miRNEST 2.0, an integrative microRNA resource :: BLAST
>26680_cfa-mir-105a:mirbase
Length = 81
Score = 137 bits (69), Expect = 1e-33
Identities = 78/81 (96%)
Strand = Plus / Plus
Query: 1 tgtgcatcgtagtcaaatgctcagactcctgtggtggccgttcatgcaccacggatgttt 60
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||
Sbjct: 1 tgtgcatcgtagtcaaatgctcagactcctgtggtggctgctcatgcaccacggatgttt 60
Query: 61 gagcatgtgctatggtgtcta 81
|||||||||||| ||||||||
Sbjct: 61 gagcatgtgctacggtgtcta 81
>33192_bta-mir-105a:mirbase
Length = 81
Score = 137 bits (69), Expect = 1e-33
Identities = 78/81 (96%)
Strand = Plus / Plus
Query: 1 tgtgcatcgtagtcaaatgctcagactcctgtggtggccgttcatgcaccacggatgttt 60
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||
Sbjct: 1 tgtgcatcgtagtcaaatgctcagactcctgtggtggctgctcatgcaccacggatgttt 60
Query: 61 gagcatgtgctatggtgtcta 81
|||||||||||| ||||||||
Sbjct: 61 gagcatgtgctacggtgtcta 81
>33963_ssc-mir-105-1:mirbase
Length = 81
Score = 137 bits (69), Expect = 1e-33
Identities = 78/81 (96%)
Strand = Plus / Plus
Query: 1 tgtgcatcgtagtcaaatgctcagactcctgtggtggccgttcatgcaccacggatgttt 60
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||
Sbjct: 1 tgtgcatcgtagtcaaatgctcagactcctgtggtggctgctcatgcaccacggatgttt 60
Query: 61 gagcatgtgctatggtgtcta 81
|||||||||||| ||||||||
Sbjct: 61 gagcatgtgctacggtgtcta 81
>27566_lla-mir-105:mirbase
Length = 81
Score = 129 bits (65), Expect = 3e-31
Identities = 77/81 (95%)
Strand = Plus / Plus
Query: 1 tgtgcatcgtagtcaaatgctcagactcctgtggtggccgttcatgcaccacggatgttt 60
|||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||
Sbjct: 1 tgtgcatcgtggtcaaatgctcagactcctgtggtggctgctcatgcaccacggatgttt 60
Query: 61 gagcatgtgctatggtgtcta 81
|||||||||||| ||||||||
Sbjct: 61 gagcatgtgctacggtgtcta 81
>27612_sla-mir-105:mirbase
Length = 81
Score = 129 bits (65), Expect = 3e-31
Identities = 77/81 (95%)
Strand = Plus / Plus
Query: 1 tgtgcatcgtagtcaaatgctcagactcctgtggtggccgttcatgcaccacggatgttt 60
|||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||
Sbjct: 1 tgtgcatcgtggtcaaatgctcagactcctgtggtggctgctcatgcaccacggatgttt 60
Query: 61 gagcatgtgctatggtgtcta 81
|||||||||||| ||||||||
Sbjct: 61 gagcatgtgctacggtgtcta 81
>27709_mml-mir-105-1:mirbase
Length = 81
Score = 129 bits (65), Expect = 3e-31
Identities = 77/81 (95%)
Strand = Plus / Plus
Query: 1 tgtgcatcgtagtcaaatgctcagactcctgtggtggccgttcatgcaccacggatgttt 60
|||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||
Sbjct: 1 tgtgcatcgtggtcaaatgctcagactcctgtggtggctgctcatgcaccacggatgttt 60
Query: 61 gagcatgtgctatggtgtcta 81
|||||||||||| ||||||||
Sbjct: 61 gagcatgtgctacggtgtcta 81
>27710_mml-mir-105-2:mirbase
Length = 81
Score = 129 bits (65), Expect = 3e-31
Identities = 77/81 (95%)
Strand = Plus / Plus
Query: 1 tgtgcatcgtagtcaaatgctcagactcctgtggtggccgttcatgcaccacggatgttt 60
|||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||
