miRNEST 2.0, an integrative microRNA resource :: BLAST
BLASTN 2.2.20 [Feb-08-2009]
Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer,
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997),
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.
>32101_mmu-mir-466a:mirbase
Length = 73
Score = 145 bits (73), Expect = 5e-36
Identities = 73/73 (100%)
Strand = Plus / Plus
Query: 1 tatatgtgtttatgtgtgtgtacatgtacatatgtgaatatgatatccatatacatacac 60
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1 tatatgtgtttatgtgtgtgtacatgtacatatgtgaatatgatatccatatacatacac 60
Query: 61 gcacacataagac 73
|||||||||||||
Sbjct: 61 gcacacataagac 73
>32116_mmu-mir-466b-8:mirbase
Length = 86
Score = 125 bits (63), Expect = 4e-30
Identities = 69/71 (97%)
Strand = Plus / Plus
Query: 3 tatgtgtttatgtgtgtgtacatgtacatatgtgaatatgatatccatatacatacacgc 62
|||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct: 6 tatgtgttgatgtgtgtgtacatgtacatatgtgaatatgatatacatatacatacacgc 65
Query: 63 acacataagac 73
|||||||||||
Sbjct: 66 acacataagac 76
>32117_mmu-mir-466b-8:mirbase
Length = 86
Score = 125 bits (63), Expect = 4e-30
Identities = 69/71 (97%)
Strand = Plus / Plus
Query: 3 tatgtgtttatgtgtgtgtacatgtacatatgtgaatatgatatccatatacatacacgc 62
|||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct: 6 tatgtgttgatgtgtgtgtacatgtacatatgtgaatatgatatacatatacatacacgc 65
Query: 63 acacataagac 73
|||||||||||
Sbjct: 66 acacataagac 76
>32124_mmu-mir-466e:mirbase
Length = 84
Score = 125 bits (63), Expect = 4e-30
Identities = 69/71 (97%)
Strand = Plus / Plus
Query: 3 tatgtgtttatgtgtgtgtacatgtacatatgtgaatatgatatccatatacatacacgc 62
|||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct: 4 tatgtgttgatgtgtgtgtacatgtacatatgtgaatatgatatacatatacatacacgc 63
Query: 63 acacataagac 73
|||||||||||
Sbjct: 64 acacataagac 74
>32125_mmu-mir-466e:mirbase
Length = 84
Score = 125 bits (63), Expect = 4e-30
Identities = 69/71 (97%)
Strand = Plus / Plus
Query: 3 tatgtgtttatgtgtgtgtacatgtacatatgtgaatatgatatccatatacatacacgc 62
|||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct: 4 tatgtgttgatgtgtgtgtacatgtacatatgtgaatatgatatacatatacatacacgc 63
Query: 63 acacataagac 73
|||||||||||
Sbjct: 64 acacataagac 74
>32118_mmu-mir-466c-1:mirbase
Length = 84
Score = 121 bits (61), Expect = 7e-29
Identities = 70/73 (95%)
Strand = Plus / Plus
Query: 1 tatatgtgtttatgtgtgtgtacatgtacatatgtgaatatgatatccatatacatacac 60
|||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct: 2 tatatgtgttgatgtgtgtgtgcatgtacatatgtgaatatgatatacatatacatacac 61
Query: 61 gcacacataagac 73
|||||||||||||
Sbjct: 62 gcacacataagac 74
>32119_mmu-mir-466c-1:mirbase
Length = 84
Score = 121 bits (61), Expect = 7e-29
Identities = 70/73 (95%)
Strand = Plus / Plus
Query: 1 tatatgtgtttatgtgtgtgtacatgtacatatgtgaatatgatatccatatacatacac 60
|||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct: 2 tatatgtgttgatgtgtgtgtgcatgtacatatgtgaatatgatatacatatacatacac 61
Query: 61 gcacacataagac 73
|||||||||||||
Sbjct: 62 gcacacataagac 74
