miRNEST 2.0, an integrative microRNA resource :: BLAST
BLASTN 2.2.20 [Feb-08-2009]
Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer,
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997),
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.
>47071_ath-miR842:pmrd
Length = 199
Score = 394 bits (199), Expect = e-111
Identities = 199/199 (100%)
Strand = Plus / Plus
Query: 1 cagtaccgttcagggtgacagaaacattttcgaaaagagaggctataagcgggatgatga 60
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Sbjct: 1 cagtaccgttcagggtgacagaaacattttcgaaaagagaggctataagcgggatgatga 60
Query: 61 atccgaccatgatggtgttgcagaaatttatgtatgatgtagttattgtccagggatcga 120
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Sbjct: 61 atccgaccatgatggtgttgcagaaatttatgtatgatgtagttattgtccagggatcga 120
Query: 121 aacaccatcatggtcagatccgtcatcccacttatgttttcttaggtcaacaaatatgga 180
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Sbjct: 121 aacaccatcatggtcagatccgtcatcccacttatgttttcttaggtcaacaaatatgga 180
Query: 181 caattgaaaagtgaagctc 199
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Sbjct: 181 caattgaaaagtgaagctc 199
>47157_ath-miRf10057-akr:pmrd
Length = 127
Score = 252 bits (127), Expect = 9e-68
Identities = 127/127 (100%)
Strand = Plus / Plus
Query: 37 gagaggctataagcgggatgatgaatccgaccatgatggtgttgcagaaatttatgtatg 96
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Sbjct: 1 gagaggctataagcgggatgatgaatccgaccatgatggtgttgcagaaatttatgtatg 60
Query: 97 atgtagttattgtccagggatcgaaacaccatcatggtcagatccgtcatcccacttatg 156
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Sbjct: 61 atgtagttattgtccagggatcgaaacaccatcatggtcagatccgtcatcccacttatg 120
Query: 157 ttttctt 163
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Sbjct: 121 ttttctt 127
>47469_ath-miRf10369-akr:pmrd
Length = 109
Score = 216 bits (109), Expect = 5e-57
Identities = 109/109 (100%)
Strand = Plus / Minus
Query: 46 taagcgggatgatgaatccgaccatgatggtgttgcagaaatttatgtatgatgtagtta 105
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Sbjct: 109 taagcgggatgatgaatccgaccatgatggtgttgcagaaatttatgtatgatgtagtta 50
Query: 106 ttgtccagggatcgaaacaccatcatggtcagatccgtcatcccactta 154
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Sbjct: 49 ttgtccagggatcgaaacaccatcatggtcagatccgtcatcccactta 1
>48086_ath-miRf10986-akr:pmrd
Length = 105
Score = 208 bits (105), Expect = 1e-54
Identities = 105/105 (100%)
Strand = Plus / Minus
Query: 48 agcgggatgatgaatccgaccatgatggtgttgcagaaatttatgtatgatgtagttatt 107
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Sbjct: 105 agcgggatgatgaatccgaccatgatggtgttgcagaaatttatgtatgatgtagttatt 46
Query: 108 gtccagggatcgaaacaccatcatggtcagatccgtcatcccact 152
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Sbjct: 45 gtccagggatcgaaacaccatcatggtcagatccgtcatcccact 1
>47156_ath-miRf10056-akr:pmrd
Length = 105
Score = 208 bits (105), Expect = 1e-54
Identities = 105/105 (100%)
Strand = Plus / Plus
Query: 48 agcgggatgatgaatccgaccatgatggtgttgcagaaatttatgtatgatgtagttatt 107
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Sbjct: 1 agcgggatgatgaatccgaccatgatggtgttgcagaaatttatgtatgatgtagttatt 60
Query: 108 gtccagggatcgaaacaccatcatggtcagatccgtcatcccact 152
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Sbjct: 61 gtccagggatcgaaacaccatcatggtcagatccgtcatcccact 105
