAATGTTGACAGAGACTGTCGGAC
CCGATCAGATTGCGGAAGTAGTTAGTCGCTGGACTGGAATTCCTGTCTCTAGGCTTGGCCAGAATGAGAAGGAGAAATTG
ATTGGTCTTGCTGATAGATTGCACCTAAGAGTTGTCGGGCAAGATCAAGCTGTTAAAGCTGTTGCTGAGGCTGTGTTGAG
GTCTAGAGCTGGATTAGGAAGGCCACAGCAACCAACTGGTTCATTCCTTTTCTTGGGGCCAACTGGTGTTGGAAAGACTG
AACTTGCTAAAGCTCTTGCTGAGCAGCTATTTGATGATGACAAATTGATGGTCAGAATTGACATGTCCGAATACATGGAA
CAACATTCTGTTGCCCGGTTGATTGGTGCTCCACCAGGTTATGTTGGACATGAGGAAGGAGGGCAACTTACGGAAGCTGT
AAGGAGGCGCCCTTACAGTGTTGTGCTATTTGACGAAGTGGAAAAAGCTCACCCTGCAGTGTTTAATGCCTTGCTTCAAG
TGTTGGATGATGGAAGATTAACTGATGGTCAAGGTCGTACTGTTGATTTCACCAACACTGTGATCATTATGACCTCAAAT
TTGGGAGCAGAGTATCTCTTGTCAGGATTAAGTGGCAAGTGTACCATGGAGAAGGCCCGTGAAATGGTCATGCAGGAGGT
GAGGAAGCAATTTAAGCCCGAGTTACTCAACAGGCTCGATGAGATTGTGGTGTTCGATCCTTTATCACACGAGCAGTTGA
GGCAAGTCTGCCGTCACCAACTGAAAGATGTGGCAAGCCGTTTAGCTGAGAGGGGTATTGCTTTGGGTGTTACAGAGGCC
GCCTTAGATGTCATACTTGCTCAGAGTTATGATCCGGTGTATGGTGCAAGGCCTATTAGGAGGTGGTTGGAGAAGAAAGT
TGTAACGGAGTTATCAAAGATGCTTGTGAAGGAGGAGATTGATGAGAATTCGACCGTGTACATAGATGCTGGACGTGGCG
GAAAAGATCTAACATATAGGGTGGAGAATAATGGAGGGCTTGTGAATGCTGCTACTGGTCAAAAATCTGATGTACTGATT
CAGCTACCTAATGGGCCAAGGAATGATGCTGCTCAAGCAGTGAAGAAAATGAGGATTGAAGAAATAGATGACGAAGATGA
TGAAATGGCAGATTAA
ATGAATCCTGAAAAATTTACTCACAAGACAAATGAGGCTATTGCTGAGGCACATGAACTGGCTGTATCAGCAGGGCATGC
TCAGTTGACACCTCTGCATATGGCTTTGGCTTTATTATCTGATCACAGTGGTATATTCTGGCAAGCAATTGTCAATGCTG
CTGGTAGTGAAGAGACTGCCAATGGTGTTGAAAGAGTGTTCAATCAAGCTAAGAAGAAAATTCCTTCTCAGTCACCAGCA
CCTGATCAAGTTCCAGCAAGTACTTCGCTTATTAAGGTGCTACGACGAGCACAGTCGTTGCAGAAGTCTCGTGGTGACAG
CCATTTGGCGGTTGATCTGTTGATTTTAGGCCTTCTGGAAGATTCCCAAATTGCAGATCTTTTGAAAGATTCTGGTCTTA
GTGCAGCAAGAGTGAAATCAGAAGTTGAGAAACTTAGAGGAAAAGATGGAAAGAAAGTGGAAAGTGCTACAGGGGATACT
ACATTTCAAGCACTTAAGACCTATGGTCGTGATCTTGTGGAACAGGCAGGAAAACTTGATCCTGTGATTGGTAGGGATGA
AGAAATTCGAAGAGTAATTCGGATTCTTTCGAGGAGGACAAAGAACAATCCGGTGCTTATTGGTGAGCCTGGTGTTGGTA
AAACAGCTGTAGTTGAAGGGCTAGCACAAAGGATAGTTCGAGGGGATGTTCCAAGCAATTTGGCTGATGTTAGGCTTATA
GCATTGGATATGGGAGCACTCATTGCTGGAGCAAAGTACAGAGGTGAATTTGAAGAGAGATTGAAGGCTGTTCTGAAGGA
AGTGGAAGATGCAGAAGGGAAAGTAATTCTCTTCATTGATGAGATCCACTTGGTTTTAGGTGCTGGTAGGACTGAAGGAT
CAATGGATGCTGCCAATTTGTTCAAACCGATGCTTGCTCGGGGCCAATTAAGGTGCATTGGTGCAACAACCCTGGAAGAG
