miRNEST 2.0: an integrative microRNA resource miRNEST 2.0, an integrative microRNA resource :: BLAST


>46801_miR809:micropc
          Length = 110

 Score = 93.7 bits (47), Expect = 4e-20
 Identities = 71/78 (91%), Gaps = 2/78 (2%)
 Strand = Plus / Plus

                                                                       
Query: 36  catttcctacatttatattgatgttaatgaatctagatagatatatatatgtctagattc 95
           ||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||
Sbjct: 8   catttcccacattcatattaatgttaatgaatctagatag--atatatatgtttagattc 65

                             
Query: 96  attaacaccaatataaat 113
           ||||||| ||||||||||
Sbjct: 66  attaacatcaatataaat 83



 Score = 77.8 bits (39), Expect = 2e-15
 Identities = 69/78 (88%), Gaps = 2/78 (2%)
 Strand = Plus / Minus

                                                                       
Query: 46  atttatattgatgttaatgaatctagatagatatatatatgtctagattcattaacacca 105
           ||||||||||||||||||||||||| | | |||||| |||  |||||||||||||||  |
Sbjct: 83  atttatattgatgttaatgaatctaaacatatatatctat--ctagattcattaacatta 26

                             
Query: 106 atataaatgtgggaaatg 123
           |||| |||||||||||||
Sbjct: 25  atatgaatgtgggaaatg 8




>45708_miR809:micropc
          Length = 100

 Score = 91.7 bits (46), Expect = 1e-19
 Identities = 67/73 (91%), Gaps = 2/73 (2%)
 Strand = Plus / Plus

                                                                       
Query: 50  atattgatgttaatgaatctagatagatatatatatgtctagattcattaacaccaatat 109
           |||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| || ||||||
Sbjct: 22  atattgatattaatgaatctagatagatat--atatgtctagattcattagcatcaatat 79

                        
Query: 110 aaatgtgggaaat 122
           ||||||| |||||
Sbjct: 80  aaatgtgagaaat 92



 Score = 61.9 bits (31), Expect = 1e-10
 Identities = 58/66 (87%), Gaps = 2/66 (3%)
 Strand = Plus / Minus

                                                                       
Query: 44  acatttatattgatgttaatgaatctagatagatatatatatgtctagattcattaacac 103
           ||||||||||||||| ||||||||||||  | |||||||| | |||||||||||||| | 
Sbjct: 85  acatttatattgatgctaatgaatctag--acatatatatctatctagattcattaatat 28

                 
Query: 104 caatat 109
           ||||||
Sbjct: 27  caatat 22




>46775_miR808:micropc
          Length = 98

 Score = 81.8 bits (41), Expect = 1e-16
 Identities = 64/71 (90%), Gaps = 3/71 (4%)
 Strand = Plus / Plus

                                                                       
Query: 53  ttgatgttaatgaatctagatagatatatatatgtctagattcattaacaccaatataaa 112
           ||||||||||| |||||||||||||||||||   | |||||||||||||| |||||| ||
Sbjct: 25  ttgatgttaataaatctagatagatatatat---tttagattcattaacatcaatatgaa 81

                      
Query: 113 tgtgggaaatg 123
           |||||||||||
Sbjct: 82  tgtgggaaatg 92



 Score = 61.9 bits (31), Expect = 1e-10
 Identities = 60/69 (86%), Gaps = 3/69 (4%)
 Strand = Plus / Minus

                                                                       
Query: 34  aacatttcctacatttatattgatgttaatgaatctagatagatatatatatgtctagat 93
           ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||   | |||||||| | |||||||
Sbjct: 94  aacatttcccacattcatattgatgttaatgaatcta---aaatatatatctatctagat 38

                    
Query: 94  tcattaaca 102
           | |||||||
Sbjct: 37  ttattaaca 29




>45995_miR446:micropc
          Length = 86

 Score = 81.8 bits (41), Expect = 1e-16
 Identities = 64/71 (90%), Gaps = 3/71 (4%)
 Strand = Plus / Plus

