miRNEST 2.0: an integrative microRNA resource miRNEST 2.0, an integrative microRNA resource :: BLAST


>45522_miR809:micropc
          Length = 100

 Score =  121 bits (61), Expect = 2e-28
 Identities = 85/93 (91%)
 Strand = Plus / Minus

                                                                       
Query: 46  cattttccacattcatattgatgttaatgaatctagatagatatatatgtctagattcat 105
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Sbjct: 93  catttcccacattcgtgttgatgttaatgaatctagatagatacatatgtctagattcat 34

                                            
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           |||| ||| || |||||||| ||||||||||||
Sbjct: 33  taacatcattacgaatgtggaaaatgctagaat 1



 Score =  103 bits (52), Expect = 4e-23
 Identities = 85/96 (88%)
 Strand = Plus / Plus

                                                                       
Query: 43  tagcattttccacattcatattgatgttaatgaatctagatagatatatatgtctagatt 102
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Sbjct: 5   tagcattttccacattcgtaatgatgttaatgaatctagacatatgtatctatctagatt 64

                                               
Query: 103 cattaacttcaatatgaatgtgggaaatgctagaat 138
           ||||||| |||| | |||||||||||||| ||||||
Sbjct: 65  cattaacatcaacacgaatgtgggaaatgatagaat 100




>46833_miR446:micropc
          Length = 81

 Score =  119 bits (60), Expect = 7e-28
 Identities = 69/72 (95%)
 Strand = Plus / Minus

                                                                       
Query: 46  cattttccacattcatattgatgttaatgaatctagatagatatatatgtctagattcat 105
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Sbjct: 81  cattttccacattcatattgatgttaatgaatttagatagatatgtatgtctagattcat 22

                       
Query: 106 taacttcaatat 117
           |||| |||||||
Sbjct: 21  taacatcaatat 10



 Score = 79.8 bits (40), Expect = 6e-16
 Identities = 64/72 (88%)
 Strand = Plus / Plus

                                                                       
Query: 60  atattgatgttaatgaatctagatagatatatatgtctagattcattaacttcaatatga 119
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Sbjct: 10  atattgatgttaatgaatctagacatacatatctatctaaattcattaacatcaatatga 69

                       
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           |||||| |||||
Sbjct: 70  atgtggaaaatg 81




>46080_miR809:micropc
          Length = 99

 Score =  119 bits (60), Expect = 7e-28
 Identities = 91/100 (91%), Gaps = 1/100 (1%)
 Strand = Plus / Plus

                                                                       
Query: 39  attttagcattttccacattcatattgatgttaatgaatctagatagatatatatgtcta 98
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Sbjct: 1   attttagtatttcccacattcatattgatgctgatga-tctagatagatatatatgtcta 59

                                                   
Query: 99  gattcattaacttcaatatgaatgtgggaaatgctagaat 138
            |||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct: 60  tattcattaccatcaatatgaatgtgagaaatgctagaat 99



 Score = 71.9 bits (36), Expect = 2e-13
 Identities = 76/88 (86%), Gaps = 1/88 (1%)
 Strand = Plus / Minus

                                                                       
Query: 43  tagcattttccacattcatattgatgttaatgaatctagatagatatatatgtctagatt 102
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Sbjct: 95  tagcatttctcacattcatattgatggtaatgaatatagacatatatatctatctaga-t 37

                                       
Query: 103 cattaacttcaatatgaatgtgggaaat 130
           ||| | | ||||||||||||||||||||
Sbjct: 36  catcagcatcaatatgaatgtgggaaat 9




>45707_miR809:micropc
          Length = 99

 Score =  119 bits (60), Expect = 7e-28
 Identities = 91/100 (91%), Gaps = 1/100 (1%)
 Strand = Plus / Plus

                                                                       
Query: 39  attttagcattttccacattcatattgatgttaatgaatctagatagatatatatgtcta 98
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Sbjct: 1   attttagtatttcccacattcatattgatgctgatga-tctagatagatatatatgtcta 59

                                                   
Query: 99  gattcattaacttcaatatgaatgtgggaaatgctagaat 138
            |||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct: 60  tattcattaccatcaatatgaatgtgagaaatgctagaat 99



 Score = 71.9 bits (36), Expect = 2e-13
 Identities = 76/88 (86%), Gaps = 1/88 (1%)
 Strand = Plus / Minus

                                                                       
Query: 43  tagcattttccacattcatattgatgttaatgaatctagatagatatatatgtctagatt 102
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Sbjct: 95  tagcatttctcacattcatattgatggtaatgaatatagacatatatatctatctaga-t 37

