miRNEST 2.0: an integrative microRNA resource miRNEST 2.0, an integrative microRNA resource :: BLAST


>27885_mml-mir-379:mirbase
          Length = 67

 Score =  125 bits (63), Expect = 4e-30
 Identities = 66/67 (98%)
 Strand = Plus / Plus

                                                                      
Query: 1  agagatggtagactatggaacgtaggctttatgatttttgacctatgtaacatggtccac 60
          ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1  agagatggtagactatggaacgtaggcgttatgatttttgacctatgtaacatggtccac 60

                 
Query: 61 taactct 67
          |||||||
Sbjct: 61 taactct 67




>30986_ppy-mir-379:mirbase
          Length = 67

 Score =  125 bits (63), Expect = 4e-30
 Identities = 66/67 (98%)
 Strand = Plus / Plus

                                                                      
Query: 1  agagatggtagactatggaacgtaggctttatgatttttgacctatgtaacatggtccac 60
          ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1  agagatggtagactatggaacgtaggcgttatgatttttgacctatgtaacatggtccac 60

                 
Query: 61 taactct 67
          |||||||
Sbjct: 61 taactct 67




>33355_bta-mir-379:mirbase
          Length = 86

 Score =  125 bits (63), Expect = 4e-30
 Identities = 66/67 (98%)
 Strand = Plus / Plus

                                                                      
Query: 1  agagatggtagactatggaacgtaggctttatgatttttgacctatgtaacatggtccac 60
          |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 11 agagatggtagactatggaacgtaggctttgtgatttttgacctatgtaacatggtccac 70

                 
Query: 61 taactct 67
          |||||||
Sbjct: 71 taactct 77




>28632_hsa-mir-379:mirbase
          Length = 67

 Score =  117 bits (59), Expect = 1e-27
 Identities = 65/67 (97%)
 Strand = Plus / Plus

                                                                      
Query: 1  agagatggtagactatggaacgtaggctttatgatttttgacctatgtaacatggtccac 60
          ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1  agagatggtagactatggaacgtaggcgttatgatttctgacctatgtaacatggtccac 60

                 
Query: 61 taactct 67
          |||||||
Sbjct: 61 taactct 67




>30359_ptr-mir-379:mirbase
          Length = 66

 Score =  115 bits (58), Expect = 4e-27
 Identities = 64/66 (96%)
 Strand = Plus / Plus

                                                                      
Query: 2  gagatggtagactatggaacgtaggctttatgatttttgacctatgtaacatggtccact 61
          |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1  gagatggtagactatggaacgtaggcgttatgatttctgacctatgtaacatggtccact 60

                
Query: 62 aactct 67
          ||||||
Sbjct: 61 aactct 66




>26830_cfa-mir-379:mirbase
          Length = 59

 Score =  109 bits (55), Expect = 2e-25
 Identities = 58/59 (98%)
 Strand = Plus / Plus

                                                                     
Query: 6  tggtagactatggaacgtaggctttatgatttttgacctatgtaacatggtccactaac 64
          ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1  tggtagactatggaacgtaggctttgtgatttttgacctatgtaacatggtccactaac 59




>32051_mmu-mir-379:mirbase
          Length = 66

 Score =  109 bits (55), Expect = 2e-25
 Identities = 65/67 (97%), Gaps = 1/67 (1%)
 Strand = Plus / Plus

                                                                      
Query: 1  agagatggtagactatggaacgtaggctttatgatttttgacctatgtaacatggtccac 60
          ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1  agagatggtagactatggaacgtaggcgttatg-tttttgacctatgtaacatggtccac 59

                 
Query: 61 taactct 67
          |||||||
Sbjct: 60 taactct 66




>33828_oar-mir-379:mirbase
          Length = 126

 Score =  101 bits (51), Expect = 6e-23
 Identities = 63/67 (94%)
 Strand = Plus / Plus

                                                                       
Query: 1   agagatggtagactatggaacgtaggctttatgatttttgacctatgtaacatggtccac 60
           |||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||| |||||||
Sbjct: 38  agagatggtagactatggaacgtaggctgtgtgatttctgacctatgtaacacggtccac 97

                  
Query: 61  taactct 67
           |||||||
Sbjct: 98  taactct 104




>33829_oar-mir-379:mirbase
          Length = 126

 Score =  101 bits (51), Expect = 6e-23
 Identities = 63/67 (94%)
 Strand = Plus / Plus

                                                                       
Query: 1   agagatggtagactatggaacgtaggctttatgatttttgacctatgtaacatggtccac 60
           |||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||| |||||||
Sbjct: 38  agagatggtagactatggaacgtaggctgtgtgatttctgacctatgtaacacggtccac 97

                  
Query: 61  taactct 67
           |||||||
Sbjct: 98  taactct 104




>32895_rno-mir-379:mirbase
          Length = 85

 Score = 93.7 bits (47), Expect = 1e-20
 Identities = 63/67 (94%), Gaps = 1/67 (1%)
 Strand = Plus / Plus

                                                                      
Query: 1  agagatggtagactatggaacgtaggctttatgatttttgacctatgtaacatggtccac 60
          |||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct: 11 agaggtggtagactatggaacgtaggcgttatg-tttctgacctatgtaacatggtccac 69

                 
Query: 61 taactct 67
          |||||||
Sbjct: 70 taactct 76




>33842_oar-mir-411b:mirbase
          Length = 102

 Score = 42.1 bits (21), Expect = 5e-05
 Identities = 24/25 (96%)
 Strand = Plus / Plus

                                   
Query: 39 tgacctatgtaacatggtccactaa 63
          |||| ||||||||||||||||||||
Sbjct: 54 tgacgtatgtaacatggtccactaa 78




>33843_oar-mir-411b:mirbase
          Length = 102

 Score = 42.1 bits (21), Expect = 5e-05
 Identities = 24/25 (96%)
 Strand = Plus / Plus

                                   
Query: 39 tgacctatgtaacatggtccactaa 63
          |||| ||||||||||||||||||||
Sbjct: 54 tgacgtatgtaacatggtccactaa 78