                                                                       
Query: 53  ttgatgttaatgaatctagatagatatatatatgtctagattcattaacaccaatataaa 112
           ||||||||||| |||||||||||||||||||   | |||||||||||||| |||||| ||
Sbjct: 19  ttgatgttaataaatctagatagatatatat---tttagattcattaacatcaatatgaa 75

                      
Query: 113 tgtgggaaatg 123
           |||||||||||
Sbjct: 76  tgtgggaaatg 86



 Score = 58.0 bits (29), Expect = 2e-09
 Identities = 58/67 (86%), Gaps = 3/67 (4%)
 Strand = Plus / Minus

                                                                       
Query: 36  catttcctacatttatattgatgttaatgaatctagatagatatatatatgtctagattc 95
           ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||   | |||||||| | |||||||| 
Sbjct: 86  catttcccacattcatattgatgttaatgaatcta---aaatatatatctatctagattt 30

                  
Query: 96  attaaca 102
           |||||||
Sbjct: 29  attaaca 23




>45913_miR809:micropc
          Length = 100

 Score = 81.8 bits (41), Expect = 1e-16
 Identities = 64/71 (90%), Gaps = 3/71 (4%)
 Strand = Plus / Plus

                                                                       
Query: 53  ttgatgttaatgaatctagatagatatatatatgtctagattcattaacaccaatataaa 112
           ||||||||||| |||||||||||||||||||   | |||||||||||||| |||||| ||
Sbjct: 26  ttgatgttaataaatctagatagatatatat---tttagattcattaacatcaatatgaa 82

                      
Query: 113 tgtgggaaatg 123
           |||||||||||
Sbjct: 83  tgtgggaaatg 93



 Score = 63.9 bits (32), Expect = 3e-11
 Identities = 64/74 (86%), Gaps = 3/74 (4%)
 Strand = Plus / Minus

                                                                       
Query: 29  attcaaacatttcctacatttatattgatgttaatgaatctagatagatatatatatgtc 88
           |||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||   | |||||||| | ||
Sbjct: 100 attctaacatttcccacattcatattgatgttaatgaatcta---aaatatatatctatc 44

                         
Query: 89  tagattcattaaca 102
           |||||| |||||||
Sbjct: 43  tagatttattaaca 30




>45717_miR446:micropc
          Length = 86

 Score = 81.8 bits (41), Expect = 1e-16
 Identities = 64/71 (90%), Gaps = 3/71 (4%)
 Strand = Plus / Plus

                                                                       
Query: 53  ttgatgttaatgaatctagatagatatatatatgtctagattcattaacaccaatataaa 112
           ||||||||||| |||||||||||||||||||   | |||||||||||||| |||||| ||
Sbjct: 19  ttgatgttaataaatctagatagatatatat---tttagattcattaacatcaatatgaa 75

                      
Query: 113 tgtgggaaatg 123
           |||||||||||
Sbjct: 76  tgtgggaaatg 86



 Score = 58.0 bits (29), Expect = 2e-09
 Identities = 58/67 (86%), Gaps = 3/67 (4%)
 Strand = Plus / Minus

                                                                       
Query: 36  catttcctacatttatattgatgttaatgaatctagatagatatatatatgtctagattc 95
           ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||   | |||||||| | |||||||| 
Sbjct: 86  catttcccacattcatattgatgttaatgaatcta---aaatatatatctatctagattt 30

                  
Query: 96  attaaca 102
           |||||||
Sbjct: 29  attaaca 23




>45176_miR446:micropc
          Length = 86

 Score = 81.8 bits (41), Expect = 1e-16
 Identities = 64/71 (90%), Gaps = 3/71 (4%)
 Strand = Plus / Plus

                                                                       
Query: 53  ttgatgttaatgaatctagatagatatatatatgtctagattcattaacaccaatataaa 112
           ||||||||||| |||||||||||||||||||   | |||||||||||||| |||||| ||
Sbjct: 19  ttgatgttaataaatctagatagatatatat---tttagattcattaacatcaatatgaa 75

