miRNEST 2.0, an integrative microRNA resource :: BLAST
>42125_osa-MIR809d:mirbase
Length = 167
Score = 168 bits (85), Expect = 8e-43
Identities = 134/153 (87%), Gaps = 13/153 (8%)
Strand = Plus / Plus
Query: 3 tactccctccgtttcacaatgtaagtcattctagcattttccatattcatattgatgtta 62
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||
Sbjct: 9 tactccctccgtttcacaatgtaagtcattctagcatttcccacattcatattgatgtta 68
Query: 63 atgaatctaga-------------ctagatttattaacatcaatataaatgtgagaaatg 109
||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct: 69 atgaatctagacatagttatctatctagattcattaacatcaatatgaatgtgagaaatg 128
Query: 110 ctagaatgacttacattatgaaacggaggaagt 142
|||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct: 129 ttagaatgacttacattgtgaaacggaggaagt 161
Score = 137 bits (69), Expect = 3e-33
Identities = 127/149 (85%), Gaps = 13/149 (8%)
Strand = Plus / Minus
Query: 3 tactccctccgtttcacaatgtaagtcattctagcattttccatattcatattgatgtta 62
|||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||
Sbjct: 162 tacttcctccgtttcacaatgtaagtcattctaacatttctcacattcatattgatgtta 103
Query: 63 atgaatctaga-------------ctagatttattaacatcaatataaatgtgagaaatg 109
||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||
Sbjct: 102 atgaatctagatagataactatgtctagattcattaacatcaatatgaatgtgggaaatg 43
Query: 110 ctagaatgacttacattatgaaacggagg 138
||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct: 42 ctagaatgacttacattgtgaaacggagg 14
>42077_osa-MIR441b:mirbase
Length = 152
Score = 137 bits (69), Expect = 3e-33
Identities = 117/131 (89%), Gaps = 4/131 (3%)
Strand = Plus / Plus
Query: 3 tactccctccgtttcacaatgtaagtcattctagcattttccatattcatattgatgtta 62
|||| ||||||||||||||||||||||||| ||| | ||| |||||||||||||||||||
Sbjct: 16 tacttcctccgtttcacaatgtaagtcattttagtaattttcatattcatattgatgtta 75
Query: 63 atgaatctagactagatttattaacatcaatataaatgtgagaaatgctagaatgactta 122
||||||||||||| || || |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||
Sbjct: 76 atgaatctagact-cat---gtaccatcaatataaatgtgggaaatggtagaatgactta 131
Query: 123 cattatgaaac 133
|||||||||||
Sbjct: 132 cattatgaaac 142
Score = 85.7 bits (43), Expect = 9e-18
Identities = 110/131 (83%), Gaps = 6/131 (4%)
Strand = Plus / Minus
Query: 13 gtttcacaatgtaagtcattctagcattttccatattcatattgatgtta-atgaatcta 71
|||||| |||||||||||||||| ||||| ||| ||| ||||||||| || |||| ||||
Sbjct: 142 gtttcataatgtaagtcattctaccatttcccacatttatattgatggtacatgagtcta 83
Query: 72 gactagatttattaacatcaatataaatgtgagaaatgctagaatgacttacattatgaa 131
|| || |||||||||||||| ||| ||| || | ||| ||||||||||||| ||||
Sbjct: 82 ga-----ttcattaacatcaatatgaatatgaaaattactaaaatgacttacattgtgaa 28
Query: 132 acggaggaagt 142
|||||||||||
Sbjct: 27 acggaggaagt 17
>42121_osa-MIR808:mirbase
Length = 152
Score = 135 bits (68), Expect = 1e-32
Identities = 129/152 (84%), Gaps = 13/152 (8%)
Strand = Plus / Minus
Query: 4 actccctccgtttcacaatgtaagtcattctagcattttccatattcatattgatgttaa 63
||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||
Sbjct: 152 actccctccatttcacaatgtaagtcattcttacatttcccacattcatattgatgttaa 93
Query: 64 tgaatctaga-------------ctagatttattaacatcaatataaatgtgagaaatgc 110
|||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||
Sbjct: 92 tgaatctagacatatatatctatctagattcattaacatcaatatgaatgtggaaaatgc 33
Query: 111 tagaatgacttacattatgaaacggaggaagt 142
|||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct: 32 tagaatgacttacattgtgaaacggaggaagt 1
Score = 135 bits (68), Expect = 1e-32
Identities = 123/144 (85%), Gaps = 13/144 (9%)
