Detailed information on TCONS_00242486

lncRNA-RNA interactions

Number of interactions: 6

Potential function Interacting transcript Gene description Transcript biotype lncRNA id Alignment score (LAST) Alignment length Transcript region involved in interaction Genomic orientation of interacting RNAs
TCONS_00148704 WD repeat containing planar cell polarity effector novel protein coding TCONS_00242486 2347 1042 UTR3 Trans
TCONS_00148705 WD repeat containing planar cell polarity effector novel protein coding TCONS_00242486 2347 1042 UTR3 Trans
TCONS_00168219 THO complex 5 novel protein coding TCONS_00242486 664 370 UTR3 Trans
TCONS_00168220 THO complex 5 novel protein coding TCONS_00242486 664 370 UTR3 Trans
TCONS_00193640 hematopoietic prostaglandin D synthase novel protein coding TCONS_00242486 2485 1139 CDS_UTR Trans
TCONS_00193640 hematopoietic prostaglandin D synthase novel protein coding TCONS_00242486 693 924 CDS_UTR Trans

Sequence

>TCONS_00193640 (8294 nt)
CACCCCTCAATCTGGGTGGGCAACATCTAATCAACTGTCAGCATGGCTAGAATAAAGTAGGCAGAAGAAGACGGGAGAAGCCAACTTGCTGAGTCTTCTT
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TCAATGTTTTCTTTTTTCCACAACTATTTTGAGAAGCAGTGAAATCTTACATATTTGGCCTTCACTGTTACATAATTACTCAGACAGAAATCAAGCTGAA
GTTACCTTGCTGAACAACCTTTCCTGTGAAGTTAGCATTACTCAATTAGTATGATTAATTAACACAGTTAATAGACTAGACAAAACTGAAATAGA

Expression



Full and truncated open reading frames discovered in TCONS_00193640

In silico ORF/peptide predictions
Nothing found.


RiboTaper predictions from Ribo-Seq data (HEK293 cell line)
Nothing found.

BLAST search results

No hits found.