miRNEST 2.0, an integrative microRNA resource :: BLAST
>27710_mml-mir-105-2:mirbase
Length = 81
Score = 83.8 bits (42), Expect = 2e-17
Identities = 63/70 (90%)
Strand = Plus / Plus
Query: 3 gtcaagtgctcagatgtctgtggtggctgcttatgtatcacggatgtttgagcatgtgct 62
||||| |||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||
Sbjct: 12 gtcaaatgctcagactcctgtggtggctgcttatgcaccacggatgtttgagcatgtgct 71
Query: 63 atggtatcta 72
||||| ||||
Sbjct: 72 atggtgtcta 81
>28422_hsa-mir-105-2:mirbase
Length = 81
Score = 83.8 bits (42), Expect = 2e-17
Identities = 63/70 (90%)
Strand = Plus / Plus
Query: 3 gtcaagtgctcagatgtctgtggtggctgcttatgtatcacggatgtttgagcatgtgct 62
||||| |||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||
Sbjct: 12 gtcaaatgctcagactcctgtggtggctgcttatgcaccacggatgtttgagcatgtgct 71
Query: 63 atggtatcta 72
||||| ||||
Sbjct: 72 atggtgtcta 81
>30203_ptr-mir-105:mirbase
Length = 81
Score = 83.8 bits (42), Expect = 2e-17
Identities = 63/70 (90%)
Strand = Plus / Plus
Query: 3 gtcaagtgctcagatgtctgtggtggctgcttatgtatcacggatgtttgagcatgtgct 62
||||| |||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||
Sbjct: 12 gtcaaatgctcagactcctgtggtggctgcttatgcaccacggatgtttgagcatgtgct 71
Query: 63 atggtatcta 72
||||| ||||
Sbjct: 72 atggtgtcta 81
>30810_ppy-mir-105-2:mirbase
Length = 81
Score = 83.8 bits (42), Expect = 2e-17
Identities = 63/70 (90%)
Strand = Plus / Plus
Query: 3 gtcaagtgctcagatgtctgtggtggctgcttatgtatcacggatgtttgagcatgtgct 62
||||| |||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||
Sbjct: 12 gtcaaatgctcagactcctgtggtggctgcttatgcaccacggatgtttgagcatgtgct 71
Query: 63 atggtatcta 72
||||| ||||
Sbjct: 72 atggtgtcta 81
>31833_mmu-mir-105:mirbase
Length = 80
Score = 81.8 bits (41), Expect = 6e-17
Identities = 62/69 (89%)
Strand = Plus / Plus
Query: 5 caagtgctcagatgtctgtggtggctgcttatgtatcacggatgtttgagcatgtgctat 64
|||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||| ||| |||||||||||||||
Sbjct: 12 caagtgctcagatgcttgtggtggctgcttatgcaccacgaatgcttgagcatgtgctat 71
Query: 65 ggtatctac 73
|||| ||||
Sbjct: 72 ggtacctac 80
>33964_ssc-mir-105-2:mirbase
Length = 80
Score = 75.8 bits (38), Expect = 4e-15
Identities = 47/50 (94%)
Strand = Plus / Plus
Query: 23 tggtggctgcttatgtatcacggatgtttgagcatgtgctatggtatcta 72
||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct: 31 tggtggctgcttatgcaccacggatgtttgagcatgtgctatggtgtcta 80
>26680_cfa-mir-105a:mirbase
Length = 81
Score = 71.9 bits (36), Expect = 6e-14
Identities = 63/72 (87%)
Strand = Plus / Plus
Query: 1 tagtcaagtgctcagatgtctgtggtggctgcttatgtatcacggatgtttgagcatgtg 60
||||||| |||||||| |||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||
Sbjct: 10 tagtcaaatgctcagactcctgtggtggctgctcatgcaccacggatgtttgagcatgtg 69
Query: 61 ctatggtatcta 72
||| ||| ||||
Sbjct: 70 ctacggtgtcta 81
>33192_bta-mir-105a:mirbase
Length = 81
Score = 71.9 bits (36), Expect = 6e-14
Identities = 63/72 (87%)
Strand = Plus / Plus
Query: 1 tagtcaagtgctcagatgtctgtggtggctgcttatgtatcacggatgtttgagcatgtg 60
||||||| |||||||| |||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||
Sbjct: 10 tagtcaaatgctcagactcctgtggtggctgctcatgcaccacggatgtttgagcatgtg 69
Query: 61 ctatggtatcta 72
||| ||| ||||
Sbjct: 70 ctacggtgtcta 81
>33963_ssc-mir-105-1:mirbase
Length = 81
Score = 71.9 bits (36), Expect = 6e-14
Identities = 63/72 (87%)
Strand = Plus / Plus
Query: 1 tagtcaagtgctcagatgtctgtggtggctgcttatgtatcacggatgtttgagcatgtg 60
||||||| |||||||| |||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||
Sbjct: 10 tagtcaaatgctcagactcctgtggtggctgctcatgcaccacggatgtttgagcatgtg 69
Query: 61 ctatggtatcta 72
||| ||| ||||
Sbjct: 70 ctacggtgtcta 81
>27566_lla-mir-105:mirbase
Length = 81
Score = 67.9 bits (34), Expect = 9e-13
Identities = 61/70 (87%)
Strand = Plus / Plus
Query: 3 gtcaagtgctcagatgtctgtggtggctgcttatgtatcacggatgtttgagcatgtgct 62
||||| |||||||| |||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||
Sbjct: 12 gtcaaatgctcagactcctgtggtggctgctcatgcaccacggatgtttgagcatgtgct 71