TACAGGAAGTATGTGGAGAAAGATGCTGCATTCGAAAGGCGTTTCCAGCAGGTATATGTCGCTGAGCCTAGCGTTCCCGA
CACTATAAGTATCCTTCGAGGGTTGAAGGAGAAGTATGAAGGCCATCATGGTGTCAAGATTCAGGATAGGGCTCTCGTTA
TTGCAGCCCAGCTTTCAGCTCGATACATTACAGGTCGACATTTGCCTGATAAGGCTATTGACTTAGTTGATGAGGCTTGT
GCAAATGTGAGGGTGCAACTTGATAGCCAGCCAGAAGAAATTGATAATCTTGAAAGGAAGAGGATTCAGCTAGAAGTTGA
ACATCATGCTCTTGAAAAGGAAAAAGACAAGGCTAGCAAGGCTCGACTTGTTGAAGTGAGGAAAGAGCTCGATGACTTGA
GGGACAAACTCCAACCTTTGATGATGAGGTATAAGAAAGAGAAGGAACGGGTTGATGAGCTTCGAAGGCTTAAGCAAAAG
CGCGATGAACTTACATATGCTTTACAAGAAGCTGAAAGGAGATATGATCTTGCTAGAGCAGCAGATCTTAGATACGGTGC
CATCCAAGAAGTAGAATCTGCAATAGCAAATCTTGAGAGTAGCACAGATGAGAGTACAATGTTGACAGAGACTGTCGGAC
CCGATCAGATTGCGGAAGTAGTTAGTCGCTGGACTGGAATTCCTGTCTCTAGGCTTGGCCAGAATGAGAAGGAGAAATTG
ATTGGTCTTGCTGATAGATTGCACCTAAGAGTTGTCGGGCAAGATCAAGCTGTTAAAGCTGTTGCTGAGGCTGTGTTGAG
GTCTAGAGCTGGATTAGGAAGGCCACAGCAACCAACTGGTTCATTCCTTTTCTTGGGGCCAACTGGTGTTGGAAAGACTG
AACTTGCTAAAGCTCTTGCTGAGCAGCTATTTGATGATGACAAATTGATGGTCAGAATTGACATGTCCGAATACATGGAA
CAACATTCTGTTGCCCGGTTGATTGGTGCTCCACCAGGTTATGTTGGACATGAGGAAGGAGGGCAACTTACGGAAGCTGT
AAGGAGGCGCCCTTACAGTGTTGTGCTATTTGACGAAGTGGAAAAAGCTCACCCTGCAGTGTTTAATGCCTTGCTTCAAG
TGTTGGATGATGGAAGATTAACTGATGGTCAAGGTCGTACTGTTGATTTCACCAACACTGTGATCATTATGACCTCAAAT
TTGGGAGCAGAGTATCTCTTGTCAGGATTAAGTGGCAAGTGTACCATGGAGAAGGCCCGTGAAATGGTCATGCAGGAGGT
GAGGAAGCAATTTAAGCCCGAGTTACTCAACAGGCTCGATGAGATTGTGGTGTTCGATCCTTTATCACACGAGCAGTTGA
GGCAAGTCTGCCGTCACCAACTGAAAGATGTGGCAAGCCGTTTAGCTGAGAGGGGTATTGCTTTGGGTGTTACAGAGGCC
GCCTTAGATGTCATACTTGCTCAGAGTTATGATCCGGTGTATGGTGCAAGGCCTATTAGGAGGTGGTTGGAGAAGAAAGT
TGTAACGGAGTTATCAAAGATGCTTGTGAAGGAGGAGATTGATGAGAATTCGACCGTGTACATAGATGCTGGACGTGGCG
GAAAAGATCTAACATATAGGGTGGAGAATAATGGAGGGCTTGTGAATGCTGCTACTGGTCAAAAATCTGATGTACTGATT
CAGCTACCTAATGGGCCAAGGAATGATGCTGCTCAAGCAGTGAAGAAAATGAGGATTGAAGAAATAGATGACGAAGATGA
TGAAATGGCAGATTAA
No homologs available
| # | RetrogeneDB ID | Identity (%) | Coverage (%) | ORF conservation | Expression evidence | RDV |
|---|---|---|---|---|---|---|
| 1. | retro_slyc_4 | 91.42 | 81.89 | Please wait, loading  | Please wait, loading | Please wait, loading |
Download FASTA sequences of all Solyc03g115230.2 retrocopies