Detailed information on TCONS_00251315

lncRNA-RNA interactions

Number of interactions: 1

Potential function Interacting transcript Gene description Transcript biotype lncRNA id Alignment score (LAST) Alignment length Transcript region involved in interaction Genomic orientation of interacting RNAs
ENST00000552220 antisense antisense TCONS_00251315 549 631 noncoding Trans

Sequence

>ENST00000552220 (10274 nt)
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TTGCCTAAAATGCTGATTATCTGAGCCTTCAGCAAGTCATGTAATCTTTTTGCCGGAAAGATTTCTCTGTTGCTTAATATTATTTTACCCACAGTAGAAC
TTCTTTCACAATTGGAGTCAGTTCTCTCAAATTCTGCCTCTGCTTTATCAACTAAATTCATGTCATATTCTAAATCCTTTATTGTTGTTTCAACAATGTT
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ATCTCTTCCAGAAGGTGTTCAATTTACTTTGACCAGATCCAACAGATGAATCACTGTCTATGGTAGCTATAGCCTTATAAGATATATTTCTTAAATAATA
TGAATTAAAAGCCAAAATTACTCCATAAGTAATTACTGCAGAATTGATGTTGTGTTAGTAGGCATGAAAACAACATAAATCTTGTACGTCTCCATCAGAG
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AGCTGGTAGGTGGATCAGTCAGAACACACACAACATTTATTGATTAAGTTTGCCATCATATATGAACATGGTTCATGGTGCCCCAAAACAATTATAATAG
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CACAGTAAAGCAAAGCATAATAAGGTGAGGTACACTTATACACGGTGATGATTAAAGTACATTAACATGCAGAAAAAGAGGGCAAGAAGCAAGTTATCAA
TTGAACAAAACAATAGATGTATAAAACACATCATTACAGAAACCTGGCAACTTGGTGGTACTAGTCCTTGTTTATGGACACACCCTTCATAATCAGCTCT
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TTCTGAAGGTTCTAAAGGAAAGTCTCTTTCCGTCCCTTTTTCAGCTTCTAGATGACAACTGCATTCCTTTGTTCCTGGCCCCTTCCTCTACCTTCAAAAT
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TCCTTGACTTAAGACACCTTCAAAGTCCCTTTTGCCATGTAAGCTAATATAGTCACAATGTTGGGGGGATTCGAACAAGGACATATTTAGAGGGGGATTG
TTTTGTCTATTGCAGTATTCTAAAGGTACTTATTAAGCTTTACTGATTAACTTTTGAACTCAAAATAATATATGTTTACATTTGAAAAATTTTTTGATTG
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ATTAACATATTTAATAGAATTATAGTATTATATATTTTATATATATAATTATATTGTATACATTATATGCTTATA

Expression



Full and truncated open reading frames discovered in ENST00000552220

In silico ORF/peptide predictions
Nothing found.


RiboTaper predictions from Ribo-Seq data (HEK293 cell line)
Nothing found.

BLAST search results

Best hit to NONCODE v4:
NONHSAT074744 (Evalue: 0)

Best hit to Swiss-Prot:
sp|Q96MW7|TIGD1_HUMAN (Evalue: 2e-24)