miRNEST 2.0, an integrative microRNA resource :: BLAST
BLASTN 2.2.20 [Feb-08-2009]
Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer,
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997),
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.
>32246_mmu-mir-669a-3:mirbase
Length = 109
Score = 119 bits (60), Expect = 4e-28
Identities = 60/60 (100%)
Strand = Plus / Plus
Query: 50 ctatatttgaatatacataacatacacacacatgtataaacgcaagcacacatacacaga 109
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 50 ctatatttgaatatacataacatacacacacatgtataaacgcaagcacacatacacaga 109
>32236_mmu-mir-669a-1:mirbase
Length = 97
Score = 103 bits (52), Expect = 3e-23
Identities = 55/56 (98%)
Strand = Plus / Plus
Query: 50 ctatatttgaatatacataacatacacacacatgtataaacgcaagcacacataca 105
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct: 42 ctatatttgaatatacataacatacacacacacgtataaacgcaagcacacataca 97
>32237_mmu-mir-669a-1:mirbase
Length = 97
Score = 103 bits (52), Expect = 3e-23
Identities = 55/56 (98%)
Strand = Plus / Plus
Query: 50 ctatatttgaatatacataacatacacacacatgtataaacgcaagcacacataca 105
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct: 42 ctatatttgaatatacataacatacacacacacgtataaacgcaagcacacataca 97
>32244_mmu-mir-669a-2:mirbase
Length = 97
Score = 95.6 bits (48), Expect = 6e-21
Identities = 51/52 (98%)
Strand = Plus / Plus
Query: 50 ctatatttgaatatacataacatacacacacatgtataaacgcaagcacaca 101
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct: 44 ctatatttgaatatacataacatacacacacacgtataaacgcaagcacaca 95
>32245_mmu-mir-669a-2:mirbase
Length = 97
Score = 95.6 bits (48), Expect = 6e-21
Identities = 51/52 (98%)
Strand = Plus / Plus
Query: 50 ctatatttgaatatacataacatacacacacatgtataaacgcaagcacaca 101
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct: 44 ctatatttgaatatacataacatacacacacacgtataaacgcaagcacaca 95
>32239_mmu-mir-669a-10:mirbase
Length = 87
Score = 91.7 bits (46), Expect = 1e-19
Identities = 49/50 (98%)
Strand = Plus / Plus
Query: 50 ctatatttgaatatacataacatacacacacatgtataaacgcaagcaca 99
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct: 38 ctatatttgaatatacataacatacacacacacgtataaacgcaagcaca 87
>32238_mmu-mir-669a-10:mirbase
Length = 87
Score = 91.7 bits (46), Expect = 1e-19
Identities = 49/50 (98%)
Strand = Plus / Plus
Query: 50 ctatatttgaatatacataacatacacacacatgtataaacgcaagcaca 99
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct: 38 ctatatttgaatatacataacatacacacacacgtataaacgcaagcaca 87
>32240_mmu-mir-669a-11:mirbase
Length = 87
Score = 91.7 bits (46), Expect = 1e-19
Identities = 49/50 (98%)
Strand = Plus / Plus
Query: 50 ctatatttgaatatacataacatacacacacatgtataaacgcaagcaca 99
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct: 38 ctatatttgaatatacataacatacacacacacgtataaacgcaagcaca 87
>32241_mmu-mir-669a-11:mirbase
Length = 87
Score = 91.7 bits (46), Expect = 1e-19
Identities = 49/50 (98%)
Strand = Plus / Plus
Query: 50 ctatatttgaatatacataacatacacacacatgtataaacgcaagcaca 99
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct: 38 ctatatttgaatatacataacatacacacacacgtataaacgcaagcaca 87
>32242_mmu-mir-669a-12:mirbase
Length = 87
Score = 91.7 bits (46), Expect = 1e-19
Identities = 49/50 (98%)
