Detailed information on TCONS_00181738

lncRNA-RNA interactions

Number of interactions: 9

Potential function Interacting transcript Gene description Transcript biotype lncRNA id Alignment score (LAST) Alignment length Transcript region involved in interaction Genomic orientation of interacting RNAs
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TCONS_00213738 enoyl-CoA delta isomerase 2 novel protein coding TCONS_00181738 510 297 UTR3 Trans

Sequence

>TCONS_00213738 (15643 nt)
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GATCTCAGTTCACTGCAACCTCTGCCTCCAAGGTTCAAGTGATTCTCCTGCCTCTACCCCCTAAGTAGCTGGGATTACAGGTGTGCACCACTACACTCGG
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TCCTCCTTTTCAAAAGAAATATTTTAATATTTTAATGCTATTGCATATCATAGAGCATAAAGATTTTTTTGGCTGATAAATGAGCATTTGAGTATTGTTT
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GAATGGGACTCAGTGGTCACAAGCCTTCCTGGTGATTCTGATGCATGTTCAAGTTTGAAATATACTGGGCTGGGGTATTCTCAAAAAAGTGCAACCAGGA
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GTTTTTACACTTGGTAAAAATTTGGAAGTGTTTCAGATAGTGAAGAAAAAAAAGAATTAAGAAAAACATTCCAGGCCAGGTACAGGCTCATGCCTGTAAT
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CTATTTGCCAAGAGTGTTCTAGGTGCTATGTTTGATTTAGGAGGTATAATTCAAACATGAGAAGTAGGAAAAGATCCCTCAGATCCCTGTCCTCAGAAGA
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AGCTGTTTTTATTGTCAACAATCTTATAATTAAATATATCTGCAAAATATAAATATAAAACAAGTAGTCTTTATTATCTGGAAATAAATGTGAAGAGCAT
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ATCGATGTATTCCAAGAGTGTGGAAATAAAGAGAACTGAGATGGAATTCAAGAGAGAAGTGTCTCCTCCTCGTGTAGCAGCTTGAGAAGAGGCTTGGGAG
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TGTAACCTTTAATCCTCCATATTCTCATGTCTGTCATCCCAGGGGTGTCACAACTGTAAAAATCTACAATATTAGAAAGCAGCTACTACAGATGTGGAAG
AGAGAACACTTGTATAAGACAATGCTGTACTGAAGTTATATAACAAGGTCCCCTGATACTTATGCCTGCATTACTTTGAGGGATGCTGAATGAGAGGACC
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TGCAAAGTTCTCAGTAATTTTCTCTCTGCAATCAAATTAGAGTTCATATTTAATTTGCAGATTCTCTCATTCATTGCTCCACACTGCTTTATCAAATCAG
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ATATGTGGCCAATATCAACCCTTCTCACCCAACCCAAACATGTTCTGGAGATAGAAGGACTTATCCTCAATTATATTCCAGTAAATTTATCTCCATAATC
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TCAGCTCTTCCCTCTCTGTTTCCCTTTTGCCCACATTGCAAATAGTCTTCATAATAGAACCCTCACTGCAACTTAAAAGGGTCCCATTTCTTAACTCAGC
ATTTCATATACCAAGAACACTTGCAAAGATTTCTTCATAATGTGATTTTTTAATTTTTCAGTTCCAGAAGCATTTCCTACAGTTCGAACGTTATTTTTTC
TCTCAGATTTTCAACTTGAAGCTTTGATTTGCACTGAATTAACTTGGATAAAATTTTAGTTTCTCTCTTCAGCTAACAGATTTGGAAGCAAATTACAGTA
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AAAGCCCCCCCTCCCCCCGGGAAACCTCTGTGGGACTCATTAAGAGGCTGGTGGCAGAACTTCCATTCCTGTGTCCTAAGAGTCATCATGAGCAGAAGAG
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TGAGAACTTACTGTATGGGCAAAATACAAAATCAAACATGCCCTACAATAGCACTTGTAAAAAGAATTTTACTCCTTTCCTTAACTCTTCTTCCCCTATC
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AGATGGTCTAAAACAAGACTAATATATCTCTACTGGGCATTTTAATCAGTGCTAACATAATTAAATATTTATACAGCACTTTGGGTTTGGGAACATTTTC
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GGGACCCAGTGGGAGGTAATTGAATCACAGGGGCAGTTAACCCTCATGTTCTCGTGATAGTGAGTAAGTCTCACGAGATCTGATGGTTTTATAAGGGGCT
CTTCCCCCCGTGGCTGGGCACTTCTCTTTGTTGCCGCCATGTATAAGAGGACGTGTTTGCTTCCCCTTATGCCATGATTGTAAGTTTCCTGAGGCATCTC
CAGCCATGCTGGACTGTGTGTCAATTAAAACTCTTTCCTTTATGAATACCCAGTCTCAGGTATGTCTTTATTAGTGTGAGAACTGACTCCTACATGTTAA
ACATGACTAATACATGTAAACATGTTACTTATTGACTAGTTGGGGTGTTTAAAAAATGATTTGCTAATTGGTCAGCACTAATCATGTAAACAAAATCATG
TAGTTGAAGCTGAACTACATATGCACAGCAAATTTTGCAAAGAGATCAGCAACTTGAAAGTGTGGATGAGTTAAGCAACCTGCATTCTAAAGTGGCTTAG
CACTATGGGTCTTTCTAGTGCCATTTTTAATGTGTGTAAGTACCTATTTTTAAAATTAATTTACTGTTTACTACGAAGAGGAAAGGAAAAATCACCTTAC
TGCTTGCCATTTTTCAGCAAAGGAAGTGTTCTAATTGCTCAATTCAGTAAAAAGGCTAATAGGGAAGGAGAACAAATAAATATCCTCAGAGGTTAAATCA
AAAAAACACCTGTTTCATTTGTGAACCTTTAATGTGTAGGCACAGAAGCAATTTTGGCAGCCATGCTATTAATCTGTAAGAGGCCATAAACTTGTCATGG
TGAGGACACTGCAAATTCAACTTGAATATACTTTGCTTTTCACATTAATGACATATAAGGACACTTAAGCCTCTCATCATCACTTTAGCACCTTGAGAAG
ACCAATGTTCTTGTTCTCCTCTCAAAGGACCATTACCACTTCAATGTGTGACTTGTCAATCCTTTGTGATACTAACCCCTAAAATTAAACTCTCTTGAAG
TTGAAGATGACAACAATTTCATTCCACCTGGAAAATTTAGAAGTATTCAAACCCTTCACTGTTGATTAAAATCAGATTCAAGCTCCATTTTCCTCAGGAA
AATGGCCAGGCTATTTGATAAAACATTAAAGAGAGAATGCTAACTCACAGACTAGATCTAGCAGTGTTGTGGTTGTGTGTTTGTTAGCTAAGTTAAACTC
TAGTGTCCTCTGATTTTACTTTATGCTCAAATCTCTTAACCTAG

Expression



Full and truncated open reading frames discovered in TCONS_00213738

In silico ORF/peptide predictions
Nothing found.


RiboTaper predictions from Ribo-Seq data (HEK293 cell line)
Nothing found.

BLAST search results

No hits found.