Strand = Plus / Plus
Query: 8 cctccgtttcacaatgtaagtcattctagcattttccatattcatattgatgttaatgaa 67
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct: 5 cctccgtttcacaatgtaagtcattctagcattttccacattcatattgatgttaatgaa 64
Query: 68 tctaga-------------ctagatttattaacatcaatataaatgtgagaaatgctaga 114
|||||| ||||||| |||||||||||||| |||||| |||||| |||
Sbjct: 65 tctagatagatatatatgtctagattcattaacatcaatatgaatgtgggaaatgtaaga 124
Query: 115 atgacttacattatgaaacggagg 138
|||||||||||| ||||| |||||
Sbjct: 125 atgacttacattgtgaaatggagg 148
>42123_osa-MIR809b:mirbase
Length = 152
Score = 133 bits (67), Expect = 4e-32
Identities = 112/125 (89%), Gaps = 4/125 (3%)
Strand = Plus / Plus
Query: 14 tttcacaatgtaagtcattctagcattttccatattcatattgatgttaatgaatctaga 73
||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 20 tttcacaatataagtcattctagcatttcccacattcatattgatgttaatgaatctaga 79
Query: 74 ctagatttattaacatcaatataaatgtgagaaatgctagaatgacttacattatgaaac 133
| ||| | |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||
Sbjct: 80 -ttgat---gttacatcaatatgaatgtgagaaatgttagaatgacttacattgtgaaac 135
Query: 134 ggagg 138
|||||
Sbjct: 136 ggagg 140
Score = 117 bits (59), Expect = 3e-27
Identities = 114/131 (87%), Gaps = 6/131 (4%)
Strand = Plus / Minus
Query: 3 tactccctccgtttcacaatgtaagtcattctagcattttccatattcatattgatgtta 62
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| |
Sbjct: 145 tactccctccgtttcacaatgtaagtcattctaacatttctcacattcatattgatgtaa 86
Query: 63 -atgaatctagactagatttattaacatcaatataaatgtgagaaatgctagaatgactt 121
|| ||| ||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||
Sbjct: 85 catcaat-----ctagattcattaacatcaatatgaatgtgggaaatgctagaatgactt 31
Query: 122 acattatgaaa 132
| ||| |||||
Sbjct: 30 atattgtgaaa 20
>42665_tae-MIR1132:mirbase
Length = 154
Score = 125 bits (63), Expect = 1e-29
Identities = 124/147 (84%), Gaps = 13/147 (8%)
Strand = Plus / Plus
Query: 3 tactccctccgtttcacaatgtaagtcattctagcattttccatattcatattgatgtta 62
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||
Sbjct: 1 tactccctccgtttcacaatgtaagtcattctagcattttccacattcatataggtgtta 60
Query: 63 atgaatctaga-------------ctagatttattaacatcaatataaatgtgagaaatg 109
||||||||||| ||||||| ||||||| | |||| |||||| ||||||
Sbjct: 61 atgaatctagacatctatatatatctagattcattaacacctatatgaatgtgggaaatg 120
Query: 110 ctagaatgacttacattatgaaacgga 136
||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct: 121 ttagaatgacttacattatggaacgga 147
Score = 89.7 bits (45), Expect = 6e-19
Identities = 121/149 (81%), Gaps = 13/149 (8%)
Strand = Plus / Minus
Query: 3 tactccctccgtttcacaatgtaagtcattctagcattttccatattcatattgatgtta 62
|||||| |||||| || |||||||||||||||| ||||| ||| |||||||| | |||||
Sbjct: 154 tactccttccgttccataatgtaagtcattctaacatttcccacattcatataggtgtta 95
Query: 63 atgaatctaga-------------ctagatttattaacatcaatataaatgtgagaaatg 109
||||||||||| ||||||| ||||||| | |||| |||||| |||||
Sbjct: 94 atgaatctagatatatatagatgtctagattcattaacacctatatgaatgtggaaaatg 35
Query: 110 ctagaatgacttacattatgaaacggagg 138
||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct: 34 ctagaatgacttacattgtgaaacggagg 6
>42078_osa-MIR441c:mirbase
Length = 154
Score = 121 bits (61), Expect = 2e-28
Identities = 128/153 (83%), Gaps = 13/153 (8%)
Strand = Plus / Plus
Query: 3 tactccctccgtttcacaatgtaagtcattctagcattttccatattcatattgatgtta 62
|||| |||| |||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||| ||
Sbjct: 1 tacttcctctgtttcataatgtaagtcattttagcatttttcatatttatattgatggta 60