                      
Query: 113 tgtgggaaatg 123
           |||||||||||
Sbjct: 76  tgtgggaaatg 86



 Score = 58.0 bits (29), Expect = 2e-09
 Identities = 58/67 (86%), Gaps = 3/67 (4%)
 Strand = Plus / Minus

                                                                       
Query: 36  catttcctacatttatattgatgttaatgaatctagatagatatatatatgtctagattc 95
           ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||   | |||||||| | |||||||| 
Sbjct: 86  catttcccacattcatattgatgttaatgaatcta---aaatatatatctatctagattt 30

                  
Query: 96  attaaca 102
           |||||||
Sbjct: 29  attaaca 23




>46833_miR446:micropc
          Length = 81

 Score = 79.8 bits (40), Expect = 6e-16
 Identities = 61/67 (91%), Gaps = 2/67 (2%)
 Strand = Plus / Minus

                                                                       
Query: 44  acatttatattgatgttaatgaatctagatagatatatatatgtctagattcattaacac 103
           ||||| |||||||||||||||||| |||||||  |||| |||||||||||||||||||| 
Sbjct: 73  acattcatattgatgttaatgaatttagatag--atatgtatgtctagattcattaacat 16

                  
Query: 104 caatata 110
           |||||||
Sbjct: 15  caatata 9



 Score = 63.9 bits (32), Expect = 3e-11
 Identities = 65/75 (86%), Gaps = 2/75 (2%)
 Strand = Plus / Plus

                                                                       
Query: 49  tatattgatgttaatgaatctagatagatatatatatgtctagattcattaacaccaata 108
           |||||||||||||||||||||||  | ||| |||| | |||| ||||||||||| |||||
Sbjct: 9   tatattgatgttaatgaatctag--acatacatatctatctaaattcattaacatcaata 66

                          
Query: 109 taaatgtgggaaatg 123
           | ||||||| |||||
Sbjct: 67  tgaatgtggaaaatg 81




>45522_miR809:micropc
          Length = 100

 Score = 79.8 bits (40), Expect = 6e-16
 Identities = 82/95 (86%), Gaps = 2/95 (2%)
 Strand = Plus / Minus

                                                                       
Query: 36  catttcctacatttatattgatgttaatgaatctagatagatatatatatgtctagattc 95
           ||||||| |||||  | |||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||
Sbjct: 93  catttcccacattcgtgttgatgttaatgaatctagatag--atacatatgtctagattc 36

                                              
Query: 96  attaacaccaatataaatgtgggaaatgcttgaat 130
           ||||||| || ||  ||||||| ||||||| ||||
Sbjct: 35  attaacatcattacgaatgtggaaaatgctagaat 1



 Score = 54.0 bits (27), Expect = 3e-08
 Identities = 60/70 (85%), Gaps = 2/70 (2%)
 Strand = Plus / Plus

                                                                       
Query: 54  tgatgttaatgaatctagatagatatatatatgtctagattcattaacaccaatataaat 113
           ||||||||||||||||||| | || ||| |||  ||||||||||||||| ||| |  |||
Sbjct: 26  tgatgttaatgaatctagacatatgtatctat--ctagattcattaacatcaacacgaat 83

                     
Query: 114 gtgggaaatg 123
           ||||||||||
Sbjct: 84  gtgggaaatg 93




>46637_miR446:micropc
          Length = 80

 Score = 75.8 bits (38), Expect = 9e-15
 Identities = 50/53 (94%), Gaps = 2/53 (3%)
 Strand = Plus / Minus

                                                                
Query: 50  atattgatgttaatgaatctagatagatatatatatgtctagattcattaaca 102
           |||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||
Sbjct: 68  atattgatgttaatgaatctagctagatat--atatgtctagattcattaaca 18



 Score = 58.0 bits (29), Expect = 2e-09
 Identities = 62/72 (86%), Gaps = 2/72 (2%)
 Strand = Plus / Plus

