miRNEST 2.0: an integrative microRNA resource miRNEST 2.0, an integrative microRNA resource :: BLAST


>45913_miR809:micropc
          Length = 100

 Score =  129 bits (65), Expect = 7e-31
 Identities = 94/101 (93%), Gaps = 2/101 (1%)
 Strand = Plus / Plus

                                                                       
Query: 27  attctagcattttccacattcatatt-gatgttaatgaatctagatagatatatatgtct 85
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Sbjct: 1   attctagcatttttcgcattcatatttgatgttaataaatctagatagatatatattt-t 59

                                                    
Query: 86  agattcattaacatcaatatgaatgtgggaaatgtaagaat 126
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct: 60  agattcattaacatcaatatgaatgtgggaaatgttagaat 100



 Score = 81.8 bits (41), Expect = 1e-16
 Identities = 76/85 (89%), Gaps = 2/85 (2%)
 Strand = Plus / Minus

                                                                       
Query: 27  attctagcattttccacattcatattgatgttaatgaatctagatagatatatatgtcta 86
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Sbjct: 100 attctaacatttcccacattcatattgatgttaatgaatcta-aaatatatatctatcta 42

                                    
Query: 87  gattcattaacatc-aatatgaatg 110
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Sbjct: 41  gatttattaacatcaaatatgaatg 17




>46833_miR446:micropc
          Length = 81

 Score =  127 bits (64), Expect = 3e-30
 Identities = 70/72 (97%)
 Strand = Plus / Minus

                                                                       
Query: 34  cattttccacattcatattgatgttaatgaatctagatagatatatatgtctagattcat 93
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Sbjct: 81  cattttccacattcatattgatgttaatgaatttagatagatatgtatgtctagattcat 22

                       
Query: 94  taacatcaatat 105
           ||||||||||||
Sbjct: 21  taacatcaatat 10



 Score = 87.7 bits (44), Expect = 2e-18
 Identities = 65/72 (90%)
 Strand = Plus / Plus

                                                                       
Query: 48  atattgatgttaatgaatctagatagatatatatgtctagattcattaacatcaatatga 107
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Sbjct: 10  atattgatgttaatgaatctagacatacatatctatctaaattcattaacatcaatatga 69

                       
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Sbjct: 70  atgtggaaaatg 81




>45708_miR809:micropc
          Length = 100

 Score =  127 bits (64), Expect = 3e-30
 Identities = 85/92 (92%)
 Strand = Plus / Plus

                                                                       
Query: 27  attctagcattttccacattcatattgatgttaatgaatctagatagatatatatgtcta 86
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Sbjct: 1   attctaacatttttcatattcatattgatattaatgaatctagatagatatatatgtcta 60

                                           
Query: 87  gattcattaacatcaatatgaatgtgggaaat 118
           ||||||||| ||||||||| |||||| |||||
Sbjct: 61  gattcattagcatcaatataaatgtgagaaat 92



 Score = 83.8 bits (42), Expect = 3e-17
 Identities = 75/86 (87%)
 Strand = Plus / Minus

                                                                       
Query: 41  cacattcatattgatgttaatgaatctagatagatatatatgtctagattcattaacatc 100
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Sbjct: 86  cacatttatattgatgctaatgaatctagacatatatatctatctagattcattaatatc 27

                                     
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           ||||||||| ||  |||||| |||||
Sbjct: 26  aatatgaatatgaaaaatgttagaat 1




>46801_miR809:micropc
          Length = 110

 Score =  125 bits (63), Expect = 1e-29
 Identities = 75/79 (94%)
 Strand = Plus / Plus

                                                                       
Query: 27  attctagcattttccacattcatattgatgttaatgaatctagatagatatatatgtcta 86
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Sbjct: 1   attctatcatttcccacattcatattaatgttaatgaatctagatagatatatatgttta 60

                              
Query: 87  gattcattaacatcaatat 105
           |||||||||||||||||||
Sbjct: 61  gattcattaacatcaatat 79



 Score = 95.6 bits (48), Expect = 9e-21
 Identities = 66/72 (91%)
 Strand = Plus / Minus

                                                                       
Query: 48  atattgatgttaatgaatctagatagatatatatgtctagattcattaacatcaatatga 107
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Sbjct: 79  atattgatgttaatgaatctaaacatatatatctatctagattcattaacattaatatga 20

