Detailed information on CNT0002707 (Glycine max)


BLAST search results

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CNT0041776, E-value = 1e-17 (A. thaliana)

Expression of CNT0002707

Created with Highcharts 4.1.6Chart context menuExpression (RPKM)142.15131.857129.16714.39657.94993.13987.08989.47836.63356.4344.34849.66636.60722.34821.538leaves (SRR924099)leaves (SRR924144)leaves (SRR926169)seed (SRR639168)shoot apical meristem (SRR824155)shoot apical meristem (SRR824156)shoot apical meristem (SRR824157)shoot apical meristem (SRR824158)shoot apical meristem (SRR824159)shoot apical meristem (SRR824160)shoot apical meristem (SRR824161)shoot apical meristem (SRR824162)shoot apical meristem (SRR824163)whole seed (SRR639162)whole seed (SRR639164)0102030405060708090100110120130140150

Peptides detected in this lncRNA

>peptide 1 (41 aa)
MHVLFKFLPVYLKCLLRTYSKQKPRVVSSIWPSYFECCIVF*

>peptide 2 (31 aa)
MLGGVHQYSAACCDFLMHNFTVYRNCEAILL*

>peptide 3 (30 aa)
MSTSIFNSIIIHVIYLRQFTCSTFNLKQCY*

>peptide 4 (36 aa)
MDLIQIYTPMVVLAGSFIDLVRRGSDLRYRGTTENR*

>peptide 5 (31 aa)
MPFIITYLSLHSVLRLWIRGYIRGFAPTPIE*

>peptide 6 (37 aa)
MLHCFLMYFNFHLQFTNHICYLFEVDSPIYKFVTCML*

>peptide 7 (83 aa)
MAGQKMLIKKVLLVWGEIARGLPGVSSSCVVWCLLCSPFRYAFYYYLSVAPLRITTLDQRIHQRIRSNPYRVRYYLSIYIRKG*

>peptide 8 (35 aa)
HSAPPRLQSFRYSLIHPSLLNNPDLFLPFSPSRFS*

>peptide 9 (73 aa)
MLLSSRFFFHLIKLHIFALNLNLLIDLFKQHNVACFPRYFLSTYRCWNFPKGSQRHYPCLNLFRYFFSVCYCQ*

Sequence

>CNT0002707
CTCATTCAGCGCCTCCTCGTCTTCAATCCTTTCGTTATTCTCTTATTCATCCTTCTCTTCTGAATAATCCAGATCTCTTTCTGCCCTTTTCTCCGTCACG
CTTTTCGTGACCGGATCTGTATGGATTTGATCCAGATCTACACGCCGATGGTGGTTTTGGCCGGGTCTTTCATAGATCTGGTGCGTAGAGGCTCAGATCT
ACGGTACCGAGGTACAACAGAGAATCGATGACAAGAACGCAGATCCGACGGTAGATCCAGCCGATTCCGCTTGTTCGATCGCTACAGACCCCTGTATCGG
ATCATTAAGCAGCGTGTCTCGCGCGTTCTACACGTGTTGCCGATCTCGGATGTTGTAAAATTAGTTTATGATGTGAAGCTATGGAGTGGAAAATATGTGG
ATGTAGGAGATTTCGGGATGAATGGCCTCAAAACGCTTTGTCGTTTGTGGTTATTGAGTCCTGAGTGATCTTGTCATCCGACCTTTGCCATGACAGGTGC
GCTTGCATGGCAGGTCAAAAAATGTTAATAAAAAAAGTTTTATTGGTTTGGGGAGAGATCGCACGGGGGTTGCCCGGGGTCTCTTCCTCTTGTGTGGTGT
GGTGTTTGCTGTGCTCTCCTTTTCGTTATGCCTTTTATTATTACCTATCTGTCGCTCCACTCCGTATTACGACTCTGGATCAGAGGATACATCAGAGGAT
TCGCTCCAACCCCTATCGAGTAAGGTATTATCTGTCAATTTACATTCGAAAGGGTTAGGCTATTGAATTTTAAATAATTACAGATAAAATAATCGATAGC
TTTGATTTTAAAAATTAATCATAATCATCGGTTAGGTTGCAACATAATACTTAATTCGCTTAATTTTTTAACTGCGCCTCAGAGTATTCATAACATATTC
TATTAAATTAATAAGCTGGTGATGTAATTAATATTAATATGTAGTTTTGGCAATCTTATTGGCAGAAGATGCTAGGTGGAGTTCATCAATATTCTGCTGC
CTGCTGCGACTTCCTTATGCATAATTTTACTGTTTATAGAAATTGTGAAGCTATACTGTTGTAATTGTCATGTAAATTGTTCCCTTTTTCATCTTACTTG