>32120_mmu-mir-466c-2:mirbase
Length = 90
Score = 121 bits (61), Expect = 7e-29
Identities = 70/73 (95%)
Strand = Plus / Plus
Query: 1 tatatgtgtttatgtgtgtgtacatgtacatatgtgaatatgatatccatatacatacac 60
|||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct: 5 tatatgtgttgatgtgtgtgtgcatgtacatatgtgaatatgatatacatatacatacac 64
Query: 61 gcacacataagac 73
|||||||||||||
Sbjct: 65 gcacacataagac 77
>32121_mmu-mir-466c-2:mirbase
Length = 90
Score = 121 bits (61), Expect = 7e-29
Identities = 70/73 (95%)
Strand = Plus / Plus
Query: 1 tatatgtgtttatgtgtgtgtacatgtacatatgtgaatatgatatccatatacatacac 60
|||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct: 5 tatatgtgttgatgtgtgtgtgcatgtacatatgtgaatatgatatacatatacatacac 64
Query: 61 gcacacataagac 73
|||||||||||||
Sbjct: 65 gcacacataagac 77
>32102_mmu-mir-466b-1:mirbase
Length = 82
Score = 117 bits (59), Expect = 1e-27
Identities = 68/71 (95%)
Strand = Plus / Plus
Query: 3 tatgtgtttatgtgtgtgtacatgtacatatgtgaatatgatatccatatacatacacgc 62
|||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct: 3 tatgtgttgatgtgtgtgtacatgtacatgtgtgaatatgatatacatatacatacacgc 62
Query: 63 acacataagac 73
|||||||||||
Sbjct: 63 acacataagac 73
>32103_mmu-mir-466b-1:mirbase
Length = 82
Score = 117 bits (59), Expect = 1e-27
Identities = 68/71 (95%)
Strand = Plus / Plus
Query: 3 tatgtgtttatgtgtgtgtacatgtacatatgtgaatatgatatccatatacatacacgc 62
|||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct: 3 tatgtgttgatgtgtgtgtacatgtacatgtgtgaatatgatatacatatacatacacgc 62
Query: 63 acacataagac 73
|||||||||||
Sbjct: 63 acacataagac 73
>32108_mmu-mir-466b-4:mirbase
Length = 90
Score = 117 bits (59), Expect = 1e-27
Identities = 68/71 (95%)
Strand = Plus / Plus
Query: 3 tatgtgtttatgtgtgtgtacatgtacatatgtgaatatgatatccatatacatacacgc 62
|||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct: 7 tatgtgttgatgtgtgtgtacatgtacatgtgtgaatatgatatacatatacatacacgc 66
Query: 63 acacataagac 73
|||||||||||
Sbjct: 67 acacataagac 77
>32109_mmu-mir-466b-4:mirbase
Length = 90
Score = 117 bits (59), Expect = 1e-27
Identities = 68/71 (95%)
Strand = Plus / Plus
Query: 3 tatgtgtttatgtgtgtgtacatgtacatatgtgaatatgatatccatatacatacacgc 62
|||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct: 7 tatgtgttgatgtgtgtgtacatgtacatgtgtgaatatgatatacatatacatacacgc 66
Query: 63 acacataagac 73
|||||||||||
Sbjct: 67 acacataagac 77
>32110_mmu-mir-466b-5:mirbase
Length = 88
Score = 117 bits (59), Expect = 1e-27
Identities = 68/71 (95%)
Strand = Plus / Plus
Query: 3 tatgtgtttatgtgtgtgtacatgtacatatgtgaatatgatatccatatacatacacgc 62
|||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct: 5 tatgtgttgatgtgtgtgtacatgtacatgtgtgaatatgatatacatatacatacacgc 64
Query: 63 acacataagac 73
|||||||||||
Sbjct: 65 acacataagac 75
>32111_mmu-mir-466b-5:mirbase
Length = 88
Score = 117 bits (59), Expect = 1e-27
Identities = 68/71 (95%)
Strand = Plus / Plus
Query: 3 tatgtgtttatgtgtgtgtacatgtacatatgtgaatatgatatccatatacatacacgc 62