                       
Query: 108 atgtgggaaatg 119
           ||||||||||||
Sbjct: 19  atgtgggaaatg 8




>46775_miR808:micropc
          Length = 98

 Score =  125 bits (63), Expect = 1e-29
 Identities = 92/99 (92%), Gaps = 2/99 (2%)
 Strand = Plus / Plus

                                                                       
Query: 28  ttctagcattttccacattcatatt-gatgttaatgaatctagatagatatatatgtcta 86
           |||||||||||| | |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| | ||
Sbjct: 1   ttctagcatttttcgcattcatatttgatgttaataaatctagatagatatatattt-ta 59

                                                  
Query: 87  gattcattaacatcaatatgaatgtgggaaatgtaagaa 125
           |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct: 60  gattcattaacatcaatatgaatgtgggaaatgttagaa 98



 Score = 79.8 bits (40), Expect = 5e-16
 Identities = 75/84 (89%), Gaps = 2/84 (2%)
 Strand = Plus / Minus

                                                                       
Query: 28  ttctagcattttccacattcatattgatgttaatgaatctagatagatatatatgtctag 87
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Sbjct: 98  ttctaacatttcccacattcatattgatgttaatgaatcta-aaatatatatctatctag 40

                                   
Query: 88  attcattaacatc-aatatgaatg 110
           ||| ||||||||| ||||||||||
Sbjct: 39  atttattaacatcaaatatgaatg 16




>45522_miR809:micropc
          Length = 100

 Score =  121 bits (61), Expect = 2e-28
 Identities = 85/93 (91%)
 Strand = Plus / Minus

                                                                       
Query: 27  attctagcattttccacattcatattgatgttaatgaatctagatagatatatatgtcta 86
           |||||| ||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct: 100 attctatcatttcccacattcgtgttgatgttaatgaatctagatagatacatatgtcta 41

                                            
Query: 87  gattcattaacatcaatatgaatgtgggaaatg 119
           ||||||||||||||| || |||||||| |||||
Sbjct: 40  gattcattaacatcattacgaatgtggaaaatg 8



 Score =  113 bits (57), Expect = 4e-26
 Identities = 84/93 (90%)
 Strand = Plus / Plus

                                                                       
Query: 27  attctagcattttccacattcatattgatgttaatgaatctagatagatatatatgtcta 86
           ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| | || ||| | ||||
Sbjct: 1   attctagcattttccacattcgtaatgatgttaatgaatctagacatatgtatctatcta 60

                                            
Query: 87  gattcattaacatcaatatgaatgtgggaaatg 119
           |||||||||||||||| | ||||||||||||||
Sbjct: 61  gattcattaacatcaacacgaatgtgggaaatg 93




>46637_miR446:micropc
          Length = 80

 Score =  113 bits (57), Expect = 4e-26
 Identities = 63/65 (96%)
 Strand = Plus / Minus

                                                                       
Query: 44  attcatattgatgttaatgaatctagatagatatatatgtctagattcattaacatcaat 103
           |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct: 72  attcatattgatgttaatgaatctagctagatatatatgtctagattcattaacattaat 13

                
Query: 104 atgaa 108
           |||||
Sbjct: 12  atgaa 8



 Score = 89.7 bits (45), Expect = 6e-19
 Identities = 66/73 (90%)
 Strand = Plus / Plus

                                                                       
Query: 45  ttcatattgatgttaatgaatctagatagatatatatgtctagattcattaacatcaata 104
           |||||||| ||||||||||||||||| | |||||| |  |||||||||||||||||||||
Sbjct: 8   ttcatattaatgttaatgaatctagacatatatatctagctagattcattaacatcaata 67

                        
Query: 105 tgaatgtgggaaa 117
           ||||| |||||||
Sbjct: 68  tgaatatgggaaa 80




>45342_miR809:micropc
          Length = 100

 Score =  113 bits (57), Expect = 4e-26
 Identities = 84/93 (90%)
 Strand = Plus / Minus

                                                                       
Query: 27  attctagcattttccacattcatattgatgttaatgaatctagatagatatatatgtcta 86
           |||||| ||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct: 100 attctaacatttcccatattcatattaatgttaatgaatctagatggatatatatgtcta 41

                                            
Query: 87  gattcattaacatcaatatgaatgtgggaaatg 119
           ||||| ||| ||||||||||||| || ||||||
Sbjct: 40  gattcgttagcatcaatatgaatatgagaaatg 8



