Common name: Longstamen rice
Latin name: Oryza longistaminata
Genome assembly: GCA_000789195.1
All retrocopies: 24
Parental genes: 24

Summary: Number of retrocopies :
Conserved ORF: 23 ORF 1 ORF

# RetrogeneDB ID Identity Coverage ORF conservation
1. retro_olon_1 59.84 % 70.31 % ORF
2. retro_olon_2 70.86 % 80.13 % ORF
3. retro_olon_3 63.84 % 66.25 % ORF
4. retro_olon_4 78.80 % 92.05 % ORF
5. retro_olon_5 72.73 % 57.69 % ORF
6. retro_olon_6 74.07 % 52.72 % ORF
7. retro_olon_7 66.17 % 92.91 % ORF
8. retro_olon_8 50.81 % 64.51 % ORF
9. retro_olon_9 51.38 % 71.24 % ORF
10. retro_olon_10 51.53 % 63.42 % ORF
11. retro_olon_11 52.99 % 64.64 % ORF
12. retro_olon_12 70.92 % 75.00 % ORF
13. retro_olon_13 77.52 % 95.19 % ORF
14. retro_olon_14 61.84 % 81.69 % ORF
15. retro_olon_15 73.63 % 96.14 % ORF
16. retro_olon_16 55.12 % 59.83 % ORF
17. retro_olon_17 61.00 % 72.68 % ORF
18. retro_olon_18 66.79 % 53.80 % ORF
19. retro_olon_19 68.39 % 86.96 % ORF
20. retro_olon_20 84.33 % 80.97 % ORF
21. retro_olon_21 60.38 % 57.84 % ORF
22. retro_olon_22 69.34 % 73.01 % ORF
23. retro_olon_23 60.23 % 54.49 % ORF
24. retro_olon_24 53.16 % 85.39 % ORF
# Ensembl ID Symbol Description
1. KN539459.1_FG006
2. KN540497.1_FG004
3. KN538756.1_FG066
4. KN540387.1_FG001
5. KN539761.1_FG003
6. KN540365.1_FG001
7. KN539849.1_FG007
8. KN538684.1_FG046
9. KN538848.1_FG012
10. KN538817.1_FG009
11. KN539056.1_FG008
12. KN539266.1_FG011
13. KN540228.1_FG005
14. KN538756.1_FG047
15. KN538949.1_FG004
16. KN538781.1_FG018
17. KN538775.1_FG004
18. KN538764.1_FG025
19. KN538917.1_FG011
20. KN540828.1_FG001
21. KN539869.1_FG002
22. KN541863.1_FG002
23. KN539908.1_FG004
24. KN538837.1_FG036
Retrogenes FASTA BED
TSV (download all or selected columns from MySQL table)
Parental genes FASTA BED
TSV (download all or selected columns from MySQL table)