miRNEST 2.0, an integrative microRNA resource :: BLAST
BLASTN 2.2.20 [Feb-08-2009]
Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer,
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997),
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.
>37160_dse-mir-280:mirbase
Length = 87
Score = 172 bits (87), Expect = 3e-44
Identities = 87/87 (100%)
Strand = Plus / Plus
Query: 1 tggcttttatgtatttacgttgcatatgaaatgatatttatagtaaacagattattttat 60
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1 tggcttttatgtatttacgttgcatatgaaatgatatttatagtaaacagattattttat 60
Query: 61 atgcaggtatatgcaagtcgaggtcct 87
|||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 61 atgcaggtatatgcaagtcgaggtcct 87
>36200_der-mir-280:mirbase
Length = 89
Score = 170 bits (86), Expect = 1e-43
Identities = 86/86 (100%)
Strand = Plus / Plus
Query: 1 tggcttttatgtatttacgttgcatatgaaatgatatttatagtaaacagattattttat 60
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1 tggcttttatgtatttacgttgcatatgaaatgatatttatagtaaacagattattttat 60
Query: 61 atgcaggtatatgcaagtcgaggtcc 86
||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 61 atgcaggtatatgcaagtcgaggtcc 86
>37529_dya-mir-280:mirbase
Length = 87
Score = 157 bits (79), Expect = 2e-39
Identities = 85/87 (97%)
Strand = Plus / Plus
Query: 1 tggcttttatgtatttacgttgcatatgaaatgatatttatagtaaacagattattttat 60
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1 tggcttttatgtatttacgttgcatatgaaatgatatttatagtaaacagattattttat 60
Query: 61 atgcaggtatatgcaagtcgaggtcct 87
|||||||||||||||| | ||||||||
Sbjct: 61 atgcaggtatatgcaacttgaggtcct 87
>36122_dan-mir-280:mirbase
Length = 79
Score = 153 bits (77), Expect = 3e-38
Identities = 77/77 (100%)
Strand = Plus / Plus
Query: 1 tggcttttatgtatttacgttgcatatgaaatgatatttatagtaaacagattattttat 60
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1 tggcttttatgtatttacgttgcatatgaaatgatatttatagtaaacagattattttat 60
Query: 61 atgcaggtatatgcaag 77
|||||||||||||||||
Sbjct: 61 atgcaggtatatgcaag 77
>37374_dvi-mir-280:mirbase
Length = 80
Score = 141 bits (71), Expect = 1e-34
Identities = 71/71 (100%)
Strand = Plus / Plus
Query: 1 tggcttttatgtatttacgttgcatatgaaatgatatttatagtaaacagattattttat 60
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1 tggcttttatgtatttacgttgcatatgaaatgatatttatagtaaacagattattttat 60
Query: 61 atgcaggtata 71
|||||||||||
Sbjct: 61 atgcaggtata 71
>37453_dwi-mir-280:mirbase
Length = 81
Score = 141 bits (71), Expect = 1e-34
Identities = 74/75 (98%)
Strand = Plus / Plus
Query: 2 ggcttttatgtatttacgttgcatatgaaatgatatttatagtaaacagattattttata 61
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1 ggcttttatgtatttacgttgcatatgaaatgatatttatagtaaacagattattttata 60
Query: 62 tgcaggtatatgcaa 76
||||||||| |||||
Sbjct: 61 tgcaggtatgtgcaa 75
>36874_dpe-mir-280:mirbase
Length = 87
Score = 139 bits (70), Expect = 4e-34
Identities = 73/74 (98%)
Strand = Plus / Plus
Query: 2 ggcttttatgtatttacgttgcatatgaaatgatatttatagtaaacagattattttata 61
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1 ggcttttatgtatttacgttgcatatgaaatgatatttatagtaaacagattattttata 60
Query: 62 tgcaggtatatgca 75
||||||||| ||||
Sbjct: 61 tgcaggtatgtgca 74
>36954_dps-mir-280:mirbase
Length = 94
Score = 139 bits (70), Expect = 4e-34
Identities = 73/74 (98%)
Strand = Plus / Plus
Query: 2 ggcttttatgtatttacgttgcatatgaaatgatatttatagtaaacagattattttata 61
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1 ggcttttatgtatttacgttgcatatgaaatgatatttatagtaaacagattattttata 60
Query: 62 tgcaggtatatgca 75
||||||||| ||||
Sbjct: 61 tgcaggtatgtgca 74
>36797_dmo-mir-280:mirbase
Length = 83
Score = 137 bits (69), Expect = 2e-33
Identities = 69/69 (100%)
Strand = Plus / Plus
Query: 3 gcttttatgtatttacgttgcatatgaaatgatatttatagtaaacagattattttatat 62
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 3 gcttttatgtatttacgttgcatatgaaatgatatttatagtaaacagattattttatat 62
Query: 63 gcaggtata 71
|||||||||
Sbjct: 63 gcaggtata 71
>36289_dgr-mir-280:mirbase
Length = 72
Score = 131 bits (66), Expect = 1e-31
Identities = 66/66 (100%)
Strand = Plus / Plus
Query: 6 tttatgtatttacgttgcatatgaaatgatatttatagtaaacagattattttatatgca 65
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1 tttatgtatttacgttgcatatgaaatgatatttatagtaaacagattattttatatgca 60
Query: 66 ggtata 71
||||||
Sbjct: 61 ggtata 66