ATTTGGTAAACTCCGGTTACTTGTATCCAAATAAGATGGGCCATTTGTATTGCGGGGGCTTTGTATAATTGTACAATTATCTACTTGTAAGAAGTTCAGA
TTCGGGCGACAACATTTGTAATGCAGAATTAGGTCATTAACATTGTAAATCTTCTGGCGATGATTGGAATATCAATGTGAAGACGCTATATGACTTCTGC
TATGACAATATCATTGTGGTTGTCAAGGTATTTTTGAAGAAATATCGTGGATTTACAAAGAATCTGGTTAGGCTTCTACAATTCTTTAAGGTGAAGATAA
CTTCGGCTCTTTACACAAGCATAGAATGATATTTTTTCTTGGTATCAAGTTATTCAGTATGTATGTTTGTTTGTTTTAATTCCCTTGTGCTGCAATTATT
TTGATATTTCTGCTGCGATTATTCAGTATAATTAAGTTATTCAGCGTATATTCAGTTATTTAGTACATTGTTATTCAGTATACATAATTATTCTTTGTAT
ATATATAGTTATTCTGTAGTTTACATAGTAATTCTGTATAGTATAAATGGTTTTTTCTGTTTTCTATACAGTTATTTTGCTGCGATTTGTATACTGATTA
AATTAATGCATGTTCTGTTTAAGTTCTTACCTGTATACTTGAAATGCTTATTGAGAACCTACAGTAAACAGAAGCCCAGAGTAGTATCTTCGATTTGGCC
ATCCTATTTTGAATGTTGCATTGTTTTTTAATGTATTTCAACTTCCATCTTCAATTCACTAATCATATATGTTATCTATTTGAGGTTGACTCGCCGATTT
ATAAATTTGTTACCTGTATGCTTTAAAAGCTTATTGAGAACCACAGAAAACAGAAGCCCAAAGTATCTTCGATTTGAAGTTCCTATTTTGATTGTTGTAC
TGTTTTTTAATGTATTTCAATTTCGACTACCATTTTCAACTCACTAATCATTTTTGTTGATGACTTGCCGATTTATATATTATTACATGTTCTTTTTTTA
CAAGTTCTTACCTGTGTAGTATTGCTTATTGAGAACCACAGAAATCTTCGATTTGAAGTTCCTATTTTTGAAGGTTCAACTGTTTTTTAATGTATGTCAA
CTTCCATTTTTAATTCAATAATCATTCATGTTATCTACTTGAGGCAGTTTACATGTTCTACTTTTAATCTGAAACAATGTTACTGAGTTTTAAAATAGTG
TACCTGTTCCAGTAAATATAGTAGTGTTTATTTATTGTTATATTATTTTACGTATGATGTCAATAATGTGTAATGTATTTTTATTGATATAATAATTTTT
ATAGTGTTACGAGACACAATAAAAAGTCATTACGTTAAGGATTTATAGTGTCATAGATGTTTGGATAAAAATAATTCTCCTTCAAGTACAAGTTATTTAA
GGACAGGATGATATTAATGTTTTATTTCGGTCCTCTTTATCTCCATGTCAGTGTTAATTTCATTTAATCTCAGTTTTTAAAGTTTATATGAAGTAATGGA
ATTTTAGATACTTTTTAATTTTTTAAATGATAAAATGTTTTGGACGACAGGACAATATGGATGTTTTATATAGATAAATCCATGTCAAAGTTAATTTCTT
TTAATCACAGTTTTAAATTTTATATGAAGTAATGGAATTTTAAATATTTAAAAAAAATTATGTTTTTTGGTTGTTTTTTTGCATCTGATAAAGCTATACA
TATTTTAGCTCTTAAATCTGAATTTGTTAATTGACTGTTTAAGCAACACAATGTTGCTTTCTTCACGTTTTTTTTTTCATCTGATAAAGCTACATATTTT
CGCTCTTAATCTGAATCTGTTAATTGACTTGTTTAAGCAACACAATGTTGCTTGCTTTCCACGTTATTTTTTAAGTACTTATCGGTGTTGGAATTTTCCT
AAAGGTTCCCAGCGCCACTATCCGTGTCTTAACCTTTTTCGTTATTTTTTTTCAGTTTGTTATTGTCAATAAAACAGGTTTGTACACAATGGATATTTCG
ATAAGCGAGTATATTTTTGTAAGAAATTCGCCAGGATTTGTGTTTTTTTTATTATAAAAATTGGTCTTTATATATTGTACAATTTTTTCCAGAGGGTCTA
AATGCATGAGTAGGTTTGTTTGAGAGAAGTTATTTTAGCTCTAAATTTGTATATCTGTTGGTGCATCTTTATTTTTAATAGCAAATTTCATGGTTTGTAA
TTATTGTATATTCGTTGATAGATCTGTAAGCTCAAAACGGTAGAGCGATCAGAGCATTTGTCCACTGACATGCTCTGGTAGGATGGTGGTTCGAATCCAC
CCAGATCTGCATGTTGAATAGTAATAAAGAAAAAAAAAATGAGGAGCGAAAATAGAATATAAGTGTGCTATTAAATTTAGATGAATAGAGTTATGTAACA
GGTAATCTTTCTGGTTGTTTATATCTGAAAATTAATTAGAATACATGTAGAAAGTGTAATTTTAGTAACCATGTAAGATTAATTTTTCAGGTTAACAACA
TGGTATGAAAG