                                       
Query: 103 cattaacttcaatatgaatgtgggaaat 130
           ||| | | ||||||||||||||||||||
Sbjct: 36  catcagcatcaatatgaatgtgggaaat 9




>45913_miR809:micropc
          Length = 100

 Score =  113 bits (57), Expect = 5e-26
 Identities = 89/97 (91%), Gaps = 2/97 (2%)
 Strand = Plus / Plus

                                                                       
Query: 43  tagcattttccacattcatatt-gatgttaatgaatctagatagatatatatgtctagat 101
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Sbjct: 5   tagcatttttcgcattcatatttgatgttaataaatctagatagatatatattt-tagat 63

                                                
Query: 102 tcattaacttcaatatgaatgtgggaaatgctagaat 138
           |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct: 64  tcattaacatcaatatgaatgtgggaaatgttagaat 100



 Score = 75.8 bits (38), Expect = 1e-14
 Identities = 82/94 (87%), Gaps = 2/94 (2%)
 Strand = Plus / Minus

                                                                       
Query: 46  cattttccacattcatattgatgttaatgaatctagatagatatatatgtctagattcat 105
           ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||| | |||||||| ||
Sbjct: 93  catttcccacattcatattgatgttaatgaatcta-aaatatatatctatctagatttat 35

                                             
Query: 106 taacttc-aatatgaatgtgggaaatgctagaat 138
           |||| || |||||||||| |  ||||||||||||
Sbjct: 34  taacatcaaatatgaatgcgaaaaatgctagaat 1




>45708_miR809:micropc
          Length = 100

 Score =  113 bits (57), Expect = 5e-26
 Identities = 78/85 (91%)
 Strand = Plus / Plus

                                                                       
Query: 46  cattttccacattcatattgatgttaatgaatctagatagatatatatgtctagattcat 105
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Sbjct: 8   catttttcatattcatattgatattaatgaatctagatagatatatatgtctagattcat 67

                                    
Query: 106 taacttcaatatgaatgtgggaaat 130
           || | ||||||| |||||| |||||
Sbjct: 68  tagcatcaatataaatgtgagaaat 92



 Score = 75.8 bits (38), Expect = 1e-14
 Identities = 74/86 (86%)
 Strand = Plus / Minus

                                                                       
Query: 53  cacattcatattgatgttaatgaatctagatagatatatatgtctagattcattaacttc 112
           |||||| ||||||||| ||||||||||||| | |||||| | ||||||||||||||  ||
Sbjct: 86  cacatttatattgatgctaatgaatctagacatatatatctatctagattcattaatatc 27

                                     
Query: 113 aatatgaatgtgggaaatgctagaat 138
           ||||||||| ||  ||||| ||||||
Sbjct: 26  aatatgaatatgaaaaatgttagaat 1




>46801_miR809:micropc
          Length = 110

 Score =  111 bits (56), Expect = 2e-25
 Identities = 68/72 (94%)
 Strand = Plus / Plus

                                                                       
Query: 46  cattttccacattcatattgatgttaatgaatctagatagatatatatgtctagattcat 105
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Sbjct: 8   catttcccacattcatattaatgttaatgaatctagatagatatatatgtttagattcat 67

                       
Query: 106 taacttcaatat 117
           |||| |||||||
Sbjct: 68  taacatcaatat 79



 Score = 93.7 bits (47), Expect = 4e-20
 Identities = 71/79 (89%)
 Strand = Plus / Minus

                                                                       
Query: 60  atattgatgttaatgaatctagatagatatatatgtctagattcattaacttcaatatga 119
           ||||||||||||||||||||| | | |||||| | ||||||||||||||| | |||||||
Sbjct: 79  atattgatgttaatgaatctaaacatatatatctatctagattcattaacattaatatga 20

                              
Query: 120 atgtgggaaatgctagaat 138
           |||||||||||| ||||||
Sbjct: 19  atgtgggaaatgatagaat 1




>46775_miR808:micropc
          Length = 98

 Score =  111 bits (56), Expect = 2e-25
 Identities = 88/96 (91%), Gaps = 2/96 (2%)
 Strand = Plus / Plus

                                                                       
Query: 43  tagcattttccacattcatatt-gatgttaatgaatctagatagatatatatgtctagat 101
           ||||||||| | |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||
Sbjct: 4   tagcatttttcgcattcatatttgatgttaataaatctagatagatatatattt-tagat 62