Query: 63 atgaatctaga-------------ctagatttattaacatcaatataaatgtgagaaatg 109
||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||
Sbjct: 61 atgaatctagatagatatatatgtctagattcattaccatcaatataaatgtgggaaatg 120
Query: 110 ctagaatgacttacattatgaaacggaggaagt 142
||||||| ||||||||| |||||||||||||||
Sbjct: 121 ctagaataacttacattgtgaaacggaggaagt 153
Score = 121 bits (61), Expect = 2e-28
Identities = 128/153 (83%), Gaps = 13/153 (8%)
Strand = Plus / Minus
Query: 3 tactccctccgtttcacaatgtaagtcattctagcattttccatattcatattgatgtta 62
|||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||| ||||||||| ||
Sbjct: 154 tacttcctccgtttcacaatgtaagttattctagcatttcccacatttatattgatggta 95
Query: 63 atgaatctaga-------------ctagatttattaacatcaatataaatgtgagaaatg 109
||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||| ||| |||||
Sbjct: 94 atgaatctagacatatatatctatctagattcattaccatcaatataaatatgaaaaatg 35
Query: 110 ctagaatgacttacattatgaaacggaggaagt 142
||| |||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct: 34 ctaaaatgacttacattatgaaacagaggaagt 2
>42128_osa-MIR809g:mirbase
Length = 152
Score = 119 bits (60), Expect = 6e-28
Identities = 121/144 (84%), Gaps = 13/144 (9%)
Strand = Plus / Plus
Query: 8 cctccgtttcacaatgtaagtcattctagcattttccatattcatattgatgttaatgaa 67
||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||
Sbjct: 5 cctccgtttcacaatgtaagtcattttagcatttcccatattcatattgatgctaatgaa 64
Query: 68 tcta-------------gactagatttattaacatcaatataaatgtgagaaatgctaga 114
| || | ||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||| ||||
Sbjct: 65 tatatataaatatatatgtctagattcattagcatcaatatgaatgtgagaaatgttaga 124
Query: 115 atgacttacattatgaaacggagg 138
|||||||||||| |||||||||||
Sbjct: 125 atgacttacattgtgaaacggagg 148
Score = 111 bits (56), Expect = 2e-25
Identities = 126/152 (82%), Gaps = 13/152 (8%)
Strand = Plus / Minus
Query: 4 actccctccgtttcacaatgtaagtcattctagcattttccatattcatattgatgttaa 63
|||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||| |||
Sbjct: 152 actccctccgtttcacaatgtaagtcattctaacatttctcacattcatattgatgctaa 93
Query: 64 tgaatctagac-------------tagatttattaacatcaatataaatgtgagaaatgc 110
||||||||||| || ||| |||| ||||||||| ||| || |||||||
Sbjct: 92 tgaatctagacatatatatttatatatattcattagcatcaatatgaatatgggaaatgc 33
Query: 111 tagaatgacttacattatgaaacggaggaagt 142
|| ||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct: 32 taaaatgacttacattgtgaaacggaggaagt 1
>42122_osa-MIR809a:mirbase
Length = 161
Score = 113 bits (57), Expect = 4e-26
Identities = 125/151 (82%), Gaps = 15/151 (9%)
Strand = Plus / Plus
Query: 3 tactccctccgtttcacaatgtaagtcattctagcattttccatattcatattgatgtta 62
|||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||| ||||
Sbjct: 3 tactccttccgtttcacaatgtaagtcattatagcatttttcaaattcatattgaggtta 62
Query: 63 atgaatcta---------------gactagatttattaacatcaatataaatgtgagaaa 107
||||||||| | ||||||| |||||||||||||| |||||||||||
Sbjct: 63 atgaatctatatagatatatatatgtctagattcattaacatcaatatgaatgtgagaaa 122
Query: 108 tgctagaatgacttacattatgaaacggagg 138
|| |||||||||||||||| ||||| |||||
Sbjct: 123 tgttagaatgacttacattgtgaaatggagg 153
Score = 107 bits (54), Expect = 2e-24
Identities = 69/74 (93%)
Strand = Plus / Minus
Query: 1 gttactccctccgtttcacaatgtaagtcattctagcattttccatattcatattgatgt 60
|||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||
Sbjct: 160 gttactccctccatttcacaatgtaagtcattctaacatttctcacattcatattgatgt 101
Query: 61 taatgaatctagac 74
||||||||||||||
Sbjct: 100 taatgaatctagac 87