                                                                       
Query: 50  atattgatgttaatgaatctagatagatatatatatgtctagattcattaacaccaatat 109
           ||||| ||||||||||||||||| | |||||| ||   ||||||||||||||| ||||||
Sbjct: 11  atattaatgttaatgaatctagacatatatatctag--ctagattcattaacatcaatat 68

                       
Query: 110 aaatgtgggaaa 121
            ||| |||||||
Sbjct: 69  gaatatgggaaa 80




>46318_miR446:micropc
          Length = 86

 Score = 73.8 bits (37), Expect = 3e-14
 Identities = 76/88 (86%), Gaps = 2/88 (2%)
 Strand = Plus / Plus

                                                                       
Query: 36  catttcctacatttatattgatgttaatgaatctagatagatatatatatgtctagattc 95
           ||||||| | ||||||| ||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||| 
Sbjct: 1   catttcccatatttataatgatgttaatgaatctatatag--atatatatgtctagattt 58

                                       
Query: 96  attaacaccaatataaatgtgggaaatg 123
           ||||||  |||||| ||| | |||||||
Sbjct: 59  attaacgtcaatatgaatataggaaatg 86



 Score = 65.9 bits (33), Expect = 8e-12
 Identities = 75/88 (85%), Gaps = 2/88 (2%)
 Strand = Plus / Minus

                                                                       
Query: 36  catttcctacatttatattgatgttaatgaatctagatagatatatatatgtctagattc 95
           ||||||||| ||| ||||||| |||||| |||||||| | |||||| ||| |  ||||||
Sbjct: 86  catttcctatattcatattgacgttaataaatctagacatatatatctatat--agattc 29

                                       
Query: 96  attaacaccaatataaatgtgggaaatg 123
           ||||||| || ||||||| |||||||||
Sbjct: 28  attaacatcattataaatatgggaaatg 1




>45342_miR809:micropc
          Length = 100

 Score = 73.8 bits (37), Expect = 3e-14
 Identities = 82/96 (85%), Gaps = 2/96 (2%)
 Strand = Plus / Minus

                                                                       
Query: 29  attcaaacatttcctacatttatattgatgttaatgaatctagatagatatatatatgtc 88
           |||| ||||||||| | ||| ||||| |||||||||||||||||| |  |||||||||||
Sbjct: 100 attctaacatttcccatattcatattaatgttaatgaatctagatgg--atatatatgtc 43

                                               
Query: 89  tagattcattaacaccaatataaatgtgggaaatgc 124
           ||||||| ||| || |||||| ||| || |||||||
Sbjct: 42  tagattcgttagcatcaatatgaatatgagaaatgc 7



 Score = 46.1 bits (23), Expect = 8e-06
 Identities = 62/74 (83%), Gaps = 2/74 (2%)
 Strand = Plus / Plus

                                                                       
Query: 50  atattgatgttaatgaatctagatagatatatatatgtctagattcattaacaccaatat 109
           ||||||||| ||| ||||||||| | ||||||  ||  |||||||||||||||  |||||
Sbjct: 22  atattgatgctaacgaatctagacatatatatccat--ctagattcattaacattaatat 79

                         
Query: 110 aaatgtgggaaatg 123
            ||| |||||||||
Sbjct: 80  gaatatgggaaatg 93




>46758_miR808:micropc
          Length = 98

 Score = 71.9 bits (36), Expect = 1e-13
 Identities = 78/91 (85%), Gaps = 2/91 (2%)
 Strand = Plus / Minus

                                                                       
Query: 34  aacatttcctacatttatattgatgttaatgaatctagatagatatatatatgtctagat 93
           ||||||||| | ||| ||||| |||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||
Sbjct: 94  aacatttcccatattcatattaatgttaatgaatctagatgg--atatatatgtctagat 37

                                          
Query: 94  tcattaacaccaatataaatgtgggaaatgc 124
           || ||| || |||||| ||| || |||||||
Sbjct: 36  tcgttagcatcaatatgaatatgagaaatgc 6



