Detailed information on ENST00000475922

lncRNA-RNA interactions

Number of interactions: 3

Potential function Interacting transcript Gene description Transcript biotype lncRNA id Alignment score (LAST) Alignment length Transcript region involved in interaction Genomic orientation of interacting RNAs
TCONS_00192320 TXK tyrosine kinase novel protein coding ENST00000475922 872 398 UTR5 Trans
TCONS_00192322 tec protein tyrosine kinase novel protein coding ENST00000475922 872 398 UTR5 Trans
TCONS_00193640 hematopoietic prostaglandin D synthase novel protein coding ENST00000475922 557 271 UTR3 Trans

Sequence

>TCONS_00193640 (5431 nt)
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CCAGCCTGGGTGACAGAGTAAGACTCCATGTC

Expression



Full and truncated open reading frames discovered in TCONS_00193640

In silico ORF/peptide predictions
Nothing found.


RiboTaper predictions from Ribo-Seq data (HEK293 cell line)
Nothing found.

BLAST search results

No hits found.