Detailed information on TCONS_00181738

lncRNA-RNA interactions

Number of interactions: 9

Potential function Interacting transcript Gene description Transcript biotype lncRNA id Alignment score (LAST) Alignment length Transcript region involved in interaction Genomic orientation of interacting RNAs
ENST00000439138 transmembrane protein 98 protein coding TCONS_00181738 535 291 UTR5 Trans
ENST00000463899 N-acetylneuraminate pyruvate lyase (dihy... processed transcript TCONS_00181738 515 292 noncoding Trans
TCONS_00011236 solute carrier family 35, member F3 novel protein coding TCONS_00181738 636 299 UTR3 Trans
TCONS_00030591 cytoplasmic polyadenylation element bind... novel protein coding TCONS_00181738 582 296 UTR3 Trans
TCONS_00057601 transcribed_unprocessed_pseudogene novel protein coding TCONS_00181738 589 292 UTR3 Trans
TCONS_00095053 epithelial membrane protein 2 novel protein coding TCONS_00181738 517 286 UTR3 Trans
TCONS_00116668 desmoglein 3 novel protein coding TCONS_00181738 528 301 UTR3 Trans
TCONS_00165341 TTC28 antisense RNA 1 novel protein coding TCONS_00181738 630 293 UTR5 Trans
TCONS_00213738 enoyl-CoA delta isomerase 2 novel protein coding TCONS_00181738 510 297 UTR3 Trans

