miRNEST 2.0, an integrative microRNA resource :: BLAST
BLASTN 2.2.20 [Feb-08-2009]
Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer,
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997),
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.
>46773_miR159:micropc
Length = 172
Score = 337 bits (170), Expect = 2e-93
Identities = 170/170 (100%)
Strand = Plus / Plus
Query: 1 gagctctctatcgcctcaaccctgaaaggaaatcgatcatggtggttcatggctgctctt 60
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2 gagctctctatcgcctcaaccctgaaaggaaatcgatcatggtggttcatggctgctctt 61
Query: 61 tcatgaatgcctgtaggtgcaccaatggtgttgtagtgtgcattctaaggttagcatgaa 120
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 62 tcatgaatgcctgtaggtgcaccaatggtgttgtagtgtgcattctaaggttagcatgaa 121
Query: 121 ggtggagctgtggttcgatcatccttttgggattggggtgaagggagctc 170
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 122 ggtggagctgtggttcgatcatccttttgggattggggtgaagggagctc 171
>46547_miR319:micropc
Length = 172
Score = 337 bits (170), Expect = 2e-93
Identities = 170/170 (100%)
Strand = Plus / Plus
Query: 1 gagctctctatcgcctcaaccctgaaaggaaatcgatcatggtggttcatggctgctctt 60
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2 gagctctctatcgcctcaaccctgaaaggaaatcgatcatggtggttcatggctgctctt 61
Query: 61 tcatgaatgcctgtaggtgcaccaatggtgttgtagtgtgcattctaaggttagcatgaa 120
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 62 tcatgaatgcctgtaggtgcaccaatggtgttgtagtgtgcattctaaggttagcatgaa 121
Query: 121 ggtggagctgtggttcgatcatccttttgggattggggtgaagggagctc 170
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 122 ggtggagctgtggttcgatcatccttttgggattggggtgaagggagctc 171
>45950_miR159:micropc
Length = 173
Score = 337 bits (170), Expect = 2e-93
Identities = 170/170 (100%)
Strand = Plus / Plus
Query: 1 gagctctctatcgcctcaaccctgaaaggaaatcgatcatggtggttcatggctgctctt 60
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2 gagctctctatcgcctcaaccctgaaaggaaatcgatcatggtggttcatggctgctctt 61
Query: 61 tcatgaatgcctgtaggtgcaccaatggtgttgtagtgtgcattctaaggttagcatgaa 120
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 62 tcatgaatgcctgtaggtgcaccaatggtgttgtagtgtgcattctaaggttagcatgaa 121
Query: 121 ggtggagctgtggttcgatcatccttttgggattggggtgaagggagctc 170
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 122 ggtggagctgtggttcgatcatccttttgggattggggtgaagggagctc 171
>46781_miR159:micropc
Length = 172
Score = 281 bits (142), Expect = 8e-77
Identities = 163/170 (95%)
Strand = Plus / Plus
Query: 1 gagctctctatcgcctcaaccctgaaaggaaatcgatcatggtggttcatggctgctctt 60
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2 gagctctctatcgcctcgaccctgaaaggaaatcgatcatggtggttcatggctgctctt 61
Query: 61 tcatgaatgcctgtaggtgcaccaatggtgttgtagtgtgcattctaaggttagcatgaa 120
|||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 62 tcatgaatgcttgtaggtgcaccaatgttgttgtagtgtgcattctaaggttagcatgaa 121
Query: 121 ggtggagctgtggttcgatcatccttttgggattggggtgaagggagctc 170
|||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 122 ggtggagccatggtttgatcatctttttgggattggggtgaagggagctc 171
>46103_miR319:micropc
Length = 172
Score = 281 bits (142), Expect = 8e-77
Identities = 163/170 (95%)
Strand = Plus / Plus
Query: 1 gagctctctatcgcctcaaccctgaaaggaaatcgatcatggtggttcatggctgctctt 60
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2 gagctctctatcgcctcgaccctgaaaggaaatcgatcatggtggttcatggctgctctt 61
Query: 61 tcatgaatgcctgtaggtgcaccaatggtgttgtagtgtgcattctaaggttagcatgaa 120
|||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 62 tcatgaatgcttgtaggtgcaccaatgttgttgtagtgtgcattctaaggttagcatgaa 121
Query: 121 ggtggagctgtggttcgatcatccttttgggattggggtgaagggagctc 170
|||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 122 ggtggagccatggtttgatcatctttttgggattggggtgaagggagctc 171
>45527_miR159:micropc
Length = 170
Score = 281 bits (142), Expect = 8e-77
Identities = 163/170 (95%)
Strand = Plus / Plus
Query: 1 gagctctctatcgcctcaaccctgaaaggaaatcgatcatggtggttcatggctgctctt 60
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1 gagctctctatcgcctcgaccctgaaaggaaatcgatcatggtggttcatggctgctctt 60
Query: 61 tcatgaatgcctgtaggtgcaccaatggtgttgtagtgtgcattctaaggttagcatgaa 120
|||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 61 tcatgaatgcttgtaggtgcaccaatgttgttgtagtgtgcattctaaggttagcatgaa 120
Query: 121 ggtggagctgtggttcgatcatccttttgggattggggtgaagggagctc 170
|||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 121 ggtggagccatggtttgatcatctttttgggattggggtgaagggagctc 170
>45517_miR159:micropc
Length = 173
Score = 281 bits (142), Expect = 8e-77
Identities = 163/170 (95%)
Strand = Plus / Plus
Query: 1 gagctctctatcgcctcaaccctgaaaggaaatcgatcatggtggttcatggctgctctt 60
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2 gagctctctatcgcctcgaccctgaaaggaaatcgatcatggtggttcatggctgctctt 61
Query: 61 tcatgaatgcctgtaggtgcaccaatggtgttgtagtgtgcattctaaggttagcatgaa 120
|||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 62 tcatgaatgcttgtaggtgcaccaatgttgttgtagtgtgcattctaaggttagcatgaa 121
Query: 121 ggtggagctgtggttcgatcatccttttgggattggggtgaagggagctc 170
|||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 122 ggtggagccatggtttgatcatctttttgggattggggtgaagggagctc 171
