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Detailed information on CNT0001141


BLAST search results

BLAST vs PNRD: nothing found

BLAST vs Swiss-Prot:
sp|Q53YF3|SPC3B_ARATH, E-value = 2e-29

BLAST vs NONCODE (A. thaliana): nothing found

Potential orthologs: nothing found

Most similar lncRNAs:
CNT0006427, E-value = 3e-12 (V. vinifera)

Expression of CNT0001141

Peptides detected in this lncRNA

>peptide 1 (38 aa)
MTMNISANLQSLFTWNTKQVFVFLAAEYETPKKPLNQV*

>peptide 2 (68 aa)
MLQISLCLSFPFFFFFRVYGSNLRGKEFNLTMHWHVMPKTGKMFADKIVMPGYRLPEEYRRSLHLLMY*

>peptide 3 (31 aa)
MKNFSVLLCSLALDRTFSLFFLRNVSDIIFL*

Sequence

>CNT0001141
GTGTGGGAGGGAGAGAGTACTAGAGTTGCTTCTGCTTCTGGATAGTAGCAGCCAGAGAGAGCTAATGCTTTGTTAACCTTCGCCATAACCCTTCTGGCCG
CCATGGCTTCTCTCTCCGACAACCTCAATTCCCCCACTCCCTTTCTGCATGTTCAGATCTGTAATCCTCTCATTCCTTAACCTAACATCATTTCATCTTG
TCTCTGTATTGGTTTCATAAACACCCCAACGGCGACGACGAGGTCAGCATGACAATGAATATATCAGCAAATTTGCAGTCTCTTTTCACATGGAACACAA
AACAGGTTTTTGTATTTTTAGCTGCTGAGTATGAAACCCCTAAGAAACCCTTGAATCAGGTTTGATTTGATCTGTTTGTTTGCATCTTAGCTTTGATATT
TAAATAATTTGAGGTCCATTTCAAAAGGGGGAGAACAAAAGGAAGCCATGGTCCTTTGCGCTTCATTATTGCATGTTGTGTTGCATCTTTCTCCTACATT
TCAAGCTTTGCTATATGGTATCTCGTAGCTGTTGCTTATGCTTTTAGGATGCCAATTTATAGATATCGCTGTGGGATGGTATAATTCCTTCAAAAGATCA
TGCTAAGTTTTGGATTCATACATCCAATAAGTACCGCTTCATTGATCAGGTACAAAACTCTTCAAGGATGCAATTGCTAGCATAAATGCTTCAGATTTCT
TTATGCCTTAGTTTTCCCTTCTTTTTTTTTTTCCGTGTCTATGGAAGCAATTTGCGCGGTAAAGAATTTAATTTGACAATGCACTGGCATGTTATGCCCA
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TAACTTTAACCTTTTCTATGATTAGTTGGAGTATTATGTTGGGAAAAGGTTAGCCAAAAAATTGCAATTTGGGAAAAGTTTGGCAAAAGTTAAAATGAAA
ATAGTTGGAGTATTATGAAAAATTTCAGCGTGTTATTGTGTTCTCTTGCGTTGGACCGAACATTTTCTTTATTTTTTTTAAGGAATGTTAGTGATATTAT
CTTTCTATGATTAGTTGGAATTAATTGGAAACCAC