Detailed information on CNT0002248 (Glycine max)


BLAST search results

BLAST vs PNRD: nothing found

BLAST vs Swiss-Prot:
sp|P49158|ACCD_SOYBN, E-value = 3e-111

BLAST vs NONCODE (A. thaliana):
NONATHT003814, E-value = 2e-23

Potential orthologs: nothing found

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Expression of CNT0002248

Peptides detected in this lncRNA

>peptide 1 (52 aa)
MELEKKKTSLYLIFFILSLFFLFDFDSLLYSLFFYFLVSFFLFLQPKSPAST*

>peptide 2 (82 aa)
MKILIKKTKIIYIFLKNKMFVMLNIFNLVCICIHSILYSSSFFSAKLPEAYAFLNPIVDIMPVIPLLFFLLAFVWQAAVSFR*

>peptide 3 (38 aa)
MIYIMNGYALGRKDSNLRIVGPKPVALPLGHAPFSILY*

>peptide 4 (33 aa)
MYSHWMKNKIIEIFHFEYSISCIYYKKVYKSNN*

>peptide 5 (44 aa)
MKINSVFYQSIFYSLFRICKVEKWEFKNIRKKEKNYKIEKIIKL*

>peptide 6 (30 aa)
MLWVNILIFHLLIFSVKEPNETKVSCSVLN*

>peptide 7 (41 aa)
QRINTIFIRFLFGMKFNRIQRNHVFIHRIPSTRINRKFDSI*

>peptide 8 (47 aa)
MLIFFTFIEIIRTFSYSGITIICIIRTSYYTSTRIITFTTISALKKM*

>peptide 9 (49 aa)
MNRPRERGDKREKSFRNLYTSHPHPPFFISLMKFRLLIRAKFHKNTSPF*

>peptide 10 (47 aa)
MLYHINKKRKKWSLKKKRLLFILFFLSYLFFFYLISIHYYILYSSIF*

>peptide 11 (36 aa)
MLTLKLFVYTVVIFFVSLFIFGFLSNDPGRNPGREE*

>peptide 12 (44 aa)
MCIYISIYIYLDIDRIRLNLLIITYNSIKILYRSVIYSIFFISE*

Sequence

>CNT0002248
CAAAGAATCAATACGATCTTTATAAGGTTCCTCTTCGGAATGAAATTCAATAGGATCCAGAGAAACCATGTCTTCATCCATAGGATTCCAAGTACCCGAA
TCAATCGAAAGTTTGATTCTATCTGAACTGCCCATTTTCAAATGATATCCACAGTATTCACAAATATTCATTTTTGATTTAATTTTTTTTTATAATTTAA
TCCATAACAATTTTCGCATTCAAGCCACAAATGCTTATATTTTTTACTTTCATCGAGATTATTAGAACTTTCTCCTATAGTGGAATCACTATCATTTGTA
TCATTCGTACTAGTTATTATACTAGTACTAGAATTATCACTTTCACTACAATTTCTGCCCTTAAAAAAATGTAACTATAAAAATAAATATCATTGTATTT
GTCAATATCACCTAAATTGAAACTCTCAATGCAACTATCAATGAAACTAGTAATATTATTGTTAAAACTAAATTGAGTCTCATACATGTAATGATCATCA
TCATTCTTAGAAACAGTATTCAGATCGCTAGAAAAAAAACCTTCCATTTCTAAATAATCCAAATCCTTGTGAATTTTTTTTTCTATATCGGTTAAAATTT
TAGGGTCTTCCCTTAGACTGGTATTTTCAATAGGACCAAGACTATCCATTGATTTACTTAATTCACACCTGTATTCTAACTTCCTATTAAACAACATAGA
ATTAAACCACCATTTTCCATCGAGTTTTTCCTCTATTTACACCAAAATATAATGAATGTATAGTCATTGGATGAAGAATAAAATAATAGAAATATTCCAT
TTTGAATATTCTATCTCATGTATTTACTATAAAAAAGTATATAAATCAAATAACTAGGATTAGTAACTGAAAATAATGAAGAGCGAGTTGGTATTAAAAA
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GACTATTTTTTTTTCTTTTTCCTATATTCTATCTTTTATCTCTATACATTTTTTCATTTTGTTTTGAAGATCGATGCAAATTTCATTTCTTTTTCTGGCT
ATAGAAAACTACATCCTATCATTCTTTATAAACAACAAGAAATAAGAAAAATTAGGTATGAATAGACCAAGAGAGCGGGGGGATAAAAGAGAAAAGAGTT
TTAGAAATCTATATACAAGTCATCCACACCCCCCTTTTTTTATTTCATTAATGAAATTTCGTTTGTTGATTCGAGCTAAGTTCCATAAAAACACCAGCCC