Strand = Plus / Plus
Query: 50 ctatatttgaatatacataacatacacacacatgtataaacgcaagcaca 99
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct: 38 ctatatttgaatatacataacatacacacacacgtataaacgcaagcaca 87
>32243_mmu-mir-669a-12:mirbase
Length = 87
Score = 91.7 bits (46), Expect = 1e-19
Identities = 49/50 (98%)
Strand = Plus / Plus
Query: 50 ctatatttgaatatacataacatacacacacatgtataaacgcaagcaca 99
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct: 38 ctatatttgaatatacataacatacacacacacgtataaacgcaagcaca 87
>32248_mmu-mir-669a-4:mirbase
Length = 87
Score = 91.7 bits (46), Expect = 1e-19
Identities = 49/50 (98%)
Strand = Plus / Plus
Query: 50 ctatatttgaatatacataacatacacacacatgtataaacgcaagcaca 99
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct: 38 ctatatttgaatatacataacatacacacacacgtataaacgcaagcaca 87
>32249_mmu-mir-669a-4:mirbase
Length = 87
Score = 91.7 bits (46), Expect = 1e-19
Identities = 49/50 (98%)
Strand = Plus / Plus
Query: 50 ctatatttgaatatacataacatacacacacatgtataaacgcaagcaca 99
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct: 38 ctatatttgaatatacataacatacacacacacgtataaacgcaagcaca 87
>32250_mmu-mir-669a-5:mirbase
Length = 87
Score = 91.7 bits (46), Expect = 1e-19
Identities = 49/50 (98%)
Strand = Plus / Plus
Query: 50 ctatatttgaatatacataacatacacacacatgtataaacgcaagcaca 99
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct: 38 ctatatttgaatatacataacatacacacacacgtataaacgcaagcaca 87
>32251_mmu-mir-669a-5:mirbase
Length = 87
Score = 91.7 bits (46), Expect = 1e-19
Identities = 49/50 (98%)
Strand = Plus / Plus
Query: 50 ctatatttgaatatacataacatacacacacatgtataaacgcaagcaca 99
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct: 38 ctatatttgaatatacataacatacacacacacgtataaacgcaagcaca 87
>32252_mmu-mir-669a-6:mirbase
Length = 87
Score = 91.7 bits (46), Expect = 1e-19
Identities = 49/50 (98%)
Strand = Plus / Plus
Query: 50 ctatatttgaatatacataacatacacacacatgtataaacgcaagcaca 99
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct: 38 ctatatttgaatatacataacatacacacacacgtataaacgcaagcaca 87
>32253_mmu-mir-669a-6:mirbase
Length = 87
Score = 91.7 bits (46), Expect = 1e-19
Identities = 49/50 (98%)
Strand = Plus / Plus
Query: 50 ctatatttgaatatacataacatacacacacatgtataaacgcaagcaca 99
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct: 38 ctatatttgaatatacataacatacacacacacgtataaacgcaagcaca 87
>32254_mmu-mir-669a-7:mirbase
Length = 87
Score = 91.7 bits (46), Expect = 1e-19
Identities = 49/50 (98%)
Strand = Plus / Plus
Query: 50 ctatatttgaatatacataacatacacacacatgtataaacgcaagcaca 99
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct: 38 ctatatttgaatatacataacatacacacacacgtataaacgcaagcaca 87
>32255_mmu-mir-669a-7:mirbase
Length = 87
Score = 91.7 bits (46), Expect = 1e-19
Identities = 49/50 (98%)
Strand = Plus / Plus
Query: 50 ctatatttgaatatacataacatacacacacatgtataaacgcaagcaca 99
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct: 38 ctatatttgaatatacataacatacacacacacgtataaacgcaagcaca 87
>32256_mmu-mir-669a-8:mirbase
Length = 87
Score = 91.7 bits (46), Expect = 1e-19
Identities = 49/50 (98%)
Strand = Plus / Plus
Query: 50 ctatatttgaatatacataacatacacacacatgtataaacgcaagcaca 99