 Score = 87.7 bits (44), Expect = 2e-18
 Identities = 86/100 (86%)
 Strand = Plus / Plus

                                                                       
Query: 27  attctagcattttccacattcatattgatgttaatgaatctagatagatatatatgtcta 86
           ||||| ||||||  || ||||||||||||| ||| ||||||||| | ||||||   ||||
Sbjct: 1   attctggcatttctcatattcatattgatgctaacgaatctagacatatatatccatcta 60

                                                   
Query: 87  gattcattaacatcaatatgaatgtgggaaatgtaagaat 126
           ||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||
Sbjct: 61  gattcattaacattaatatgaatatgggaaatgttagaat 100




>46758_miR808:micropc
          Length = 98

 Score =  111 bits (56), Expect = 2e-25
 Identities = 83/92 (90%)
 Strand = Plus / Minus

                                                                       
Query: 28  ttctagcattttccacattcatattgatgttaatgaatctagatagatatatatgtctag 87
           ||||| ||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct: 98  ttctaacatttcccatattcatattaatgttaatgaatctagatggatatatatgtctag 39

                                           
Query: 88  attcattaacatcaatatgaatgtgggaaatg 119
           |||| ||| ||||||||||||| || ||||||
Sbjct: 38  attcgttagcatcaatatgaatatgagaaatg 7



 Score = 83.8 bits (42), Expect = 3e-17
 Identities = 72/82 (87%)
 Strand = Plus / Plus

                                                                       
Query: 44  attcatattgatgttaatgaatctagatagatatatatgtctagattcattaacatcaat 103
           ||||||||||||| ||| ||||||||| | ||||||   ||||||||||||||||| |||
Sbjct: 17  attcatattgatgctaacgaatctagacatatatatccatctagattcattaacattaat 76

                                 
Query: 104 atgaatgtgggaaatgtaagaa 125
           |||||| |||||||||| ||||
Sbjct: 77  atgaatatgggaaatgttagaa 98




>45995_miR446:micropc
          Length = 86

 Score =  109 bits (55), Expect = 6e-25
 Identities = 81/87 (93%), Gaps = 2/87 (2%)
 Strand = Plus / Plus

                                                                       
Query: 34  cattttccacattcatatt-gatgttaatgaatctagatagatatatatgtctagattca 92
           |||||| | |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||
Sbjct: 1   catttttcgcattcatatttgatgttaataaatctagatagatatatattt-tagattca 59

                                      
Query: 93  ttaacatcaatatgaatgtgggaaatg 119
           |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 60  ttaacatcaatatgaatgtgggaaatg 86



 Score = 75.8 bits (38), Expect = 8e-15
 Identities = 70/78 (89%), Gaps = 2/78 (2%)
 Strand = Plus / Minus

                                                                       
Query: 34  cattttccacattcatattgatgttaatgaatctagatagatatatatgtctagattcat 93
           ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||| | |||||||| ||
Sbjct: 86  catttcccacattcatattgatgttaatgaatcta-aaatatatatctatctagatttat 28

                             
Query: 94  taacatc-aatatgaatg 110
           ||||||| ||||||||||
Sbjct: 27  taacatcaaatatgaatg 10




>45717_miR446:micropc
          Length = 86

 Score =  109 bits (55), Expect = 6e-25
 Identities = 81/87 (93%), Gaps = 2/87 (2%)
 Strand = Plus / Plus

                                                                       
Query: 34  cattttccacattcatatt-gatgttaatgaatctagatagatatatatgtctagattca 92
           |||||| | |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||
Sbjct: 1   catttttcgcattcatatttgatgttaataaatctagatagatatatattt-tagattca 59

                                      
Query: 93  ttaacatcaatatgaatgtgggaaatg 119
           |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 60  ttaacatcaatatgaatgtgggaaatg 86



 Score = 75.8 bits (38), Expect = 8e-15
 Identities = 70/78 (89%), Gaps = 2/78 (2%)
 Strand = Plus / Minus

                                                                       
Query: 34  cattttccacattcatattgatgttaatgaatctagatagatatatatgtctagattcat 93
           ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||| | |||||||| ||
Sbjct: 86  catttcccacattcatattgatgttaatgaatcta-aaatatatatctatctagatttat 28