Sbjct: 1 tgtgcatcgtggtcaaatgctcagactcctgtggtggctgcttatgcaccacggatgttt 60
Query: 61 gagcatgtgctatggtgtcta 81
|||||||||||||||||||||
Sbjct: 61 gagcatgtgctatggtgtcta 81
>28204_mne-mir-105:mirbase
Length = 81
Score = 129 bits (65), Expect = 3e-31
Identities = 77/81 (95%)
Strand = Plus / Plus
Query: 1 tgtgcatcgtagtcaaatgctcagactcctgtggtggccgttcatgcaccacggatgttt 60
|||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||
Sbjct: 1 tgtgcatcgtggtcaaatgctcagactcctgtggtggctgctcatgcaccacggatgttt 60
Query: 61 gagcatgtgctatggtgtcta 81
|||||||||||| ||||||||
Sbjct: 61 gagcatgtgctacggtgtcta 81
>28296_ggo-mir-105:mirbase
Length = 81
Score = 129 bits (65), Expect = 3e-31
Identities = 77/81 (95%)
Strand = Plus / Plus
Query: 1 tgtgcatcgtagtcaaatgctcagactcctgtggtggccgttcatgcaccacggatgttt 60
|||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||
Sbjct: 1 tgtgcatcgtggtcaaatgctcagactcctgtggtggctgctcatgcaccacggatgttt 60
Query: 61 gagcatgtgctatggtgtcta 81
|||||||||||| ||||||||
Sbjct: 61 gagcatgtgctacggtgtcta 81
>28421_hsa-mir-105-1:mirbase
Length = 81
Score = 129 bits (65), Expect = 3e-31
Identities = 77/81 (95%)
Strand = Plus / Plus
Query: 1 tgtgcatcgtagtcaaatgctcagactcctgtggtggccgttcatgcaccacggatgttt 60
|||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||
Sbjct: 1 tgtgcatcgtggtcaaatgctcagactcctgtggtggctgctcatgcaccacggatgttt 60
Query: 61 gagcatgtgctatggtgtcta 81
|||||||||||| ||||||||
Sbjct: 61 gagcatgtgctacggtgtcta 81
>28422_hsa-mir-105-2:mirbase
Length = 81
Score = 129 bits (65), Expect = 3e-31
Identities = 77/81 (95%)
Strand = Plus / Plus
Query: 1 tgtgcatcgtagtcaaatgctcagactcctgtggtggccgttcatgcaccacggatgttt 60
|||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||
Sbjct: 1 tgtgcatcgtggtcaaatgctcagactcctgtggtggctgcttatgcaccacggatgttt 60
Query: 61 gagcatgtgctatggtgtcta 81
|||||||||||||||||||||
Sbjct: 61 gagcatgtgctatggtgtcta 81
>30083_ppa-mir-105:mirbase
Length = 81
Score = 129 bits (65), Expect = 3e-31
Identities = 77/81 (95%)
Strand = Plus / Plus
Query: 1 tgtgcatcgtagtcaaatgctcagactcctgtggtggccgttcatgcaccacggatgttt 60
|||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||
Sbjct: 1 tgtgcatcgtggtcaaatgctcagactcctgtggtggctgctcatgcaccacggatgttt 60
Query: 61 gagcatgtgctatggtgtcta 81
|||||||||||| ||||||||
Sbjct: 61 gagcatgtgctacggtgtcta 81
>30203_ptr-mir-105:mirbase
Length = 81
Score = 129 bits (65), Expect = 3e-31
Identities = 77/81 (95%)
Strand = Plus / Plus
Query: 1 tgtgcatcgtagtcaaatgctcagactcctgtggtggccgttcatgcaccacggatgttt 60
|||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||
Sbjct: 1 tgtgcatcgtggtcaaatgctcagactcctgtggtggctgcttatgcaccacggatgttt 60
Query: 61 gagcatgtgctatggtgtcta 81
|||||||||||||||||||||
Sbjct: 61 gagcatgtgctatggtgtcta 81
>30809_ppy-mir-105:mirbase
Length = 81
Score = 129 bits (65), Expect = 3e-31
Identities = 77/81 (95%)
