Parental gene: | TCM_007148 |
| Aliases: | None |
| Description: | Monovalent cation:proton antiporter, putative |
| Organism: | Cacao (Theobroma cacao) |
| Coordinates: | 2:5524172..5538475(+) |
>TCM_007148
ATGGCATTTAGTAATTTAAGCTCGTCCACCACCGGAATGGAAGGTCAAGGCATCGTGGAGGAGATCTGTCTTAAATTTCC
TCCCAAAGTCAGCTCTCCAGGCTTGGCTGCATACATCTTGAGCAACGAACAAAATGAAAAATTCACAGATTTTGCTGCGC
CAAGACTTCATTTCCAGATGATTGTCATTTTTGCTCTCACTCAAATTATTCATTATCTGCTTAAACACCTGGGATTGCCA
ATTTTCATCTCCCAAATTCTTGCAGGGATATTACTCGGTCCTATGGTTTTCAAGGGTCATAATTCATTGGTTACAATGTC
AGAGGATAGTGTTCAGGTTCTCGGTACGGTGGCATCCTTGGGATATATATTCTTTTTGTTTTTAAGTGGGGTGAAGATGG
ACCTGAGCATGACATACAAAGCTGGAAGGAAGGCCGTCTGCATTGGTTTACTAACAGTGGTGGTGCCTCTGACATTTTCT
TTGATAACGGTTAAGGCCCTCAGCACAGACGAATTGTTTAAAAACAACAGTTTCTTTCTTGCAGTAACTTATTCCGGAAC
TTCATTTCCGGTCATACATTGCCTTCTCAGTGAGCTGAAAATCCTGAATTCAGAACTTGGCAGGCTAGGACTCTCAGCAG
CACTTGTCAGTGACATGGCGTCATTAGTTCTTATGAATCTCAGCCAATGGGTGAAGGTAGCGCAAGAAAAATCAGCAACA
CTGGTTCTCAAGGATTTTGGACTGGCTATAGCCTTTTTTTTAGTAGTGGCATTTGTGTTGCGACCGGGGATGAAATGGAT
GGTGAAACGCACGCCTGAGGGTGGCCAGATAAAAGATGTATTCCTTTATGCCGTCATTTTGGGGTTCATGTCGTCACCTA
GGATTACTGGAATCTTTAATATATTCCTTCTCTTTGGTCCATTTATCCTGGGATTGGCTGTCCCAGATGGACCCCCTTTG
GGATCTGCTCTGGTCGAAAAGTTGGACCCTGTTGTTTCAGGGTTGTTTTTGCCTTTGTTTGCATCAACATGTGGCATGAG
GATTGATTTGTCTTACCTCAAAGAGAGTAAGGAATATGCACAACACCAAGCAATTGCTGCTGTTGTAGCACTTATTGTCA
AATTTGGGGTCTCTCTAGCGCTGCCCTTATTATGCAAGATGCCCATGAGGGATTCTTTGGCACTTGCTTGTATAATGATG
TCCAAAGGAATTGTTGAGATGGCTTCGTATAGCTTCTTGAATGACAACATGGTTATATCTCAGGATGTATTCGCTTTCAT
GTCTATTATCATCGTTTTGTTAGCAAGCATTGTGCCACTGCTTGTGAAAAGACTCTATGATCCTTCGAGGAAGTATATAG
GCTACCAGAAAAGGAGCATCATCCATTCCAAGCTCAATGAGGAGCTGCGGATGATTGGCTGCATTCACGTACCGGGTAAT
GTCAATTCTATCATTAACATTTTGAATGCCTCCTGTCCAAACAGAGAAAACCCCATTGCTCTTGACGTCCTTCACCTTGT
TAAGCTCAGTGGACGTGCCACACCACTTTTCATTGCACATCAAAAGCACAAGAATACCCTGTCTAACAAATCTTACTCTG
AGAACGTTGTCCTAGCTTTTAATCAGTTTGAACGAGACAATTGGGAAGCTGTATCAGTGAATGTTTTCACCGCAGTCTCT
CCGCCAAATTTAATGTATGAGGATATATGCAATCTCGCCTTAGACAAGCTCACATCCTTTATACTGCTTCCATTTCACCG
CAGATGGTATATTGACGGAAGCATTGAATCTGAAGGCCAAGCCATCAGGAGCCTGAATTGTAGCATCCTAGAAAGGGCGC
CTTGCTCAGTAGGGATCCTTGTCGAAGGCCGCCGCCATCTAAAACGCTCCAATTCGAGAGACATATTATCTTCAGAATCA
TCATCATACAGCATCGCTGTGATTTTCTTAGGGGGTAAAGATGATAGGGAGGCGCTAGCGTTAGCCAAACGCATTTCCCA
AGGTCAAAGGGTTAACCTTACTGTTATTCATCTCAAAGCTACCAATGGTTTAGGCGCTGTCCTAAGTGATTCTGATAGAC
TTCTTGATGATGAGATGTTGAGGGGTGTTAAGGAAAGTGGATATATAAGATACGTAGATGAGCAAGTAAACGATGGGCCT
GAAACTTCATCGTTTCTTCGATCCATTGCGGATAACTACCAGCTTATCATTGTTGGGAGACGATACAACACGGAAGATCC
CCGAACTTTAGGTCTCGAGGAATGGAGTGAATTTCAAGAGATTGGAATCATTGGAGACCTGCTTTCATCTGCAGATTTTG
GTGGCAATTATTCTGTGTTGATTGTGCAACAACAACAACTAAGGGCTGCTTAA
ATGGCATTTAGTAATTTAAGCTCGTCCACCACCGGAATGGAAGGTCAAGGCATCGTGGAGGAGATCTGTCTTAAATTTCC