                             
Query: 94  taacatc-aatatgaatg 110
           ||||||| ||||||||||
Sbjct: 27  taacatcaaatatgaatg 10




>45176_miR446:micropc
          Length = 86

 Score =  109 bits (55), Expect = 6e-25
 Identities = 81/87 (93%), Gaps = 2/87 (2%)
 Strand = Plus / Plus

                                                                       
Query: 34  cattttccacattcatatt-gatgttaatgaatctagatagatatatatgtctagattca 92
           |||||| | |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||
Sbjct: 1   catttttcgcattcatatttgatgttaataaatctagatagatatatattt-tagattca 59

                                      
Query: 93  ttaacatcaatatgaatgtgggaaatg 119
           |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 60  ttaacatcaatatgaatgtgggaaatg 86



 Score = 75.8 bits (38), Expect = 8e-15
 Identities = 70/78 (89%), Gaps = 2/78 (2%)
 Strand = Plus / Minus

                                                                       
Query: 34  cattttccacattcatattgatgttaatgaatctagatagatatatatgtctagattcat 93
           ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||| | |||||||| ||
Sbjct: 86  catttcccacattcatattgatgttaatgaatcta-aaatatatatctatctagatttat 28

                             
Query: 94  taacatc-aatatgaatg 110
           ||||||| ||||||||||
Sbjct: 27  taacatcaaatatgaatg 10




>46080_miR809:micropc
          Length = 99

 Score =  105 bits (53), Expect = 9e-24
 Identities = 78/85 (91%), Gaps = 1/85 (1%)
 Strand = Plus / Plus

                                                                       
Query: 35  attttccacattcatattgatgttaatgaatctagatagatatatatgtctagattcatt 94
           |||| ||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct: 9   atttcccacattcatattgatgctgatga-tctagatagatatatatgtctatattcatt 67

                                    
Query: 95  aacatcaatatgaatgtgggaaatg 119
           | |||||||||||||||| ||||||
Sbjct: 68  accatcaatatgaatgtgagaaatg 92



 Score = 87.7 bits (44), Expect = 2e-18
 Identities = 81/92 (88%), Gaps = 1/92 (1%)
 Strand = Plus / Minus

                                                                       
Query: 27  attctagcattttccacattcatattgatgttaatgaatctagatagatatatatgtcta 86
           ||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||| |||| | |||||| | ||||
Sbjct: 99  attctagcatttctcacattcatattgatggtaatgaatatagacatatatatctatcta 40

                                           
Query: 87  gattcattaacatcaatatgaatgtgggaaat 118
           || |||| | ||||||||||||||||||||||
Sbjct: 39  ga-tcatcagcatcaatatgaatgtgggaaat 9




>45707_miR809:micropc
          Length = 99

 Score =  105 bits (53), Expect = 9e-24
 Identities = 78/85 (91%), Gaps = 1/85 (1%)
 Strand = Plus / Plus

                                                                       
Query: 35  attttccacattcatattgatgttaatgaatctagatagatatatatgtctagattcatt 94
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Sbjct: 9   atttcccacattcatattgatgctgatga-tctagatagatatatatgtctatattcatt 67

                                    
Query: 95  aacatcaatatgaatgtgggaaatg 119
           | |||||||||||||||| ||||||
Sbjct: 68  accatcaatatgaatgtgagaaatg 92



 Score = 87.7 bits (44), Expect = 2e-18
 Identities = 81/92 (88%), Gaps = 1/92 (1%)
 Strand = Plus / Minus

                                                                       
Query: 27  attctagcattttccacattcatattgatgttaatgaatctagatagatatatatgtcta 86
           ||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||| |||| | |||||| | ||||
Sbjct: 99  attctagcatttctcacattcatattgatggtaatgaatatagacatatatatctatcta 40

                                           
Query: 87  gattcattaacatcaatatgaatgtgggaaat 118
           || |||| | ||||||||||||||||||||||
Sbjct: 39  ga-tcatcagcatcaatatgaatgtgggaaat 9




>46318_miR446:micropc
          Length = 86

 Score = 99.6 bits (50), Expect = 6e-22
 Identities = 77/86 (89%)
 Strand = Plus / Plus

                                                                       
Query: 34  cattttccacattcatattgatgttaatgaatctagatagatatatatgtctagattcat 93
           ||||| ||| ||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||
Sbjct: 1   catttcccatatttataatgatgttaatgaatctatatagatatatatgtctagatttat 60