>42101_osa-MIR446:mirbase
Length = 175
Score = 113 bits (57), Expect = 4e-26
Identities = 127/153 (83%), Gaps = 13/153 (8%)
Strand = Plus / Minus
Query: 3 tactccctccgtttcacaatgtaagtcattctagcattttccatattcatattgatgtta 62
|||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct: 161 tactccctccgtttcacaatgtaagttattctaccatttcccatattcatattgatgtta 102
Query: 63 atgaatctagac-------------tagatttattaacatcaatataaatgtgagaaatg 109
|| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct: 101 ataaatctagacatatatatctatatagattcattaacatcaatataaatgtgggaaatt 42
Query: 110 ctagaatgacttacattatgaaacggaggaagt 142
|| ||||||||||| | |||||| |||||||
Sbjct: 41 ttataatgacttacactgtgaaacaaaggaagt 9
Score = 81.8 bits (41), Expect = 1e-16
Identities = 59/65 (90%)
Strand = Plus / Plus
Query: 74 ctagatttattaacatcaatataaatgtgagaaatgctagaatgacttacattatgaaac 133
|||||||||||||||||||||| ||| || |||||| |||||| ||||||||| ||||||
Sbjct: 92 ctagatttattaacatcaatatgaatatgggaaatggtagaataacttacattgtgaaac 151
Query: 134 ggagg 138
|||||
Sbjct: 152 ggagg 156
>42129_osa-MIR809h:mirbase
Length = 134
Score = 107 bits (54), Expect = 2e-24
Identities = 112/134 (83%), Gaps = 13/134 (9%)
Strand = Plus / Plus
Query: 13 gtttcacaatgtaagtcattctagcattttccatattcatattgatgttaatgaatctag 72
||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1 gtttcacaatgtaagtcattctaacatttcccacattcatattgatgttaatgaatctag 60
Query: 73 ac-------------tagatttattaacatcaatataaatgtgagaaatgctagaatgac 119
|| |||||| ||||| |||||||| ||||||||||||| |||||| ||
Sbjct: 61 acatatatatctatttagattcattaaaatcaatatgaatgtgagaaatgttagaataac 120
Query: 120 ttacattatgaaac 133
||||||| ||||||
Sbjct: 121 ttacattgtgaaac 134
Score = 83.8 bits (42), Expect = 4e-17
Identities = 109/134 (81%), Gaps = 13/134 (9%)
Strand = Plus / Minus
Query: 13 gtttcacaatgtaagtcattctagcattttccatattcatattgatgttaatgaatctag 72
|||||||||||||||| |||||| ||||| || |||||||||||| ||||||||||||
Sbjct: 134 gtttcacaatgtaagttattctaacatttctcacattcatattgattttaatgaatctaa 75
Query: 73 a-------------ctagatttattaacatcaatataaatgtgagaaatgctagaatgac 119
| ||||||| |||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||
Sbjct: 74 atagatatatatgtctagattcattaacatcaatatgaatgtgggaaatgttagaatgac 15
Query: 120 ttacattatgaaac 133
||||||| ||||||
Sbjct: 14 ttacattgtgaaac 1
>42127_osa-MIR809f:mirbase
Length = 154
Score = 105 bits (53), Expect = 1e-23
Identities = 126/153 (82%), Gaps = 13/153 (8%)
Strand = Plus / Plus
Query: 3 tactccctccgtttcacaatgtaagtcattctagcattttccatattcatattgatgtta 62
|||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| || ||||||||| ||||||
Sbjct: 1 tactccctccgtttcacaatttaagtcattctatcatttctcacattcatattaatgtta 60
Query: 63 atgaatctaga-------------ctagatttattaacatcaatataaatgtgagaaatg 109
||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||| |||||||||||||
Sbjct: 61 atgaatctagacatatatatctatctaaattcattaccatcaatatgaatgtgagaaatg 120
Query: 110 ctagaatgacttacattatgaaacggaggaagt 142
|||||||| ||| ||| |||||||||||||||
Sbjct: 121 ttagaatgatttaaattgtgaaacggaggaagt 153
Score = 89.7 bits (45), Expect = 6e-19
Identities = 121/149 (81%), Gaps = 13/149 (8%)
Strand = Plus / Minus
Query: 3 tactccctccgtttcacaatgtaagtcattctagcattttccatattcatattgatgtta 62
|||| ||||||||||||||| ||| |||||||| ||||| || ||||||||||||| ||
Sbjct: 154 tacttcctccgtttcacaatttaaatcattctaacatttctcacattcatattgatggta 95
Query: 63 atgaatctaga-------------ctagatttattaacatcaatataaatgtgagaaatg 109
|||||| |||| ||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||