|||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct: 5 tatgtgttgatgtgtgtgtacatgtacatgtgtgaatatgatatacatatacatacacgc 64
Query: 63 acacataagac 73
|||||||||||
Sbjct: 65 acacataagac 75
>32112_mmu-mir-466b-6:mirbase
Length = 90
Score = 117 bits (59), Expect = 1e-27
Identities = 68/71 (95%)
Strand = Plus / Plus
Query: 3 tatgtgtttatgtgtgtgtacatgtacatatgtgaatatgatatccatatacatacacgc 62
|||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct: 7 tatgtgttgatgtgtgtgtacatgtacatgtgtgaatatgatatacatatacatacacgc 66
Query: 63 acacataagac 73
|||||||||||
Sbjct: 67 acacataagac 77
>32113_mmu-mir-466b-6:mirbase
Length = 90
Score = 117 bits (59), Expect = 1e-27
Identities = 68/71 (95%)
Strand = Plus / Plus
Query: 3 tatgtgtttatgtgtgtgtacatgtacatatgtgaatatgatatccatatacatacacgc 62
|||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct: 7 tatgtgttgatgtgtgtgtacatgtacatgtgtgaatatgatatacatatacatacacgc 66
Query: 63 acacataagac 73
|||||||||||
Sbjct: 67 acacataagac 77
>32114_mmu-mir-466b-7:mirbase
Length = 88
Score = 117 bits (59), Expect = 1e-27
Identities = 68/71 (95%)
Strand = Plus / Plus
Query: 3 tatgtgtttatgtgtgtgtacatgtacatatgtgaatatgatatccatatacatacacgc 62
|||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct: 5 tatgtgttgatgtgtgtgtacatgtacatgtgtgaatatgatatacatatacatacacgc 64
Query: 63 acacataagac 73
|||||||||||
Sbjct: 65 acacataagac 75
>32115_mmu-mir-466b-7:mirbase
Length = 88
Score = 117 bits (59), Expect = 1e-27
Identities = 68/71 (95%)
Strand = Plus / Plus
Query: 3 tatgtgtttatgtgtgtgtacatgtacatatgtgaatatgatatccatatacatacacgc 62
|||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct: 5 tatgtgttgatgtgtgtgtacatgtacatgtgtgaatatgatatacatatacatacacgc 64
Query: 63 acacataagac 73
|||||||||||
Sbjct: 65 acacataagac 75
>32106_mmu-mir-466b-3:mirbase
Length = 81
Score = 113 bits (57), Expect = 2e-26
Identities = 69/73 (94%)
Strand = Plus / Plus
Query: 1 tatatgtgtttatgtgtgtgtacatgtacatatgtgaatatgatatccatatacatacac 60
|||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||
Sbjct: 1 tatatgtgttgatgtgtgtgtacatgtacatgtgtgaatatgatatacaaatacatacac 60
Query: 61 gcacacataagac 73
|||||||||||||
Sbjct: 61 gcacacataagac 73
>32107_mmu-mir-466b-3:mirbase
Length = 81
Score = 113 bits (57), Expect = 2e-26
Identities = 69/73 (94%)
Strand = Plus / Plus
Query: 1 tatatgtgtttatgtgtgtgtacatgtacatatgtgaatatgatatccatatacatacac 60
|||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||
Sbjct: 1 tatatgtgttgatgtgtgtgtacatgtacatgtgtgaatatgatatacaaatacatacac 60
Query: 61 gcacacataagac 73
|||||||||||||
Sbjct: 61 gcacacataagac 73
>32104_mmu-mir-466b-2:mirbase
Length = 82
Score = 109 bits (55), Expect = 3e-25
Identities = 67/71 (94%)
Strand = Plus / Plus
Query: 3 tatgtgtttatgtgtgtgtacatgtacatatgtgaatatgatatccatatacatacacgc 62
|||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct: 3 tatgtgttgatgtgtgtgtacatgtacatgtctgaatatgatatacatatacatacacgc 62
Query: 63 acacataagac 73
|||||||||||
Sbjct: 63 acacataagac 73
>32105_mmu-mir-466b-2:mirbase
Length = 82
Score = 109 bits (55), Expect = 3e-25
