miRNEST 2.0, an integrative microRNA resource :: BLAST
>40166_ath-MIR842:mirbase
Length = 199
Score = 252 bits (127), Expect = 5e-68
Identities = 127/127 (100%)
Strand = Plus / Plus
Query: 1 gagaggctataagcgggatgatgaatccgaccatgatggtgttgcagaaatttatgtatg 60
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Sbjct: 37 gagaggctataagcgggatgatgaatccgaccatgatggtgttgcagaaatttatgtatg 96
Query: 61 atgtagttattgtccagggatcgaaacaccatcatggtcagatccgtcatcccacttatg 120
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Sbjct: 97 atgtagttattgtccagggatcgaaacaccatcatggtcagatccgtcatcccacttatg 156
Query: 121 ttttctt 127
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Sbjct: 157 ttttctt 163
>39924_aly-MIR842:mirbase
Length = 157
Score = 159 bits (80), Expect = 6e-40
Identities = 106/114 (92%), Gaps = 3/114 (2%)
Strand = Plus / Plus
Query: 11 aagcgggatgatgaatccgaccatgatggtgttgcagaaatttatgtatgatgtagttat 70
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Sbjct: 28 aagcgggatgatggatccgaccatgatggtgttgcagaaacttatgtacgaggtagttat 87
Query: 71 tgtccagggatcgaaacaccatcatggtcagatccgtcatcccacttatgtttt 124
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Sbjct: 88 ---ccaggggtcgaaacaccatcatggtcagatccgtcatcccacttatgtttt 138
Score = 42.1 bits (21), Expect = 1e-04
Identities = 27/29 (93%)
Strand = Plus / Minus
Query: 85 aacaccatcatggtcagatccgtcatccc 113
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Sbjct: 60 aacaccatcatggtcggatccatcatccc 32