Detailed information on ENST00000518876

lncRNA-RNA interactions

Number of interactions: 3

Potential function Interacting transcript Gene description Transcript biotype lncRNA id Alignment score (LAST) Alignment length Transcript region involved in interaction Genomic orientation of interacting RNAs
ENST00000498813 delta(4)-desaturase, sphingolipid 1 processed transcript ENST00000518876 517 287 noncoding Trans
ENST00000620139 melanoregulin protein coding ENST00000518876 500 311 UTR3 Trans
TCONS_00116668 desmoglein 3 novel protein coding ENST00000518876 517 286 UTR3 Trans

Sequence

>TCONS_00116668 (3967 nt)
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AAACAAACAATTTTAAGAATTATTTGGTCTGAAGATGTTTTACTTTAAATAAATGTCTATTGTAATGG

Expression



Full and truncated open reading frames discovered in TCONS_00116668

In silico ORF/peptide predictions
Nothing found.


RiboTaper predictions from Ribo-Seq data (HEK293 cell line)
Nothing found.

BLAST search results

No hits found.