Identities = 67/71 (94%)
Strand = Plus / Plus
Query: 3 tatgtgtttatgtgtgtgtacatgtacatatgtgaatatgatatccatatacatacacgc 62
|||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct: 3 tatgtgttgatgtgtgtgtacatgtacatgtctgaatatgatatacatatacatacacgc 62
Query: 63 acacataagac 73
|||||||||||
Sbjct: 63 acacataagac 73
>32148_mmu-mir-466p:mirbase
Length = 89
Score = 101 bits (51), Expect = 6e-23
Identities = 70/74 (94%), Gaps = 3/74 (4%)
Strand = Plus / Plus
Query: 1 tatatgtgtttatgtgtgtgtacatgtacatatgtgaatatgat-atccatatacataca 59
||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||
Sbjct: 5 tatatgtgtttatgtgtgtgtacatgtacatgtgtgaatatgatgat--atatacataca 62
Query: 60 cgcacacataagac 73
||||||||||||||
Sbjct: 63 cgcacacataagac 76
>32149_mmu-mir-466p:mirbase
Length = 89
Score = 101 bits (51), Expect = 6e-23
Identities = 70/74 (94%), Gaps = 3/74 (4%)
Strand = Plus / Plus
Query: 1 tatatgtgtttatgtgtgtgtacatgtacatatgtgaatatgat-atccatatacataca 59
||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||
Sbjct: 5 tatatgtgtttatgtgtgtgtacatgtacatgtgtgaatatgatgat--atatacataca 62
Query: 60 cgcacacataagac 73
||||||||||||||
Sbjct: 63 cgcacacataagac 76
>32123_mmu-mir-466d:mirbase
Length = 96
Score = 75.8 bits (38), Expect = 4e-15
Identities = 60/66 (90%), Gaps = 1/66 (1%)
Strand = Plus / Plus
Query: 5 tgtgtttatgtgtgtgtacatgtacatatgtgaatatg-atatccatatacatacacgca 63
||||||| |||||| |||||||||||| |||| ||||| |||| ||||||||||||||||
Sbjct: 5 tgtgtttgtgtgtgcgtacatgtacatgtgtgtatatgaatatacatatacatacacgca 64
Query: 64 cacata 69
||||||
Sbjct: 65 cacata 70
>32122_mmu-mir-466d:mirbase
Length = 96
Score = 75.8 bits (38), Expect = 4e-15
Identities = 60/66 (90%), Gaps = 1/66 (1%)
Strand = Plus / Plus
Query: 5 tgtgtttatgtgtgtgtacatgtacatatgtgaatatg-atatccatatacatacacgca 63
||||||| |||||| |||||||||||| |||| ||||| |||| ||||||||||||||||
Sbjct: 5 tgtgtttgtgtgtgcgtacatgtacatgtgtgtatatgaatatacatatacatacacgca 64
Query: 64 cacata 69
||||||
Sbjct: 65 cacata 70
>32146_mmu-mir-466o:mirbase
Length = 84
Score = 73.8 bits (37), Expect = 1e-14
Identities = 46/49 (93%)
Strand = Plus / Plus
Query: 3 tatgtgtttatgtgtgtgtacatgtacatatgtgaatatgatatccata 51
|||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||
Sbjct: 7 tatgtgttgatgtgtgtgtacatgtacatgtgtgaatatgatatacata 55
>32147_mmu-mir-466o:mirbase
Length = 84
Score = 73.8 bits (37), Expect = 1e-14
Identities = 46/49 (93%)
Strand = Plus / Plus
Query: 3 tatgtgtttatgtgtgtgtacatgtacatatgtgaatatgatatccata 51
|||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||
Sbjct: 7 tatgtgttgatgtgtgtgtacatgtacatgtgtgaatatgatatacata 55
>31976_mmu-mir-297c:mirbase
Length = 98
Score = 50.1 bits (25), Expect = 2e-07
Identities = 50/57 (87%), Gaps = 1/57 (1%)
Strand = Plus / Plus
Query: 5 tgtgtttatgtgtgtgtacatgtacatatgtgaatatga-tatccatatacatacac 60
||||| ||||| ||||| ||||||||| |||| |||||| ||| |||||||||||||
Sbjct: 4 tgtgtatatgtatgtgtgcatgtacatgtgtgtatatgaatatacatatacatacac 60
>32144_mmu-mir-466n:mirbase
Length = 94
