Parental gene: | TCM_025075 |
| Aliases: | None |
| Description: | IBR domain-containing protein isoform 1 |
| Organism: | Cacao (Theobroma cacao) |
| Coordinates: | 5:30504852..30516731(+) |
>TCM_025075
ATGGAATCGGAGGATGATATCGATATGCACGACGCCAACAACGAATCGGGGGAAGACGATTTCTACAGCGGCGGCGACGA
TGATGCTGGAGCCATGGCTGCTTACGATGATTCCGATGCCGATGTCGCTGATTATGAGTTCATCGACAACGATTCTGATG
ATTCTGATGACCTTGTCTCTCATCGATACCAGCAAAATTATACCGTTTTGAGCGAAGTAGATATTTGTCAGCGTCAAGAG
GATGATATTATGAGGGTATCTACTGTACTTTCCATCTCAAAGGTTGAAGCAGGCATCCTGCTACGCTACTATAATTGGAG
CGTCAGTAAGGTACATGATGAATGGTTTGCAGATGAGGAAAAGGTTCGCAGGTCTGTTGGTTTGTTGGAGAAGCCTGTAG
TCCCATTTCCAGATGGTAGAGAAATGACTTGTGGGATATGTTTTGAAACATATCCTTATGATCGGCTACACACTGCTGCA
TGTGGTCATCCTTTTTGTAACTCTTGCTGGGCAGGTTATATTAGCACATCCATCAATGATGGTCCTGGATGTTTGATGTT
GCGATGTCCTGATCCATCCTGTGCTGCTGCTGTTGGTCAAGATATGATAAATGTATTGGCTTCTGATGAGGACAAAGAGA
AATATTTTCGTTATTTCATTAGATCCTATGTTGAAGACAATAGGAAGACCAAATGGTGTCCTGCACCAGGCTGTGATTAT
GCTGTGGACTTTATTTTGGGCAGTGGAAGTTATGATGTTACTTGTCGCTGCTCTTATAGCTTTTGCTGGAATTGCACTGA
GGAAGCTCACCGTCCTGTTGATTGTGGCACTGTAGCCAAGTGGATACTGAAAAACAGTGCAGAGTCTGAAAATATGAATT
GGATATTGGCTAATTCCAAGCCTTGTCCAAAATGCAAGCGCCCGATTGAGAAGAACCAAGGGTGTATGCATATTACATGC
ACACCACCTTGTAAATTTGAATTTTGCTGGCTTTGCCTTGGTGCATGGTCAGACCATGGTGAGAGAACTGGTGGATTTTA
TGCTTGCAACCGTTACGAGACAGCAAAACAAGAGGGTGTGTATGATGAGGCTGAGAAACGAAGAGAGATGGCTAAAAACT
CTCTAGAGAGATATACTCATTACTACGAACGATGGGCAACCAACCAATCATCTAGGCAAAAGGCACTGGCAGATCTACAG
CAAATGCAGACCGTGCATCTTGAGAAGCTGAGTGACAGACAGTGCCAACCTGAGTCACAGCTGAAGTTCATCACTGAGGC
ATGGCTACAGATAGTAGAATGTAGGAGAGTTCTGAAATGGACATATGCCTATGGATATTATTTACCAGAACATGAACATG
CTAAAAGACAGTTCTTTGAATACTTGCAAGGTGAGGCCGAGTCTGGGTTAGAACGACTTCACCAATGTGCAGAGAAGGAG
CTACAGGTTTACCTCAATGCAGAGGGCCCATCAAAAGATTTTAATGAGTTTCGGACAAAACTTGCTGGATTGACAAGTGT
GACTCGAAATTACTTTGAGAATTTAGTTCGAGCTCTAGAAAATGGTCTATCGGATGTGGACTCCCATGGTGCCTGCAGCA
GGATGGGGAGCTCAAAGAGCTTGGGAGGTGGTAGCAGTAGGGGAAGAAGTGGGAAGGCAAAAGGTTCAACCTCCAGATCC
AGTGGCTCTAGCAGAAATATTGACGATTCAGGCCATTGGTCCTGTGAATATTGCACCTATGCAAATGTCAAGTCTGCCAC
CATTTGCCAAATGTGCCAGCAGCGTCGATAA
ATGGAATCGGAGGATGATATCGATATGCACGACGCCAACAACGAATCGGGGGAAGACGATTTCTACAGCGGCGGCGACGA