                                               
Query: 102 tcattaacttcaatatgaatgtgggaaatgctagaa 137
           |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct: 63  tcattaacatcaatatgaatgtgggaaatgttagaa 98



 Score = 73.8 bits (37), Expect = 4e-14
 Identities = 81/93 (87%), Gaps = 2/93 (2%)
 Strand = Plus / Minus

                                                                       
Query: 46  cattttccacattcatattgatgttaatgaatctagatagatatatatgtctagattcat 105
           ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||| | |||||||| ||
Sbjct: 92  catttcccacattcatattgatgttaatgaatcta-aaatatatatctatctagatttat 34

                                            
Query: 106 taacttc-aatatgaatgtgggaaatgctagaa 137
           |||| || |||||||||| |  |||||||||||
Sbjct: 33  taacatcaaatatgaatgcgaaaaatgctagaa 1




>46637_miR446:micropc
          Length = 80

 Score =  105 bits (53), Expect = 1e-23
 Identities = 62/65 (95%)
 Strand = Plus / Minus

                                                                       
Query: 56  attcatattgatgttaatgaatctagatagatatatatgtctagattcattaacttcaat 115
           |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||
Sbjct: 72  attcatattgatgttaatgaatctagctagatatatatgtctagattcattaacattaat 13

                
Query: 116 atgaa 120
           |||||
Sbjct: 12  atgaa 8



 Score = 81.8 bits (41), Expect = 2e-16
 Identities = 65/73 (89%)
 Strand = Plus / Plus

                                                                       
Query: 57  ttcatattgatgttaatgaatctagatagatatatatgtctagattcattaacttcaata 116
           |||||||| ||||||||||||||||| | |||||| |  |||||||||||||| ||||||
Sbjct: 8   ttcatattaatgttaatgaatctagacatatatatctagctagattcattaacatcaata 67

                        
Query: 117 tgaatgtgggaaa 129
           ||||| |||||||
Sbjct: 68  tgaatatgggaaa 80




>45342_miR809:micropc
          Length = 100

 Score =  105 bits (53), Expect = 1e-23
 Identities = 83/93 (89%)
 Strand = Plus / Minus

                                                                       
Query: 46  cattttccacattcatattgatgttaatgaatctagatagatatatatgtctagattcat 105
           ||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |
Sbjct: 93  catttcccatattcatattaatgttaatgaatctagatggatatatatgtctagattcgt 34

                                            
Query: 106 taacttcaatatgaatgtgggaaatgctagaat 138
           || | ||||||||||| || ||||||| |||||
Sbjct: 33  tagcatcaatatgaatatgagaaatgccagaat 1



 Score = 77.8 bits (39), Expect = 2e-15
 Identities = 72/83 (86%)
 Strand = Plus / Plus

                                                                       
Query: 56  attcatattgatgttaatgaatctagatagatatatatgtctagattcattaacttcaat 115
           ||||||||||||| ||| ||||||||| | ||||||   ||||||||||||||| | |||
Sbjct: 18  attcatattgatgctaacgaatctagacatatatatccatctagattcattaacattaat 77

                                  
Query: 116 atgaatgtgggaaatgctagaat 138
           |||||| ||||||||| ||||||
Sbjct: 78  atgaatatgggaaatgttagaat 100




>46758_miR808:micropc
          Length = 98

 Score =  103 bits (52), Expect = 4e-23
 Identities = 82/92 (89%)
 Strand = Plus / Minus

                                                                       
Query: 46  cattttccacattcatattgatgttaatgaatctagatagatatatatgtctagattcat 105
           ||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |
Sbjct: 92  catttcccatattcatattaatgttaatgaatctagatggatatatatgtctagattcgt 33

                                           
Query: 106 taacttcaatatgaatgtgggaaatgctagaa 137
           || | ||||||||||| || ||||||| ||||
Sbjct: 32  tagcatcaatatgaatatgagaaatgccagaa 1



 Score = 75.8 bits (38), Expect = 1e-14
 Identities = 71/82 (86%)
 Strand = Plus / Plus

                                                                       
Query: 56  attcatattgatgttaatgaatctagatagatatatatgtctagattcattaacttcaat 115
           ||||||||||||| ||| ||||||||| | ||||||   ||||||||||||||| | |||
Sbjct: 17  attcatattgatgctaacgaatctagacatatatatccatctagattcattaacattaat 76

                                 
Query: 116 atgaatgtgggaaatgctagaa 137
           |||||| ||||||||| |||||
Sbjct: 77  atgaatatgggaaatgttagaa 98