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct: 38 ctatatttgaatatacataacatacacacacacgtataaacgcaagcaca 87
>32257_mmu-mir-669a-8:mirbase
Length = 87
Score = 91.7 bits (46), Expect = 1e-19
Identities = 49/50 (98%)
Strand = Plus / Plus
Query: 50 ctatatttgaatatacataacatacacacacatgtataaacgcaagcaca 99
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct: 38 ctatatttgaatatacataacatacacacacacgtataaacgcaagcaca 87
>32258_mmu-mir-669a-9:mirbase
Length = 87
Score = 91.7 bits (46), Expect = 1e-19
Identities = 49/50 (98%)
Strand = Plus / Plus
Query: 50 ctatatttgaatatacataacatacacacacatgtataaacgcaagcaca 99
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct: 38 ctatatttgaatatacataacatacacacacacgtataaacgcaagcaca 87
>32259_mmu-mir-669a-9:mirbase
Length = 87
Score = 91.7 bits (46), Expect = 1e-19
Identities = 49/50 (98%)
Strand = Plus / Plus
Query: 50 ctatatttgaatatacataacatacacacacatgtataaacgcaagcaca 99
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct: 38 ctatatttgaatatacataacatacacacacacgtataaacgcaagcaca 87
>32279_mmu-mir-669o:mirbase
Length = 96
Score = 81.8 bits (41), Expect = 1e-16
Identities = 47/49 (95%)
Strand = Plus / Plus
Query: 53 tatttgaatatacataacatacacacacatgtataaacgcaagcacaca 101
||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||
Sbjct: 45 tatttgaatatacataacatacacacacacgtataaacacaagcacaca 93
>32280_mmu-mir-669o:mirbase
Length = 96
Score = 81.8 bits (41), Expect = 1e-16
Identities = 47/49 (95%)
Strand = Plus / Plus
Query: 53 tatttgaatatacataacatacacacacatgtataaacgcaagcacaca 101
||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||
Sbjct: 45 tatttgaatatacataacatacacacacacgtataaacacaagcacaca 93
>32281_mmu-mir-669p-1:mirbase
Length = 87
Score = 71.9 bits (36), Expect = 9e-14
Identities = 48/51 (94%), Gaps = 2/51 (3%)
Strand = Plus / Plus
Query: 50 ctatatttgaatatacataacat--acacacacatgtataaacgcaagcac 98
||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct: 37 ctatatttgaatatacataacatacacacacacacgtataaacgcaagcac 87
>32282_mmu-mir-669p-2:mirbase
Length = 87
Score = 71.9 bits (36), Expect = 9e-14
Identities = 48/51 (94%), Gaps = 2/51 (3%)
Strand = Plus / Plus
Query: 50 ctatatttgaatatacataacat--acacacacatgtataaacgcaagcac 98
||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct: 37 ctatatttgaatatacataacatacacacacacacgtataaacgcaagcac 87
>32265_mmu-mir-669f:mirbase
Length = 121
Score = 63.9 bits (32), Expect = 2e-11
Identities = 42/44 (95%), Gaps = 1/44 (2%)
Strand = Plus / Plus
Query: 57 tgaatatacata-acatacacacacatgtataaacgcaagcaca 99
|||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct: 49 tgaatatacatatacatacacacacacgtataaacgcaagcaca 92
>32266_mmu-mir-669f:mirbase
Length = 121
Score = 63.9 bits (32), Expect = 2e-11
Identities = 42/44 (95%), Gaps = 1/44 (2%)
Strand = Plus / Plus
Query: 57 tgaatatacata-acatacacacacatgtataaacgcaagcaca 99
|||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct: 49 tgaatatacatatacatacacacacacgtataaacgcaagcaca 92
>32261_mmu-mir-669c:mirbase
Length = 109
Score = 42.1 bits (21), Expect = 8e-05
Identities = 27/29 (93%)
Strand = Plus / Plus
Query: 53 tatttgaatatacataacatacacacaca 81
|||||| ||||| ||||||||||||||||
Sbjct: 45 tatttgcatataaataacatacacacaca 73