Score = 50.1 bits (25), Expect = 2e-07
Identities = 47/53 (88%), Gaps = 1/53 (1%)
Strand = Plus / Plus
Query: 5 tgtgtttatgtgtgtgtacatgtacatatgtgaatatg-atatccatatacat 56
||||||| |||||| |||||||||||| |||| ||||| |||| |||||||||
Sbjct: 12 tgtgtttgtgtgtgcgtacatgtacatgtgtgtatatgaatatgcatatacat 64
>32145_mmu-mir-466n:mirbase
Length = 94
Score = 50.1 bits (25), Expect = 2e-07
Identities = 47/53 (88%), Gaps = 1/53 (1%)
Strand = Plus / Plus
Query: 5 tgtgtttatgtgtgtgtacatgtacatatgtgaatatg-atatccatatacat 56
||||||| |||||| |||||||||||| |||| ||||| |||| |||||||||
Sbjct: 12 tgtgtttgtgtgtgcgtacatgtacatgtgtgtatatgaatatgcatatacat 64
>32128_mmu-mir-466f-2:mirbase
Length = 94
Score = 44.1 bits (22), Expect = 1e-05
Identities = 56/66 (84%), Gaps = 1/66 (1%)
Strand = Plus / Plus
Query: 5 tgtgtttatgtgtgtgtacatgtacatatgtgaatatga-tatccatatacatacacgca 63
|||||||| |||||||| ||||| ||| |||| |||||| ||| ||||||||||| ||
Sbjct: 5 tgtgtttacgtgtgtgtgcatgtgcatgtgtgtatatgaatatatgtatacatacacaca 64
Query: 64 cacata 69
||||||
Sbjct: 65 cacata 70
>32129_mmu-mir-466f-2:mirbase
Length = 94
Score = 44.1 bits (22), Expect = 1e-05
Identities = 56/66 (84%), Gaps = 1/66 (1%)
Strand = Plus / Plus
Query: 5 tgtgtttatgtgtgtgtacatgtacatatgtgaatatga-tatccatatacatacacgca 63
|||||||| |||||||| ||||| ||| |||| |||||| ||| ||||||||||| ||
Sbjct: 5 tgtgtttacgtgtgtgtgcatgtgcatgtgtgtatatgaatatatgtatacatacacaca 64
Query: 64 cacata 69
||||||
Sbjct: 65 cacata 70
>32130_mmu-mir-466f-3:mirbase
Length = 94
Score = 44.1 bits (22), Expect = 1e-05
Identities = 56/66 (84%), Gaps = 1/66 (1%)
Strand = Plus / Plus
Query: 5 tgtgtttatgtgtgtgtacatgtacatatgtgaatatga-tatccatatacatacacgca 63
|||||||| |||||||| ||||| ||| |||| |||||| ||| ||||||||||| ||
Sbjct: 5 tgtgtttacgtgtgtgtgcatgtgcatgtgtgtatatgaatatatgtatacatacacaca 64
Query: 64 cacata 69
||||||
Sbjct: 65 cacata 70
>32131_mmu-mir-466f-3:mirbase
Length = 94
Score = 44.1 bits (22), Expect = 1e-05
Identities = 56/66 (84%), Gaps = 1/66 (1%)
Strand = Plus / Plus
Query: 5 tgtgtttatgtgtgtgtacatgtacatatgtgaatatga-tatccatatacatacacgca 63
|||||||| |||||||| ||||| ||| |||| |||||| ||| ||||||||||| ||
Sbjct: 5 tgtgtttacgtgtgtgtgcatgtgcatgtgtgtatatgaatatatgtatacatacacaca 64
Query: 64 cacata 69
||||||
Sbjct: 65 cacata 70
>31970_mmu-mir-297a-3:mirbase
Length = 102
Score = 42.1 bits (21), Expect = 5e-05
Identities = 49/57 (85%), Gaps = 1/57 (1%)
Strand = Plus / Plus
Query: 5 tgtgtttatgtgtgtgtacatgtacatatgtgaatatga-tatccatatacatacac 60
||||| ||||| ||||| ||||| ||| |||| |||||| ||| |||||||||||||
Sbjct: 4 tgtgtatatgtatgtgtgcatgtgcatgtgtgtatatgaatatacatatacatacac 60
>31971_mmu-mir-297a-4:mirbase
Length = 98
Score = 42.1 bits (21), Expect = 5e-05
Identities = 49/57 (85%), Gaps = 1/57 (1%)
Strand = Plus / Plus
Query: 5 tgtgtttatgtgtgtgtacatgtacatatgtgaatatga-tatccatatacatacac 60
||||| ||||| ||||| ||||| ||| |||| |||||| ||| |||||||||||||
Sbjct: 4 tgtgtatatgtatgtgtgcatgtgcatgtgtgtatatgagtatacatatacatacac 60
>32265_mmu-mir-669f:mirbase
Length = 121
Score = 42.1 bits (21), Expect = 5e-05
