Detailed information on CNT0000518 (Glycine max)


BLAST search results

BLAST vs PNRD: nothing found

BLAST vs Swiss-Prot:
sp|Q9FF10|HPSE1_ARATH, E-value = 3e-24

BLAST vs NONCODE (A. thaliana): nothing found

Potential orthologs: nothing found

Most similar lncRNAs:
CNT0022093, E-value = 5e-09 (A. trichopoda)
CNT0011077, E-value = 3e-07 (S. tuberosum)

Expression of CNT0000518

Peptides detected in this lncRNA

>peptide 1 (58 aa)
MKRWDELNQFFYETGYLDQFGIASCYSTKVYCRQTLIGGNYGLLNTTTFAPNPDYYSF*

>peptide 2 (64 aa)
MLMTFTYTLYIVGKTYSDRQLAVIIRPLKVDRRNVRRTKSIIHLAMNFLFTVTVFVCRYRSFFL*

>peptide 3 (31 aa)
MWVDFSGLVSSFPCQGNPRYVYLHYFYIKLL*

>peptide 4 (37 aa)
MAFSIPPPLLPILTTTVSKQCSFVASVNGKEGSCGLK*

Sequence

>CNT0000518
ATAAATTTAATTTTAGTTTATCATGTACTAGTATAATTATACTTCTTTTATGGGCAAACAAATGTTAAATTTTTTTTAAGATACCTGGAACCTTGCTAAT
TTAGCTTCTTTTTTTTTTTTGTGCAATCAAAATTGGAGTGTCCAATACCTAGAACCTTGCTACTGTTCATATTGAAGGGAAACAATTTTATTCATCGGGT
ATGTCGTGTTCCATGTCTCCATGAAGTGACATTTTGGTTTGAATTTTACAATGTTGAGTCTTTAAATGATTGCTTGTGTGAGGCTAAAAGAATTCTGCAT
GACATTGTTTTGAATTAACTATGGCAAACTTAATTCATTGTTTTCTCTTGTTTGGTAATTACATCATATGCGCTAACAAGTAACATCTTGAATTTTCTTG
TTGTGCTGCTTGTGTAGACAGCTATTTTCGAATTTATGTTTCCCGTCCACTCCCAATCCACTATGTAGAACCTTGGCAAGCAATCAAGTAATTTTATTCA
TTGTTCACTTTAATGTGGGTTGATTTTTCAGGACTTGTCTCATCCTTTCCTTGCCAAGGCAATCCAAGGTATGTATATCTGCATTACTTCTATATAAAGT
TACTCTGATGACATTCTATTGTACATCACTTCCGAGTAACTGATTAAGAAAATCAGTTACTTTGATGACATTCTGTTGTTTGTGACTGCATAAAGTTATA
ATGTATTTTATGAATATCTTCTTTGGAATAATTATGTTTAGCATGATGTTATTTGTTTCATAATTGTTGCACGATAGCCCTCAGGCCATTGAGGATAAGA
CTTGGAGGTTCTTTGCAAGACCAGGTTCTGTATGATGTGGGAAGTTTGAAGTCTCCTTGCCATTCCCTTCAAAAGGTTAAAGGTGGATTGTTTGGATTTT
CAAAGGGATGTTTACACATGAAAAGGTGGGATGAGCTGAATCAGTTTTTCTACGAGACAGGGTACTTAGATCAATTTGGAATAGCATCCTGCTACAGCAC
TAAAGTCTATTGCAGGCAGACTTTAATTGGAGGGAACTATGGCCTTCTCAATACCACCACCTTTGCTCCCAATCCTGACTACTACAGTTTCTAAACAGTG
CAGTTTTGTGGCATCGGTTAATGGGAAAGAAGGTTCTTGCGGTCTCAAGTGATGTTCATATTAAAGACTTTTACCAATAATTAGGAAATGTAAGTAGAAG
TTAATGACTTTTACCTACAGTTGAAGATGATAGGTACATATTAAAGAATTTTACCTACAGGTAGGAAATGTTAATGACTTTTACCTACACATTATACATA
GTAGGTAAAACCTATAGTGATAGACAATTAGCCGTCATTATACGCCCCCTCAAAGTTGACAGAAGAAACGTTCGTAGGACAAAGTCTATCATACATTTGG
CTATGAATTTTTTATTTACAGTGACAGTTTTTGTCTGTAGGTATAGGTCATTTTTCTTGTAGTTTGGTCCTTCAAAGGAGTCCCAAATTAAATAACAATT
TGTATCATTCACACAAACAAGGTATACATATACTTATGATCTAATAGCTACATTCAAC