 Score = 46.1 bits (23), Expect = 8e-06
 Identities = 62/74 (83%), Gaps = 2/74 (2%)
 Strand = Plus / Plus

                                                                       
Query: 50  atattgatgttaatgaatctagatagatatatatatgtctagattcattaacaccaatat 109
           ||||||||| ||| ||||||||| | ||||||  ||  |||||||||||||||  |||||
Sbjct: 21  atattgatgctaacgaatctagacatatatatccat--ctagattcattaacattaatat 78

                         
Query: 110 aaatgtgggaaatg 123
            ||| |||||||||
Sbjct: 79  gaatatgggaaatg 92




>46080_miR809:micropc
          Length = 99

 Score = 69.9 bits (35), Expect = 5e-13
 Identities = 81/94 (86%), Gaps = 3/94 (3%)
 Strand = Plus / Plus

                                                                       
Query: 37  atttcctacatttatattgatgttaatgaatctagatagatatatatatgtctagattca 96
           |||||| ||||| ||||||||| | |||| |||||||||||||  ||||||||| |||||
Sbjct: 9   atttcccacattcatattgatgctgatga-tctagatagatat--atatgtctatattca 65

                                             
Query: 97  ttaacaccaatataaatgtgggaaatgcttgaat 130
           ||| || |||||| |||||| |||||||| ||||
Sbjct: 66  ttaccatcaatatgaatgtgagaaatgctagaat 99



 Score = 40.1 bits (20), Expect = 5e-04
 Identities = 66/79 (83%), Gaps = 3/79 (3%)
 Strand = Plus / Minus

                                                                       
Query: 44  acatttatattgatgttaatgaatctagatagatatatatatgtctagattcattaacac 103
           ||||| ||||||||| |||||||| |||| | |||||| |||  |||||| ||| | || 
Sbjct: 84  acattcatattgatggtaatgaatatagacatatatatctat--ctagat-catcagcat 28

                              
Query: 104 caatataaatgtgggaaat 122
           |||||| ||||||||||||
Sbjct: 27  caatatgaatgtgggaaat 9




>45707_miR809:micropc
          Length = 99

 Score = 69.9 bits (35), Expect = 5e-13
 Identities = 81/94 (86%), Gaps = 3/94 (3%)
 Strand = Plus / Plus

                                                                       
Query: 37  atttcctacatttatattgatgttaatgaatctagatagatatatatatgtctagattca 96
           |||||| ||||| ||||||||| | |||| |||||||||||||  ||||||||| |||||
Sbjct: 9   atttcccacattcatattgatgctgatga-tctagatagatat--atatgtctatattca 65

                                             
Query: 97  ttaacaccaatataaatgtgggaaatgcttgaat 130
           ||| || |||||| |||||| |||||||| ||||
Sbjct: 66  ttaccatcaatatgaatgtgagaaatgctagaat 99



 Score = 40.1 bits (20), Expect = 5e-04
 Identities = 66/79 (83%), Gaps = 3/79 (3%)
 Strand = Plus / Minus

                                                                       
Query: 44  acatttatattgatgttaatgaatctagatagatatatatatgtctagattcattaacac 103
           ||||| ||||||||| |||||||| |||| | |||||| |||  |||||| ||| | || 
Sbjct: 84  acattcatattgatggtaatgaatatagacatatatatctat--ctagat-catcagcat 28

                              
Query: 104 caatataaatgtgggaaat 122
           |||||| ||||||||||||
Sbjct: 27  caatatgaatgtgggaaat 9




>46589_miR809:micropc
          Length = 100

 Score = 67.9 bits (34), Expect = 2e-12
 Identities = 46/50 (92%)
 Strand = Plus / Plus

                                                            
Query: 34 aacatttcctacatttatattgatgttaatgaatctagatagatatatat 83
          |||||||  |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct: 6  aacattttatacatttataatgatgttaataaatctagatagatatatat 55