>45995_miR446:micropc
          Length = 86

 Score =  101 bits (51), Expect = 2e-22
 Identities = 80/87 (91%), Gaps = 2/87 (2%)
 Strand = Plus / Plus

                                                                       
Query: 46  cattttccacattcatatt-gatgttaatgaatctagatagatatatatgtctagattca 104
           |||||| | |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||
Sbjct: 1   catttttcgcattcatatttgatgttaataaatctagatagatatatattt-tagattca 59

                                      
Query: 105 ttaacttcaatatgaatgtgggaaatg 131
           ||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct: 60  ttaacatcaatatgaatgtgggaaatg 86



 Score = 67.9 bits (34), Expect = 2e-12
 Identities = 69/78 (88%), Gaps = 2/78 (2%)
 Strand = Plus / Minus

                                                                       
Query: 46  cattttccacattcatattgatgttaatgaatctagatagatatatatgtctagattcat 105
           ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||| | |||||||| ||
Sbjct: 86  catttcccacattcatattgatgttaatgaatcta-aaatatatatctatctagatttat 28

                             
Query: 106 taacttc-aatatgaatg 122
           |||| || ||||||||||
Sbjct: 27  taacatcaaatatgaatg 10




>45717_miR446:micropc
          Length = 86

 Score =  101 bits (51), Expect = 2e-22
 Identities = 80/87 (91%), Gaps = 2/87 (2%)
 Strand = Plus / Plus

                                                                       
Query: 46  cattttccacattcatatt-gatgttaatgaatctagatagatatatatgtctagattca 104
           |||||| | |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||
Sbjct: 1   catttttcgcattcatatttgatgttaataaatctagatagatatatattt-tagattca 59

                                      
Query: 105 ttaacttcaatatgaatgtgggaaatg 131
           ||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct: 60  ttaacatcaatatgaatgtgggaaatg 86



 Score = 67.9 bits (34), Expect = 2e-12
 Identities = 69/78 (88%), Gaps = 2/78 (2%)
 Strand = Plus / Minus

                                                                       
Query: 46  cattttccacattcatattgatgttaatgaatctagatagatatatatgtctagattcat 105
           ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||| | |||||||| ||
Sbjct: 86  catttcccacattcatattgatgttaatgaatcta-aaatatatatctatctagatttat 28

                             
Query: 106 taacttc-aatatgaatg 122
           |||| || ||||||||||
Sbjct: 27  taacatcaaatatgaatg 10




>45176_miR446:micropc
          Length = 86

 Score =  101 bits (51), Expect = 2e-22
 Identities = 80/87 (91%), Gaps = 2/87 (2%)
 Strand = Plus / Plus

                                                                       
Query: 46  cattttccacattcatatt-gatgttaatgaatctagatagatatatatgtctagattca 104
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Sbjct: 1   catttttcgcattcatatttgatgttaataaatctagatagatatatattt-tagattca 59

                                      
Query: 105 ttaacttcaatatgaatgtgggaaatg 131
           ||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct: 60  ttaacatcaatatgaatgtgggaaatg 86



 Score = 67.9 bits (34), Expect = 2e-12
 Identities = 69/78 (88%), Gaps = 2/78 (2%)
 Strand = Plus / Minus

                                                                       
Query: 46  cattttccacattcatattgatgttaatgaatctagatagatatatatgtctagattcat 105
           ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||| | |||||||| ||
Sbjct: 86  catttcccacattcatattgatgttaatgaatcta-aaatatatatctatctagatttat 28

                             
Query: 106 taacttc-aatatgaatg 122
           |||| || ||||||||||
Sbjct: 27  taacatcaaatatgaatg 10




>46318_miR446:micropc
          Length = 86

 Score = 99.6 bits (50), Expect = 7e-22
 Identities = 77/86 (89%)
 Strand = Plus / Plus

                                                                       
Query: 46  cattttccacattcatattgatgttaatgaatctagatagatatatatgtctagattcat 105
           ||||| ||| ||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||
Sbjct: 1   catttcccatatttataatgatgttaatgaatctatatagatatatatgtctagatttat 60

                                     
Query: 106 taacttcaatatgaatgtgggaaatg 131
           |||| ||||||||||| | |||||||
Sbjct: 61  taacgtcaatatgaatataggaaatg 86



 Score = 63.9 bits (32), Expect = 4e-11
 Identities = 65/76 (85%)
 Strand = Plus / Minus