TGATGCTGGAGCCATGGCTGCTTACGATGATTCCGATGCCGATGTCGCTGATTATGAGTTCATCGACAACGATTCTGATG
ATTCTGATGACCTTGTCTCTCATCGATACCAGCAAAATTATACCGTTTTGAGCGAAGTAGATATTTGTCAGCGTCAAGAG
GATGATATTATGAGGGTATCTACTGTACTTTCCATCTCAAAGGTTGAAGCAGGCATCCTGCTACGCTACTATAATTGGAG
CGTCAGTAAGGTACATGATGAATGGTTTGCAGATGAGGAAAAGGTTCGCAGGTCTGTTGGTTTGTTGGAGAAGCCTGTAG
TCCCATTTCCAGATGGTAGAGAAATGACTTGTGGGATATGTTTTGAAACATATCCTTATGATCGGCTACACACTGCTGCA
TGTGGTCATCCTTTTTGTAACTCTTGCTGGGCAGGTTATATTAGCACATCCATCAATGATGGTCCTGGATGTTTGATGTT
GCGATGTCCTGATCCATCCTGTGCTGCTGCTGTTGGTCAAGATATGATAAATGTATTGGCTTCTGATGAGGACAAAGAGA
AATATTTTCGTTATTTCATTAGATCCTATGTTGAAGACAATAGGAAGACCAAATGGTGTCCTGCACCAGGCTGTGATTAT
GCTGTGGACTTTATTTTGGGCAGTGGAAGTTATGATGTTACTTGTCGCTGCTCTTATAGCTTTTGCTGGAATTGCACTGA
GGAAGCTCACCGTCCTGTTGATTGTGGCACTGTAGCCAAGTGGATACTGAAAAACAGTGCAGAGTCTGAAAATATGAATT
GGATATTGGCTAATTCCAAGCCTTGTCCAAAATGCAAGCGCCCGATTGAGAAGAACCAAGGGTGTATGCATATTACATGC
ACACCACCTTGTAAATTTGAATTTTGCTGGCTTTGCCTTGGTGCATGGTCAGACCATGGTGAGAGAACTGGTGGATTTTA
TGCTTGCAACCGTTACGAGACAGCAAAACAAGAGGGTGTGTATGATGAGGCTGAGAAACGAAGAGAGATGGCTAAAAACT
CTCTAGAGAGATATACTCATTACTACGAACGATGGGCAACCAACCAATCATCTAGGCAAAAGGCACTGGCAGATCTACAG
CAAATGCAGACCGTGCATCTTGAGAAGCTGAGTGACAGACAGTGCCAACCTGAGTCACAGCTGAAGTTCATCACTGAGGC
ATGGCTACAGATAGTAGAATGTAGGAGAGTTCTGAAATGGACATATGCCTATGGATATTATTTACCAGAACATGAACATG
CTAAAAGACAGTTCTTTGAATACTTGCAAGGTGAGGCCGAGTCTGGGTTAGAACGACTTCACCAATGTGCAGAGAAGGAG
CTACAGGTTTACCTCAATGCAGAGGGCCCATCAAAAGATTTTAATGAGTTTCGGACAAAACTTGCTGGATTGACAAGTGT
GACTCGAAATTACTTTGAGAATTTAGTTCGAGCTCTAGAAAATGGTCTATCGGATGTGGACTCCCATGGTGCCTGCAGCA
GGATGGGGAGCTCAAAGAGCTTGGGAGGTGGTAGCAGTAGGGGAAGAAGTGGGAAGGCAAAAGGTTCAACCTCCAGATCC
AGTGGCTCTAGCAGAAATATTGACGATTCAGGCCATTGGTCCTGTGAATATTGCACCTATGCAAATGTCAAGTCTGCCAC
CATTTGCCAAATGTGCCAGCAGCGTCGATAA
No homologs available
| # | RetrogeneDB ID | Identity (%) | Coverage (%) | ORF conservation | Expression evidence | RDV |
|---|---|---|---|---|---|---|
| 1. | retro_tcac_20 | 56.31 | 54.53 | Please wait, loading  | Please wait, loading | Please wait, loading |
Download FASTA sequences of all TCM_025075 retrocopies