Detailed information on ENST00000593427

lncRNA-RNA interactions

Number of interactions: 3

Potential function Interacting transcript Gene description Transcript biotype lncRNA id Alignment score (LAST) Alignment length Transcript region involved in interaction Genomic orientation of interacting RNAs
ENST00000475187 THO complex 5 retained intron ENST00000593427 545 281 noncoding Trans
TCONS_00109011 trans-golgi network vesicle protein 23 homolog C (S. cerevisiae) novel protein coding ENST00000593427 544 278 UTR5 Trans
TCONS_00203663 ribosomal protein L3 pseudogene 6 novel protein coding ENST00000593427 502 285 UTR3 Trans

Sequence

>TCONS_00203663 (4257 nt)
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GTTACAGTGTACAATGCATAAGCAACATAATAAATTATATATCTGGTGAACAAATGGA

Expression



Full and truncated open reading frames discovered in TCONS_00203663

In silico ORF/peptide predictions
Nothing found.


RiboTaper predictions from Ribo-Seq data (HEK293 cell line)
Nothing found.

BLAST search results

No hits found.