Sequence

>TCONS_00181738 (15644 nt)
ATTATTATTTACATATGTATATATTATATAATATTATTTGTTTAATATTAGTAAACTAATTTTTTATATTAGTATATTTTAAAATTTCAAAAGAGGATCT<br />GAAATAAAAATGAAGACTTAATAAACTATCTGTTGCATTAGTTAGAATTATCAGGAAAAAGAAAAAAAAATGTTATATGGAATCTGCTGATACTAATTAA<br />CAGTTCCAGTCTGTCTTGTTAGTGATACTGTGCCCTGAAACCTTTGCCTCCTTGGACTTGATTTGGGAAAATACAGGGTAAAGATGTTCTTTTTTTCATA<br />GTTCCTTACATTTCTACATGAGATAAATCATGAAAATCTTTAAAAAGTGCTCAGTTTGTCCTTTAGCTACGTATATGCCTCATGGAAACTTGAGAATCTT<br />TATTCCCAACTGATTCCCTTATCAGCTTCCTCAGTTGATTATTAGTCATGTCTACCATTAGTTTTTCTTAGTTTTTTTTTTTTTTTTTTACTTGGTTTGA<br />TAGTTTAGAAAGTTTGAAGAGATTTGATAAGACACACAAGTTATGGACGTACAACTTGGAATACACAGCTTCAATTTCTTAAAGTGGTTTATTTTTCAAG<br />AATAATCTTCTGCTTTTACATCAGTAAATATTGATTGAGCCATTCACTGTTTACCCATTTGTGATAGATGCCTCCTGACCTGTGGAACCTTATGAGTTTA<br />CTGGATTCTGCCAATGAAAGCACTAGTGTCATAATCCATTCCGGTCCAAGCAGGAAGTATAGTGTATGAGTCCGTTTTCACACTGCCATAAAAGCACTAC<br />CCAAGACTAGGTAATTTGTAAAGAAAAGGGGTTTCATTGCTTCACAGTTCTGCATGCCTGGGGAGGCCTCAGAAAACATACAATCATGGCAGAGGTGAAG<br />GGGAACCAGGGCATGTCTTACATGGCAGCAGGTGCCAGAGAGAGTGAGCAAGCAGGGAAAATGCCAGACATTTATCAAAAACCAGATCTCATGAGCACTC<br />ACTATCATGAGAACAGCATGGGGGAACCACCCCCATGATCCAGTCATCTCCCATCAGTTCCCTCCCTAACACGTGGGGATTACAACTCAAAATGAAATTT<br />GAGTGGGGACACAGAGCCAAACCATATCATAACTGCTTGGGCTTTTATTCATATAGTTAGTTACATGTAAACACTGCTGTATTTCGCTATTTTTTTTCAC<br />TTATTCAAAACTTTGTCTTATACATAGACTTTAACATGATTTTTAGAACAATGAGTCATTCCAAATCTTAGTTACTTAAATTTCCTGATGCTAAGTTCAA<br />GATAGTTTCTGGCTCTCCTATTACCTTTTATATGCGTAACTTAAGCCCCAATAGATGGAACTTTGATGATGTGGCTTTTCTGACAAATAAAGTCAAGCTT<br />TCCAAGAGCTATAATAAAAGAGAACATTTTACACAAATACACACTTTTACCTGTTTTTGTCAAAAGAATTGTAAAAGGTTTTAGTTATTTATTTTATCTT<br />AATTGTTCATTTCCTTTTATATAAAATCTTCATAAAGAAACCCCTCAAGATTAATTGCTAAAAAAAATTACTAGTTTAAAATGAAAATGTCCCCTCTTAT<br />TAGCTAAAATGCAATTTTTATAAACCGTTGTATTTATTTTATAGATTTGCCTGTTTTGTGTTTGCTTGGCTGCCAGGGAGCTCAACAACACTTATCCTTA<br />ACTTAGAGTGTCAGGCTAGCATGGGAGTCAGGGCAATGTTTTTCAAGCCTGTTGACTCTCTCTTGACTTTCATTAATAGATGGACATATTCTAATTCTCT<br />TCCCAATAATATCAACATCCCTTATAATAAGTATTTCTTAAAAAAAAAAAAAGGCAACTTTTTTGTTTCCTTTTCCAGTCTTTCATAATCATTTACATGA<br />CAGATTTCTAGTCTGGTACCAGATCCTTTATGACTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGACAGGGTCTCACTCTGTTGCCCAGGCTGGAGTACAGTGGTGC<br />GATCTCAGTTCACTGCAACCTCTGCCTCCAAGGTTCAAGTGATTCTCCTGCCTCTACCCCCTAAGTAGCTGGGATTACAGGTGTGCACCACTACACTCGG<br />CTAATTTTTTATATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTTGCCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCGAACTCCTGGCCTTATGTGATCCCCCTGCTTCAACCTCCCAA<br />AATGCTAGAATTGCAGGCGTGAACCACTGCACCCAGCCCCTTTATGACTTTCATTGTGACAATTATTTTGATTCAAATTTAAAACCGTGTGTATTAGCTT<br />TCCTCCTTTTCAAAAGAAATATTTTAATATTTTAATGCTATTGCATATCATAGAGCATAAAGATTTTTTTGGCTGATAAATGAGCATTTGAGTATTGTTT<br />TGCAAAGTATTTAATACATTATACTGTCTAAAGAAATGTAAAAGATTCATTATAGCAGTTCTCCCTAAGAATTGACTTTATTAAGAATATGCTATAAATG<br />CTAAAGTTTAACTCAGTAGTTTTAGAATTATAAAAGGTAAATAAAAGGGACTGCAAAATTTAAACAAACTCTGTGAGCATTTTACCGTTGTTTTCGTTGT<br />TCAGTCTGTAAAATCTTAGTCTGGTGTAATGATACATCTTTTCTAAACATTATTGAGATTTGGTTTCCTGAGGAAATAATTATTTCTAATTAAAGACAAA<br />TGATAGGTGTCTTAGGAAGAGAGGTTGAATTTTCTCATGATATTATACTAAGTACCTAATCAAGCCTACATTTTTATTCCAGCATTCAGTGCCCTGCACA<br />GTTGGGCCAGGTTCAGCTTTTCAGCCTTATAGCTCATTGACTTCTATATAGTAGTGATTGTCAAATTGCAGTGTCCTATGTCTCTGCAAAAGTGCCTCAG<br />TACTGTTGTAGGATCAAGGGGGCAGGGCAAGCAGAGGCAGGGCTCTCATTCTTCTTTTATCTCTTTTCTATTTTAGGCCTTCATGTAAGATTTCTTTTGG<br />CAGAATAGTAATGCCTACAGCTGTACATGAGCCCTCAGTTTTGGACAGGCCAATCATATCTTAACAAAACCTGAAGTCCCCAACAAAAGCTTTACACTCT<br />TTTGTCTCCAATCCCAAGGCTACCACTAGTGTATATGTGCTTTTTTCCATATTACAAAAAAGTACTTCCTTTTTGCTGGTAGATTGAAGTAGACACCCCT<br />ACCTCTACTTTGTGCCAGGTCAGGGCTCAAGAAACAAAGCAAAGACTGTATTTAAGTCCTGCTCATAACCATAACTAGGTGTCTTTGTGCAGTGCACAAA<br />ATACAGTGTTTTTGTCAGTCTTTATGCTACCTTTATTTTGCTGTTTCTCTAACCTGTAATCTCACTTGAAGATCTTATCTAATCTTAAAGTCACAGTTCA<br />ACTCTGAAAGCTAGCCAAATTGACTTTATTAAAGATAAATGGAAGTTTTATTCTTGGATCCAGAAATGCAACTGCATAAGTAAAATATGAAGAAAATCCA<br />GATCATTAGCAACAATTGTTGAAAAGGTTTTAGGGGTTTTGTTGACTACAATCTTTATAAAGCATCATCATGATGAGAAAGCGCATGCCATTTGGGGCTT<br />GAACTCACAGAATTCAAATCTGAGGAGTGAAGTCCTCCACAGTACTCAGCCTTTGTGGAGACCACTGTGTTCAGATGTTGAAGCATTAATGGGCTAGAGC<br />AGCAATTCTCAAATTGTGTTCTCCGGATTCACAACATTAGCATCTCCTGGGGATTTGCTTTAAAATGAAAATTCAAGACTTAATAAATCAGAAACCCTGG<br />GAATGGGACTCAGTGGTCACAAGCCTTCCTGGTGATTCTGATGCATGTTCAAGTTTGAAATATACTGGGCTGGGGTATTCTCAAAAAAGTGCAACCAGGA<br />TGATAAAGTAAACTAGAGTGGATTAAAGGAACTGAGAATTGGCTCAGAGAAGAGAAGACCTTGGATGTAGACGAGAGTTGTCTTCAGTTACAGTATTTGG<br />GAAAGAAGGATTATATTTTTTCCATGTCACTTCAGAAGGTAGGAGTAAGATCAATGGGAAATGTTAAGAATGAAAATTGCATTCATCCTACAAAGAAGTT<br />TCCTAAATCATTACGAATTGTTCTACCTTGAGTGTAGTGAGTTATCTGACACTGGAGGATTTAAACCAATGGTAGATCATTACATAGTAGAGATATGAAC<br />ATGAGCTAAAGCATGAGGGCAGCAAAGAGGGGAGAACTTTGTTTCACCTAAATGGCTCTTCAAACCTTTTTTAGCATTAGTTTCTGCTTTGATATACTCT<br />ATTAAAATTTGGGGGATAATTGATAAATCTTCCAGGTGGTTTATGGATGGCCAGGGAGGAAATTTGCCATTGTTTTAATTATTTAATTTTATTTGCCTCT<br />GTTTTTACACTTGGTAAAAATTTGGAAGTGTTTCAGATAGTGAAGAAAAAAAAGAATTAAGAAAAACATTCCAGGCCAGGTACAGGCTCATGCCTGTAAT<br />CCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGCAGGCATATTTCTTGAGCTCAGGAATTTGACACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACTCCAGCTCTACAAAAATACAA<br />AAATTAGCCGGGTGTTGGTGGCTCGCGCCTGTAGTCTCAGCTACTTGGGAGGCCAAGGCAAGAGAATGGCTTGTGCCCGGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAG<br />TCAAGATTGAACCACTCCACTCCAGCCTGGGTGACAGAACAAGACGCTCTCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAATCCATACTTCCTCCTCCTAATCATTGAT<br />AGGTATCCTTCCTTTTTTTTTGTTGTTTTTTTGTTTAGTTTTGTTTTGTTTTTTGCCTACGAGTATGTAAGTTCACATTTATGTAAAATTTATTTCTCAT<br />AGTATATGCTATTTATAACCATTTTCCAGTTAATATGTCATGAGCAATGTATATAGTTGTTAAATATTTGTACACAATATAATTTTTATTGATGTATATT<br />TCCTCATTTCTTTTTTAAGTAGCAAACCATTTCCTCCCAGTCTTCCCTTAGTTTTTTATAATCTCTCAAATAAGTACTAAATTTTCAGTTTTGCAGTGCT<br />GTACTATAAATCACAGGCAGTAGTACTTTGCTTTTTACAACAGATTAGTCTCTGTATGTGTATCCATTTATTTCTCAAACACTTATATAAGTGATAAATT<br />GGCTGTGATCATTTCAGTTTGTTTTAATCCTGTGGATATAATATTTTTCTTTAGTTTTTGAAGAATTTATTTTAGAAAAGCTTTATTACTTTACAAAGTT<br />TTCTTATCAGGGGACAATTGGTAATTATTATACTCTGTGTAGCAATTGTGTTATATCTAATCTCTTTCCCTTTAAAGCCTGAATGCTTCCAACTTTATAA<br />TTTGCTTTAGAGAGCCCAGTTTACCCTATGGCTGACAAATAGCAAACTTAGGATATGATGCAAGATAGAACATGATAATGATTCAAAACAGAACCATAAG<br />CAGGTATTTTTGCTATTTATAATAATATTTTGAGTGTATCTAGTACCTTTTAAATAATATAGTTTAATGGAAGAATATAGTACAGTGGTATATTTTATAG<br />TCTATGTATGGCTCTGAAGTGTATCCAGAGTTTACTTTTTAACCTTAAATAAATAGATGATTAGAAATAGCATTAAGTGTATTTGACAAACCTATAAATT<br />TCCCGTAAAGAAATAAGCAAGTGTATGTATTGTAAAAGACAGTCTTTCCTCTGACTTAATGTTGTATCAGGGGCATTTAGAGTCTACAAGAACCTAAAGT<br />AAATTTTATGAAATATCTAGTGCAAAATCTTTGGGAAATTTCAAAATTTATGCTGAAATCACCATATTTGTTTCCTTTGGTTTCTCTAACAAACCAAAAG<br />ATCAACATTGTCTCATGCGATTTATCTTCTCATTCCTTCCTAAAAATATTTCTGGAAAATTAATGGAGCTGGACCACCAATTCTTCAAATATTGAAAACT<br />CAAAATCTAAGAGTTATTTTAATCTTGAAATTAATGAAAACAAGTTAAAGAGCCTTGTCTAAGTCAAAAAGTCCTCAGCAAAGCTGGTGATAATTATTAT<br />ACTCCAAAAAAGGTGAAAAGATAATGGCTTCAAATCCTGCCTTACATTATCCAGTCAAAAACTAATATAAAAATAGTCAATATTTAAGCCTATGTTTTCA<br />TCGTAAGTAATCAAATACTTACATATTATTAATGTCTAAGGGAGTGGAAGTTAAAACAATGAAATTCAATCGGGTCTTCTTTAATATTTACAATTTTTGC<br />TTTACATTAGCAATTCAGGTTTCACTGATTTTAAAATTGTGAACAATCTGAATTTGTGTGGATTTATTTGTGGTAGTTAAAAGTAAATATTAAGTGCAAG<br />CTATTTGCCAAGAGTGTTCTAGGTGCTATGTTTGATTTAGGAGGTATAATTCAAACATGAGAAGTAGGAAAAGATCCCTCAGATCCCTGTCCTCAGAAGA<br />ATTGACGGTACTTTCAGAGATATCGACAACATAAAAGTACTATGAGAGGAAAGCAGCGGTGCCTGAGGTGGGAGTGATAGCTAGATAAATTATTAGTGAA<br />CCAAGGTTTTCAGATGTAATGTTTGTCTACTCAAAAAGGGAATCAATTCTCTAAGAATTTAAACCCATATAATACTATGAATGTTAAACCAGTTGGGTTT<br />ATGGTATTAATGATTTAATACAGCAACACTGACAAAATCTCTTTTTCTCCCTTTAGTTCCAGTTAGTAAATATCATATTTTTTACTATTTCAGATGCCCC<br />GTCTCTGACTGCCAAGGTGGTAAATTATCACATTTTACTGTATATTCAAATGTTAATTACTAAATGGCATAATTTTAACAATTAAATTTACTATTTTGTG<br />AGCCAACTAACAACAATGATGTTAAGCATAGGATGCCCAATATAATAATAAGCACCTTGTATGTACAGAAGATTTTACATGCACAAATTCATTTAATCCA<br />CACAAATCCGAAGTTTCAGGTCTGTTTTACAAATTTTGTATGCCCAATGCTTAGAGAGATCAAGTAATTTGATAATACTCTTATAGGGAGGATCCAAACC<br />CATGGTTTTATGTATATTTGTTTGTTTGTTTTTTGCTTTTACTTTAGAACAGTTTCTATACATTGTACAGGTTGGATTGGGACAGAAAATAAAATTTAGA<br />AGCTGTTTTTATTGTCAACAATCTTATAATTAAATATATCTGCAAAATATAAATATAAAACAAGTAGTCTTTATTATCTGGAAATAAATGTGAAGAGCAT<br />ATTTAAGCAAGTGATGAATAAATTAGAAAATATGCAGGCAGTAAAAAATGGTTAATATCAGTCATGAATTTAATTTTCTAATTTATTTTTGAAAGCCATA<br />ATCTTCATAAAATAATTCTAGAATTTTTTTCTTCAGCCAATCAACAGAGATCATCCTTTTAATTTGAAACTTGTTTTTATTTTTAAGATCCCTTTGTTGA<br />TCTAGCAAGTGGCCAAGTTCCTTTGCCTCCTGCTAGAAGGTTACCAGGTGAAAATGTCAAAACTAACAGAACATCACAGGACTATGATCAGCTTCCTTCA<br />TGTTCAGATGGTTCACAGGCACCAGCCAGACCCCCTAAACCACGACCGCGCAGGACTGCACCAGAAATTCACCACAGAAAACCCCATGGGCCTGAGGCGG<br />CATTGGAAAATGTCGATGCAAAAATTGCAAAACTCATGGGAGAGGGTTATGCCTTTGAAGAGGTGAAGAGAGCCTTAGAGATAGCCCAGAATAATGTCGA<br />AGTTGCCCGGAGCATCCTCCGAGAATTTGCCTTCCCTCCTCCAGTATCCCCACGTCTAAATCTATAGCAGCCAGAACTGTAGACACCAAAATGGAAAGCA<br />ATCGATGTATTCCAAGAGTGTGGAAATAAAGAGAACTGAGATGGAATTCAAGAGAGAAGTGTCTCCTCCTCGTGTAGCAGCTTGAGAAGAGGCTTGGGAG<br />TGCAGCTTCTCAAAGGAGACCGATGCTTGCTCAGGATGTCGACAGCTGTGGCTTCCTTGTTTTTGCTAGCCATATTTTTAAATCAGGGTTGAACTGACAA<br />AAATAATTTAAAGACGTTTACTTCCCTTGAACTTTGAACCTGTGAAATGCTTTACCTTGTTTACAGTTTGGCAAAGTTGCAGTTTGTTCTTGTTTTTAGT<br />TTAGTTTTGTTTTGGTGTTTTGATACCTGTACTGTGTTCTTCACAGACCCTTTGTAGCGTGGTCAGGTCTGCTGTAACATTTCCCACCAACTCTCTTGCT<br />GTCCACATCAACAGCTAAATCATTTATTCATATGGATCTCTACCATCCCCATGCCTTGCCCAGGTCCAGTTCCATTTCTCTCATTCACAAGATGCTTTGA<br />AGGTTCTGATTTTCAACTGATCAAACTAATGCAAAAAAAAAAAAGTATGTATTCTTCACTACTGAGTTTCTTCTTTGGAAACCATCACTATTGAGAGATG<br />GGAAAAACCTGAATGTATAAAGCATTTATTTGTCAATAAACTGCCTTTTGTAAGGGGTTTTCACATAACATAGAGGAGCTTCCCTTTTTTGTTTAAGTTT<br />TGTAACCTTTAATCCTCCATATTCTCATGTCTGTCATCCCAGGGGTGTCACAACTGTAAAAATCTACAATATTAGAAAGCAGCTACTACAGATGTGGAAG<br />AGAGAACACTTGTATAAGACAATGCTGTACTGAAGTTATATAACAAGGTCCCCTGATACTTATGCCTGCATTACTTTGAGGGATGCTGAATGAGAGGACC<br />ATCTCCCTGAAATATATTAATAATTTTCAGATAAAATTATGAACATAACATACCTTTTCTCAAGTGGAATTAGAGTTCATTTCCCATTTAAGTGATTACA<br />CTCTATCTCCTAAGAGCTGTGGGAACCAGTTCATATTGCAGTGGAAACATTAACTCTTCGTTGCACTGTTGAGTGTCAAGGCTACTGTGGCAATGTTTTT<br />TGCAAAGTTCTCAGTAATTTTCTCTCTGCAATCAAATTAGAGTTCATATTTAATTTGCAGATTCTCTCATTCATTGCTCCACACTGCTTTATCAAATCAG<br />GTGAAAGAAATTAATGTAGTTTTGCCTATTTTACAAAATGGTGGTTGGTTCTTTAAACACCATGTTATTACTCTTAATAAATCTACAAATATTTATTGAG<br />CATCTATGATATGCTTGGTGCTGTTAGGCACTGTGTTTTTAAAGCACAAACTCTCAAAAGCTGATTCCAGCGTAATGTTTTATTTTTGTTTTTCTGTGTT<br />TTTTATGACAAAGTCTGTCTGATAGACAAAGCCTGGAAGGTTTCCCCCAGGGCTTTAGAATTTAGAATTAGCTGGTTTTCATTTCAAATGGGAAATTAAT<br />GGAGAAATGAGATAAAATCATCTCTGTGTAAATGCTTGAACCCACAGAAAGTTTTCTAAATATGGACTAATTGTGGGTTTGTGCATATTTCTGTGTCTCC<br />TCTTTTCACTTCACACCCACCATGATATAAAAAGATGCATCAGAGAGTGAGCCTGCCTTCAGGACCTGAAAGGACATGACTGAACATCTAGTAGATCTGG<br />TGGAAATTAATGTTATACAAAAGACACGTAGACTAAGTTGACCCTGGGAGAGGAGTTAATACATTCCTTTGCAAAGTGACATGTGCCCTTTTTTTGACAG<br />TCTGGCTTTCATGGTATGAGATGAGGACTCACAGGCCTTGGGTAATTTCTGCTTTTGTATGAATTTTTTCAGATGGTTCTGAGCTGGTTATGTCCCTGGA<br />GGGGAATTTTTCATTTGCCTTAGATGTTCTTCCCATGAGTAGGTACATGAGTGAAGTTTCTTACACTTTTAAAATTGCATTGGCAAATTTTCTTTTGCTT<br />TATGAACCCCTGTTTTGTCATTATGATTTTTCACTTGTTTTAACAGTTTCAGATGTCACCTTGGAATAGCACTGTTTATTTTGGCCTTTTTATGATTGCT<br />GATGATAGGTACAGTCTAAAGGCCAAAAGTTGCCACTTCATTGTGATAACATTGTTGCAACATTCCTAATATATTAGAGAATGATGTAAAATAAGAATGT<br />TAGAGAACATAGCACATTCTCATTCAGTTTATAAACAATATTTGAAAATTTCCAGTGAGAATTAAAAAAGGACTAGTGATGATATAGCAAACCTGGACCT<br />GAAATTTGGGGGTGGGGGGTGGGGGGATATCTGTTTTGCAGAGAAAATTTACCAGCCTCCAGCAAAATCTCTGCATCTTGTACTCAATAGCAACCATTAG<br />TATTGTCATTTAAAAAGAATGAATCAAAAATTCATACGTAATGGAATGAAAAGAGGAAAACTTTCTATTAAACACTGTCAAGAAAGACCCATTGCTATCT<br />ATCACCTATGAAATTAAACCTAAAAAAATTTTTTTTTATTGTAAAAGCGACTGCTCGTTGATGTCTGGAAGTGATCCAGACTTTGTTTCACTGTGATCCA<br />AAAAGTTAGACATTCCTTCCATTTCTCAAGATTTGGTAACAATTTTTTTTTAAGTCAGCATTTCATATAATACATAAAATTAAGACAAATTAACTTACTG<br />ATATGTGGCCAATATCAACCCTTCTCACCCAACCCAAACATGTTCTGGAGATAGAAGGACTTATCCTCAATTATATTCCAGTAAATTTATCTCCATAATC<br />TGTTTTATCCCCTAATGTATGATATATCTCACCAAATTTTTCTAGAATTGAATAAAAGCAGTTTTTGCTTAACTTGAATTTCCTTCCACAAATACAACCT<br />TCAGCTCTTCCCTCTCTGTTTCCCTTTTGCCCACATTGCAAATAGTCTTCATAATAGAACCCTCACTGCAACTTAAAAGGGTCCCATTTCTTAACTCAGC<br />ATTTCATATACCAAGAACACTTGCAAAGATTTCTTCATAATGTGATTTTTTAATTTTTCAGTTCCAGAAGCATTTCCTACAGTTCGAACGTTATTTTTTC<br />TCTCAGATTTTCAACTTGAAGCTTTGATTTGCACTGAATTAACTTGGATAAAATTTTAGTTTCTCTCTTCAGCTAACAGATTTGGAAGCAAATTACAGTA<br />TACTTGAATAATTCAGGTACTACCTGTTGACCTGGAATTTTAGTGATTCTGGGAAAGTTTTCCAGACAAAGACACCAATAGAGTGAAGGGTTTTTTCCCC<br />AATTACTATTTTATTGTTTTTTAAAATGCCTTTTTAAAACTTGTGTGATGTGGCAAAATAGTCATATGTTCAATTAATTTATATTTTATTCATTCCTTTT<br />CAATTCTGGTTATTATGTAACCTCAAGTACTTTATCTGTTCTTTTAAAGTATTTTATAAAATGAACGTTAACTAAATGCAGAGTTGGTACTTTATTTTTC<br />AAATGAACACAAAAATTTTAGAGCATTTCTATGATGTAATTTTTCTTTTTCATGTCTAATTGAACAAAGTGGTGCAAGGTGTACCCATCCTAGGTAATTT<br />AGTTATTAAGTACCAAAATCACAATTTTAAGGTAGCCTAATAGATAAAATTGCCCCTATGTCATAGATCTGAATGTCAAAGGTGTATCAAGGTTCCAAGT<br />AAGAAATATCATATCTGGGAAATGCTGAAAGCCTTCAGGATGATGTACTATAATATATAATTGATAATTCCTGATCAACAGTACCATCTGGTCTTTAAAT<br />TCCTCATTTCTTAAATCATTTTTTCACTGATCAGTATATAGTGGGGAGAGAACAACAGAGATAACAATGTTAATAATTGCTTTTATATCAAGAATCATGG<br />CAGAATATTGTGAAACTAATTGTTACATGCAAAGTTCCGTGCATAGTAATAACAATTACTTCCTGGAAGCATATACCATGAAATGGAAGATACACATAAG<br />CAAGTAATTCCAGTACAAAAATGTGTGTACAACATACCACATTGTACTAGAATTACGTCTGTATGATAAGTGCTTAAGAACTAATTATTGAGCCTTTATT<br />ATGTGTAAGGAGCTTAGTGTCAAAGCATTTAATGCTTTCGACAACCCTGCCTCTTTTAGGACTGTGGAAGGGAAGTTGGGAATTATATTTCTAATAGAAA<br />GTTTGACAACCCATAAGACTAAGTAGTCTTTTGTAAGCCTAAAAGGAGCAAGGATTTGTTGTTGGTATTAAGAAAGAAATTCAGAGTTAAAGCTTTTCAA<br />ATAGGAAGAGCACACATGATAAAATATTGTTATTTAAGCAAAGGTGAGATGCCGCTCATCATCACTTCAGTGCTTTGAGAAGACTTGTTCTTCTCTCCTA<br />AAAGCCCCCCCTCCCCCCGGGAAACCTCTGTGGGACTCATTAAGAGGCTGGTGGCAGAACTTCCATTCCTGTGTCCTAAGAGTCATCATGAGCAGAAGAG<br />GATGGGCTGGAGGGTTACCTGGGAAAAGTGAGTGATGAGTGAGAATGTTCTGGGTTTGGTCCACCTCTCCCAATTCAACTAATGATAGCTCCCAGAGAAC<br />ACCAATTATAGATATTAGGGAACTGGCATTTTATTCTGTTAGAGTCCACACAGTGGACTTACTGATCTGCCATCTGCGGTTACTAGAGCAGAGCAGAACA<br />TAACTAGAGAGGAGTCAACAGTGAATCAGGTAATAAGCATCTCCACCATTGGGAGAACAAGGATACATCATACGCCCCTGGGATAGGCAGAGCCCTGTCA<br />AGGCAGCTGAGCTGGAGTTGTCTTGGCAGGACCCAAGAAGGCCACCTGTCAGCCACAGTAACCCAAGCAGCAAGAGACTTTGGGGTATACACTGCTGGAC<br />TAGGCACAAGGAAGTCAAGCCAGTGGATATCTGATGTATCTGATGTGTCAGACACTAACCGAGTGTCCTCCCACTTGAGCTTGACAACAAAGTCCACCTT<br />TGAGAACTTACTGTATGGGCAAAATACAAAATCAAACATGCCCTACAATAGCACTTGTAAAAAGAATTTTACTCCTTTCCTTAACTCTTCTTCCCCTATC<br />CCAATCCCAAAGAAGCAGAAATGTAAGAATGAAGAGGAGTGATTAAAAAGGGTACATCTTGCCCCTTCTCTGCTCCTAGTCCCTGAGGTTAAGGGCTGCC<br />CAACACTGGGAGACAGTGGACAGGCTAGACTGAATTAGAATGCAGGTGATTAAACAAGGAAAGATAATTAATAGTTAAAAGAAGTGATTAAAGAAAAAAT<br />CTCAACATACCATGTTGGCAGCCTATCAGGTTCAAGGTGTTTAGTAAATTACTAAAAAAAAAAAAAAAAAGCCAGACATTTCATTTCAAATGAACTTTAG<br />TGGTTTCCTTAGTTTAACAAAAAGTATTTATAGTCAGATAGCCATCATTAGAGGGTCCTTCTATGGGGAGATGATGTGGGATGGATAGATGCATTTTATT<br />TCTCTGGAAATACTCCCTGCCTGGCAAGCTCAGAGGGCTCACCCCTGGAGATGCAAATTCTGCCTAACCCCTCCCACAGTCTTTTGAGCAGAGATCCTCT<br />CCTCTGTCCCTTAGCAGTGCAGGGCCCAATCTCACCCAGTTCTCCCTTCACTGCAAGCATTGCTTCCCCCTCAGTAAACTACCCAAACCTCATTTGTTAG<br />CTTGTTTATGAAGTAAATATCAGGGACATGAAATAAAACGTCTGGCAGCAACTTCCCTAGGACATCAGTGACTGTCCTCAAACTACTCTCAAAAGGAGCT<br />GTACATTTCCCTAAAGAACCATTCCAATGTAAGATGCAAAGTATCCTTGCAGAAAATTAAACCTAACCACAAGTGCCTAGGCCCTAGGCTATTTAGACAT<br />GAATCAAAAACAGCAGTACCAAGGCACTTATTTGTATAGATGTTTAATCAAGAGTGATGCTTAATGTCTATCTGGAATTTCTTGCAAAAAAAGAGAGGAT<br />AGATGGTCTAAAACAAGACTAATATATCTCTACTGGGCATTTTAATCAGTGCTAACATAATTAAATATTTATACAGCACTTTGGGTTTGGGAACATTTTC<br />TGTTTGATTTTCAAAGTTGCATTTCTCAAAATTCTTGTAAAGTAGGTCCATTACACTTGATACCTTCTCTTTGCACATAGAATTTATAAATCAGAGAACA<br />TAACTTTCCCTGAGTCACTCAACAATTGACAAGCACTAGAATTATGATCGTATCAATTAGTCCCACCTCATGCATTAGATATTAAAAATAGACCTAAAAA<br />CAGTTAGGCAAGATCTAAGCAATCCTTCTGTGGGCAAGAAAGAGAATTTAAAATAAGTATGTGACTTTCACCTCCTGCTATTATCACATATTGCAGGAGG<br />TATCACCCAGAAAGATAAGTACATGTTGACATGATTTGGCTGTTCTCCACCCAAATCTCATCTTGAAATATAGTTCATGTAATCCCCACATGTTGTGAGA<br />GGGACCCAGTGGGAGGTAATTGAATCACAGGGGCAGTTAACCCTCATGTTCTCGTGATAGTGAGTAAGTCTCACGAGATCTGATGGTTTTATAAGGGGCT<br />CTTCCCCCCGTGGCTGGGCACTTCTCTTTGTTGCCGCCATGTATAAGAGGACGTGTTTGCTTCCCCTTATGCCATGATTGTAAGTTTCCTGAGGCATCTC<br />CAGCCATGCTGGACTGTGTGTCAATTAAAACTCTTTCCTTTATGAATACCCAGTCTCAGGTATGTCTTTATTAGTGTGAGAACTGACTCCTACATGTTAA<br />ACATGACTAATACATGTAAACATGTTACTTATTGACTAGTTGGGGTGTTTAAAAAATGATTTGCTAATTGGTCAGCACTAATCATGTAAACAAAATCATG<br />TAGTTGAAGCTGAACTACATATGCACAGCAAATTTTGCAAAGAGATCAGCAACTTGAAAGTGTGGATGAGTTAAGCAACCTGCATTCTAAAGTGGCTTAG<br />CACTATGGGTCTTTCTAGTGCCATTTTTAATGTGTGTAAGTACCTATTTTTAAAATTAATTTACTGTTTACTACGAAGAGGAAAGGAAAAATCACCTTAC<br />TGCTTGCCATTTTTCAGCAAAGGAAGTGTTCTAATTGCTCAATTCAGTAAAAAGGCTAATAGGGAAGGAGAACAAATAAATATCCTCAGAGGTTAAATCA<br />AAAAAACACCTGTTTCATTTGTGAACCTTTAATGTGTAGGCACAGAAGCAATTTTGGCAGCCATGCTATTAATCTGTAAGAGGCCATAAACTTGTCATGG<br />TGAGGACACTGCAAATTCAACTTGAATATACTTTGCTTTTCACATTAATGACATATAAGGACACTTAAGCCTCTCATCATCACTTTAGCACCTTGAGAAG<br />ACCAATGTTCTTGTTCTCCTCTCAAAGGACCATTACCACTTCAATGTGTGACTTGTCAATCCTTTGTGATACTAACCCCTAAAATTAAACTCTCTTGAAG<br />TTGAAGATGACAACAATTTCATTCCACCTGGAAAATTTAGAAGTATTCAAACCCTTCACTGTTGATTAAAATCAGATTCAAGCTCCATTTTCCTCAGGAA<br />AATGGCCAGGCTATTTGATAAAACATTAAAGAGAGAATGCTAACTCACAGACTAGATCTAGCAGTGTTGTGGTTGTGTGTTTGTTAGCTAAGTTAAACTC<br />TAGTGTCCTCTGATTTTACTTTATGCTCAAATCTCTTAACCTAG