Query: 63 atggtatcta 72
| ||| ||||
Sbjct: 72 acggtgtcta 81
>27612_sla-mir-105:mirbase
Length = 81
Score = 67.9 bits (34), Expect = 9e-13
Identities = 61/70 (87%)
Strand = Plus / Plus
Query: 3 gtcaagtgctcagatgtctgtggtggctgcttatgtatcacggatgtttgagcatgtgct 62
||||| |||||||| |||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||
Sbjct: 12 gtcaaatgctcagactcctgtggtggctgctcatgcaccacggatgtttgagcatgtgct 71
Query: 63 atggtatcta 72
| ||| ||||
Sbjct: 72 acggtgtcta 81
>27709_mml-mir-105-1:mirbase
Length = 81
Score = 67.9 bits (34), Expect = 9e-13
Identities = 61/70 (87%)
Strand = Plus / Plus
Query: 3 gtcaagtgctcagatgtctgtggtggctgcttatgtatcacggatgtttgagcatgtgct 62
||||| |||||||| |||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||
Sbjct: 12 gtcaaatgctcagactcctgtggtggctgctcatgcaccacggatgtttgagcatgtgct 71
Query: 63 atggtatcta 72
| ||| ||||
Sbjct: 72 acggtgtcta 81
>28204_mne-mir-105:mirbase
Length = 81
Score = 67.9 bits (34), Expect = 9e-13
Identities = 61/70 (87%)
Strand = Plus / Plus
Query: 3 gtcaagtgctcagatgtctgtggtggctgcttatgtatcacggatgtttgagcatgtgct 62
||||| |||||||| |||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||
Sbjct: 12 gtcaaatgctcagactcctgtggtggctgctcatgcaccacggatgtttgagcatgtgct 71
Query: 63 atggtatcta 72
| ||| ||||
Sbjct: 72 acggtgtcta 81
>28296_ggo-mir-105:mirbase
Length = 81
Score = 67.9 bits (34), Expect = 9e-13
Identities = 61/70 (87%)
Strand = Plus / Plus
Query: 3 gtcaagtgctcagatgtctgtggtggctgcttatgtatcacggatgtttgagcatgtgct 62
||||| |||||||| |||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||
Sbjct: 12 gtcaaatgctcagactcctgtggtggctgctcatgcaccacggatgtttgagcatgtgct 71
Query: 63 atggtatcta 72
| ||| ||||
Sbjct: 72 acggtgtcta 81
>28421_hsa-mir-105-1:mirbase
Length = 81
Score = 67.9 bits (34), Expect = 9e-13
Identities = 61/70 (87%)
Strand = Plus / Plus
Query: 3 gtcaagtgctcagatgtctgtggtggctgcttatgtatcacggatgtttgagcatgtgct 62
||||| |||||||| |||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||
Sbjct: 12 gtcaaatgctcagactcctgtggtggctgctcatgcaccacggatgtttgagcatgtgct 71
Query: 63 atggtatcta 72
| ||| ||||
Sbjct: 72 acggtgtcta 81
>30083_ppa-mir-105:mirbase
Length = 81
Score = 67.9 bits (34), Expect = 9e-13
Identities = 61/70 (87%)
Strand = Plus / Plus
Query: 3 gtcaagtgctcagatgtctgtggtggctgcttatgtatcacggatgtttgagcatgtgct 62
||||| |||||||| |||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||
Sbjct: 12 gtcaaatgctcagactcctgtggtggctgctcatgcaccacggatgtttgagcatgtgct 71
Query: 63 atggtatcta 72
| ||| ||||
Sbjct: 72 acggtgtcta 81
>30809_ppy-mir-105:mirbase
Length = 81
Score = 67.9 bits (34), Expect = 9e-13
Identities = 61/70 (87%)
Strand = Plus / Plus
Query: 3 gtcaagtgctcagatgtctgtggtggctgcttatgtatcacggatgtttgagcatgtgct 62
||||| |||||||| |||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||
Sbjct: 12 gtcaaatgctcagactcctgtggtggctgctcatgcaccacggatgtttgagcatgtgct 71
Query: 63 atggtatcta 72
| ||| ||||
Sbjct: 72 acggtgtcta 81
>33193_bta-mir-105b:mirbase
Length = 80
Score = 67.9 bits (34), Expect = 9e-13
Identities = 46/50 (92%)
Strand = Plus / Plus
Query: 23 tggtggctgcttatgtatcacggatgtttgagcatgtgctatggtatcta 72
||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct: 31 tggtggctgcttatgcaccatggatgtttgagcatgtgctatggtgtcta 80
>27001_eca-mir-105:mirbase
Length = 81
Score = 63.9 bits (32), Expect = 1e-11
Identities = 62/72 (86%)
Strand = Plus / Plus
Query: 1 tagtcaagtgctcagatgtctgtggtggctgcttatgtatcacggatgtttgagcatgtg 60
||||||| |||||||| |||||||||| | | ||| | ||||||||||||||||||||
Sbjct: 10 tagtcaaatgctcagactcctgtggtggccgttcatgcaccacggatgtttgagcatgtg 69
Query: 61 ctatggtatcta 72
||||||| ||||
Sbjct: 70 ctatggtgtcta 81
>26681_cfa-mir-105b:mirbase
Length = 80
Score = 60.0 bits (30), Expect = 2e-10
Identities = 45/50 (90%)
Strand = Plus / Plus
Query: 23 tggtggctgcttatgtatcacggatgtttgagcatgtgctatggtatcta 72
||||||||||||||| | || | |||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct: 31 tggtggctgcttatgcaccatgaatgtttgagcatgtgctatggtgtcta 80