Identities = 46/53 (86%), Gaps = 1/53 (1%)
Strand = Plus / Plus
Query: 15 tgtgtgtacatgtacatatgtgaatatga-tatccatatacatacacgcacac 66
||||||| ||||| ||| |||| |||||| ||| ||||||||||||| |||||
Sbjct: 23 tgtgtgtgcatgtgcatgtgtgtatatgaatatacatatacatacacacacac 75
>32266_mmu-mir-669f:mirbase
Length = 121
Score = 42.1 bits (21), Expect = 5e-05
Identities = 46/53 (86%), Gaps = 1/53 (1%)
Strand = Plus / Plus
Query: 15 tgtgtgtacatgtacatatgtgaatatga-tatccatatacatacacgcacac 66
||||||| ||||| ||| |||| |||||| ||| ||||||||||||| |||||
Sbjct: 23 tgtgtgtgcatgtgcatgtgtgtatatgaatatacatatacatacacacacac 75
>32924_rno-mir-466b-2:mirbase
Length = 82
Score = 42.1 bits (21), Expect = 5e-05
Identities = 49/57 (85%), Gaps = 1/57 (1%)
Strand = Plus / Plus
Query: 5 tgtgtttatgtgtgtgtacatgtacatatgtgaatatga-tatccatatacatacac 60
||||| ||||||||||| |||| ||| |||| |||||| ||| |||||||||||||
Sbjct: 5 tgtgtatatgtgtgtgtgtatgtccatgtgtgtatatgattatacatatacatacac 61
>31969_mmu-mir-297a-2:mirbase
Length = 64
Score = 38.2 bits (19), Expect = 8e-04
Identities = 25/27 (92%)
Strand = Plus / Plus
Query: 2 atatgtgtttatgtgtgtgtacatgta 28
||||||| | |||||||||||||||||
Sbjct: 14 atatgtgctcatgtgtgtgtacatgta 40
>31972_mmu-mir-297a-5:mirbase
Length = 90
Score = 38.2 bits (19), Expect = 8e-04
Identities = 47/55 (85%), Gaps = 1/55 (1%)
Strand = Plus / Plus
Query: 5 tgtgtttatgtgtgtgtacatgtacatatgtgaatatga-tatccatatacatac 58
||||| ||||| ||||| ||||| ||| |||| |||||| ||| |||||||||||
Sbjct: 4 tgtgtatatgtatgtgtgcatgtgcatgtgtgtatatgagtatacatatacatac 58
>32139_mmu-mir-466k:mirbase
Length = 122
Score = 38.2 bits (19), Expect = 8e-04
Identities = 19/19 (100%)
Strand = Plus / Plus
Query: 13 tgtgtgtgtacatgtacat 31
|||||||||||||||||||
Sbjct: 20 tgtgtgtgtacatgtacat 38
>32142_mmu-mir-466m:mirbase
Length = 84
Score = 38.2 bits (19), Expect = 8e-04
Identities = 41/47 (87%), Gaps = 1/47 (2%)
Strand = Plus / Plus
Query: 15 tgtgtgtacatgtacatatgtgaatatga-tatccatatacatacac 60
||||||| ||||| ||| |||| |||||| ||| |||||||||||||
Sbjct: 13 tgtgtgtgcatgtgcatgtgtgtatatgaatatacatatacatacac 59
>32143_mmu-mir-466m:mirbase
Length = 84
Score = 38.2 bits (19), Expect = 8e-04
Identities = 41/47 (87%), Gaps = 1/47 (2%)
Strand = Plus / Plus
Query: 15 tgtgtgtacatgtacatatgtgaatatga-tatccatatacatacac 60
||||||| ||||| ||| |||| |||||| ||| |||||||||||||
Sbjct: 13 tgtgtgtgcatgtgcatgtgtgtatatgaatatacatatacatacac 59
>32262_mmu-mir-669d:mirbase
Length = 121
Score = 38.2 bits (19), Expect = 8e-04
Identities = 41/47 (87%), Gaps = 1/47 (2%)
Strand = Plus / Plus
Query: 15 tgtgtgtacatgtacatatgtgaatatga-tatccatatacatacac 60
||||||| |||||| || |||| |||||| ||| |||||||||||||
Sbjct: 45 tgtgtgtgcatgtatatgtgtgtatatgaatatacatatacatacac 91
>32273_mmu-mir-669l:mirbase
Length = 98
Score = 38.2 bits (19), Expect = 8e-04
Identities = 41/47 (87%), Gaps = 1/47 (2%)
Strand = Plus / Plus
Query: 15 tgtgtgtacatgtacatatgtgaatatga-tatccatatacatacac 60
||||||| |||||| || |||| |||||| ||| |||||||||||||
Sbjct: 22 tgtgtgtgcatgtatatgtgtgtatatgaatatacatatacatacac 68