Strand = Plus / Plus
Query: 1 tgtgcatcgtagtcaaatgctcagactcctgtggtggccgttcatgcaccacggatgttt 60
|||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||
Sbjct: 1 tgtgcatcgtggtcaaatgctcagactcctgtggtggctgctcatgcaccacggatgttt 60
Query: 61 gagcatgtgctatggtgtcta 81
|||||||||||| ||||||||
Sbjct: 61 gagcatgtgctacggtgtcta 81
>30810_ppy-mir-105-2:mirbase
Length = 81
Score = 129 bits (65), Expect = 3e-31
Identities = 77/81 (95%)
Strand = Plus / Plus
Query: 1 tgtgcatcgtagtcaaatgctcagactcctgtggtggccgttcatgcaccacggatgttt 60
|||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||
Sbjct: 1 tgtgcatcgtggtcaaatgctcagactcctgtggtggctgcttatgcaccacggatgttt 60
Query: 61 gagcatgtgctatggtgtcta 81
|||||||||||||||||||||
Sbjct: 61 gagcatgtgctatggtgtcta 81
>33964_ssc-mir-105-2:mirbase
Length = 80
Score = 113 bits (57), Expect = 2e-26
Identities = 76/81 (93%), Gaps = 1/81 (1%)
Strand = Plus / Plus
Query: 1 tgtgcatcgtagtcaaatgctcagactcctgtggtggccgttcatgcaccacggatgttt 60
|||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| | | |||||||||||||||||
Sbjct: 1 tgtgcatcgtggtcaaatgctcagactcct-tggtggctgcttatgcaccacggatgttt 59
Query: 61 gagcatgtgctatggtgtcta 81
|||||||||||||||||||||
Sbjct: 60 gagcatgtgctatggtgtcta 80
>33193_bta-mir-105b:mirbase
Length = 80
Score = 105 bits (53), Expect = 5e-24
Identities = 75/81 (92%), Gaps = 1/81 (1%)
Strand = Plus / Plus
Query: 1 tgtgcatcgtagtcaaatgctcagactcctgtggtggccgttcatgcaccacggatgttt 60
|||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| | | |||||||| ||||||||
Sbjct: 1 tgtgcatcgtggtcaaatgctcagactcct-tggtggctgcttatgcaccatggatgttt 59
Query: 61 gagcatgtgctatggtgtcta 81
|||||||||||||||||||||
Sbjct: 60 gagcatgtgctatggtgtcta 80
>26681_cfa-mir-105b:mirbase
Length = 80
Score = 89.7 bits (45), Expect = 3e-19
Identities = 73/81 (90%), Gaps = 1/81 (1%)
Strand = Plus / Plus
Query: 1 tgtgcatcgtagtcaaatgctcagactcctgtggtggccgttcatgcaccacggatgttt 60
|||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||| | | |||||||| | ||||||
Sbjct: 1 tgtgcatcatggtcaaatgctcagactcct-tggtggctgcttatgcaccatgaatgttt 59
Query: 61 gagcatgtgctatggtgtcta 81
|||||||||||||||||||||
Sbjct: 60 gagcatgtgctatggtgtcta 80
>32713_rno-mir-105:mirbase
Length = 73
Score = 63.9 bits (32), Expect = 2e-11
Identities = 62/72 (86%)
Strand = Plus / Plus
Query: 10 tagtcaaatgctcagactcctgtggtggccgttcatgcaccacggatgtttgagcatgtg 69
||||||| |||||||| |||||||||| | | ||| | ||||||||||||||||||||
Sbjct: 1 tagtcaagtgctcagatgtctgtggtggctgcttatgtatcacggatgtttgagcatgtg 60
Query: 70 ctatggtgtcta 81
||||||| ||||
Sbjct: 61 ctatggtatcta 72
>31833_mmu-mir-105:mirbase
Length = 80
Score = 54.0 bits (27), Expect = 2e-08
Identities = 42/47 (89%)
Strand = Plus / Plus
Query: 30 tgtggtggccgttcatgcaccacggatgtttgagcatgtgctatggt 76
||||||||| | | |||||||||| ||| ||||||||||||||||||
Sbjct: 28 tgtggtggctgcttatgcaccacgaatgcttgagcatgtgctatggt 74