TCCCAAAGTCAGCTCTCCAGGCTTGGCTGCATACATCTTGAGCAACGAACAAAATGAAAAATTCACAGATTTTGCTGCGC
CAAGACTTCATTTCCAGATGATTGTCATTTTTGCTCTCACTCAAATTATTCATTATCTGCTTAAACACCTGGGATTGCCA
ATTTTCATCTCCCAAATTCTTGCAGGGATATTACTCGGTCCTATGGTTTTCAAGGGTCATAATTCATTGGTTACAATGTC
AGAGGATAGTGTTCAGGTTCTCGGTACGGTGGCATCCTTGGGATATATATTCTTTTTGTTTTTAAGTGGGGTGAAGATGG
ACCTGAGCATGACATACAAAGCTGGAAGGAAGGCCGTCTGCATTGGTTTACTAACAGTGGTGGTGCCTCTGACATTTTCT
TTGATAACGGTTAAGGCCCTCAGCACAGACGAATTGTTTAAAAACAACAGTTTCTTTCTTGCAGTAACTTATTCCGGAAC
TTCATTTCCGGTCATACATTGCCTTCTCAGTGAGCTGAAAATCCTGAATTCAGAACTTGGCAGGCTAGGACTCTCAGCAG
CACTTGTCAGTGACATGGCGTCATTAGTTCTTATGAATCTCAGCCAATGGGTGAAGGTAGCGCAAGAAAAATCAGCAACA
CTGGTTCTCAAGGATTTTGGACTGGCTATAGCCTTTTTTTTAGTAGTGGCATTTGTGTTGCGACCGGGGATGAAATGGAT
GGTGAAACGCACGCCTGAGGGTGGCCAGATAAAAGATGTATTCCTTTATGCCGTCATTTTGGGGTTCATGTCGTCACCTA
GGATTACTGGAATCTTTAATATATTCCTTCTCTTTGGTCCATTTATCCTGGGATTGGCTGTCCCAGATGGACCCCCTTTG
GGATCTGCTCTGGTCGAAAAGTTGGACCCTGTTGTTTCAGGGTTGTTTTTGCCTTTGTTTGCATCAACATGTGGCATGAG
GATTGATTTGTCTTACCTCAAAGAGAGTAAGGAATATGCACAACACCAAGCAATTGCTGCTGTTGTAGCACTTATTGTCA
AATTTGGGGTCTCTCTAGCGCTGCCCTTATTATGCAAGATGCCCATGAGGGATTCTTTGGCACTTGCTTGTATAATGATG
TCCAAAGGAATTGTTGAGATGGCTTCGTATAGCTTCTTGAATGACAACATGGTTATATCTCAGGATGTATTCGCTTTCAT
GTCTATTATCATCGTTTTGTTAGCAAGCATTGTGCCACTGCTTGTGAAAAGACTCTATGATCCTTCGAGGAAGTATATAG
GCTACCAGAAAAGGAGCATCATCCATTCCAAGCTCAATGAGGAGCTGCGGATGATTGGCTGCATTCACGTACCGGGTAAT
GTCAATTCTATCATTAACATTTTGAATGCCTCCTGTCCAAACAGAGAAAACCCCATTGCTCTTGACGTCCTTCACCTTGT
TAAGCTCAGTGGACGTGCCACACCACTTTTCATTGCACATCAAAAGCACAAGAATACCCTGTCTAACAAATCTTACTCTG
AGAACGTTGTCCTAGCTTTTAATCAGTTTGAACGAGACAATTGGGAAGCTGTATCAGTGAATGTTTTCACCGCAGTCTCT
CCGCCAAATTTAATGTATGAGGATATATGCAATCTCGCCTTAGACAAGCTCACATCCTTTATACTGCTTCCATTTCACCG
CAGATGGTATATTGACGGAAGCATTGAATCTGAAGGCCAAGCCATCAGGAGCCTGAATTGTAGCATCCTAGAAAGGGCGC
CTTGCTCAGTAGGGATCCTTGTCGAAGGCCGCCGCCATCTAAAACGCTCCAATTCGAGAGACATATTATCTTCAGAATCA
TCATCATACAGCATCGCTGTGATTTTCTTAGGGGGTAAAGATGATAGGGAGGCGCTAGCGTTAGCCAAACGCATTTCCCA
AGGTCAAAGGGTTAACCTTACTGTTATTCATCTCAAAGCTACCAATGGTTTAGGCGCTGTCCTAAGTGATTCTGATAGAC
TTCTTGATGATGAGATGTTGAGGGGTGTTAAGGAAAGTGGATATATAAGATACGTAGATGAGCAAGTAAACGATGGGCCT
GAAACTTCATCGTTTCTTCGATCCATTGCGGATAACTACCAGCTTATCATTGTTGGGAGACGATACAACACGGAAGATCC
CCGAACTTTAGGTCTCGAGGAATGGAGTGAATTTCAAGAGATTGGAATCATTGGAGACCTGCTTTCATCTGCAGATTTTG
GTGGCAATTATTCTGTGTTGATTGTGCAACAACAACAACTAAGGGCTGCTTAA
No homologs available
| # | RetrogeneDB ID | Identity (%) | Coverage (%) | ORF conservation | Expression evidence | RDV |
|---|---|---|---|---|---|---|
| 1. | retro_tcac_7 | 90.52 | 100.00 | Please wait, loading  | Please wait, loading | Please wait, loading |
Download FASTA sequences of all TCM_007148 retrocopies