miRNEST 2.0, an integrative microRNA resource :: BLAST
>27885_mml-mir-379:mirbase
Length = 67
Score = 125 bits (63), Expect = 4e-30
Identities = 66/67 (98%)
Strand = Plus / Plus
Query: 1 agagatggtagactatggaacgtaggctttatgatttttgacctatgtaacatggtccac 60
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1 agagatggtagactatggaacgtaggcgttatgatttttgacctatgtaacatggtccac 60
Query: 61 taactct 67
|||||||
Sbjct: 61 taactct 67
>30986_ppy-mir-379:mirbase
Length = 67
Score = 125 bits (63), Expect = 4e-30
Identities = 66/67 (98%)
Strand = Plus / Plus
Query: 1 agagatggtagactatggaacgtaggctttatgatttttgacctatgtaacatggtccac 60
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1 agagatggtagactatggaacgtaggcgttatgatttttgacctatgtaacatggtccac 60
Query: 61 taactct 67
|||||||
Sbjct: 61 taactct 67
>33355_bta-mir-379:mirbase
Length = 86
Score = 125 bits (63), Expect = 4e-30
Identities = 66/67 (98%)
Strand = Plus / Plus
Query: 1 agagatggtagactatggaacgtaggctttatgatttttgacctatgtaacatggtccac 60
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 11 agagatggtagactatggaacgtaggctttgtgatttttgacctatgtaacatggtccac 70
Query: 61 taactct 67
|||||||
Sbjct: 71 taactct 77
>28632_hsa-mir-379:mirbase
Length = 67
Score = 117 bits (59), Expect = 1e-27
Identities = 65/67 (97%)
Strand = Plus / Plus
Query: 1 agagatggtagactatggaacgtaggctttatgatttttgacctatgtaacatggtccac 60
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1 agagatggtagactatggaacgtaggcgttatgatttctgacctatgtaacatggtccac 60
Query: 61 taactct 67
|||||||
Sbjct: 61 taactct 67
>30359_ptr-mir-379:mirbase
Length = 66
Score = 115 bits (58), Expect = 4e-27
Identities = 64/66 (96%)
Strand = Plus / Plus
Query: 2 gagatggtagactatggaacgtaggctttatgatttttgacctatgtaacatggtccact 61
|||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1 gagatggtagactatggaacgtaggcgttatgatttctgacctatgtaacatggtccact 60
Query: 62 aactct 67
||||||
Sbjct: 61 aactct 66
>26830_cfa-mir-379:mirbase
Length = 59
Score = 109 bits (55), Expect = 2e-25
Identities = 58/59 (98%)
Strand = Plus / Plus
Query: 6 tggtagactatggaacgtaggctttatgatttttgacctatgtaacatggtccactaac 64
||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1 tggtagactatggaacgtaggctttgtgatttttgacctatgtaacatggtccactaac 59
>32051_mmu-mir-379:mirbase
Length = 66
Score = 109 bits (55), Expect = 2e-25
Identities = 65/67 (97%), Gaps = 1/67 (1%)
Strand = Plus / Plus
Query: 1 agagatggtagactatggaacgtaggctttatgatttttgacctatgtaacatggtccac 60
||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1 agagatggtagactatggaacgtaggcgttatg-tttttgacctatgtaacatggtccac 59
Query: 61 taactct 67
|||||||
Sbjct: 60 taactct 66
>33828_oar-mir-379:mirbase
Length = 126
Score = 101 bits (51), Expect = 6e-23
Identities = 63/67 (94%)
Strand = Plus / Plus
Query: 1 agagatggtagactatggaacgtaggctttatgatttttgacctatgtaacatggtccac 60
|||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||| |||||||
Sbjct: 38 agagatggtagactatggaacgtaggctgtgtgatttctgacctatgtaacacggtccac 97
Query: 61 taactct 67
|||||||
Sbjct: 98 taactct 104
>33829_oar-mir-379:mirbase
Length = 126
Score = 101 bits (51), Expect = 6e-23
Identities = 63/67 (94%)
Strand = Plus / Plus
Query: 1 agagatggtagactatggaacgtaggctttatgatttttgacctatgtaacatggtccac 60
|||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||| |||||||
Sbjct: 38 agagatggtagactatggaacgtaggctgtgtgatttctgacctatgtaacacggtccac 97
Query: 61 taactct 67
|||||||
Sbjct: 98 taactct 104
>32895_rno-mir-379:mirbase
Length = 85
Score = 93.7 bits (47), Expect = 1e-20
Identities = 63/67 (94%), Gaps = 1/67 (1%)
Strand = Plus / Plus
Query: 1 agagatggtagactatggaacgtaggctttatgatttttgacctatgtaacatggtccac 60
|||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct: 11 agaggtggtagactatggaacgtaggcgttatg-tttctgacctatgtaacatggtccac 69
Query: 61 taactct 67
|||||||
Sbjct: 70 taactct 76
>33842_oar-mir-411b:mirbase
Length = 102
Score = 42.1 bits (21), Expect = 5e-05
Identities = 24/25 (96%)
Strand = Plus / Plus
Query: 39 tgacctatgtaacatggtccactaa 63
|||| ||||||||||||||||||||
Sbjct: 54 tgacgtatgtaacatggtccactaa 78
>33843_oar-mir-411b:mirbase
Length = 102
Score = 42.1 bits (21), Expect = 5e-05
Identities = 24/25 (96%)
Strand = Plus / Plus
Query: 39 tgacctatgtaacatggtccactaa 63
|||| ||||||||||||||||||||
Sbjct: 54 tgacgtatgtaacatggtccactaa 78