Common name: | Indian wild rice | |
---|---|---|
Latin name: | Oryza nivara | |
Genome assembly: | AWHD00000000 | |
All retrocopies: | 39 | |
Parental genes: | 39 | |
Summary: | Number of retrocopies : | |
Conserved ORF: | 38 ORF | 1 ORF |
# | RetrogeneDB ID | Identity | Coverage | ORF conservation |
---|---|---|---|---|
1. | retro_oniv_1 | 55.90 % | 78.27 % | ORF |
2. | retro_oniv_2 | 71.26 % | 93.96 % | ORF |
3. | retro_oniv_3 | 64.44 % | 92.99 % | ORF |
4. | retro_oniv_4 | 65.36 % | 71.39 % | ORF |
5. | retro_oniv_5 | 70.52 % | 93.17 % | ORF |
6. | retro_oniv_6 | 63.59 % | 77.78 % | ORF |
7. | retro_oniv_7 | 62.03 % | 54.27 % | ORF |
8. | retro_oniv_8 | 69.92 % | 95.19 % | ORF |
9. | retro_oniv_9 | 84.42 % | 78.96 % | ORF |
10. | retro_oniv_10 | 73.21 % | 97.30 % | ORF |
11. | retro_oniv_11 | 80.00 % | 78.77 % | ORF |
12. | retro_oniv_12 | 66.34 % | 97.39 % | ORF |
13. | retro_oniv_13 | 57.19 % | 77.13 % | ORF |
14. | retro_oniv_14 | 51.09 % | 96.48 % | ORF |
15. | retro_oniv_15 | 63.12 % | 91.90 % | ORF |
16. | retro_oniv_16 | 71.49 % | 87.06 % | ORF |
17. | retro_oniv_17 | 77.58 % | 99.46 % | ORF |
18. | retro_oniv_18 | 65.03 % | 71.76 % | ORF |
19. | retro_oniv_19 | 69.81 % | 86.48 % | ORF |
20. | retro_oniv_20 | 66.42 % | 92.91 % | ORF |
21. | retro_oniv_21 | 76.40 % | 99.16 % | ORF |
22. | retro_oniv_22 | 63.07 % | 51.04 % | ORF |
23. | retro_oniv_23 | 59.32 % | 69.71 % | ORF |
24. | retro_oniv_24 | 57.64 % | 92.87 % | ORF |
25. | retro_oniv_25 | 69.11 % | 71.43 % | ORF |
26. | retro_oniv_26 | 76.08 % | 58.49 % | ORF |
27. | retro_oniv_27 | 52.41 % | 57.89 % | ORF |
28. | retro_oniv_28 | 54.17 % | 76.13 % | ORF |
29. | retro_oniv_29 | 56.67 % | 73.87 % | ORF |
30. | retro_oniv_30 | 76.83 % | 52.73 % | ORF |
31. | retro_oniv_31 | 70.06 % | 72.29 % | ORF |
32. | retro_oniv_32 | 71.58 % | 97.70 % | ORF |
33. | retro_oniv_33 | 66.91 % | 75.35 % | ORF |
34. | retro_oniv_34 | 56.67 % | 88.03 % | ORF |
35. | retro_oniv_35 | 79.83 % | 86.94 % | ORF |
36. | retro_oniv_36 | 80.82 % | 55.81 % | ORF |
37. | retro_oniv_37 | 52.81 % | 92.61 % | ORF |
38. | retro_oniv_40 | 50.77 % | 50.39 % | ORF |
39. | retro_oniv_49 | 60.49 % | 87.64 % | ORF |