                                     
Query: 94  taacatcaatatgaatgtgggaaatg 119
           |||| ||||||||||| | |||||||
Sbjct: 61  taacgtcaatatgaatataggaaatg 86



 Score = 71.9 bits (36), Expect = 1e-13
 Identities = 66/76 (86%)
 Strand = Plus / Minus

                                                                       
Query: 44  attcatattgatgttaatgaatctagatagatatatatgtctagattcattaacatcaat 103
           ||||||||||| |||||| |||||||| | |||||| | | ||||||||||||||||| |
Sbjct: 76  attcatattgacgttaataaatctagacatatatatctatatagattcattaacatcatt 17

                           
Query: 104 atgaatgtgggaaatg 119
           || ||| |||||||||
Sbjct: 16  ataaatatgggaaatg 1




>45731_miR446:micropc
          Length = 86

 Score = 99.6 bits (50), Expect = 6e-22
 Identities = 77/86 (89%)
 Strand = Plus / Plus

                                                                       
Query: 34  cattttccacattcatattgatgttaatgaatctagatagatatatatgtctagattcat 93
           |||| ||||||||||||| ||| |||||||||||| | | |||| | |||||||||||||
Sbjct: 1   cattgtccacattcatatagattttaatgaatctaaacatatatgtgtgtctagattcat 60

                                     
Query: 94  taacatcaatatgaatgtgggaaatg 119
           ||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct: 61  taacatcaatatgaatgtgggcaatg 86



 Score = 99.6 bits (50), Expect = 6e-22
 Identities = 68/74 (91%)
 Strand = Plus / Minus

                                                                       
Query: 40  ccacattcatattgatgttaatgaatctagatagatatatatgtctagattcattaacat 99
           ||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||| |||||||||||| ||
Sbjct: 80  ccacattcatattgatgttaatgaatctagacacacatatatgtttagattcattaaaat 21

                         
Query: 100 caatatgaatgtgg 113
           | ||||||||||||
Sbjct: 20  ctatatgaatgtgg 7




>46589_miR809:micropc
          Length = 100

 Score = 81.8 bits (41), Expect = 1e-16
 Identities = 74/85 (87%)
 Strand = Plus / Plus

                                                                       
Query: 42  acattcatattgatgttaatgaatctagatagatatatatgtctagattcattaacatca 101
           ||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||| 
Sbjct: 16  acatttataatgatgttaataaatctagatagatatatatttttagattcattaatatcg 75

                                    
Query: 102 atatgaatgtgggaaatgtaagaat 126
           ||||||| |||  |||||| |||||
Sbjct: 76  atatgaacgtgaaaaatgttagaat 100



 Score = 65.9 bits (33), Expect = 8e-12
 Identities = 72/85 (84%)
 Strand = Plus / Minus

                                                                       
Query: 27  attctagcattttccacattcatattgatgttaatgaatctagatagatatatatgtcta 86
           |||||| |||||| ||| ||||||| ||| |||||||||||| | | |||||| | ||||
Sbjct: 100 attctaacatttttcacgttcatatcgatattaatgaatctaaaaatatatatctatcta 41

                                    
Query: 87  gattcattaacatcaatatgaatgt 111
           |||| |||||||||| ||| |||||
Sbjct: 40  gatttattaacatcattataaatgt 16




>46060_miR809:micropc
          Length = 87

 Score = 79.8 bits (40), Expect = 5e-16
 Identities = 43/44 (97%)
 Strand = Plus / Plus

                                                      
Query: 27 attctagcattttccacattcatattgatgttaatgaatctaga 70
          |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1  attctagcattttccatattcatattgatgttaatgaatctaga 44



 Score = 60.0 bits (30), Expect = 5e-10
 Identities = 36/38 (94%)
 Strand = Plus / Minus

                                                 
Query: 82  gtctagattcattaacatcaatatgaatgtgggaaatg 119
           |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||
Sbjct: 45  gtctagattcattaacatcaatatgaatatggaaaatg 8



 Score = 54.0 bits (27), Expect = 3e-08
 Identities = 39/43 (90%)
 Strand = Plus / Minus

                                                     
Query: 27 attctagcattttccacattcatattgatgttaatgaatctag 69
          ||||||||||||  |||||| |||||||||||||| |||||||
Sbjct: 87 attctagcatttctcacatttatattgatgttaataaatctag 45