                                                                       
Query: 56  attcatattgatgttaatgaatctagatagatatatatgtctagattcattaacttcaat 115
           ||||||||||| |||||| |||||||| | |||||| | | ||||||||||||| ||| |
Sbjct: 76  attcatattgacgttaataaatctagacatatatatctatatagattcattaacatcatt 17

                           
Query: 116 atgaatgtgggaaatg 131
           || ||| |||||||||
Sbjct: 16  ataaatatgggaaatg 1




>45731_miR446:micropc
          Length = 86

 Score = 91.7 bits (46), Expect = 2e-19
 Identities = 76/86 (88%)
 Strand = Plus / Plus

                                                                       
Query: 46  cattttccacattcatattgatgttaatgaatctagatagatatatatgtctagattcat 105
           |||| ||||||||||||| ||| |||||||||||| | | |||| | |||||||||||||
Sbjct: 1   cattgtccacattcatatagattttaatgaatctaaacatatatgtgtgtctagattcat 60

                                     
Query: 106 taacttcaatatgaatgtgggaaatg 131
           |||| |||||||||||||||| ||||
Sbjct: 61  taacatcaatatgaatgtgggcaatg 86



 Score = 91.7 bits (46), Expect = 2e-19
 Identities = 67/74 (90%)
 Strand = Plus / Minus

                                                                       
Query: 52  ccacattcatattgatgttaatgaatctagatagatatatatgtctagattcattaactt 111
           ||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||| ||||||||||||  |
Sbjct: 80  ccacattcatattgatgttaatgaatctagacacacatatatgtttagattcattaaaat 21

                         
Query: 112 caatatgaatgtgg 125
           | ||||||||||||
Sbjct: 20  ctatatgaatgtgg 7




>46589_miR809:micropc
          Length = 100

 Score = 79.8 bits (40), Expect = 6e-16
 Identities = 85/100 (85%)
 Strand = Plus / Plus

                                                                       
Query: 39  attttagcattttccacattcatattgatgttaatgaatctagatagatatatatgtcta 98
           |||||| ||||||  ||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||| | ||
Sbjct: 1   attttaacattttatacatttataatgatgttaataaatctagatagatatatattttta 60

                                                   
Query: 99  gattcattaacttcaatatgaatgtgggaaatgctagaat 138
           ||||||||||  || ||||||| |||  ||||| ||||||
Sbjct: 61  gattcattaatatcgatatgaacgtgaaaaatgttagaat 100



 Score = 52.0 bits (26), Expect = 1e-07
 Identities = 65/78 (83%)
 Strand = Plus / Minus

                                                                       
Query: 46  cattttccacattcatattgatgttaatgaatctagatagatatatatgtctagattcat 105
           |||||| ||| ||||||| ||| |||||||||||| | | |||||| | |||||||| ||
Sbjct: 93  catttttcacgttcatatcgatattaatgaatctaaaaatatatatctatctagatttat 34

                             
Query: 106 taacttcaatatgaatgt 123
           |||| ||| ||| |||||
Sbjct: 33  taacatcattataaatgt 16




>46464_miR1132:micropc
          Length = 149

 Score = 71.9 bits (36), Expect = 2e-13
 Identities = 99/120 (82%)
 Strand = Plus / Plus

                                                                       
Query: 18  ctccatttcacaatgtaagtcattttagcattttccacattcatattgatgttaatgaat 77
           |||| |||||||||||||  | || |||||||   || |||||||| ||| |||||||||
Sbjct: 4   ctccgtttcacaatgtaatactttctagcattgcacatattcatatagatattaatgaat 63

                                                                       
Query: 78  ctagatagatatatatgtctagattcattaacttcaatatgaatgtgggaaatgctagaa 137
           ||||  | |||||| ||| |||||||||||||||| |||| ||| |||| | ||||||||
Sbjct: 64  ctaggcatatatatgtgtttagattcattaacttctatataaatatgggtagtgctagaa 123



 Score = 63.9 bits (32), Expect = 4e-11
 Identities = 77/92 (83%)
 Strand = Plus / Minus

                                                                       
Query: 68  gttaatgaatctagatagatatatatgtctagattcattaacttcaatatgaatgtggga 127
           ||||||||||||| | | ||||||||| |||||||||||||  || |||||||| || | 
Sbjct: 95  gttaatgaatctaaacacatatatatgcctagattcattaatatctatatgaatatgtgc 36

                                           
Query: 128 aatgctagaatgacttaaattgtgaaatggag 159
           |||||||||| |  ||| ||||||||| ||||
Sbjct: 35  aatgctagaaagtattacattgtgaaacggag 4