TTTTTGAAATATCCTGAACAGTTCCTGTAGGTTAAGCGCCTCGTTCAAGGAAATATAGAATAACATGAATATTTAAATAGGTTTGATTCTTTATTGGATC
ATAAAAACCCACTTTCCGAAGATCTCTTCCCTCTCTTCGAGATCGAACATCGATTGCAACGATTCGATAAACGGCTCGTTGCTTTTTACCACATCGTTTC
AAACGAAGTTTTACCATAACATTCCTTTAGCTTGGATCCAGTATGTAATTGATTCAATTATGGAATCATGAATAGTCATTGATTCAATTGATACATACTA
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GCTCTGGGACGGAAGGATTCGAACCTCCGAATAGTGGGACCAAAACCCGTTGCCTTACCACTTGGTCACGCCCCATTTTCGATTTTATACTAATAAACAC
TATTATTTATATTGGTTGTTCGTCAATTCCAGTTCAAAAATTTCTATAGAAAAATTTGTTGCTAGTATTTTTATATGTGTATCTACATATCTATCTATAT
CTATCTAGATATAGATAGGATAAGACTCAATTTATTGATCATTACGTACAATTCTATTAAGATATTGTATAGAAGTGTGATTTATTCAATTTTTTTTATT
TCAGAATAAAAAAAGATTTTGAACTAGATAAGTTCAAATCAAAGAAGGATTTTGGAGGGTTTTATCTTATTTTATTCATTTTTTTTAGTTTTATTCATAA
ATTAATATTAATTTCTTTTCCTTTTTATTGTATTATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATAAAATACAATAAAAAT
GAAAATTCTAATTAAAAAAACAAAAATAATTTATATTTTCTTAAAGAACAAAATGTTTGTTATGCTTAATATCTTTAATTTGGTCTGTATTTGTATTCAC
TCCATCCTTTATTCAAGTAGTTTTTTCTCGGCGAAATTGCCTGAAGCCTACGCTTTCTTGAATCCAATTGTGGATATTATGCCAGTAATACCCTTACTCT
TTTTTCTTTTAGCTTTTGTTTGGCAAGCTGCTGTAAGTTTTCGATGAGATCTGTAATTTGAGTAATGTCTTAAAAAAATTAAGAATTTATCAGAAAACTA
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ACCATCTCATCATCTACATTTTGCCAATTGAGAAGTCCTAATCCTATTATTCAATTTGAACCCATCACCAATAGAATACCTAGATTATAGATATGAAAGA
ATATTTTTGGTAAAAGTAATTATTGATAATTTTTAATAAAAGATTCGACTCTTACTACAAATCCATTTTCGAAACTTATCTTATATATCTCCTCACAAAA
ATTTAATTTTTTAGAAACTTAATATCAAAAGAAACAAAATTTGTTGTAATATAAGAGAATTTATTCTCTTTCTTTGTCGTTTTTTAATTATCTTGGAGAT
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AATAACAATGATTTATTTGAATTGAATGTACTTTATTAAAAAAAAATACCTTCAACAAAAACAAAATCCAAAAATGTAATTCACCCCGTTTTTCAAATTT
CATTAGAAGATACTCTAATTAAACATGTCAATACTCGAATTATTAGAATATTGAATATTATGCCCCTCTATTTCTTTATTGATTTTGTCTGATTGCTTTG
TTCGACAAAAGATACAATAATTGTATTGTAGCGGGTATAGTTTAGTGGTAAAAGTGTGATTCGTTCCATGGACCCCTAAATAGTTAAGGGATCCCCCGTT
TGATTCATATTCCGATCAAAAACTTTATTTCTTACTTAAAGGGAATCCTTTATACCCTCAATGAATGATTTGCGGTATAATATACATTATCGTAATTTGT
ATACAAGAAGAATCAATTCTAAATTGACAACTTGAGTTCTAAAATTATGAAACATAAGTTTTTGGAATTGGATCTATAATCCGAATTTTTTTTAGTATGA
CGAAAGGATCTATGGAGAGATATATAGAAAGTTTATTTCTAATCGTAACTAAATCTTCCATTTTTTTGTATAGTAGATATTGAAGCAAAATAGCTATTAA
ACGATTCTTTTAGTTTACTAGAGACATCTACATTTTTTTAGCTCGACAGAAATTTTATACTTTTCCTAAAGATTCTATTAAATAGAAATAGAGAACGAAG
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ATAGATGTTATGGGTCAATATTTTGATTTTCCATCTCTTAATTTTTTCTGTAAAGGAGCCGAATGAAACAAAAGTTTCATGTTCGGTTTTGAATTAGAGA
TGTTAAATTGAAATCAAAATGATGAATCAACGTCGACTATAACCCCTAGCCTTCCAAGCTAACGATGCGGGTTCGATTCCCGCTACCCG