Expression



Full and truncated open reading frames discovered in TCONS_00181738

In silico ORF/peptide predictions
>peptide 1 (70 aa)
MSKLTEHHRTMISFLHVQMVHRHQPDPLNHDRAGLHQKFTTENPMGLRRHWKMSMQKLQNSWERVMPLKR

>peptide 2 (69 aa)
MGFCHVGQAGLELLALCDPPASTSQNARIAGVNHCTQPLYDFHCDNYFDSNLKPCVLAFLLFKRNILIF

>peptide 3 (63 aa)
MGLSSAIFNVCKYLFLKLIYCLLRRGKEKSPYCLPFFSKGSVLIAQFSKKANREGEQINILRG

>peptide 4 (59 aa)
MSLEGNFSFALDVLPMSRYMSEVSYTFKIALANFLLLYEPLFCHYDFSLVLTVSDVTLE

>peptide 5 (55 aa)
MGVRAMFFKPVDSLLTFINRWTYSNSLPNNINIPYNKYFLKKKKGNFFVSFSSLS

>peptide 6 (52 aa)
MFWVWSTSPNSTNDSSQRTPIIDIRELAFYSVRVHTVDLLICHLRLLEQSRT

>peptide 7 (51 aa)
MKYLVQNLWEISKFMLKSPYLFPLVSLTNQKINIVSCDLSSHSFLKIFLEN

>peptide 8 (50 aa)
MAEVKGNQGMSYMAAGARESEQAGKMPDIYQKPDLMSTHYHENSMGEPPP

>peptide 9 (50 aa)
MRNLSPNRWNFDDVAFLTNKVKLSKSYNKREHFTQIHTFTCFCQKNCKRF


RiboTaper predictions from Ribo-Seq data (HEK293 cell line)
Nothing found.

BLAST search results

Best hit to NONCODE v4:
NONHSAT090968 (Evalue: 0)

Best hit to Swiss-Prot:
sp|Q13191|CBLB_HUMAN (Evalue: 8.0E-57)