Detailed information on CNT0002066 (Glycine max)


BLAST search results

BLAST vs PNRD: nothing found

BLAST vs Swiss-Prot:
sp|Q9USZ5|TRS20_SCHPO, E-value = 7e-15

BLAST vs NONCODE (A. thaliana): nothing found

Potential orthologs: nothing found

Most similar lncRNAs:
CNT0021733, E-value = 7e-17 (A. trichopoda)

Expression of CNT0002066

Peptides detected in this lncRNA

>peptide 1 (35 aa)
VLIQDRFGTNSLKHLGHLGLRTEPVKVVQFGSGFE*

>peptide 2 (38 aa)
MYLKSVDRFNELVVSVYVTAGHILYTWDYFIVEIKRIA*

>peptide 3 (55 aa)
MLLHDSRNDDGIKSFFQEVHELYIKTLLNPLYLPGSRITSSHFDTKVRALARKYL*

Sequence

>CNT0002066
GTTTTAATTCAGGACCGGTTTGGAACCAATTCTCTAAAACACTTGGGACATTTGGGTTTAAGAACCGAACCTGTTAAAGTGGTTCAGTTTGGTTCGGGTT
TTGAATGAACTGATTTTTGCACACCCTAGTTTTAGGCTTTTAGCCCAGGCCACTCAATAAGGGGCTTAACAAAAACCCAAAAAACATGCATTTGTTCCTG
AATTTCTTGACGAATCCTAATTCCTAACTAATTCTACTCAACAGTACATTCAATCCACCGCTTTGTTCAACTCAAATCCTCAATCGCTCGCGATTTCTTC
TTCTGGAATTCTCAAGGATCTCGATAAATGGCAACCACTGCCTGTTTCATCATTGTTAGCAGAAATGACATTCCTATATATGAAGCTGAAGTTGGAGTAG
CTGCTAAACACTAAGCAAGGGATTATTGTATTCTTCACCAAATTTACATCATTTTGCAATTCCATGCTACCTTGAGACAGAGGGAGGATTCTGCTCAGCT
GCATCAATTTATCCTTCATGCTGCTCTCGATATTGTTCAGGACCTTGCATGGACTACTAGCGCTATGTACTTGAAATCAGTAGACAGGTTTAATGAACTT
GTGGTGTCAGTGTATGTTACAGCTGGTCATATCCTTTATACATGGGATTATTTTATAGTTGAGATAAAAAGAATTGCATAGCTCTTGTTTGTTCACTTTT
TTTTAATCTTGTTTTTCCAAATAAATGAAGTACCGATACCCAACTTTAAGGACCAATCAATTTAGTTAGCTTCATTAATTGTATAATTATGCCATTGTCA
CTGGCAGGGTAACAAAATAAAAGCACTTGGAGTGGAGAAGTCTTAAACTTAAAGCTTACAGCAAACACATATCTCTTTATGCCTTTTTTTTTGTGTGTGA
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ACATAAAGACTCTCCTTAATCCCCTGTACTTACCTGGCTCCCGGATCACGTCATCACATTTTGATACTAAAGTCCGAGCCCTTGCACGAAAGTATTTGTA
GAAACCACTAATTTGTCTGTGGTTGATAGTTCATATAGCACTGTGGCCCGACTCTTAACCTTGTTCGTTCTTGATTACATTTGAAAAGCTGTATTTCTTT
TTCTTTATTTCCATGATTTGGCGGCAAGAGTAGATTTGCTGCTGTCTATAATGTACCTCAGTCATTAGCAGGTGGTGCCTGTTTTTGCTAATGAAGGCGA
TTGTTGACGAGCTATTTAATTGCTAGTGGCTTCATTTGTGATACATATTAATCTTGTACTTAATGCTCAACTATTTGATCTTGTACTTTTCTTTCAATAT
TTACTATAAAAGATAGTAGGAGGATTTGTAGGA