Detailed information on TCONS_00030995

lncRNA-RNA interactions

Number of interactions: 1

Potential function Interacting transcript Gene description Transcript biotype lncRNA id Alignment score (LAST) Alignment length Transcript region involved in interaction Genomic orientation of interacting RNAs
ENST00000512143 platelet-derived growth factor receptor, alpha polypeptide protein coding TCONS_00030995 559 272 CDS_UTR Trans

Sequence

>ENST00000512143 (2654 nt)
GGTCCTACCCGGAAGCGCGCCCGGGCTCCTGCAGGCGGGGCGCTGTGCGCGCCGCGATCCGGTACGTGGGCCTCCGGGCTGTCCCCTCTGGGGGCGGCGA
TCCTCCCTCCGGAGCCCCCCTTCAACCCTCCCGGAAGTGAGCATTTGCAGGACCAGGGATGCTGTGCTGCTCTCCCATGAGCCAGTCACCGAGTCGGTCT
GCTGCAGCCCTTTCTGAACCTCTGGCCGTCTGGATGCTCCACTGTGCTTGCCAAGATGAAGTGCGTCTTGGTGGCCACTGAGGGCGCAGAGGTCCTCTTC
TACTGGACAGATCAGGAGTTTGAAGAGAGTCTCCGGCTGAAGTTCGGGCAGTCAGAGAATGAGGAAGAAGAGGTTGGCCTCTTGATGCTCTGAGCTCGGT
GACCCCACCCCCACACCCCACCAGTCCTCTCTGGACTAAATGAGGGCAAGAAGAAGTCGAATTTTATCACGTAACAGAAGAACTTGGAGCCATCAGTTTC
TGTAACCTAAAAAGTTTAACAAGGCTGGGCGCGGTGGCTCACGCCTGTAATCACAACACTTTGGGAAGCCAAGGTGGGCCAGTTGCTTGAGCTCAGGGAT
TTGAGACCAGCCTGGGCAGCATGGCGAAACCCTGTCTCTACAAAAAAAATACAAAAATTAGCCAGGTGTGGTGGTGCGTGCCTATAGTCCCAGCTACTTG
GGAGGTTGAGGTGGGAGGATCACTTGAGTCCAGGTGGTAGAGGCTGCAGTGAGCCGAGACTGTGCCCATGCATTCCAACCTGGGCGACAGAGCAAAAAAA
AAAAAAAAAAGTTTAACGTAAGCTGAACACGTTAATTTTTTAATAGCTGTATTAAGGTATGATTAACATACCATAAATTGCACATATTTAAAGTGCATAA
TTTGATAAGCTTTGATATGTATATACCTATGATTCTATCACAATCAATAAAAGGAATATATCTACCACCTCAAACATTTGTAATCCCTTCTTTCCCATCC
CCATCGCATAGGAACTGCTGATCTGCTTTCTGTCATGATAGATTAGTTTGTATCATATGGCCTTATATAAATGGAGTCATACAGTATGTGCTTGGATTTA
GTTTGGTTTTGGTTTGACTGCTTTCACTCAGCATAATTATTTTGTGATTCATCTGTGTTGTGGCATGTATCAATCGTTCATTCCTTGTCATTGAGTAGTA
ATCTATTGTATCAGGATGCCACCATTTGTTCATTCATTTACTTGTTGATGGACATCTGTGTTATTTTCAGTTTTTGACTATTACAAATAAAGCAACTATG
AACATGCACGTACAAGTCTATGTATACATGGATGCTTTCATGTCCAAGGACAGATACTTAGGATAGACTGGCTAGGTCATGTAGGTGTATGTGTAACTTT
TTAATAAACTGCCAAACTTTTCCAAAGTGGTTGTGTAATTTTTGATTCCACCTGTAGTGTTTGAGAGTTCAGTTCCTCCATATCCTCACCAACACTATAG
TCCGTCTTTTTAATTTTAGCCATTCTAATAGATGTTCACTAGAATCTCACTGTGTTTTAAATTTCATTTCCTTAATGACTAATGCTTTTGAGCATCTTTT
CATGTGCTTATTTGCCATATCTTTTGCCCAGTTTTTATTTGAGTTGATTGTTTCTTCTTCTTATTCTTACTGAGTTTTGAGAGCTTCTAATATATTTTGG
ATGGAATCCTTTATCAGATACATGTTTTACAAATATTTTCTTTCAGTTTGTGGCTTGTGTTTGTATTCTCAATGGTATCTTTCAAAGAGCAGAAGTATTA
GAACTCGAGTTTATCCATTTTGCATTTATGGATTATGCTTTTAGTGTTATATCTAAGAAATCTTTGCCCAACTTACAAAGAGTTTTCTCTACATATTCTT
TTGAAAGTTTTATAGTTTTAGGTTTTATATCAGGTCTGATGATCTACTTTGAATTTTTGTGTGTGGTATGAGCTATGGATTGAAGATAATTTTTTTTTTG
CATGTGGACATCCAGTTCAACAGTTTAACATTACAACTCAGAAATACTTGTCATTTTCACTTACATAATTTCCACTCTACATTTTAAAGGAGTAATTTAT
TTTGAAAATGTTTTCCAGATTAATTTTGGGTTAAAAATATTTTTACTGGGGATGCAGTGGAAGGTGTTCTTACATTTCTGCAGCATGGGCTGATTGCCTC
TCTGTCCCTTTCTGCTCTAAGGGGTCTCATCATCCAGCCAATGAGTGAGCTGACTCCACCTCAGGGAGTCCATTTACCATCAACATCACTCGTGTTCTCA
TCACAGTCTTTAGGCAAACACAAGATATCAGAGATCATAGACATTCAAGTGGTTTTATTTAAGCTAACTGTTAGGCTTTTTTATTTTTTAACAGTCAATA
CATATAATATTTAAATTAAGAATTTTTAAATATTTCAGTTTTTAAACTACTGTTACAACTATGTCAACTTAAGAAGCAAACTATTTGGTGGCCTTTCTCT
TCCTCTTTATTGAAAACCTGGCAAAGGAACGAACTCCTGAATTTTCAGTTCCTAAAAATGAGTAGTGTAAAGGAAAGGTGGTCTTTAAAGTTTTTTTTTT
TTGTTAATGTGCAACACATTCTTTTCTCATCATATAAATAATGAGTTAATTGTAG

Expression



Full and truncated open reading frames discovered in ENST00000512143

In silico ORF/peptide predictions
Nothing found.


RiboTaper predictions from Ribo-Seq data (HEK293 cell line)
Nothing found.

BLAST search results

No hits found.