miRNEST 2.0, an integrative microRNA resource :: BLAST
BLASTN 2.2.20 [Feb-08-2009]
Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer,
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997),
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.
>40861_mtr-MIR2618b:mirbase
Length = 287
Score = 167 bits (84), Expect = 7e-42
Identities = 108/116 (93%)
Strand = Plus / Plus
Query: 224 ttaatgtaaattcagtttatttatgttcaatttaagttaatgtaaattaattttacgtat 283
|||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| || || |||
Sbjct: 172 ttaatgtaaattcaatttacttatgttcaatttaagttaatgtaaattaagttaacatat 231
Query: 284 gtatataagagattagtgtgaattcagtttacgtacgttcaatttatgttaatgta 339
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||
Sbjct: 232 gtatataagaggttagtgtgaattcagtttacgtacgttcaatctaggttaatgta 287
Score = 151 bits (76), Expect = 4e-37
Identities = 136/156 (87%)
Strand = Plus / Plus
Query: 76 taggttaatgtaaattcagtttacgtatattcaatttagtttaatgtaaattcaatttac 135
|||||||||||||||| | ||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct: 132 taggttaatgtaaatttaatttacttatgaacaatttagattaatgtaaattcaatttac 191
Query: 136 gtatgttaaatttaggttaacgtaaattaagtttacgtatgtttataagaggttagtatg 195
|||||| |||||| ||||| |||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||
Sbjct: 192 ttatgttcaatttaagttaatgtaaattaagttaacatatgtatataagaggttagtgtg 251
Query: 196 aatttagtttagttatgtttaatctaggttaatgta 231
|||| |||||| || ||| ||||||||||||||||
Sbjct: 252 aattcagtttacgtacgttcaatctaggttaatgta 287
Score = 121 bits (61), Expect = 4e-28
Identities = 103/117 (88%)
Strand = Plus / Plus
Query: 169 tacgtatgtttataagaggttagtatgaatttagtttagttatgtttaatctaggttaat 228
||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||
Sbjct: 81 tacgtatgtatataagaggttagtgtgaatttaatttacttatgtttaatctaggttaat 140
Query: 229 gtaaattcagtttatttatgttcaatttaagttaatgtaaattaattttacgtatgt 285
||||||| | |||| ||||| ||||||| |||||||||||| | ||||| |||||
Sbjct: 141 gtaaatttaatttacttatgaacaatttagattaatgtaaattcaatttacttatgt 197
Score = 85.7 bits (43), Expect = 2e-17
Identities = 100/118 (84%), Gaps = 2/118 (1%)
Strand = Plus / Plus
Query: 6 ttaatgtaatttcagtttacgtatgttcaatttaggttaatgtaaattcagtttacttat 65
||||||||| |||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||| || |||
Sbjct: 172 ttaatgtaaattcaatttacttatgttcaatttaagttaatgtaaattaagttaacatat 231
Query: 66 gtatatggtgtaggttaatgtaaattcagtttacgtatattcaatttagtttaatgta 123
|||||| |||||| ||| ||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||
Sbjct: 232 gtatat--aagaggttagtgtgaattcagtttacgtacgttcaatctaggttaatgta 287
Score = 71.9 bits (36), Expect = 3e-13
Identities = 90/107 (84%), Gaps = 2/107 (1%)
Strand = Plus / Plus
Query: 21 tttacgtatgttcaatttaggttaatgtaaattcagtttacttatgtatatggtgtaggt 80
||||| |||||| ||| |||||||||||||||| | |||||||||| | | | ||| |
Sbjct: 115 tttacttatgtttaatctaggttaatgtaaatttaatttacttatgaaca--atttagat 172
Query: 81 taatgtaaattcagtttacgtatattcaatttagtttaatgtaaatt 127
||||||||||||| ||||| ||| ||||||||| ||||||||||||
Sbjct: 173 taatgtaaattcaatttacttatgttcaatttaagttaatgtaaatt 219
Score = 67.9 bits (34), Expect = 5e-12
Identities = 58/66 (87%)
Strand = Plus / Plus
Query: 2 taggttaatgtaatttcagtttacgtatgttcaatttaggttaatgtaaattcagtttac 61
||||||||||||| || | ||||| |||| |||||||| |||||||||||||| |||||
Sbjct: 132 taggttaatgtaaatttaatttacttatgaacaatttagattaatgtaaattcaatttac 191
Query: 62 ttatgt 67
||||||
Sbjct: 192 ttatgt 197
Score = 63.9 bits (32), Expect = 8e-11
Identities = 56/64 (87%)
Strand = Plus / Plus
Query: 277 tacgtatgtatataagagattagtgtgaattcagtttacgtacgttcaatttatgttaat 336
|||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||| || ||| ||| || ||||||
Sbjct: 81 tacgtatgtatataagaggttagtgtgaatttaatttacttatgtttaatctaggttaat 140
Query: 337 gtaa 340
||||
Sbjct: 141 gtaa 144
Score = 54.0 bits (27), Expect = 7e-08
Identities = 42/47 (89%)
Strand = Plus / Plus
Query: 3 aggttaatgtaatttcagtttacgtatgttcaatttaggttaatgta 49
|||||| ||| | ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||
Sbjct: 241 aggttagtgtgaattcagtttacgtacgttcaatctaggttaatgta 287
Score = 52.0 bits (26), Expect = 3e-07
Identities = 83/102 (81%)
Strand = Plus / Plus
Query: 77 aggttaatgtaaattcagtttacgtatattcaatttagtttaatgtaaattcaatttacg 136
|||||| ||| |||| | ||||| ||| || ||| ||| |||||||||||| |||||||
Sbjct: 97 aggttagtgtgaatttaatttacttatgtttaatctaggttaatgtaaatttaatttact 156
Query: 137 tatgttaaatttaggttaacgtaaattaagtttacgtatgtt 178
|||| ||||||| |||| ||||||| | ||||| ||||||
Sbjct: 157 tatgaacaatttagattaatgtaaattcaatttacttatgtt 198