Sbjct: 94 atgaatttagatagatatatatgtctagattcattaacattaatatgaatgtgagaaatg 35
Query: 110 ctagaatgacttacattatgaaacggagg 138
|||||||||||| ||| |||||||||||
Sbjct: 34 atagaatgacttaaattgtgaaacggagg 6
>42076_osa-MIR441a:mirbase
Length = 153
Score = 101 bits (51), Expect = 1e-22
Identities = 66/71 (92%)
Strand = Plus / Minus
Query: 3 tactccctccgtttcacaatgtaagtcattctagcattttccatattcatattgatgtta 62
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||| ||||||||| ||
Sbjct: 142 tactccctccgtttcacaatgtaagtcattttagcatttcccacatttatattgatggta 83
Query: 63 atgaatctaga 73
|||||||||||
Sbjct: 82 atgaatctaga 72
Score = 89.7 bits (45), Expect = 6e-19
Identities = 60/65 (92%)
Strand = Plus / Plus
Query: 74 ctagatttattaacatcaatataaatgtgagaaatgctagaatgacttacattatgaaac 133
||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||
Sbjct: 73 ctagattcattaccatcaatataaatgtgggaaatgctaaaatgacttacattgtgaaac 132
Query: 134 ggagg 138
|||||
Sbjct: 133 ggagg 137
>42126_osa-MIR809e:mirbase
Length = 161
Score = 97.6 bits (49), Expect = 2e-21
Identities = 64/69 (92%)
Strand = Plus / Plus
Query: 74 ctagatttattaacatcaatataaatgtgagaaatgctagaatgacttacattatgaaac 133
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||
Sbjct: 92 ctagatttattaacatcaatatgaatgtgagaaatgttagaataacttacattgtgaaac 151
Query: 134 ggaggaagt 142
||| |||||
Sbjct: 152 ggatgaagt 160
Score = 81.8 bits (41), Expect = 1e-16
Identities = 59/65 (90%)
Strand = Plus / Minus
Query: 10 tccgtttcacaatgtaagtcattctagcattttccatattcatattgatgttaatgaatc 69
||||||||||||||||||| |||||| ||||| || |||||||||||||||||| ||||
Sbjct: 154 tccgtttcacaatgtaagttattctaacatttctcacattcatattgatgttaataaatc 95
Query: 70 tagac 74
|||||
Sbjct: 94 tagac 90
Score = 73.8 bits (37), Expect = 3e-14
Identities = 58/65 (89%)
Strand = Plus / Minus
Query: 74 ctagatttattaacatcaatataaatgtgagaaatgctagaatgacttacattatgaaac 133
||||||| |||||||| ||||||||||| |||||| |||||| ||||||||| ||||||
Sbjct: 70 ctagattcattaacattaatataaatgtaggaaatgttagaataacttacattgtgaaac 11
Query: 134 ggagg 138
|||||
Sbjct: 10 ggagg 6
>42124_osa-MIR809c:mirbase
Length = 155
Score = 89.7 bits (45), Expect = 6e-19
Identities = 125/153 (81%), Gaps = 14/153 (9%)
Strand = Plus / Plus
Query: 3 tactccctccgtttcacaatgtaagtcattctagcattttccatattcatattgatgtta 62
|||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| | | ||||||||||| || |||
Sbjct: 2 tactccctccatttcacaatataagtcattctagcatatcctatattcatattaatatta 61
Query: 63 atgaatctaga-------------ctagatttattaacatcaatataaatgtgagaaatg 109
||||||||||| || ||| ||||||||||| || |||||||||||||
Sbjct: 62 atgaatctagatatatatatttatataaattcattaacatcaa-atgaatgtgagaaatg 120
Query: 110 ctagaatgacttacattatgaaacggaggaagt 142
|||||||||||||||| ||||| |||||||||
Sbjct: 121 ttagaatgacttacattgtgaaatggaggaagt 153
Score = 67.9 bits (34), Expect = 2e-12
Identities = 59/66 (89%), Gaps = 1/66 (1%)
Strand = Plus / Minus
Query: 3 tactccctccgtttcacaatgtaagtcattctagcattttccatattcatattgatgtta 62
|||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||| || |||||| |||||||||
Sbjct: 154 tacttcctccatttcacaatgtaagtcattctaacatttctcacattcat-ttgatgtta 96
Query: 63 atgaat 68
||||||
Sbjct: 95 atgaat 90
Score = 42.1 bits (21), Expect = 1e-04
Identities = 54/65 (83%)
Strand = Plus / Minus
Query: 74 ctagatttattaacatcaatataaatgtgagaaatgctagaatgacttacattatgaaac 133
||||||| ||||| || ||||| ||| | || |||||||||||||||| ||| |||||
Sbjct: 71 ctagattcattaatattaatatgaatataggatatgctagaatgacttatattgtgaaat 12
Query: 134 ggagg 138
|||||
Sbjct: 11 ggagg 7
